MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187102	ACC	2	6	29049	29054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250094
502	NT_187102	CGG	2	6	29065	29070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250094
503	NT_187102	TCA	2	6	29101	29106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250094
504	NT_187102	TCA	2	6	29129	29134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250095
505	NT_187102	CGGTAA	2	12	29202	29213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250095
506	NT_187102	ATG	2	6	29224	29229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250095
507	NT_187102	GGC	2	6	29242	29247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250095
508	NT_187102	CCA	2	6	29268	29273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250095
509	NT_187102	TCG	2	6	29300	29305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250095
510	NT_187102	CTG	2	6	29312	29317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250095
511	NT_187102	AGC	2	6	29318	29323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250095
512	NT_187102	ATG	2	6	29418	29423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250095
513	NT_187102	CAC	2	6	29434	29439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250095
514	NT_187102	TTC	2	6	29446	29451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250095
515	NT_187102	TCG	2	6	29854	29859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250096
516	NT_187102	CGC	2	6	29889	29894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250096
517	NT_187102	GAA	2	6	29915	29920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250096
518	NT_187102	T	7	7	29967	29973	0 %	100 %	0 %	0 %	409250096
519	NT_187102	GCC	2	6	30025	30030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250096
520	NT_187102	TCCT	2	8	30196	30203	0 %	50 %	0 %	50 %	409250096
521	NT_187102	CGC	3	9	30295	30303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250096
522	NT_187102	CGG	2	6	30373	30378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250096
523	NT_187102	ATC	2	6	30432	30437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250096
524	NT_187102	TAT	2	6	30494	30499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250096
525	NT_187102	GGT	2	6	30509	30514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250096
526	NT_187102	CAGA	2	8	30615	30622	50 %	0 %	25 %	25 %	409250096
527	NT_187102	CTG	2	6	30629	30634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250096
528	NT_187102	ATC	2	6	30677	30682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250096
529	NT_187102	AAG	2	6	30741	30746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250096
530	NT_187102	GCT	2	6	30811	30816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250096
531	NT_187102	GAA	2	6	30823	30828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250096
532	NT_187102	A	6	6	31215	31220	100 %	0 %	0 %	0 %	409250097
533	NT_187102	CA	3	6	31240	31245	50 %	0 %	0 %	50 %	409250097
534	NT_187102	GGA	2	6	31477	31482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250097
535	NT_187102	GGT	2	6	31489	31494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250097
536	NT_187102	CGC	2	6	31495	31500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250097
537	NT_187102	T	6	6	31702	31707	0 %	100 %	0 %	0 %	409250097
538	NT_187102	TGA	2	6	31726	31731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250097
539	NT_187102	AAG	2	6	31791	31796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250097
540	NT_187102	CAA	2	6	31826	31831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250097
541	NT_187102	CGA	2	6	31839	31844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250097
542	NT_187102	TGCCA	2	10	31944	31953	20 %	20 %	20 %	40 %	409250098
543	NT_187102	ATA	2	6	31994	31999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250098
544	NT_187102	ACCGA	2	10	32025	32034	40 %	0 %	20 %	40 %	409250098
545	NT_187102	CAA	2	6	32122	32127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250098
546	NT_187102	TCA	2	6	32157	32162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250098
547	NT_187102	ACC	2	6	32206	32211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250098
548	NT_187102	CCAG	2	8	32323	32330	25 %	0 %	25 %	50 %	409250098
549	NT_187102	ATG	2	6	32335	32340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250098
550	NT_187102	GGC	2	6	32395	32400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250098
551	NT_187102	GTAG	2	8	32420	32427	25 %	25 %	50 %	0 %	409250098
552	NT_187102	TCC	2	6	32432	32437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250098
553	NT_187102	CTG	2	6	32442	32447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250098
554	NT_187102	ACA	2	6	32451	32456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250098
555	NT_187102	TCA	2	6	32460	32465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250098
556	NT_187102	CGG	2	6	32488	32493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250098
557	NT_187102	CAA	2	6	32495	32500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250098
558	NT_187102	GCA	2	6	32637	32642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250098
559	NT_187102	CGG	2	6	32686	32691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250098
560	NT_187102	GTG	2	6	32699	32704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250098
561	NT_187102	CGC	2	6	32716	32721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250098
562	NT_187102	CCG	2	6	32873	32878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250098
563	NT_187102	GTT	2	6	32912	32917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250098
564	NT_187102	ATT	2	6	32927	32932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250098
565	NT_187102	CGC	2	6	33061	33066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250098
566	NT_187102	CCA	2	6	33091	33096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250098
567	NT_187102	ATC	2	6	33155	33160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250098
568	NT_187102	GC	3	6	33163	33168	0 %	0 %	50 %	50 %	409250098
569	NT_187102	CCTG	2	8	33192	33199	0 %	25 %	25 %	50 %	409250098
570	NT_187102	GTTT	2	8	33201	33208	0 %	75 %	25 %	0 %	409250098
