MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187100	GAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249947
502	NT_187100	GAT	2	6	27929	27934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249947
503	NT_187100	AGGT	2	8	27988	27995	25 %	25 %	50 %	0 %	409249947
504	NT_187100	AGA	2	6	28027	28032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249947
505	NT_187100	CGC	2	6	28086	28091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249947
506	NT_187100	TTC	2	6	28110	28115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249947
507	NT_187100	GCG	2	6	28294	28299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249947
508	NT_187100	GT	3	6	28397	28402	0 %	50 %	50 %	0 %	409249947
509	NT_187100	AAAT	2	8	28491	28498	75 %	25 %	0 %	0 %	409249947
510	NT_187100	AG	3	6	28577	28582	50 %	0 %	50 %	0 %	409249948
511	NT_187100	ACC	2	6	28587	28592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249948
512	NT_187100	GTT	2	6	28597	28602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249948
513	NT_187100	GCT	2	6	28612	28617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249948
514	NT_187100	CAT	2	6	28622	28627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249948
515	NT_187100	GGA	2	6	28652	28657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249948
516	NT_187100	GGC	2	6	28684	28689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249948
517	NT_187100	TCA	2	6	28716	28721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249948
518	NT_187100	CG	3	6	28742	28747	0 %	0 %	50 %	50 %	409249948
519	NT_187100	CGG	2	6	28801	28806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249948
520	NT_187100	CAT	2	6	28847	28852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249948
521	NT_187100	GCG	2	6	28897	28902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249948
522	NT_187100	TAA	2	6	28972	28977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249948
523	NT_187100	GCC	3	9	29006	29014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249948
524	NT_187100	TGG	2	6	29110	29115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249948
525	NT_187100	GCC	2	6	29133	29138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249948
526	NT_187100	TAGCG	2	10	29210	29219	20 %	20 %	40 %	20 %	409249948
527	NT_187100	CAG	2	6	29330	29335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249948
528	NT_187100	CAG	2	6	29417	29422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249948
529	NT_187100	TG	3	6	29449	29454	0 %	50 %	50 %	0 %	409249948
530	NT_187100	CGC	2	6	29455	29460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249948
531	NT_187100	CGG	2	6	29506	29511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249948
532	NT_187100	T	6	6	29556	29561	0 %	100 %	0 %	0 %	409249948
533	NT_187100	GC	3	6	29602	29607	0 %	0 %	50 %	50 %	409249948
534	NT_187100	GCC	2	6	29666	29671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249948
535	NT_187100	GC	3	6	29724	29729	0 %	0 %	50 %	50 %	409249949
536	NT_187100	AGA	2	6	29751	29756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249949
537	NT_187100	GCC	2	6	29826	29831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249949
538	NT_187100	GCC	2	6	29847	29852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249949
539	NT_187100	GCCC	2	8	29854	29861	0 %	0 %	25 %	75 %	409249949
540	NT_187100	GCC	2	6	29924	29929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249949
541	NT_187100	CGG	2	6	30103	30108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249949
542	NT_187100	CG	4	8	30206	30213	0 %	0 %	50 %	50 %	409249949
543	NT_187100	AT	3	6	30242	30247	50 %	50 %	0 %	0 %	409249949
544	NT_187100	AGC	2	6	30315	30320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249949
545	NT_187100	GACG	2	8	30325	30332	25 %	0 %	50 %	25 %	409249949
546	NT_187100	GCG	2	6	30333	30338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249949
547	NT_187100	A	6	6	30375	30380	100 %	0 %	0 %	0 %	409249949
548	NT_187100	TGA	2	6	30439	30444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249949
549	NT_187100	AATC	2	8	30493	30500	50 %	25 %	0 %	25 %	409249949
550	NT_187100	TTG	2	6	30522	30527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249949
551	NT_187100	TACC	2	8	30529	30536	25 %	25 %	0 %	50 %	409249949
552	NT_187100	CG	3	6	30557	30562	0 %	0 %	50 %	50 %	409249949
553	NT_187100	TTC	2	6	30569	30574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249949
554	NT_187100	CGG	2	6	30622	30627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249949
555	NT_187100	ATA	2	6	30723	30728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249949
556	NT_187100	GCG	2	6	30751	30756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249949
557	NT_187100	TCG	2	6	30807	30812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249949
558	NT_187100	TCG	2	6	30876	30881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249949
559	NT_187100	CG	3	6	30936	30941	0 %	0 %	50 %	50 %	409249949
560	NT_187100	CAT	2	6	30952	30957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249949
561	NT_187100	GCTGTT	2	12	31006	31017	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409249949
562	NT_187100	CGA	2	6	31048	31053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249949
563	NT_187100	ATT	2	6	31074	31079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249949
564	NT_187100	GCC	2	6	31089	31094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249950
565	NT_187100	GGC	2	6	31205	31210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249950
566	NT_187100	CGG	2	6	31213	31218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249950
