MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	GGAGT	2	10	564	573	20 %	20 %	60 %	0 %	409249476
2	NT_187088	TATCT	2	10	634	643	20 %	60 %	0 %	20 %	409249476
3	NT_187088	CACAA	2	10	801	810	60 %	0 %	0 %	40 %	409249476
4	NT_187088	TAGA	2	8	834	841	50 %	25 %	25 %	0 %	409249476
5	NT_187088	A	6	6	935	940	100 %	0 %	0 %	0 %	409249476
6	NT_187088	TGT	2	6	968	973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249476
7	NT_187088	TCA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249476
8	NT_187088	ACAT	2	8	1006	1013	50 %	25 %	0 %	25 %	409249476
9	NT_187088	TC	3	6	1021	1026	0 %	50 %	0 %	50 %	409249476
10	NT_187088	AAT	2	6	1072	1077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249476
11	NT_187088	TGC	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249476
12	NT_187088	GACA	2	8	1115	1122	50 %	0 %	25 %	25 %	409249476
13	NT_187088	TCC	2	6	1142	1147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249476
14	NT_187088	TTA	2	6	1157	1162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249476
15	NT_187088	GAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249476
16	NT_187088	TTTA	2	8	1180	1187	25 %	75 %	0 %	0 %	409249476
17	NT_187088	ATA	2	6	1191	1196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249476
18	NT_187088	ATG	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249476
19	NT_187088	CTT	3	9	1244	1252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249476
20	NT_187088	CCA	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249476
21	NT_187088	A	7	7	1267	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	409249476
22	NT_187088	GTG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249476
23	NT_187088	CTT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249476
24	NT_187088	AT	3	6	1362	1367	50 %	50 %	0 %	0 %	409249476
25	NT_187088	GTTA	2	8	1381	1388	25 %	50 %	25 %	0 %	409249476
26	NT_187088	TCA	3	9	1646	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249477
27	NT_187088	TTG	2	6	1673	1678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249477
28	NT_187088	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	409249477
29	NT_187088	TAA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249477
30	NT_187088	T	6	6	1719	1724	0 %	100 %	0 %	0 %	409249477
31	NT_187088	GCA	2	6	1725	1730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249477
32	NT_187088	AAT	2	6	1983	1988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249478
33	NT_187088	CTT	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249478
34	NT_187088	A	6	6	2106	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	409249478
35	NT_187088	TGC	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249478
36	NT_187088	GTC	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249478
37	NT_187088	CAT	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249478
38	NT_187088	TCT	2	6	2229	2234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249478
39	NT_187088	GAA	2	6	2317	2322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249479
40	NT_187088	ACTG	2	8	2332	2339	25 %	25 %	25 %	25 %	409249479
41	NT_187088	CCCGC	2	10	2419	2428	0 %	0 %	20 %	80 %	409249479
42	NT_187088	TC	3	6	2555	2560	0 %	50 %	0 %	50 %	409249479
43	NT_187088	CAT	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249479
44	NT_187088	CGC	2	6	2678	2683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249479
45	NT_187088	ATG	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249479
46	NT_187088	GC	3	6	2727	2732	0 %	0 %	50 %	50 %	409249479
47	NT_187088	GAC	2	6	2742	2747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249479
48	NT_187088	GCCA	2	8	2770	2777	25 %	0 %	25 %	50 %	409249479
49	NT_187088	TAA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249479
50	NT_187088	TATC	2	8	2854	2861	25 %	50 %	0 %	25 %	409249479
51	NT_187088	GCG	2	6	2920	2925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249479
52	NT_187088	GC	3	6	3019	3024	0 %	0 %	50 %	50 %	409249479
53	NT_187088	CTT	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249479
54	NT_187088	A	6	6	3257	3262	100 %	0 %	0 %	0 %	409249479
55	NT_187088	ATT	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249479
56	NT_187088	TGA	2	6	3322	3327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249479
57	NT_187088	T	6	6	3460	3465	0 %	100 %	0 %	0 %	409249479
58	NT_187088	TTA	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249479
59	NT_187088	GCT	2	6	3491	3496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249479
60	NT_187088	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249479
61	NT_187088	CTG	3	9	3561	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249479
62	NT_187088	GTGC	2	8	3571	3578	0 %	25 %	50 %	25 %	409249479
63	NT_187088	TTC	2	6	3601	3606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249479
64	NT_187088	CTT	3	9	3623	3631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249479
65	NT_187088	TTG	2	6	3635	3640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249479
66	NT_187088	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249479
67	NT_187088	TCT	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249479
68	NT_187088	AAT	2	6	3837	3842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249479
69	NT_187088	GA	3	6	3889	3894	50 %	0 %	50 %	0 %	409249479
70	NT_187088	T	6	6	3917	3922	0 %	100 %	0 %	0 %	409249479
71	NT_187088	CCT	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249479
72	NT_187088	GAA	2	6	4354	4359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249480
73	NT_187088	GAG	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249481
74	NT_187088	AAC	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249481
75	NT_187088	TA	3	6	4540	4545	50 %	50 %	0 %	0 %	409249481
76	NT_187088	CCT	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249481
77	NT_187088	TC	3	6	4570	4575	0 %	50 %	0 %	50 %	409249481
78	NT_187088	CT	3	6	4609	4614	0 %	50 %	0 %	50 %	409249481
79	NT_187088	ATA	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249481
80	NT_187088	ATT	2	6	4629	4634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249481
