MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 452

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187101	CGG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
2	NT_187101	CCT	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250028
3	NT_187101	CAT	3	9	483	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
4	NT_187101	GCG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
5	NT_187101	GCC	2	6	579	584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
6	NT_187101	CGC	2	6	689	694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
7	NT_187101	GCG	2	6	784	789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
8	NT_187101	CCG	2	6	845	850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
9	NT_187101	GGT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250028
10	NT_187101	CCG	2	6	1018	1023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
11	NT_187101	CAG	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
12	NT_187101	CAC	2	6	1106	1111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250028
13	NT_187101	GCG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
14	NT_187101	TAA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250028
15	NT_187101	TGC	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
16	NT_187101	GAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
17	NT_187101	TCT	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250028
18	NT_187101	CAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
19	NT_187101	GCA	2	6	1361	1366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
20	NT_187101	GGC	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
21	NT_187101	GTG	2	6	1567	1572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250028
22	NT_187101	GGC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
23	NT_187101	GAC	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
24	NT_187101	CGG	2	6	1689	1694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
25	NT_187101	TGC	2	6	1799	1804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
26	NT_187101	GAA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
27	NT_187101	GAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
28	NT_187101	CGC	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
29	NT_187101	CTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250028
30	NT_187101	TCG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
31	NT_187101	CCG	2	6	2053	2058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
32	NT_187101	ATT	2	6	2265	2270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250028
33	NT_187101	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
34	NT_187101	GAT	2	6	2473	2478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
35	NT_187101	GCC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
36	NT_187101	ATT	2	6	2526	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250028
37	NT_187101	TCA	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
38	NT_187101	CAT	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
39	NT_187101	ATG	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
40	NT_187101	ATA	2	6	2796	2801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250028
41	NT_187101	TTG	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250028
42	NT_187101	GGC	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
43	NT_187101	ATC	2	6	3307	3312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
44	NT_187101	AGC	3	9	3313	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
45	NT_187101	GAT	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
46	NT_187101	CGG	2	6	3377	3382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
47	NT_187101	CGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
48	NT_187101	TTG	2	6	3482	3487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250028
49	NT_187101	CTG	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250029
50	NT_187101	TAT	2	6	3803	3808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250029
51	NT_187101	TTA	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250030
52	NT_187101	CAG	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250030
53	NT_187101	GCG	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250030
54	NT_187101	GCC	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250030
55	NT_187101	GTT	2	6	4195	4200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250031
56	NT_187101	CAT	2	6	4308	4313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250031
57	NT_187101	GGT	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250031
58	NT_187101	ATG	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250031
59	NT_187101	TTC	2	6	4564	4569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250031
60	NT_187101	CGG	2	6	4824	4829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
61	NT_187101	CAT	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250032
62	NT_187101	TTC	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250032
63	NT_187101	GCC	2	6	4944	4949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250032
64	NT_187101	AAC	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250032
65	NT_187101	GCG	2	6	5130	5135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
66	NT_187101	GCG	2	6	5196	5201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
67	NT_187101	CGG	2	6	5316	5321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
68	NT_187101	TCA	3	9	5329	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250032
69	NT_187101	ACC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250032
70	NT_187101	ATT	2	6	5429	5434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250032
71	NT_187101	CGT	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250032
72	NT_187101	CAG	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250032
73	NT_187101	GCC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
74	NT_187101	CTG	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
75	NT_187101	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250033
76	NT_187101	CGC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
77	NT_187101	TGC	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
78	NT_187101	CAG	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250033
79	NT_187101	CGC	2	6	6477	6482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
80	NT_187101	TGG	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250033
81	NT_187101	TGA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250033
82	NT_187101	CGC	2	6	7115	7120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
83	NT_187101	GCG	2	6	7121	7126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
84	NT_187101	TTC	2	6	7184	7189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250033
85	NT_187101	TGC	2	6	7502	7507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
86	NT_187101	TGG	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250033
87	NT_187101	CCA	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250033
88	NT_187101	CCG	2	6	7745	7750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
89	NT_187101	GGC	2	6	7795	7800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
90	NT_187101	GCA	2	6	8061	8066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250033
91	NT_187101	GCG	2	6	8159	8164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
92	NT_187101	GGT	2	6	8268	8273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250033
93	NT_187101	GGC	2	6	8382	8387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
94	NT_187101	GAA	2	6	8449	8454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250033
95	NT_187101	CCT	2	6	8536	8541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250033
96	NT_187101	GTG	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250034
97	NT_187101	CGC	2	6	8648	8653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250034
98	NT_187101	GAA	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250034
99	NT_187101	TGG	2	6	8894	8899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250035
100	NT_187101	ATG	2	6	8909	8914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250035
101	NT_187101	CGC	2	6	8953	8958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250035
102	NT_187101	CAG	2	6	8968	8973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250035
103	NT_187101	ATC	2	6	8987	8992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250035
104	NT_187101	CTG	2	6	9258	9263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250036
105	NT_187101	CGT	2	6	9280	9285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250036
106	NT_187101	TCA	2	6	9487	9492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250036
107	NT_187101	ATG	2	6	9579	9584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250036
108	NT_187101	GGC	2	6	9605	9610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250036
109	NT_187101	GCG	2	6	9615	9620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250036
110	NT_187101	AAG	2	6	9647	9652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250036
111	NT_187101	GCC	2	6	9737	9742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250037
112	NT_187101	CCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250037
113	NT_187101	ACC	2	6	9881	9886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250037
114	NT_187101	AGT	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250037
115	NT_187101	CGT	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250037
116	NT_187101	TCA	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250037
117	NT_187101	CTG	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250037
118	NT_187101	CCA	2	6	10122	10127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250037
119	NT_187101	GCC	2	6	10157	10162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250037
120	NT_187101	TGC	2	6	10474	10479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250038
121	NT_187101	CAG	2	6	10527	10532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250038
122	NT_187101	TGC	2	6	10549	10554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250038
123	NT_187101	GCG	2	6	10686	10691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250038
124	NT_187101	AGA	2	6	10732	10737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250038
125	NT_187101	ATC	2	6	10765	10770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250038
126	NT_187101	ACC	2	6	10809	10814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250038
127	NT_187101	GGC	2	6	10889	10894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250038
128	NT_187101	GGC	2	6	10941	10946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250038
129	NT_187101	TGA	2	6	11005	11010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250038
130	NT_187101	CTG	2	6	11022	11027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250038
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256	NT_187101	TAC	2	6	22072	22077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250047
257	NT_187101	TAT	2	6	22143	22148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250047
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