MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187103	CTTA	2	8	197	204	25 %	50 %	0 %	25 %	409250471
2	NT_187103	ATGA	2	8	553	560	50 %	25 %	25 %	0 %	409250471
3	NT_187103	CCAG	2	8	2043	2050	25 %	0 %	25 %	50 %	409250474
4	NT_187103	AAAC	2	8	2073	2080	75 %	0 %	0 %	25 %	409250474
5	NT_187103	GTTG	2	8	2471	2478	0 %	50 %	50 %	0 %	409250475
6	NT_187103	TCGT	2	8	2828	2835	0 %	50 %	25 %	25 %	409250476
7	NT_187103	GACG	2	8	4573	4580	25 %	0 %	50 %	25 %	409250477
8	NT_187103	TCCC	2	8	5475	5482	0 %	25 %	0 %	75 %	409250479
9	NT_187103	ACAA	2	8	5857	5864	75 %	0 %	0 %	25 %	409250479
10	NT_187103	GATA	2	8	6081	6088	50 %	25 %	25 %	0 %	409250479
11	NT_187103	TGAT	2	8	6971	6978	25 %	50 %	25 %	0 %	409250480
12	NT_187103	GCAG	2	8	7455	7462	25 %	0 %	50 %	25 %	409250481
13	NT_187103	CGTT	2	8	7640	7647	0 %	50 %	25 %	25 %	409250482
14	NT_187103	CCAG	2	8	7648	7655	25 %	0 %	25 %	50 %	409250482
15	NT_187103	AAAG	2	8	7961	7968	75 %	0 %	25 %	0 %	409250482
16	NT_187103	ATGG	2	8	9783	9790	25 %	25 %	50 %	0 %	409250483
17	NT_187103	TCAC	2	8	10498	10505	25 %	25 %	0 %	50 %	409250484
18	NT_187103	CCCA	2	8	10795	10802	25 %	0 %	0 %	75 %	409250484
19	NT_187103	AGAT	2	8	11036	11043	50 %	25 %	25 %	0 %	409250484
20	NT_187103	ATCA	2	8	11414	11421	50 %	25 %	0 %	25 %	409250485
21	NT_187103	CCCA	2	8	11638	11645	25 %	0 %	0 %	75 %	409250485
22	NT_187103	GCAA	2	8	12284	12291	50 %	0 %	25 %	25 %	409250487
23	NT_187103	AACA	2	8	12305	12312	75 %	0 %	0 %	25 %	409250487
24	NT_187103	GGCT	2	8	12320	12327	0 %	25 %	50 %	25 %	409250487
25	NT_187103	TGTA	2	8	12384	12391	25 %	50 %	25 %	0 %	409250487
26	NT_187103	GGCG	2	8	12556	12563	0 %	0 %	75 %	25 %	409250487
27	NT_187103	ACTA	2	8	12763	12770	50 %	25 %	0 %	25 %	409250487
28	NT_187103	TAAT	2	8	12861	12868	50 %	50 %	0 %	0 %	409250487
29	NT_187103	TGAA	2	8	13318	13325	50 %	25 %	25 %	0 %	409250488
30	NT_187103	ATGA	2	8	13938	13945	50 %	25 %	25 %	0 %	409250489
31	NT_187103	TTCT	2	8	14413	14420	0 %	75 %	0 %	25 %	409250490
32	NT_187103	GGCT	2	8	14446	14453	0 %	25 %	50 %	25 %	409250490
33	NT_187103	GCTC	2	8	14637	14644	0 %	25 %	25 %	50 %	409250490
34	NT_187103	CAGC	2	8	15492	15499	25 %	0 %	25 %	50 %	409250491
35	NT_187103	CAGG	2	8	16431	16438	25 %	0 %	50 %	25 %	409250492
36	NT_187103	TGAT	2	8	16721	16728	25 %	50 %	25 %	0 %	409250492
37	NT_187103	CCCA	2	8	17220	17227	25 %	0 %	0 %	75 %	409250492
38	NT_187103	GACA	2	8	17319	17326	50 %	0 %	25 %	25 %	409250492
39	NT_187103	CAGA	2	8	17669	17676	50 %	0 %	25 %	25 %	409250493
40	NT_187103	TCCA	2	8	18547	18554	25 %	25 %	0 %	50 %	409250493
41	NT_187103	GAAA	2	8	19016	19023	75 %	0 %	25 %	0 %	409250494
42	NT_187103	CCTG	2	8	19833	19840	0 %	25 %	25 %	50 %	409250495
43	NT_187103	CCTT	2	8	20764	20771	0 %	50 %	0 %	50 %	409250497
44	NT_187103	CTGC	2	8	21075	21082	0 %	25 %	25 %	50 %	409250497
45	NT_187103	GGCA	2	8	22144	22151	25 %	0 %	50 %	25 %	409250498
46	NT_187103	CGCA	2	8	22419	22426	25 %	0 %	25 %	50 %	409250499
47	NT_187103	GAAA	2	8	22573	22580	75 %	0 %	25 %	0 %	409250499