81	NT_187088	TAA	2	6	4765	4770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249482
82	NT_187088	TAT	2	6	4771	4776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249482
83	NT_187088	CTT	2	6	4849	4854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249482
84	NT_187088	CTG	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249482
85	NT_187088	GTAG	2	8	5009	5016	25 %	25 %	50 %	0 %	409249482
86	NT_187088	ATC	2	6	5045	5050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249482
87	NT_187088	ATA	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249482
88	NT_187088	T	6	6	5280	5285	0 %	100 %	0 %	0 %	409249482
89	NT_187088	CGCTA	2	10	5291	5300	20 %	20 %	20 %	40 %	409249482
90	NT_187088	A	7	7	5319	5325	100 %	0 %	0 %	0 %	409249482
91	NT_187088	TGT	2	6	5379	5384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249482
92	NT_187088	CG	3	6	5395	5400	0 %	0 %	50 %	50 %	409249482
93	NT_187088	GGT	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249482
94	NT_187088	TGA	2	6	5445	5450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249482
95	NT_187088	CGC	2	6	5461	5466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249482
96	NT_187088	GCCA	2	8	5610	5617	25 %	0 %	25 %	50 %	409249482
97	NT_187088	TGA	2	6	5619	5624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249482
98	NT_187088	AAT	2	6	5705	5710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249482
99	NT_187088	CAGC	2	8	5815	5822	25 %	0 %	25 %	50 %	409249482
100	NT_187088	CGCC	2	8	5866	5873	0 %	0 %	25 %	75 %	409249482
101	NT_187088	TTG	2	6	5996	6001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249482
102	NT_187088	GC	3	6	6062	6067	0 %	0 %	50 %	50 %	409249482
103	NT_187088	GTA	2	6	6114	6119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249482
104	NT_187088	TACCCA	2	12	6133	6144	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409249482
105	NT_187088	CAG	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249483
106	NT_187088	CGG	2	6	6533	6538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249483
107	NT_187088	ATC	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249483
108	NT_187088	TCA	2	6	6616	6621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249483
109	NT_187088	CAG	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249483
110	NT_187088	TAA	2	6	6666	6671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249483
111	NT_187088	T	7	7	6792	6798	0 %	100 %	0 %	0 %	409249483
112	NT_187088	CG	3	6	6819	6824	0 %	0 %	50 %	50 %	409249483
113	NT_187088	TTG	2	6	6894	6899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249483
114	NT_187088	TTC	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249483
115	NT_187088	TCG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249483
116	NT_187088	TCG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249483
117	NT_187088	CGC	2	6	7125	7130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249483
118	NT_187088	TGA	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249483
119	NT_187088	TCA	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249483
120	NT_187088	GCG	2	6	7236	7241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249483
121	NT_187088	GCC	2	6	7259	7264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249483
122	NT_187088	CGC	2	6	7307	7312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249483
123	NT_187088	CCA	2	6	7496	7501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249483
124	NT_187088	TGC	2	6	7555	7560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249483
125	NT_187088	GCC	2	6	7567	7572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249483
126	NT_187088	TTA	2	6	7577	7582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249483
127	NT_187088	ATC	2	6	7590	7595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249483
128	NT_187088	CTT	2	6	7771	7776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249484
129	NT_187088	GC	3	6	7799	7804	0 %	0 %	50 %	50 %	409249484
130	NT_187088	CGA	2	6	7808	7813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249484
131	NT_187088	CAG	2	6	8065	8070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249484
132	NT_187088	CG	3	6	8148	8153	0 %	0 %	50 %	50 %	409249484
133	NT_187088	CG	3	6	8194	8199	0 %	0 %	50 %	50 %	409249484
134	NT_187088	CCAT	2	8	8209	8216	25 %	25 %	0 %	50 %	409249484
135	NT_187088	GCA	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249484
136	NT_187088	AAT	2	6	8242	8247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249484
137	NT_187088	AAT	2	6	8253	8258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249484
138	NT_187088	GCCT	2	8	8317	8324	0 %	25 %	25 %	50 %	409249484
139	NT_187088	TCAA	2	8	8369	8376	50 %	25 %	0 %	25 %	409249484
140	NT_187088	CAA	2	6	8432	8437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249484
141	NT_187088	TTG	2	6	8561	8566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249485
142	NT_187088	CAA	2	6	8595	8600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249485
143	NT_187088	GGT	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249485
144	NT_187088	A	6	6	8812	8817	100 %	0 %	0 %	0 %	409249485
145	NT_187088	TTA	2	6	8893	8898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249485
146	NT_187088	AAAT	2	8	9316	9323	75 %	25 %	0 %	0 %	409249486
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148	NT_187088	CCA	2	6	9365	9370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249486
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152	NT_187088	ATAC	2	8	9619	9626	50 %	25 %	0 %	25 %	409249486
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159	NT_187088	TTGA	2	8	9818	9825	25 %	50 %	25 %	0 %	409249487
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166	NT_187088	AAT	2	6	10181	10186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249487
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169	NT_187088	CAG	2	6	10400	10405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249487
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171	NT_187088	GCC	2	6	10472	10477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249487
