MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NT_187102	GCA	2	6	359014	359019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250433
6502	NT_187102	CAC	2	6	359106	359111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250433
6503	NT_187102	CCA	2	6	359112	359117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250433
6504	NT_187102	ACA	2	6	359119	359124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250433
6505	NT_187102	CGGGA	2	10	359153	359162	20 %	0 %	60 %	20 %	409250433
6506	NT_187102	TA	3	6	359172	359177	50 %	50 %	0 %	0 %	409250433
6507	NT_187102	ACC	2	6	359239	359244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250433
6508	NT_187102	CCG	2	6	359273	359278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250433
6509	NT_187102	CTG	2	6	359652	359657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250434
6510	NT_187102	TAT	2	6	359721	359726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250434
6511	NT_187102	CGTGAC	2	12	359728	359739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250434
6512	NT_187102	ATT	3	9	359759	359767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250434
6513	NT_187102	ATGA	2	8	359778	359785	50 %	25 %	25 %	0 %	409250434
6514	NT_187102	A	6	6	359829	359834	100 %	0 %	0 %	0 %	409250435
6515	NT_187102	ATC	2	6	359853	359858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250435
6516	NT_187102	GGA	2	6	359890	359895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250435
6517	NT_187102	TCA	2	6	359953	359958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250435
6518	NT_187102	GGC	2	6	360322	360327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250436
6519	NT_187102	CGA	2	6	360333	360338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250436
6520	NT_187102	AAG	2	6	360340	360345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250436
6521	NT_187102	AGAA	2	8	360415	360422	75 %	0 %	25 %	0 %	409250436
6522	NT_187102	GTG	2	6	360461	360466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250436
6523	NT_187102	A	6	6	360475	360480	100 %	0 %	0 %	0 %	409250436
6524	NT_187102	GCG	2	6	360495	360500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250436
6525	NT_187102	A	6	6	360523	360528	100 %	0 %	0 %	0 %	409250436
6526	NT_187102	A	6	6	360537	360542	100 %	0 %	0 %	0 %	409250436
6527	NT_187102	CGC	2	6	360619	360624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250436
6528	NT_187102	GTT	2	6	360722	360727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250436
6529	NT_187102	ATCGC	2	10	360770	360779	20 %	20 %	20 %	40 %	409250436
6530	NT_187102	CGC	2	6	360789	360794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250436
6531	NT_187102	TCC	2	6	360808	360813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250436
6532	NT_187102	AAT	2	6	360906	360911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250436
6533	NT_187102	TC	3	6	361021	361026	0 %	50 %	0 %	50 %	409250436
6534	NT_187102	GCTG	2	8	361266	361273	0 %	25 %	50 %	25 %	409250437
6535	NT_187102	AGG	2	6	361344	361349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250437
6536	NT_187102	CGAA	2	8	361414	361421	50 %	0 %	25 %	25 %	409250437
6537	NT_187102	CTT	3	9	361464	361472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250437
6538	NT_187102	AGC	2	6	361540	361545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250437
6539	NT_187102	TAA	2	6	361558	361563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250437
6540	NT_187102	GC	3	6	361590	361595	0 %	0 %	50 %	50 %	409250437
6541	NT_187102	GTG	2	6	361628	361633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250437
6542	NT_187102	CCT	2	6	361688	361693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250437
6543	NT_187102	TATGT	2	10	362055	362064	20 %	60 %	20 %	0 %	409250438
6544	NT_187102	TTAC	2	8	362087	362094	25 %	50 %	0 %	25 %	409250438
6545	NT_187102	GCA	3	9	362109	362117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250438
6546	NT_187102	ATC	2	6	362134	362139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250438
6547	NT_187102	GAC	2	6	362233	362238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250438
6548	NT_187102	AT	3	6	362244	362249	50 %	50 %	0 %	0 %	409250438
6549	NT_187102	AAT	2	6	362256	362261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250438
6550	NT_187102	TGC	2	6	362554	362559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250439
6551	NT_187102	TGC	2	6	362578	362583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250439
6552	NT_187102	TCA	2	6	362695	362700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250439
6553	NT_187102	GCA	2	6	362842	362847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250439
6554	NT_187102	CTG	2	6	362861	362866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250439
6555	NT_187102	AAT	2	6	362907	362912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250439
6556	NT_187102	CAT	3	9	362948	362956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250439
6557	NT_187102	CGG	2	6	363012	363017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250439
6558	NT_187102	TTC	2	6	363129	363134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250439
6559	NT_187102	ATA	2	6	363190	363195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250439
6560	NT_187102	TCT	2	6	363214	363219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250439
6561	NT_187102	TGT	2	6	363297	363302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250439
6562	NT_187102	GCC	2	6	363316	363321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250439
6563	NT_187102	ATG	3	9	363362	363370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250439
