MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187101	CGCTG	2	10	29655	29664	0 %	20 %	40 %	40 %	409250055
502	NT_187101	GGC	2	6	29695	29700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
503	NT_187101	CCG	2	6	29732	29737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250055
504	NT_187101	ATT	2	6	29800	29805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250055
505	NT_187101	A	7	7	29850	29856	100 %	0 %	0 %	0 %	409250055
506	NT_187101	CGT	2	6	29985	29990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
507	NT_187101	CTT	2	6	30015	30020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250055
508	NT_187101	GCG	2	6	30022	30027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
509	NT_187101	TGA	2	6	30047	30052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250055
510	NT_187101	A	6	6	30119	30124	100 %	0 %	0 %	0 %	409250055
511	NT_187101	GCG	2	6	30135	30140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
512	NT_187101	GCT	2	6	30162	30167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
513	NT_187101	CGA	2	6	30186	30191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250055
514	NT_187101	GGC	2	6	30200	30205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
515	NT_187101	GTC	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
516	NT_187101	GCA	2	6	30258	30263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250055
517	NT_187101	GTAT	2	8	30363	30370	25 %	50 %	25 %	0 %	409250055
518	NT_187101	GAATGA	2	12	30411	30422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409250055
519	NT_187101	CG	3	6	30485	30490	0 %	0 %	50 %	50 %	409250055
520	NT_187101	TGC	2	6	30494	30499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
521	NT_187101	TGCG	2	8	30599	30606	0 %	25 %	50 %	25 %	409250055
522	NT_187101	CAATGG	2	12	30905	30916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250056
523	NT_187101	CCG	2	6	30917	30922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250056
524	NT_187101	GGC	2	6	30960	30965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250056
525	NT_187101	CAAT	2	8	31027	31034	50 %	25 %	0 %	25 %	409250056
526	NT_187101	GCG	2	6	31064	31069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250056
527	NT_187101	CGC	2	6	31106	31111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250056
528	NT_187101	TCG	3	9	31212	31220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250056
529	NT_187101	ACG	3	9	31243	31251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250056
530	NT_187101	ACG	2	6	31315	31320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250056
531	NT_187101	GGCGC	2	10	31383	31392	0 %	0 %	60 %	40 %	409250056
532	NT_187101	GTC	2	6	31396	31401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250056
533	NT_187101	TCCT	2	8	31402	31409	0 %	50 %	0 %	50 %	409250056
534	NT_187101	GAT	2	6	31435	31440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250056
535	NT_187101	GATA	2	8	31476	31483	50 %	25 %	25 %	0 %	409250056
536	NT_187101	TAC	2	6	31554	31559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250056
537	NT_187101	CTG	2	6	31576	31581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250056
538	NT_187101	AAT	2	6	31729	31734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250056
539	NT_187101	GCC	2	6	31820	31825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250056
540	NT_187101	AAT	2	6	31831	31836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250056
541	NT_187101	AT	3	6	31860	31865	50 %	50 %	0 %	0 %	409250056
542	NT_187101	CTG	2	6	31891	31896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250056
543	NT_187101	ACA	2	6	31943	31948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250056
544	NT_187101	GC	3	6	32120	32125	0 %	0 %	50 %	50 %	409250056
545	NT_187101	GCC	2	6	32127	32132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250056
546	NT_187101	CGC	2	6	32141	32146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250056
547	NT_187101	GC	3	6	32230	32235	0 %	0 %	50 %	50 %	409250056
548	NT_187101	CGG	2	6	32256	32261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250056
549	NT_187101	CCCG	2	8	32481	32488	0 %	0 %	25 %	75 %	409250056
550	NT_187101	CGA	2	6	32511	32516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250056
551	NT_187101	CTGTC	2	10	32759	32768	0 %	40 %	20 %	40 %	409250057
552	NT_187101	TGC	2	6	32784	32789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250057
553	NT_187101	TA	3	6	32801	32806	50 %	50 %	0 %	0 %	409250057
554	NT_187101	ATA	2	6	32813	32818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250057
555	NT_187101	GCG	2	6	32891	32896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250057
556	NT_187101	ATA	2	6	33068	33073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250057
557	NT_187101	ACC	3	9	33133	33141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250057
558	NT_187101	GGT	2	6	33187	33192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250057
559	NT_187101	G	6	6	33224	33229	0 %	0 %	100 %	0 %	409250057
560	NT_187101	GATTT	2	10	33506	33515	20 %	60 %	20 %	0 %	409250058
561	NT_187101	T	6	6	33513	33518	0 %	100 %	0 %	0 %	409250058
562	NT_187101	AAT	2	6	33526	33531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250058
563	NT_187101	TAG	2	6	33665	33670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250058
564	NT_187101	TCA	2	6	33693	33698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250058
565	NT_187101	TGT	2	6	33714	33719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250058
566	NT_187101	T	6	6	33769	33774	0 %	100 %	0 %	0 %	409250058
567	NT_187101	TGT	2	6	33798	33803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250058
568	NT_187101	TCA	2	6	33830	33835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250058
