MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NT_187100	GAC	2	6	85766	85771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250004
1502	NT_187100	AG	3	6	86084	86089	50 %	0 %	50 %	0 %	409250005
1503	NT_187100	CAT	2	6	86099	86104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250005
1504	NT_187100	AAG	2	6	86112	86117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250005
1505	NT_187100	AAG	2	6	86222	86227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250005
1506	NT_187100	CAAAT	2	10	86244	86253	60 %	20 %	0 %	20 %	409250005
1507	NT_187100	AGCA	2	8	86265	86272	50 %	0 %	25 %	25 %	409250005
1508	NT_187100	CTT	2	6	86348	86353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250005
1509	NT_187100	TAT	2	6	86363	86368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250005
1510	NT_187100	A	6	6	86371	86376	100 %	0 %	0 %	0 %	409250005
1511	NT_187100	GTG	2	6	86378	86383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250005
1512	NT_187100	ATA	2	6	86389	86394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250005
1513	NT_187100	TGA	2	6	86409	86414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250005
1514	NT_187100	ACA	2	6	86443	86448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250005
1515	NT_187100	AGA	2	6	86481	86486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250005
1516	NT_187100	GTA	2	6	86488	86493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250005
1517	NT_187100	CCAG	2	8	86504	86511	25 %	0 %	25 %	50 %	409250005
1518	NT_187100	GTT	2	6	86524	86529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250005
1519	NT_187100	ATT	2	6	86610	86615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250005
1520	NT_187100	A	6	6	86629	86634	100 %	0 %	0 %	0 %	409250005
1521	NT_187100	TAG	2	6	86661	86666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250005
1522	NT_187100	A	6	6	86685	86690	100 %	0 %	0 %	0 %	409250005
1523	NT_187100	GATC	2	8	86744	86751	25 %	25 %	25 %	25 %	409250005
1524	NT_187100	AAG	2	6	86808	86813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250005
1525	NT_187100	TAA	3	9	87531	87539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250006
1526	NT_187100	ATT	2	6	87557	87562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250006
1527	NT_187100	TCT	2	6	87603	87608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250006
1528	NT_187100	TC	3	6	87612	87617	0 %	50 %	0 %	50 %	409250006
1529	NT_187100	AT	4	8	87648	87655	50 %	50 %	0 %	0 %	409250006
1530	NT_187100	TTG	2	6	87668	87673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250006
1531	NT_187100	TTA	2	6	87724	87729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250006
1532	NT_187100	A	7	7	87779	87785	100 %	0 %	0 %	0 %	409250006
1533	NT_187100	TAT	2	6	87814	87819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250006
1534	NT_187100	GA	3	6	87834	87839	50 %	0 %	50 %	0 %	409250006
1535	NT_187100	ATGA	2	8	87875	87882	50 %	25 %	25 %	0 %	409250006
1536	NT_187100	T	6	6	87905	87910	0 %	100 %	0 %	0 %	409250006
1537	NT_187100	TTG	2	6	87922	87927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250006
1538	NT_187100	TGA	2	6	87933	87938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250006
1539	NT_187100	TCA	2	6	87999	88004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250006
1540	NT_187100	AGG	2	6	88019	88024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250006
1541	NT_187100	T	7	7	88087	88093	0 %	100 %	0 %	0 %	409250006
1542	NT_187100	AT	3	6	88209	88214	50 %	50 %	0 %	0 %	409250006
1543	NT_187100	A	7	7	88244	88250	100 %	0 %	0 %	0 %	409250006
1544	NT_187100	AAC	2	6	88283	88288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250006
1545	NT_187100	TTC	2	6	88310	88315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250006
1546	NT_187100	T	7	7	88320	88326	0 %	100 %	0 %	0 %	409250006
1547	NT_187100	TAT	2	6	88349	88354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250006
1548	NT_187100	TCA	3	9	88363	88371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250006
1549	NT_187100	TTG	2	6	88379	88384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250006
1550	NT_187100	A	6	6	88815	88820	100 %	0 %	0 %	0 %	409250007
1551	NT_187100	GAC	2	6	88842	88847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250007
1552	NT_187100	TGAGGA	2	12	88881	88892	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409250007
1553	NT_187100	AAT	2	6	88921	88926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250007
1554	NT_187100	CGA	2	6	88929	88934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250007
1555	NT_187100	TGG	2	6	88949	88954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250007
1556	NT_187100	GCC	2	6	88963	88968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250007
1557	NT_187100	CGG	2	6	88985	88990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250007
1558	NT_187100	CTG	2	6	89015	89020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250007
1559	NT_187100	A	7	7	89032	89038	100 %	0 %	0 %	0 %	409250007
1560	NT_187100	TGCC	2	8	89093	89100	0 %	25 %	25 %	50 %	409250007
1561	NT_187100	TTA	2	6	89107	89112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250007
1562	NT_187100	TCT	2	6	89122	89127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250007
1563	NT_187100	GCG	2	6	89135	89140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250007
1564	NT_187100	CCG	2	6	89144	89149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250007
1565	NT_187100	TAA	2	6	89166	89171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250007
1566	NT_187100	TGAA	2	8	89198	89205	50 %	25 %	25 %	0 %	409250007
1567	NT_187100	TGA	2	6	89220	89225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250007
1568	NT_187100	GGC	2	6	89263	89268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250007
1569	NT_187100	GCC	2	6	89293	89298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250007