567	NT_187100	TAA	2	6	31247	31252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249950
568	NT_187100	TTC	2	6	31274	31279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249950
569	NT_187100	GCC	2	6	31286	31291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249950
570	NT_187100	TCC	2	6	31329	31334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249950
571	NT_187100	TCG	2	6	31384	31389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249950
572	NT_187100	GCC	2	6	31415	31420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249950
573	NT_187100	ACC	2	6	31428	31433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249950
574	NT_187100	CG	3	6	31436	31441	0 %	0 %	50 %	50 %	409249950
575	NT_187100	GCA	2	6	31477	31482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249950
576	NT_187100	CAAT	2	8	31504	31511	50 %	25 %	0 %	25 %	409249950
577	NT_187100	GCG	2	6	31516	31521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249950
578	NT_187100	CGC	2	6	31703	31708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249950
579	NT_187100	CAG	2	6	31709	31714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249950
580	NT_187100	CGC	2	6	31831	31836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249950
581	NT_187100	GGC	2	6	31883	31888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249950
582	NT_187100	GGC	2	6	31907	31912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249950
583	NT_187100	CGC	2	6	31936	31941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249950
584	NT_187100	GCG	3	9	31962	31970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249950
585	NT_187100	CGC	2	6	31990	31995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249950
586	NT_187100	GAC	2	6	31997	32002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249950
587	NT_187100	AAC	2	6	32010	32015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249950
588	NT_187100	CT	3	6	32022	32027	0 %	50 %	0 %	50 %	409249950
589	NT_187100	TGC	2	6	32100	32105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249950
590	NT_187100	CAG	2	6	32126	32131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249950
591	NT_187100	CG	3	6	32133	32138	0 %	0 %	50 %	50 %	409249950
592	NT_187100	GTC	2	6	32145	32150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249950
593	NT_187100	CAT	2	6	32194	32199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249950
594	NT_187100	CG	3	6	32283	32288	0 %	0 %	50 %	50 %	409249950
595	NT_187100	CCG	2	6	32388	32393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249950
596	NT_187100	GAT	2	6	32432	32437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249950
597	NT_187100	CAG	2	6	32462	32467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249950
598	NT_187100	GCCT	2	8	32480	32487	0 %	25 %	25 %	50 %	409249950
599	NT_187100	CGAT	2	8	32547	32554	25 %	25 %	25 %	25 %	409249950
600	NT_187100	CAC	2	6	32588	32593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249950
601	NT_187100	AGC	2	6	32655	32660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249950
602	NT_187100	ATG	2	6	32692	32697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249951
603	NT_187100	GC	4	8	32723	32730	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
604	NT_187100	TTA	2	6	32732	32737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249951
605	NT_187100	CCA	2	6	32817	32822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249951
606	NT_187100	GCGGA	2	10	32825	32834	20 %	0 %	60 %	20 %	409249951
607	NT_187100	ACCG	2	8	32875	32882	25 %	0 %	25 %	50 %	409249951
608	NT_187100	CGC	2	6	32883	32888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249951
609	NT_187100	GC	3	6	32949	32954	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
610	NT_187100	CAC	2	6	33025	33030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249951
611	NT_187100	GC	3	6	33112	33117	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
612	NT_187100	GC	3	6	33127	33132	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
613	NT_187100	CGGCG	2	10	33228	33237	0 %	0 %	60 %	40 %	409249951
614	NT_187100	GAC	2	6	33279	33284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249951
615	NT_187100	GGC	2	6	33286	33291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249951
616	NT_187100	GTA	2	6	33391	33396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249951
617	NT_187100	GGGCA	2	10	33413	33422	20 %	0 %	60 %	20 %	409249951
618	NT_187100	GCG	2	6	33430	33435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249951
619	NT_187100	CAC	2	6	33442	33447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249951
620	NT_187100	CG	3	6	33463	33468	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
621	NT_187100	ACC	2	6	33491	33496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249951
622	NT_187100	CGG	2	6	33562	33567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249951
623	NT_187100	GGCG	2	8	33603	33610	0 %	0 %	75 %	25 %	409249951
624	NT_187100	T	7	7	33669	33675	0 %	100 %	0 %	0 %	409249951
625	NT_187100	TGA	2	6	33677	33682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249951
626	NT_187100	TAAA	2	8	33706	33713	75 %	25 %	0 %	0 %	409249951
627	NT_187100	AGT	2	6	33717	33722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249951
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629	NT_187100	CAC	2	6	33835	33840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249951
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999	NT_187100	ATAA	2	8	55772	55779	75 %	25 %	0 %	0 %	409249973
1000	NT_187100	AG	3	6	55921	55926	50 %	0 %	50 %	0 %	409249973

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