172	NT_187088	CGA	2	6	10491	10496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249487
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220	NT_187088	GTG	2	6	14173	14178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249490
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242	NT_187088	A	6	6	15116	15121	100 %	0 %	0 %	0 %	409249492
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244	NT_187088	CTGG	2	8	15218	15225	0 %	25 %	50 %	25 %	409249492
245	NT_187088	CTATGA	2	12	15314	15325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409249492
246	NT_187088	CGA	2	6	15356	15361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249492
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250	NT_187088	ACG	2	6	15814	15819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249492
251	NT_187088	TCA	2	6	15832	15837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249492
252	NT_187088	CTGC	2	8	15888	15895	0 %	25 %	25 %	50 %	409249492
253	NT_187088	GCC	2	6	15996	16001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249493
254	NT_187088	CGG	2	6	16019	16024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249493
255	NT_187088	CTGG	2	8	16043	16050	0 %	25 %	50 %	25 %	409249493
256	NT_187088	ACAA	2	8	16255	16262	75 %	0 %	0 %	25 %	409249493
257	NT_187088	AAC	2	6	16263	16268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249493
258	NT_187088	GC	3	6	16675	16680	0 %	0 %	50 %	50 %	409249494
259	NT_187088	TTC	2	6	16695	16700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249494
260	NT_187088	CGG	2	6	16706	16711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249494
261	NT_187088	ACCG	2	8	16722	16729	25 %	0 %	25 %	50 %	409249494
262	NT_187088	CGC	2	6	16928	16933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249494
263	NT_187088	GGT	2	6	16953	16958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249494
264	NT_187088	GCT	2	6	17003	17008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249494
265	NT_187088	GAA	2	6	17028	17033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249494
266	NT_187088	CGC	2	6	17042	17047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249494
267	NT_187088	ATC	2	6	17059	17064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249494
268	NT_187088	GGCGT	2	10	17073	17082	0 %	20 %	60 %	20 %	409249494
269	NT_187088	ATC	2	6	17133	17138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249494
270	NT_187088	CGG	2	6	17141	17146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249494
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272	NT_187088	GC	3	6	17169	17174	0 %	0 %	50 %	50 %	409249494
273	NT_187088	A	6	6	17240	17245	100 %	0 %	0 %	0 %	409249495
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278	NT_187088	GC	3	6	17504	17509	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
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282	NT_187088	ACG	2	6	17663	17668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249495
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286	NT_187088	CG	3	6	17854	17859	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
287	NT_187088	GCT	2	6	17958	17963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249495
288	NT_187088	GC	3	6	17965	17970	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
289	NT_187088	GGC	2	6	17985	17990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249495
290	NT_187088	GC	3	6	17989	17994	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
291	NT_187088	A	7	7	18005	18011	100 %	0 %	0 %	0 %	409249495
292	NT_187088	A	8	8	18104	18111	100 %	0 %	0 %	0 %	409249496
293	NT_187088	CAT	2	6	18121	18126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249496
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296	NT_187088	CCG	2	6	18209	18214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249496
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299	NT_187088	CCA	2	6	18316	18321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249496
300	NT_187088	ACG	2	6	18336	18341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249496
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304	NT_187088	TGG	2	6	18505	18510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249496
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340	NT_187088	GCTG	2	8	20337	20344	0 %	25 %	50 %	25 %	409249497
341	NT_187088	AAG	2	6	20392	20397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249497
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360	NT_187088	TTC	2	6	22817	22822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249500
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378	NT_187088	CCA	2	6	23538	23543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249501
379	NT_187088	TTC	2	6	23605	23610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249501
380	NT_187088	GCG	2	6	23651	23656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249501
381	NT_187088	GGT	2	6	23661	23666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249501
382	NT_187088	ATC	2	6	23707	23712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249501
383	NT_187088	GC	3	6	23807	23812	0 %	0 %	50 %	50 %	409249501
384	NT_187088	TCA	2	6	23819	23824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249501
385	NT_187088	CGTC	2	8	23946	23953	0 %	25 %	25 %	50 %	409249501
386	NT_187088	TAA	2	6	23975	23980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249501
387	NT_187088	ACA	2	6	24238	24243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249502
388	NT_187088	TGG	2	6	24254	24259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249502
389	NT_187088	CTG	2	6	24348	24353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249502
390	NT_187088	GGT	2	6	24355	24360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249502
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392	NT_187088	GCT	2	6	24424	24429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249502
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