48	NT_187103	GTCT	2	8	23217	23224	0 %	50 %	25 %	25 %	409250499
49	NT_187103	CAAA	2	8	23247	23254	75 %	0 %	0 %	25 %	409250499
50	NT_187103	CTTT	2	8	24523	24530	0 %	75 %	0 %	25 %	409250501
51	NT_187103	AACG	2	8	24786	24793	50 %	0 %	25 %	25 %	409250501
52	NT_187103	AGCG	2	8	25219	25226	25 %	0 %	50 %	25 %	409250501
53	NT_187103	GACC	2	8	25257	25264	25 %	0 %	25 %	50 %	409250501
54	NT_187103	TAAA	2	8	25496	25503	75 %	25 %	0 %	0 %	409250501
55	NT_187103	GCTG	2	8	25779	25786	0 %	25 %	50 %	25 %	409250501
56	NT_187103	TCGG	2	8	26580	26587	0 %	25 %	50 %	25 %	409250502
57	NT_187103	ATAC	2	8	26659	26666	50 %	25 %	0 %	25 %	409250502
58	NT_187103	ATCA	2	8	26757	26764	50 %	25 %	0 %	25 %	409250502
59	NT_187103	TCCT	2	8	27048	27055	0 %	50 %	0 %	50 %	409250502
60	NT_187103	ATAA	2	8	28446	28453	75 %	25 %	0 %	0 %	409250503
61	NT_187103	TCGC	2	8	30437	30444	0 %	25 %	25 %	50 %	409250505
62	NT_187103	CAAA	2	8	30513	30520	75 %	0 %	0 %	25 %	409250505
63	NT_187103	GTTT	2	8	30564	30571	0 %	75 %	25 %	0 %	409250505
64	NT_187103	TCAC	2	8	30575	30582	25 %	25 %	0 %	50 %	409250505
65	NT_187103	ACGC	2	8	31242	31249	25 %	0 %	25 %	50 %	409250506
66	NT_187103	CCTG	2	8	31317	31324	0 %	25 %	25 %	50 %	409250506
67	NT_187103	TGAT	2	8	31500	31507	25 %	50 %	25 %	0 %	409250506
68	NT_187103	GTGA	2	8	31928	31935	25 %	25 %	50 %	0 %	409250506
69	NT_187103	AGAT	2	8	32519	32526	50 %	25 %	25 %	0 %	409250508
70	NT_187103	CCCT	2	8	32752	32759	0 %	25 %	0 %	75 %	409250508
71	NT_187103	ACCT	2	8	32886	32893	25 %	25 %	0 %	50 %	409250508
72	NT_187103	TCGG	2	8	33607	33614	0 %	25 %	50 %	25 %	409250509
73	NT_187103	GCCA	2	8	34341	34348	25 %	0 %	25 %	50 %	409250509
74	NT_187103	CGAA	2	8	34588	34595	50 %	0 %	25 %	25 %	409250510
75	NT_187103	GAAG	2	8	35150	35157	50 %	0 %	50 %	0 %	409250510
76	NT_187103	TGGA	2	8	35169	35176	25 %	25 %	50 %	0 %	409250510
77	NT_187103	ATGA	2	8	35922	35929	50 %	25 %	25 %	0 %	409250511
78	NT_187103	GCTG	2	8	37035	37042	0 %	25 %	50 %	25 %	409250512
79	NT_187103	CGCC	2	8	37354	37361	0 %	0 %	25 %	75 %	409250513
80	NT_187103	ACGC	2	8	38002	38009	25 %	0 %	25 %	50 %	409250513
81	NT_187103	CAAT	2	8	38433	38440	50 %	25 %	0 %	25 %	409250513
82	NT_187103	CAAT	2	8	38918	38925	50 %	25 %	0 %	25 %	409250514
83	NT_187103	GATA	2	8	38981	38988	50 %	25 %	25 %	0 %	409250514
84	NT_187103	AGGA	2	8	39300	39307	50 %	0 %	50 %	0 %	409250515
85	NT_187103	TGGC	2	8	39437	39444	0 %	25 %	50 %	25 %	409250515
86	NT_187103	TGCC	2	8	39801	39808	0 %	25 %	25 %	50 %	409250515
87	NT_187103	GCTG	2	8	39909	39916	0 %	25 %	50 %	25 %	409250515
88	NT_187103	CTGG	2	8	39940	39947	0 %	25 %	50 %	25 %	409250515
89	NT_187103	ATGA	2	8	43349	43356	50 %	25 %	25 %	0 %	409250516
90	NT_187103	GATC	2	8	43927	43934	25 %	25 %	25 %	25 %	409250516
91	NT_187103	CGCC	2	8	43978	43985	0 %	0 %	25 %	75 %	409250516
92	NT_187103	TTGC	2	8	44420	44427	0 %	50 %	25 %	25 %	409250517
93	NT_187103	AAAT	2	8	44512	44519	75 %	25 %	0 %	0 %	409250517
94	NT_187103	GCAG	2	8	44633	44640	25 %	0 %	50 %	25 %	409250517