6564	NT_187102	ATT	2	6	363461	363466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250440
6565	NT_187102	TTTC	2	8	363645	363652	0 %	75 %	0 %	25 %	409250440
6566	NT_187102	A	6	6	363686	363691	100 %	0 %	0 %	0 %	409250440
6567	NT_187102	CAG	2	6	363697	363702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250440
6568	NT_187102	AT	3	6	363758	363763	50 %	50 %	0 %	0 %	409250440
6569	NT_187102	ATG	2	6	363767	363772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250440
6570	NT_187102	TCA	2	6	363774	363779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250440
6571	NT_187102	CTG	2	6	363845	363850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250440
6572	NT_187102	GTA	2	6	363857	363862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250440
6573	NT_187102	TCG	2	6	363864	363869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250440
6574	NT_187102	ATA	2	6	363879	363884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250440
6575	NT_187102	TAT	2	6	363902	363907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250440
6576	NT_187102	GAT	2	6	363990	363995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250440
6577	NT_187102	CAA	2	6	364018	364023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250440
6578	NT_187102	ATC	2	6	364067	364072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250440
6579	NT_187102	CGCA	2	8	364265	364272	25 %	0 %	25 %	50 %	409250441
6580	NT_187102	AGC	2	6	364277	364282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250441
6581	NT_187102	GCC	2	6	364317	364322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250441
6582	NT_187102	CG	3	6	364493	364498	0 %	0 %	50 %	50 %	409250441
6583	NT_187102	CT	3	6	364598	364603	0 %	50 %	0 %	50 %	409250441
6584	NT_187102	CTG	2	6	364699	364704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250441
6585	NT_187102	CGG	2	6	364712	364717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250441
6586	NT_187102	CAG	2	6	364790	364795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250441
6587	NT_187102	CCGC	2	8	364821	364828	0 %	0 %	25 %	75 %	409250441
6588	NT_187102	CGC	2	6	364895	364900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250441
6589	NT_187102	TCA	2	6	364939	364944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250441
6590	NT_187102	T	6	6	364965	364970	0 %	100 %	0 %	0 %	409250441
6591	NT_187102	ACT	2	6	365314	365319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250442
6592	NT_187102	AC	3	6	365349	365354	50 %	0 %	0 %	50 %	409250442
6593	NT_187102	CGG	2	6	365362	365367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250442
6594	NT_187102	CA	3	6	365436	365441	50 %	0 %	0 %	50 %	409250442
6595	NT_187102	TGC	2	6	365454	365459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250442
6596	NT_187102	TC	3	6	365475	365480	0 %	50 %	0 %	50 %	409250442
6597	NT_187102	TTG	2	6	365592	365597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250442
6598	NT_187102	ATA	2	6	365807	365812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250443
6599	NT_187102	CAA	2	6	365837	365842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250443
6600	NT_187102	CTG	2	6	365846	365851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250443
6601	NT_187102	ATGAT	2	10	365901	365910	40 %	40 %	20 %	0 %	409250443
6602	NT_187102	T	6	6	365978	365983	0 %	100 %	0 %	0 %	409250443
6603	NT_187102	TCG	2	6	366097	366102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250443
6604	NT_187102	ATA	2	6	366116	366121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250443
6605	NT_187102	TCTT	2	8	366153	366160	0 %	75 %	0 %	25 %	409250443
6606	NT_187102	CGC	2	6	366190	366195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250443
6607	NT_187102	GC	3	6	366244	366249	0 %	0 %	50 %	50 %	409250443
6608	NT_187102	TCA	2	6	366267	366272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250443
6609	NT_187102	GC	3	6	366313	366318	0 %	0 %	50 %	50 %	409250443
6610	NT_187102	ATG	2	6	366326	366331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250443
6611	NT_187102	T	7	7	366386	366392	0 %	100 %	0 %	0 %	409250443
6612	NT_187102	TCTT	2	8	366420	366427	0 %	75 %	0 %	25 %	409250443
6613	NT_187102	GAT	2	6	366433	366438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250443
6614	NT_187102	CG	3	6	366646	366651	0 %	0 %	50 %	50 %	409250444
6615	NT_187102	GGC	2	6	366722	366727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250444
6616	NT_187102	GCC	2	6	366769	366774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250444
6617	NT_187102	TCA	2	6	366821	366826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250444
6618	NT_187102	AAG	2	6	366851	366856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250444
6619	NT_187102	CGC	3	9	366873	366881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250444
6620	NT_187102	TTG	2	6	366918	366923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250444
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6622	NT_187102	ACG	2	6	367165	367170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250445
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6869	NT_187102	AGC	2	6	387587	387592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250469
6870	NT_187102	AGG	2	6	387625	387630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250469
6871	NT_187102	GTGCC	2	10	387652	387661	0 %	20 %	40 %	40 %	409250469
6872	NT_187102	CG	3	6	387691	387696	0 %	0 %	50 %	50 %	409250469
6873	NT_187102	A	6	6	387710	387715	100 %	0 %	0 %	0 %	409250469
6874	NT_187102	ACT	2	6	387749	387754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250469

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