569	NT_187101	GT	3	6	33844	33849	0 %	50 %	50 %	0 %	409250058
570	NT_187101	ATC	2	6	33893	33898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250058
571	NT_187101	GCTGCC	2	12	33985	33996	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250058
572	NT_187101	CAC	2	6	34006	34011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250058
573	NT_187101	CTGCG	2	10	34038	34047	0 %	20 %	40 %	40 %	409250058
574	NT_187101	GGT	2	6	34075	34080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250058
575	NT_187101	CAG	2	6	34129	34134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250058
576	NT_187101	TGC	2	6	34137	34142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250058
577	NT_187101	ACA	2	6	34166	34171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250058
578	NT_187101	CCAG	2	8	34416	34423	25 %	0 %	25 %	50 %	409250059
579	NT_187101	TGA	2	6	34434	34439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250059
580	NT_187101	GC	3	6	34590	34595	0 %	0 %	50 %	50 %	409250059
581	NT_187101	TGC	2	6	34631	34636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250059
582	NT_187101	TTC	2	6	34654	34659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250059
583	NT_187101	GCC	2	6	34763	34768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250059
584	NT_187101	T	6	6	34838	34843	0 %	100 %	0 %	0 %	409250059
585	NT_187101	ACC	2	6	34934	34939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250059
586	NT_187101	GC	3	6	34980	34985	0 %	0 %	50 %	50 %	409250059
587	NT_187101	CTGC	2	8	35099	35106	0 %	25 %	25 %	50 %	409250059
588	NT_187101	CAA	2	6	35127	35132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250059
589	NT_187101	GACA	2	8	35164	35171	50 %	0 %	25 %	25 %	409250059
590	NT_187101	CG	3	6	35176	35181	0 %	0 %	50 %	50 %	409250059
591	NT_187101	TAG	2	6	35192	35197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250059
592	NT_187101	GCC	2	6	35218	35223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250059
593	NT_187101	ACG	3	9	35237	35245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250059
594	NT_187101	T	6	6	35325	35330	0 %	100 %	0 %	0 %	409250059
595	NT_187101	ATT	2	6	35350	35355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250060
596	NT_187101	T	7	7	35406	35412	0 %	100 %	0 %	0 %	409250060
597	NT_187101	CAGG	2	8	35413	35420	25 %	0 %	50 %	25 %	409250060
598	NT_187101	CCA	2	6	35437	35442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250060
599	NT_187101	TAA	2	6	35456	35461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250060
600	NT_187101	TGCG	2	8	35511	35518	0 %	25 %	50 %	25 %	409250060
601	NT_187101	ACC	2	6	35631	35636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250060
602	NT_187101	ACAG	2	8	35673	35680	50 %	0 %	25 %	25 %	409250060
603	NT_187101	AAT	2	6	35729	35734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250060
604	NT_187101	GCCA	2	8	35750	35757	25 %	0 %	25 %	50 %	409250060
605	NT_187101	T	6	6	35795	35800	0 %	100 %	0 %	0 %	409250060
606	NT_187101	CAG	2	6	35801	35806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250060
607	NT_187101	ATA	2	6	35850	35855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250060
608	NT_187101	GCA	2	6	35860	35865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250060
609	NT_187101	AG	3	6	35891	35896	50 %	0 %	50 %	0 %	409250060
610	NT_187101	A	6	6	35937	35942	100 %	0 %	0 %	0 %	409250060
611	NT_187101	TGA	2	6	35971	35976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250060
612	NT_187101	T	7	7	35992	35998	0 %	100 %	0 %	0 %	409250060
613	NT_187101	GAA	2	6	36005	36010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250060
614	NT_187101	GGA	2	6	36044	36049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250060
615	NT_187101	GCC	3	9	36068	36076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250060
616	NT_187101	CAG	2	6	36109	36114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250060
617	NT_187101	TGCTG	2	10	36115	36124	0 %	40 %	40 %	20 %	409250060
618	NT_187101	CAG	2	6	36239	36244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250060
619	NT_187101	AT	3	6	36255	36260	50 %	50 %	0 %	0 %	409250060
620	NT_187101	ATT	2	6	36321	36326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250060
621	NT_187101	CAT	2	6	36440	36445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250060
622	NT_187101	AAT	2	6	36467	36472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250060
623	NT_187101	CAC	2	6	36475	36480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250060
624	NT_187101	TAAT	2	8	36648	36655	50 %	50 %	0 %	0 %	409250060
625	NT_187101	ATA	3	9	36711	36719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250060
626	NT_187101	AGCC	2	8	36809	36816	25 %	0 %	25 %	50 %	409250061
627	NT_187101	AAT	2	6	36829	36834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250061
628	NT_187101	GAT	2	6	36863	36868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250061
629	NT_187101	AAG	2	6	36869	36874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250061
630	NT_187101	GAC	2	6	36900	36905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250061
631	NT_187101	TGC	2	6	36924	36929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250061
632	NT_187101	CAG	2	6	37038	37043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250061
633	NT_187101	GCC	2	6	37069	37074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250061
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641	NT_187101	TCCAGC	2	12	37241	37252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250061
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645	NT_187101	CGAT	2	8	38052	38059	25 %	25 %	25 %	25 %	409250062
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