MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187109	GAA	2	6	28020	28025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251092
502	NT_187109	TGAT	2	8	28096	28103	25 %	50 %	25 %	0 %	409251092
503	NT_187109	GAA	2	6	28125	28130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251092
504	NT_187109	CG	3	6	28142	28147	0 %	0 %	50 %	50 %	409251092
505	NT_187109	TTC	2	6	28184	28189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251092
506	NT_187109	TGC	2	6	28202	28207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251092
507	NT_187109	TCA	2	6	28269	28274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251092
508	NT_187109	GTT	2	6	28298	28303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251092
509	NT_187109	AAG	2	6	28734	28739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251093
510	NT_187109	CTG	2	6	28776	28781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251093
511	NT_187109	AAG	2	6	28794	28799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251093
512	NT_187109	CGT	2	6	28900	28905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251093
513	NT_187109	T	7	7	28983	28989	0 %	100 %	0 %	0 %	409251093
514	NT_187109	CTG	3	9	29078	29086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251094
515	NT_187109	AGA	2	6	29089	29094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
516	NT_187109	A	7	7	29114	29120	100 %	0 %	0 %	0 %	409251094
517	NT_187109	GAA	2	6	29228	29233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
518	NT_187109	AAG	2	6	29235	29240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
519	NT_187109	TGC	2	6	29262	29267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251094
520	NT_187109	GAG	2	6	29276	29281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251094
521	NT_187109	GAA	2	6	29375	29380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
522	NT_187109	ACGT	2	8	29415	29422	25 %	25 %	25 %	25 %	409251094
523	NT_187109	CTG	2	6	29438	29443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251094
524	NT_187109	GAA	2	6	29489	29494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
525	NT_187109	CTGAC	2	10	29511	29520	20 %	20 %	20 %	40 %	409251094
526	NT_187109	TCA	2	6	29565	29570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251094
527	NT_187109	ACGT	2	8	29584	29591	25 %	25 %	25 %	25 %	409251094
528	NT_187109	CAT	2	6	29602	29607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251094
529	NT_187109	AAC	2	6	29699	29704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251094
530	NT_187109	GC	3	6	29746	29751	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
531	NT_187109	TGGA	2	8	29820	29827	25 %	25 %	50 %	0 %	409251094
532	NT_187109	GAA	2	6	29957	29962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
533	NT_187109	GCC	2	6	29972	29977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251094
534	NT_187109	GGC	2	6	30038	30043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251094
535	NT_187109	AGA	2	6	30076	30081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
536	NT_187109	GC	3	6	30100	30105	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
537	NT_187109	CG	3	6	30152	30157	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
538	NT_187109	GAT	2	6	30202	30207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251094
539	NT_187109	GAA	2	6	30218	30223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
540	NT_187109	CG	3	6	30227	30232	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
541	NT_187109	TGG	2	6	30315	30320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251094
542	NT_187109	GCG	2	6	30332	30337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251094
543	NT_187109	AAG	2	6	30360	30365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
544	NT_187109	ATGAT	2	10	30429	30438	40 %	40 %	20 %	0 %	409251094
545	NT_187109	CCGT	2	8	30464	30471	0 %	25 %	25 %	50 %	409251094
546	NT_187109	CAAG	2	8	30484	30491	50 %	0 %	25 %	25 %	409251094
547	NT_187109	TG	3	6	30531	30536	0 %	50 %	50 %	0 %	409251094
548	NT_187109	CGA	2	6	30550	30555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251094
549	NT_187109	AAG	2	6	30629	30634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
550	NT_187109	AGCAG	2	10	30673	30682	40 %	0 %	40 %	20 %	409251094
551	NT_187109	GAA	2	6	30737	30742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
552	NT_187109	A	6	6	30741	30746	100 %	0 %	0 %	0 %	409251094
553	NT_187109	TGA	2	6	30833	30838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251095
554	NT_187109	AAGA	2	8	30840	30847	75 %	0 %	25 %	0 %	409251095
555	NT_187109	TTG	2	6	30865	30870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251095
556	NT_187109	CT	3	6	30876	30881	0 %	50 %	0 %	50 %	409251095
557	NT_187109	A	6	6	30928	30933	100 %	0 %	0 %	0 %	409251095
558	NT_187109	AACC	2	8	30958	30965	50 %	0 %	0 %	50 %	409251095
559	NT_187109	ACCA	2	8	31017	31024	50 %	0 %	0 %	50 %	409251095
560	NT_187109	GTTC	2	8	31061	31068	0 %	50 %	25 %	25 %	409251095
561	NT_187109	GAA	2	6	31122	31127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251095
562	NT_187109	GAA	2	6	31182	31187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251095
563	NT_187109	GTT	2	6	31212	31217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251095
564	NT_187109	AAG	2	6	31299	31304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251095
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567	NT_187109	ACC	2	6	31674	31679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251096