571	NT_187102	CCG	2	6	33285	33290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250098
572	NT_187102	T	6	6	33381	33386	0 %	100 %	0 %	0 %	409250098
573	NT_187102	CG	3	6	33387	33392	0 %	0 %	50 %	50 %	409250098
574	NT_187102	GTGG	2	8	33413	33420	0 %	25 %	75 %	0 %	409250098
575	NT_187102	TG	3	6	33462	33467	0 %	50 %	50 %	0 %	409250098
576	NT_187102	GTA	2	6	33524	33529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250098
577	NT_187102	GCT	2	6	33530	33535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250098
578	NT_187102	GGC	2	6	33549	33554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250098
579	NT_187102	GGT	2	6	33569	33574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250098
580	NT_187102	CGC	2	6	33586	33591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250098
581	NT_187102	TGG	2	6	33694	33699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250098
582	NT_187102	CG	3	6	33853	33858	0 %	0 %	50 %	50 %	409250098
583	NT_187102	TCT	2	6	33876	33881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250098
584	NT_187102	CGG	2	6	33898	33903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250098
585	NT_187102	GCG	2	6	33931	33936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250098
586	NT_187102	GC	3	6	33967	33972	0 %	0 %	50 %	50 %	409250098
587	NT_187102	GGC	2	6	33974	33979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250098
588	NT_187102	AAT	2	6	34043	34048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250098
589	NT_187102	T	6	6	34334	34339	0 %	100 %	0 %	0 %	409250099
590	NT_187102	CGC	2	6	34340	34345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250099
591	NT_187102	CTC	2	6	34375	34380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250099
592	NT_187102	GGC	2	6	34404	34409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250099
593	NT_187102	TGC	2	6	34418	34423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250099
594	NT_187102	CTGG	2	8	34482	34489	0 %	25 %	50 %	25 %	409250099
595	NT_187102	GGC	2	6	34519	34524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250099
596	NT_187102	CCA	2	6	34598	34603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250099
597	NT_187102	GTC	2	6	34691	34696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250099
598	NT_187102	TGA	2	6	34704	34709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250099
599	NT_187102	GCG	2	6	34765	34770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250099
600	NT_187102	AG	3	6	34803	34808	50 %	0 %	50 %	0 %	409250099
601	NT_187102	ACG	2	6	34849	34854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250099
602	NT_187102	ACC	2	6	34918	34923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250099
603	NT_187102	AAG	2	6	34981	34986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250099
604	NT_187102	CTT	2	6	35010	35015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250099
605	NT_187102	CG	3	6	35047	35052	0 %	0 %	50 %	50 %	409250099
606	NT_187102	GCCT	2	8	35130	35137	0 %	25 %	25 %	50 %	409250099
607	NT_187102	CAGG	2	8	35191	35198	25 %	0 %	50 %	25 %	409250099
608	NT_187102	GTT	2	6	35233	35238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250099
609	NT_187102	GAT	2	6	35353	35358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250099
610	NT_187102	TTAT	2	8	35533	35540	25 %	75 %	0 %	0 %	409250100
611	NT_187102	ATG	2	6	35557	35562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250100
612	NT_187102	T	6	6	35563	35568	0 %	100 %	0 %	0 %	409250100
613	NT_187102	CAAC	2	8	35585	35592	50 %	0 %	0 %	50 %	409250100
614	NT_187102	TGA	2	6	35597	35602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250100
615	NT_187102	CGA	2	6	35603	35608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250100
616	NT_187102	ATG	2	6	35714	35719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250100
617	NT_187102	GCT	2	6	35829	35834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250101
618	NT_187102	TCT	2	6	35835	35840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250101
619	NT_187102	CT	3	6	35853	35858	0 %	50 %	0 %	50 %	409250101
620	NT_187102	CCG	2	6	35866	35871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250101
621	NT_187102	ACG	2	6	35903	35908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250101
622	NT_187102	CAG	2	6	35933	35938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250101
623	NT_187102	CAG	2	6	36023	36028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250101
624	NT_187102	AGG	2	6	36037	36042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250101
625	NT_187102	GC	3	6	36049	36054	0 %	0 %	50 %	50 %	409250101
626	NT_187102	CTT	2	6	36088	36093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250101
627	NT_187102	ACG	2	6	36139	36144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250101
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755	NT_187102	CTG	2	6	43331	43336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250107
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784	NT_187102	CGG	2	6	44970	44975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250108
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789	NT_187102	CCG	2	6	45207	45212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250108
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864	NT_187102	CGG	2	6	49393	49398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250110
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884	NT_187102	CA	3	6	50359	50364	50 %	0 %	0 %	50 %	409250111
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887	NT_187102	GAT	2	6	50449	50454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250111
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892	NT_187102	GGC	2	6	50624	50629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250111
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998	NT_187102	GTT	2	6	56597	56602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250117
999	NT_187102	TCC	3	9	56640	56648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250117
1000	NT_187102	TGGGCG	2	12	56742	56753	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409250117

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