MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187100	CCTGCG	2	12	55929	55940	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409249973
1002	NT_187100	TTA	2	6	55997	56002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249973
1003	NT_187100	CAA	2	6	56047	56052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249973
1004	NT_187100	CAG	2	6	56059	56064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249973
1005	NT_187100	T	6	6	56127	56132	0 %	100 %	0 %	0 %	409249973
1006	NT_187100	GA	3	6	56156	56161	50 %	0 %	50 %	0 %	409249973
1007	NT_187100	TCA	2	6	56177	56182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249973
1008	NT_187100	TCA	2	6	56238	56243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249973
1009	NT_187100	AAT	2	6	56524	56529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249974
1010	NT_187100	GTACC	2	10	56610	56619	20 %	20 %	20 %	40 %	409249974
1011	NT_187100	ACC	2	6	56716	56721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249974
1012	NT_187100	AAT	2	6	56734	56739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249974
1013	NT_187100	TGA	2	6	56895	56900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249974
1014	NT_187100	CAG	2	6	56908	56913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249974
1015	NT_187100	CAAGAC	2	12	56973	56984	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409249974
1016	NT_187100	CGA	2	6	57032	57037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249974
1017	NT_187100	CAG	2	6	57148	57153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249974
1018	NT_187100	CG	4	8	57234	57241	0 %	0 %	50 %	50 %	409249974
1019	NT_187100	GCG	2	6	57254	57259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249974
1020	NT_187100	ATC	2	6	57260	57265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249974
1021	NT_187100	ATG	3	9	57379	57387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249974
1022	NT_187100	CACT	2	8	57392	57399	25 %	25 %	0 %	50 %	409249974
1023	NT_187100	CTG	2	6	57433	57438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249974
1024	NT_187100	CCAG	2	8	57480	57487	25 %	0 %	25 %	50 %	409249974
1025	NT_187100	TTCGA	2	10	57518	57527	20 %	40 %	20 %	20 %	409249974
1026	NT_187100	A	6	6	57538	57543	100 %	0 %	0 %	0 %	409249974
1027	NT_187100	ATC	2	6	57550	57555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249974
1028	NT_187100	GC	3	6	57617	57622	0 %	0 %	50 %	50 %	409249974
1029	NT_187100	GCA	2	6	57654	57659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249974
1030	NT_187100	CTT	2	6	57921	57926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249974
1031	NT_187100	CCA	2	6	57955	57960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249974
1032	NT_187100	TCG	2	6	57974	57979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249974
1033	NT_187100	AACG	2	8	58013	58020	50 %	0 %	25 %	25 %	409249974
1034	NT_187100	GGC	2	6	58038	58043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249974
1035	NT_187100	CTT	2	6	58068	58073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249974
1036	NT_187100	CGC	2	6	58089	58094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249974
1037	NT_187100	GCGCG	2	10	58095	58104	0 %	0 %	60 %	40 %	409249974
1038	NT_187100	GAT	2	6	58131	58136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249974
1039	NT_187100	TTC	2	6	58210	58215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249974
1040	NT_187100	CGA	2	6	58257	58262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249974
1041	NT_187100	T	6	6	58282	58287	0 %	100 %	0 %	0 %	409249974
1042	NT_187100	GCG	2	6	58293	58298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249974
1043	NT_187100	T	6	6	58314	58319	0 %	100 %	0 %	0 %	409249974
1044	NT_187100	GC	3	6	58376	58381	0 %	0 %	50 %	50 %	409249974
1045	NT_187100	AGC	2	6	58418	58423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249974
1046	NT_187100	CGC	2	6	58579	58584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249975
1047	NT_187100	A	6	6	58641	58646	100 %	0 %	0 %	0 %	409249975
1048	NT_187100	GCG	2	6	58650	58655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249975
1049	NT_187100	TCG	2	6	58731	58736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249975
1050	NT_187100	GCG	2	6	58763	58768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249975
1051	NT_187100	GGTTG	2	10	58779	58788	0 %	40 %	60 %	0 %	409249975
1052	NT_187100	GGC	2	6	58805	58810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249975
1053	NT_187100	GAG	2	6	58832	58837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249975
1054	NT_187100	AAG	2	6	58855	58860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249975
1055	NT_187100	GT	3	6	58872	58877	0 %	50 %	50 %	0 %	409249975
1056	NT_187100	CAT	2	6	58943	58948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249975
1057	NT_187100	GCC	2	6	58972	58977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249975
1058	NT_187100	GGA	2	6	58995	59000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249975
1059	NT_187100	GGC	2	6	59015	59020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249975
1060	NT_187100	GCC	2	6	59023	59028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249975
1061	NT_187100	CG	3	6	59052	59057	0 %	0 %	50 %	50 %	409249975