568	NT_187109	CGG	2	6	31711	31716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251097
569	NT_187109	TCA	2	6	31727	31732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251097
570	NT_187109	CTG	2	6	31741	31746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251097
571	NT_187109	TCA	2	6	31755	31760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251097
572	NT_187109	GTC	2	6	31796	31801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251097
573	NT_187109	T	7	7	31804	31810	0 %	100 %	0 %	0 %	409251097
574	NT_187109	AGA	2	6	31842	31847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251097
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582	NT_187109	GGT	2	6	32263	32268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251097
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584	NT_187109	AAT	2	6	32341	32346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251097
585	NT_187109	GCC	2	6	32347	32352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251097
586	NT_187109	GCG	2	6	32370	32375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251097
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588	NT_187109	CGA	2	6	32487	32492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251097
589	NT_187109	GTC	2	6	32518	32523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251097
590	NT_187109	ACTG	2	8	32531	32538	25 %	25 %	25 %	25 %	409251097
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592	NT_187109	GGA	2	6	32716	32721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251098
593	NT_187109	CCG	2	6	32729	32734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251098
594	NT_187109	GCG	2	6	32783	32788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251098
595	NT_187109	CGG	2	6	32805	32810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251098
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597	NT_187109	CGG	2	6	32914	32919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251098
598	NT_187109	CGC	2	6	32979	32984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251098
599	NT_187109	GCG	2	6	33029	33034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251098
600	NT_187109	GC	3	6	33117	33122	0 %	0 %	50 %	50 %	409251098
601	NT_187109	CTG	2	6	33125	33130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251098
602	NT_187109	T	6	6	33163	33168	0 %	100 %	0 %	0 %	409251098
603	NT_187109	TGC	2	6	33183	33188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251098
604	NT_187109	GC	3	6	33273	33278	0 %	0 %	50 %	50 %	409251098
605	NT_187109	CGC	2	6	33294	33299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251098
606	NT_187109	GC	3	6	33298	33303	0 %	0 %	50 %	50 %	409251098
607	NT_187109	CGCTG	2	10	33343	33352	0 %	20 %	40 %	40 %	409251098
608	NT_187109	CGA	2	6	33394	33399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251098
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610	NT_187109	CGGCTA	2	12	33551	33562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251098
611	NT_187109	GCCT	2	8	33611	33618	0 %	25 %	25 %	50 %	409251098
612	NT_187109	GACC	2	8	33619	33626	25 %	0 %	25 %	50 %	409251098
613	NT_187109	ACC	2	6	33668	33673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251098
614	NT_187109	CAA	2	6	33677	33682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251098
615	NT_187109	GGCT	2	8	33800	33807	0 %	25 %	50 %	25 %	409251098
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620	NT_187109	CGC	2	6	34118	34123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251099
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622	NT_187109	TTAA	2	8	34174	34181	50 %	50 %	0 %	0 %	409251099
623	NT_187109	TG	3	6	34260	34265	0 %	50 %	50 %	0 %	409251099
624	NT_187109	C	6	6	34350	34355	0 %	0 %	0 %	100 %	409251099
625	NT_187109	GCA	2	6	34530	34535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251099
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627	NT_187109	GC	3	6	34587	34592	0 %	0 %	50 %	50 %	409251099
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629	NT_187109	GAA	2	6	34747	34752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251100
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886	NT_187109	GAGGAA	2	12	47310	47321	50 %	0 %	50 %	0 %	409251115
887	NT_187109	GGAA	2	8	47327	47334	50 %	0 %	50 %	0 %	409251115
888	NT_187109	CCT	2	6	47356	47361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251115
889	NT_187109	AAC	2	6	47366	47371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251115
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893	NT_187109	GCG	2	6	47836	47841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251116
894	NT_187109	CCCGCG	2	12	47910	47921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251116
895	NT_187109	CTG	2	6	48085	48090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251116
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992	NT_187109	TGA	2	6	52396	52401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251121
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997	NT_187109	GCA	2	6	52813	52818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251121
998	NT_187109	GCG	2	6	52846	52851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251121
999	NT_187109	GC	3	6	52855	52860	0 %	0 %	50 %	50 %	409251121
1000	NT_187109	CGA	2	6	52873	52878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251121

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