MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1454

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187106	CGT	2	6	103	108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
2	NT_187106	TTC	2	6	176	181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
3	NT_187106	CAC	2	6	215	220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
4	NT_187106	CCG	2	6	232	237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
5	NT_187106	ATC	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250881
6	NT_187106	CGC	2	6	496	501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
7	NT_187106	GAT	2	6	506	511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
8	NT_187106	TCT	2	6	591	596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
9	NT_187106	CAC	2	6	605	610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
10	NT_187106	TCG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
11	NT_187106	CGT	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
12	NT_187106	ATA	2	6	702	707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250881
13	NT_187106	CGG	2	6	709	714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
14	NT_187106	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
15	NT_187106	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
16	NT_187106	GCA	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
17	NT_187106	GAC	2	6	865	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
18	NT_187106	CCA	2	6	967	972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
19	NT_187106	TCT	3	9	990	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
20	NT_187106	CAC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
21	NT_187106	ACA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250881
22	NT_187106	ACG	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
23	NT_187106	GCA	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
24	NT_187106	TCG	2	6	1287	1292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
25	NT_187106	TCA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250881
26	NT_187106	GCA	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
27	NT_187106	ACG	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
28	NT_187106	CAC	2	6	1631	1636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
29	NT_187106	CGG	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
30	NT_187106	ATG	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
31	NT_187106	CCA	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
32	NT_187106	ATT	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250881
33	NT_187106	CAC	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
34	NT_187106	GAT	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
35	NT_187106	CTT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
36	NT_187106	ACG	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
37	NT_187106	TGA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
38	NT_187106	CGG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
39	NT_187106	GCG	2	6	2164	2169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
40	NT_187106	TCG	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
41	NT_187106	GAA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250881
42	NT_187106	CAG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
43	NT_187106	GCC	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
44	NT_187106	CCA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
45	NT_187106	CAA	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250881
46	NT_187106	ATA	2	6	3207	3212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
47	NT_187106	ATG	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250882
48	NT_187106	AAT	2	6	3288	3293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
49	NT_187106	CCG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
50	NT_187106	GTG	2	6	3370	3375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250882
51	NT_187106	CCG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
52	NT_187106	GTT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250882
53	NT_187106	TTC	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250882
54	NT_187106	ATA	2	6	3670	3675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
55	NT_187106	CAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
56	NT_187106	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
57	NT_187106	CGC	2	6	3861	3866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
58	NT_187106	TCA	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
59	NT_187106	TGA	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250882
60	NT_187106	AGG	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250882
61	NT_187106	TTA	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250883
62	NT_187106	TAA	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
63	NT_187106	AAT	2	6	4572	4577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
64	NT_187106	ATC	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250883
65	NT_187106	GCA	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
66	NT_187106	CCA	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250883
67	NT_187106	AGT	2	6	4867	4872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250883
68	NT_187106	GCC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250883
69	NT_187106	AGC	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
70	NT_187106	TTA	2	6	5010	5015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250883
71	NT_187106	CTG	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250883
72	NT_187106	GAT	2	6	5171	5176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250883
73	NT_187106	GAA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250883
74	NT_187106	ATA	2	6	5279	5284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
75	NT_187106	ATA	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
76	NT_187106	AGA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250883
77	NT_187106	GCA	2	6	5547	5552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
78	NT_187106	ACT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250883
79	NT_187106	GAT	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250884
80	NT_187106	CAT	2	6	6128	6133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250884
81	NT_187106	CGA	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250884
82	NT_187106	TCA	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250884
83	NT_187106	ATA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250884
84	NT_187106	CAA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250884
85	NT_187106	CAC	2	6	6543	6548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250884
86	NT_187106	CTT	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250884
87	NT_187106	TAA	2	6	6600	6605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250884
88	NT_187106	TGG	2	6	6763	6768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250885
89	NT_187106	GGC	2	6	6841	6846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250885
90	NT_187106	GCG	3	9	6878	6886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250885
91	NT_187106	ACG	2	6	7052	7057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250885
92	NT_187106	GTC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250885
93	NT_187106	CGG	2	6	7137	7142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250885
94	NT_187106	TTC	2	6	7150	7155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250885
95	NT_187106	GTC	2	6	7195	7200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250885
96	NT_187106	GAA	2	6	7248	7253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250885
97	NT_187106	CTG	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250885
98	NT_187106	CTG	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250886
99	NT_187106	GGC	2	6	7852	7857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250886
100	NT_187106	ATG	2	6	7917	7922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250886
101	NT_187106	GCC	2	6	7961	7966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250886
102	NT_187106	GCC	2	6	8062	8067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250886
103	NT_187106	ACC	2	6	8076	8081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250886
104	NT_187106	ATC	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250886
105	NT_187106	GAA	2	6	8141	8146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250886
106	NT_187106	AGC	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250886
107	NT_187106	CAT	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250886
108	NT_187106	CGG	2	6	8575	8580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250886
109	NT_187106	CGG	2	6	8628	8633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250886
110	NT_187106	GCG	2	6	8652	8657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250886
111	NT_187106	GCG	3	9	8661	8669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250886
112	NT_187106	CTG	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250886
113	NT_187106	CAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250886
114	NT_187106	CTG	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250886
115	NT_187106	GCG	2	6	8817	8822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250886
116	NT_187106	TTC	2	6	8870	8875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250886
117	NT_187106	ACG	2	6	8919	8924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250886
118	NT_187106	TGA	2	6	8970	8975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250886
119	NT_187106	GAA	2	6	9203	9208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250886
120	NT_187106	CGT	2	6	9296	9301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250886
121	NT_187106	AAT	2	6	9377	9382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250886
122	NT_187106	ACC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250886
123	NT_187106	CGT	2	6	9639	9644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250886
124	NT_187106	CCA	2	6	9660	9665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250886
125	NT_187106	GCC	2	6	9676	9681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250886
126	NT_187106	TGT	2	6	9771	9776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250886
127	NT_187106	AAC	2	6	9788	9793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250886
128	NT_187106	TGG	2	6	9810	9815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250886
129	NT_187106	GCA	2	6	9901	9906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250886
130	NT_187106	CTG	2	6	9908	9913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250886
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250	NT_187106	ACT	2	6	18501	18506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250894
251	NT_187106	GCG	2	6	18515	18520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250894
252	NT_187106	CAG	2	6	18541	18546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250894
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254	NT_187106	CGT	2	6	18642	18647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250894
255	NT_187106	GAA	2	6	18814	18819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250894
256	NT_187106	CTG	2	6	18829	18834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250894
257	NT_187106	ACG	2	6	18836	18841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250894
258	NT_187106	ATC	2	6	18874	18879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250894
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263	NT_187106	TAG	2	6	19167	19172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250894
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279	NT_187106	TGC	2	6	20463	20468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250895
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