1570	NT_187100	GCG	2	6	89302	89307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250007
1571	NT_187100	AAT	2	6	89386	89391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250007
1572	NT_187100	AT	3	6	89412	89417	50 %	50 %	0 %	0 %	409250007
1573	NT_187100	ACG	2	6	89470	89475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250007
1574	NT_187100	AT	3	6	89618	89623	50 %	50 %	0 %	0 %	409250008
1575	NT_187100	AGG	2	6	89734	89739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250008
1576	NT_187100	GGA	2	6	89747	89752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250008
1577	NT_187100	ATC	2	6	89797	89802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250008
1578	NT_187100	ATT	2	6	89838	89843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250008
1579	NT_187100	GTG	2	6	89848	89853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250008
1580	NT_187100	TCA	2	6	89886	89891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250008
1581	NT_187100	ACA	2	6	89922	89927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250008
1582	NT_187100	CAG	3	9	89969	89977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250008
1583	NT_187100	AGG	2	6	90022	90027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250008
1584	NT_187100	ATGG	2	8	90031	90038	25 %	25 %	50 %	0 %	409250008
1585	NT_187100	GGC	2	6	90093	90098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250008
1586	NT_187100	TAT	2	6	90144	90149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250008
1587	NT_187100	CAG	2	6	90175	90180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250008
1588	NT_187100	ATG	2	6	90193	90198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250008
1589	NT_187100	CGC	2	6	90341	90346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250008
1590	NT_187100	CTTG	2	8	90377	90384	0 %	50 %	25 %	25 %	409250008
1591	NT_187100	CGG	2	6	90416	90421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250008
1592	NT_187100	GCAG	2	8	90425	90432	25 %	0 %	50 %	25 %	409250008
1593	NT_187100	CTTCAG	2	12	90714	90725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409250008
1594	NT_187100	TCCT	2	8	90748	90755	0 %	50 %	0 %	50 %	409250008
1595	NT_187100	CGAC	2	8	90772	90779	25 %	0 %	25 %	50 %	409250008
1596	NT_187100	TGAC	2	8	90808	90815	25 %	25 %	25 %	25 %	409250008
1597	NT_187100	ATCA	2	8	91048	91055	50 %	25 %	0 %	25 %	409250008
1598	NT_187100	GGT	2	6	91086	91091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250008
1599	NT_187100	GAT	2	6	91143	91148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250008
1600	NT_187100	CGCT	2	8	91152	91159	0 %	25 %	25 %	50 %	409250008
1601	NT_187100	AAGC	2	8	91174	91181	50 %	0 %	25 %	25 %	409250008
1602	NT_187100	TAC	3	9	91216	91224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250008
1603	NT_187100	GAA	2	6	91290	91295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250008
1604	NT_187100	GTC	2	6	91320	91325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250008
1605	NT_187100	ATGAA	2	10	91408	91417	60 %	20 %	20 %	0 %	409250008
1606	NT_187100	CTT	2	6	91458	91463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250008
1607	NT_187100	AATA	2	8	91494	91501	75 %	25 %	0 %	0 %	409250008
1608	NT_187100	ATT	2	6	91515	91520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250008
1609	NT_187100	GCA	2	6	91551	91556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250008
1610	NT_187100	TTA	2	6	91614	91619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250009
1611	NT_187100	GGC	2	6	91636	91641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250009
1612	NT_187100	TCG	2	6	91667	91672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250009
1613	NT_187100	TCC	2	6	91705	91710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250009
1614	NT_187100	GACTT	2	10	91776	91785	20 %	40 %	20 %	20 %	409250009
1615	NT_187100	ATA	2	6	91863	91868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250009
1616	NT_187100	TAC	2	6	91891	91896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250009
1617	NT_187100	TAT	2	6	91907	91912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250009
1618	NT_187100	TAT	2	6	92157	92162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250009
1619	NT_187100	CCA	2	6	92178	92183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250009
1620	NT_187100	AAGA	2	8	92291	92298	75 %	0 %	25 %	0 %	409250009
1621	NT_187100	AACG	2	8	92348	92355	50 %	0 %	25 %	25 %	409250009
1622	NT_187100	T	6	6	92386	92391	0 %	100 %	0 %	0 %	409250009
1623	NT_187100	AAGA	2	8	92393	92400	75 %	0 %	25 %	0 %	409250009
1624	NT_187100	TTA	2	6	92707	92712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250010
1625	NT_187100	A	6	6	92736	92741	100 %	0 %	0 %	0 %	409250010
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1753	NT_187100	GCGG	2	8	100940	100947	0 %	0 %	75 %	25 %	409250020
1754	NT_187100	GTG	2	6	100971	100976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250020
1755	NT_187100	GGC	2	6	101015	101020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250020
1756	NT_187100	A	6	6	101021	101026	100 %	0 %	0 %	0 %	409250020
1757	NT_187100	GCC	2	6	101073	101078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250020
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1760	NT_187100	TTG	2	6	101113	101118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250020
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1771	NT_187100	GCTG	2	8	101766	101773	0 %	25 %	50 %	25 %	409250021
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1773	NT_187100	CGCTG	2	10	101825	101834	0 %	20 %	40 %	40 %	409250021
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1855	NT_187100	ATCTT	2	10	106267	106276	20 %	60 %	0 %	20 %	409250026
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1859	NT_187100	CCT	2	6	106567	106572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250026

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.