95	NT_187103	CTTA	2	8	45445	45452	25 %	50 %	0 %	25 %	409250518
96	NT_187103	GGCT	2	8	46286	46293	0 %	25 %	50 %	25 %	409250519
97	NT_187103	CCTC	2	8	47704	47711	0 %	25 %	0 %	75 %	409250521
98	NT_187103	GCAG	2	8	48010	48017	25 %	0 %	50 %	25 %	409250521
99	NT_187103	CAAC	2	8	48035	48042	50 %	0 %	0 %	50 %	409250521
100	NT_187103	CGAT	2	8	48412	48419	25 %	25 %	25 %	25 %	409250521
101	NT_187103	CGAT	2	8	49164	49171	25 %	25 %	25 %	25 %	409250522
102	NT_187103	TAAA	2	8	49460	49467	75 %	25 %	0 %	0 %	409250522
103	NT_187103	GCTG	2	8	49553	49560	0 %	25 %	50 %	25 %	409250523
104	NT_187103	GGCA	2	8	49889	49896	25 %	0 %	50 %	25 %	409250523
105	NT_187103	CATG	2	8	50062	50069	25 %	25 %	25 %	25 %	409250523
106	NT_187103	CGCC	2	8	50325	50332	0 %	0 %	25 %	75 %	409250523
107	NT_187103	GCCA	2	8	50996	51003	25 %	0 %	25 %	50 %	409250524
108	NT_187103	CTGG	2	8	51139	51146	0 %	25 %	50 %	25 %	409250524
109	NT_187103	GCTG	2	8	51767	51774	0 %	25 %	50 %	25 %	409250525
110	NT_187103	CGCC	2	8	52240	52247	0 %	0 %	25 %	75 %	409250526
111	NT_187103	GCGG	2	8	52401	52408	0 %	0 %	75 %	25 %	409250527
112	NT_187103	TGCC	2	8	53158	53165	0 %	25 %	25 %	50 %	409250528
113	NT_187103	CTGG	2	8	53762	53769	0 %	25 %	50 %	25 %	409250528
114	NT_187103	ATAA	2	8	53982	53989	75 %	25 %	0 %	0 %	409250528
115	NT_187103	CGCC	2	8	56034	56041	0 %	0 %	25 %	75 %	409250529
116	NT_187103	CCGC	2	8	56606	56613	0 %	0 %	25 %	75 %	409250529
117	NT_187103	CAGC	2	8	56644	56651	25 %	0 %	25 %	50 %	409250529
118	NT_187103	GCCG	2	8	57361	57368	0 %	0 %	50 %	50 %	409250530
119	NT_187103	GCCA	2	8	58125	58132	25 %	0 %	25 %	50 %	409250531
120	NT_187103	TGGC	2	8	59553	59560	0 %	25 %	50 %	25 %	409250533
121	NT_187103	CAAC	2	8	60481	60488	50 %	0 %	0 %	50 %	409250533
122	NT_187103	GCCT	2	8	60647	60654	0 %	25 %	25 %	50 %	409250534
123	NT_187103	CGTC	2	8	60858	60865	0 %	25 %	25 %	50 %	409250534
124	NT_187103	ATTA	2	8	61318	61325	50 %	50 %	0 %	0 %	409250534
125	NT_187103	GACT	2	8	61732	61739	25 %	25 %	25 %	25 %	409250535
126	NT_187103	ACGG	2	8	62031	62038	25 %	0 %	50 %	25 %	409250535
127	NT_187103	TGAA	2	8	62471	62478	50 %	25 %	25 %	0 %	409250535
128	NT_187103	CATC	2	8	62481	62488	25 %	25 %	0 %	50 %	409250535
129	NT_187103	ACCA	2	8	63487	63494	50 %	0 %	0 %	50 %	409250537
130	NT_187103	CACG	2	8	64953	64960	25 %	0 %	25 %	50 %	409250539
131	NT_187103	ATGC	2	8	65562	65569	25 %	25 %	25 %	25 %	409250539
132	NT_187103	ACAG	2	8	66097	66104	50 %	0 %	25 %	25 %	409250540
133	NT_187103	ACTG	2	8	66777	66784	25 %	25 %	25 %	25 %	409250540
134	NT_187103	ACAG	2	8	67198	67205	50 %	0 %	25 %	25 %	409250541
135	NT_187103	GGTT	2	8	67260	67267	0 %	50 %	50 %	0 %	409250541
136	NT_187103	TTAC	2	8	67338	67345	25 %	50 %	0 %	25 %	409250542
137	NT_187103	TCGC	2	8	68219	68226	0 %	25 %	25 %	50 %	409250543
138	NT_187103	CGTA	2	8	72071	72078	25 %	25 %	25 %	25 %	409250547
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140	NT_187103	ACGG	2	8	72935	72942	25 %	0 %	50 %	25 %	409250547
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.