MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	GGAGT	2	10	564	573	20 %	20 %	60 %	0 %	409249476
2	NT_187088	TATCT	2	10	634	643	20 %	60 %	0 %	20 %	409249476
3	NT_187088	CACAA	2	10	801	810	60 %	0 %	0 %	40 %	409249476
4	NT_187088	CCCGC	2	10	2419	2428	0 %	0 %	20 %	80 %	409249479
5	NT_187088	CGCTA	2	10	5291	5300	20 %	20 %	20 %	40 %	409249482
6	NT_187088	CATCG	2	10	9738	9747	20 %	20 %	20 %	40 %	409249486
7	NT_187088	ACGTT	2	10	10170	10179	20 %	40 %	20 %	20 %	409249487
8	NT_187088	GCGAT	2	10	12798	12807	20 %	20 %	40 %	20 %	409249489
9	NT_187088	GATCT	2	10	13391	13400	20 %	40 %	20 %	20 %	409249489
10	NT_187088	GGCGT	2	10	17073	17082	0 %	20 %	60 %	20 %	409249494
11	NT_187088	ACCAT	2	10	20750	20759	40 %	20 %	0 %	40 %	409249498
12	NT_187088	TCCGC	2	10	25141	25150	0 %	20 %	20 %	60 %	409249503
13	NT_187088	TTAAT	2	10	25512	25521	40 %	60 %	0 %	0 %	409249503
14	NT_187088	GCCGT	2	10	26408	26417	0 %	20 %	40 %	40 %	409249503
15	NT_187088	GCTCC	2	10	27421	27430	0 %	20 %	20 %	60 %	409249505
16	NT_187088	TCTGC	2	10	33217	33226	0 %	40 %	20 %	40 %	409249512
17	NT_187088	CAAAC	2	10	33538	33547	60 %	0 %	0 %	40 %	409249512
18	NT_187088	GCGAG	2	10	33739	33748	20 %	0 %	60 %	20 %	409249512
19	NT_187088	ACGCG	2	10	35564	35573	20 %	0 %	40 %	40 %	409249512
20	NT_187088	GTCAC	2	10	38553	38562	20 %	20 %	20 %	40 %	409249515
21	NT_187088	GCCGA	2	10	41134	41143	20 %	0 %	40 %	40 %	409249517
22	NT_187088	AAACG	2	10	43972	43981	60 %	0 %	20 %	20 %	409249519
23	NT_187088	CAAAA	2	10	44439	44448	80 %	0 %	0 %	20 %	409249519
24	NT_187088	TGGTT	2	10	44512	44521	0 %	60 %	40 %	0 %	409249519
25	NT_187088	TTTTG	2	10	45016	45025	0 %	80 %	20 %	0 %	409249520
26	NT_187088	AAATT	2	10	45261	45270	60 %	40 %	0 %	0 %	409249520
27	NT_187088	GTTCT	2	10	46424	46433	0 %	60 %	20 %	20 %	409249521
28	NT_187088	ATTCA	2	10	46822	46831	40 %	40 %	0 %	20 %	409249521
29	NT_187088	GCGCT	2	10	46869	46878	0 %	20 %	40 %	40 %	409249521
30	NT_187088	TATAT	2	10	50215	50224	40 %	60 %	0 %	0 %	409249525
31	NT_187088	TCCAG	2	10	50715	50724	20 %	20 %	20 %	40 %	409249525
32	NT_187088	CGCAG	2	10	52128	52137	20 %	0 %	40 %	40 %	409249527
33	NT_187088	CCAGA	2	10	53161	53170	40 %	0 %	20 %	40 %	409249528
34	NT_187088	CATGG	2	10	58094	58103	20 %	20 %	40 %	20 %	409249530
35	NT_187088	AACGA	2	10	61813	61822	60 %	0 %	20 %	20 %	409249533
36	NT_187088	GGCAT	2	10	61911	61920	20 %	20 %	40 %	20 %	409249533
37	NT_187088	TCCGC	2	10	62938	62947	0 %	20 %	20 %	60 %	409249534
38	NT_187088	TGTCC	2	10	63477	63486	0 %	40 %	20 %	40 %	409249535
39	NT_187088	TGGTC	2	10	63517	63526	0 %	40 %	40 %	20 %	409249535
40	NT_187088	CGCGG	2	10	64195	64204	0 %	0 %	60 %	40 %	409249536
41	NT_187088	CGGAT	2	10	64630	64639	20 %	20 %	40 %	20 %	409249536
42	NT_187088	CCGGG	2	10	64654	64663	0 %	0 %	60 %	40 %	409249536
43	NT_187088	CCAGC	2	10	65314	65323	20 %	0 %	20 %	60 %	409249537
44	NT_187088	CCAGG	2	10	65977	65986	20 %	0 %	40 %	40 %	409249537
45	NT_187088	TGGCG	2	10	66608	66617	0 %	20 %	60 %	20 %	409249538
46	NT_187088	CGCGG	2	10	69316	69325	0 %	0 %	60 %	40 %	409249540
47	NT_187088	GATTT	2	10	70542	70551	20 %	60 %	20 %	0 %	409249541
48	NT_187088	TCATC	2	10	70564	70573	20 %	40 %	0 %	40 %	409249541
49	NT_187088	TGAAT	2	10	70646	70655	40 %	40 %	20 %	0 %	409249541

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.