1062	NT_187100	CACG	2	8	59095	59102	25 %	0 %	25 %	50 %	409249975
1063	NT_187100	CGC	2	6	59129	59134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249975
1064	NT_187100	TGAT	2	8	59169	59176	25 %	50 %	25 %	0 %	409249975
1065	NT_187100	CT	4	8	59301	59308	0 %	50 %	0 %	50 %	409249975
1066	NT_187100	GCG	2	6	59329	59334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249975
1067	NT_187100	CG	3	6	59340	59345	0 %	0 %	50 %	50 %	409249975
1068	NT_187100	GGC	2	6	59353	59358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249975
1069	NT_187100	GCG	2	6	59385	59390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249975
1070	NT_187100	A	6	6	59544	59549	100 %	0 %	0 %	0 %	409249975
1071	NT_187100	GAC	2	6	59598	59603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249975
1072	NT_187100	CAGTTC	2	12	59868	59879	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409249976
1073	NT_187100	CCG	2	6	59902	59907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249976
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1075	NT_187100	GA	3	6	59941	59946	50 %	0 %	50 %	0 %	409249976
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1077	NT_187100	CGA	2	6	59998	60003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249976
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1079	NT_187100	AG	3	6	60154	60159	50 %	0 %	50 %	0 %	409249976
1080	NT_187100	GC	3	6	60196	60201	0 %	0 %	50 %	50 %	409249976
1081	NT_187100	CAA	2	6	60275	60280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249976
1082	NT_187100	GCA	2	6	60493	60498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249976
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1085	NT_187100	ATC	2	6	61319	61324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249977
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1087	NT_187100	A	6	6	61331	61336	100 %	0 %	0 %	0 %	409249977
1088	NT_187100	T	6	6	61344	61349	0 %	100 %	0 %	0 %	409249977
1089	NT_187100	T	6	6	61372	61377	0 %	100 %	0 %	0 %	409249977
1090	NT_187100	AT	3	6	61383	61388	50 %	50 %	0 %	0 %	409249977
1091	NT_187100	AT	3	6	61424	61429	50 %	50 %	0 %	0 %	409249977
1092	NT_187100	A	7	7	61443	61449	100 %	0 %	0 %	0 %	409249977
1093	NT_187100	CTT	2	6	61529	61534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249977
1094	NT_187100	AT	3	6	61537	61542	50 %	50 %	0 %	0 %	409249977
1095	NT_187100	TAC	3	9	61620	61628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249977
1096	NT_187100	T	6	6	61687	61692	0 %	100 %	0 %	0 %	409249977
1097	NT_187100	GTA	2	6	61776	61781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249977
1098	NT_187100	CGCC	2	8	61830	61837	0 %	0 %	25 %	75 %	409249977
1099	NT_187100	TGA	2	6	61849	61854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249977
1100	NT_187100	TTA	2	6	61908	61913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249977
1101	NT_187100	A	7	7	61956	61962	100 %	0 %	0 %	0 %	409249977
1102	NT_187100	ATG	2	6	62004	62009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249977
1103	NT_187100	TGT	2	6	62014	62019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249977
1104	NT_187100	AGTA	2	8	62099	62106	50 %	25 %	25 %	0 %	409249977
1105	NT_187100	GAC	2	6	62123	62128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249977
1106	NT_187100	CAT	2	6	62149	62154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249977
1107	NT_187100	AT	3	6	62194	62199	50 %	50 %	0 %	0 %	409249977
1108	NT_187100	TGAAGA	2	12	62221	62232	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409249977
1109	NT_187100	GGA	2	6	62248	62253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249977
1110	NT_187100	CTT	2	6	62255	62260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249977
1111	NT_187100	G	6	6	62268	62273	0 %	0 %	100 %	0 %	409249977
1112	NT_187100	AAG	2	6	62316	62321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249977
1113	NT_187100	TTCTT	2	10	62325	62334	0 %	80 %	0 %	20 %	409249977
1114	NT_187100	CAA	2	6	62397	62402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249977
1115	NT_187100	GAA	2	6	62462	62467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249977
1116	NT_187100	GAA	2	6	62531	62536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249977
1117	NT_187100	GAAT	2	8	62611	62618	50 %	25 %	25 %	0 %	409249977
1118	NT_187100	A	7	7	62620	62626	100 %	0 %	0 %	0 %	409249977
1119	NT_187100	T	7	7	63104	63110	0 %	100 %	0 %	0 %	409249978
1120	NT_187100	TCG	2	6	63177	63182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249978
1121	NT_187100	ATCG	2	8	63324	63331	25 %	25 %	25 %	25 %	409249978
1122	NT_187100	TAC	2	6	63376	63381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249978
1123	NT_187100	GCG	2	6	63550	63555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249978
1124	NT_187100	T	6	6	63573	63578	0 %	100 %	0 %	0 %	409249978
1125	NT_187100	A	6	6	63592	63597	100 %	0 %	0 %	0 %	409249978
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1127	NT_187100	ATT	2	6	63631	63636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249978
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1239	NT_187100	ATG	2	6	70192	70197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249984
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1250	NT_187100	GC	3	6	70709	70714	0 %	0 %	50 %	50 %	409249985
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