MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 390

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187087	TTG	2	6	502	507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249442
2	NT_187087	AGA	3	9	1316	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249443
3	NT_187087	ATC	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249443
4	NT_187087	CGG	2	6	1390	1395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
5	NT_187087	ACC	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249443
6	NT_187087	ATT	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249443
7	NT_187087	TGG	2	6	1657	1662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249443
8	NT_187087	TGC	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249443
9	NT_187087	ACC	2	6	1695	1700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249443
10	NT_187087	TGA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249443
11	NT_187087	CCG	2	6	2399	2404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249443
12	NT_187087	GAT	2	6	2445	2450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249443
13	NT_187087	CGG	2	6	2506	2511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
14	NT_187087	AGC	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249443
15	NT_187087	CAG	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249443
16	NT_187087	GCG	2	6	2790	2795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
17	NT_187087	CTG	2	6	2802	2807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249443
18	NT_187087	TCA	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249443
19	NT_187087	GGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
20	NT_187087	ATC	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249443
21	NT_187087	AAT	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249443
22	NT_187087	GGC	2	6	3233	3238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
23	NT_187087	CTG	2	6	3244	3249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249443
24	NT_187087	GGC	2	6	3254	3259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
25	NT_187087	CGG	2	6	3361	3366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
26	NT_187087	GCA	2	6	3463	3468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249443
27	NT_187087	CGG	2	6	3472	3477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
28	NT_187087	ATG	2	6	3598	3603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249443
29	NT_187087	CAA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249444
30	NT_187087	CGC	2	6	3990	3995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249444
31	NT_187087	CGC	2	6	4006	4011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249444
32	NT_187087	CGC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249444
33	NT_187087	TGG	2	6	4219	4224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249444
34	NT_187087	TAA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249444
35	NT_187087	TTC	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249444
36	NT_187087	CCA	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249444
37	NT_187087	ATA	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249444
38	NT_187087	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249444
39	NT_187087	ATT	2	6	4743	4748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249444
40	NT_187087	TAT	2	6	4784	4789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249444
41	NT_187087	CGG	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249444
42	NT_187087	CGC	2	6	4817	4822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249444
43	NT_187087	TAT	2	6	5121	5126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249445
44	NT_187087	ATG	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249445
45	NT_187087	GAT	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249445
46	NT_187087	GAA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249445
47	NT_187087	TGG	2	6	5332	5337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249445
48	NT_187087	CGG	2	6	5446	5451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249445
49	NT_187087	CTG	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249445
50	NT_187087	GTG	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249445
51	NT_187087	GCA	2	6	5744	5749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249446
52	NT_187087	AGT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249446
53	NT_187087	ATT	2	6	5825	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249446
54	NT_187087	GTC	2	6	5900	5905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249446
55	NT_187087	CGC	2	6	5977	5982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249446
56	NT_187087	ACG	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249446
57	NT_187087	TCC	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249446
58	NT_187087	CGT	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249446
59	NT_187087	TAA	2	6	6598	6603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249446
60	NT_187087	GTT	2	6	6922	6927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249447
61	NT_187087	GCC	2	6	6986	6991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
62	NT_187087	TAT	2	6	7002	7007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249447
63	NT_187087	GTG	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249447
64	NT_187087	GGC	2	6	7365	7370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
65	NT_187087	CGC	2	6	7406	7411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
66	NT_187087	GCA	2	6	7521	7526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249447
67	NT_187087	CTG	2	6	7816	7821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249447
68	NT_187087	GGC	2	6	7846	7851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
69	NT_187087	CTG	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249447
70	NT_187087	CGG	2	6	7982	7987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
71	NT_187087	ATG	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249447
72	NT_187087	GCC	2	6	8169	8174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
73	NT_187087	ATT	2	6	8218	8223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249447
74	NT_187087	CCG	2	6	8251	8256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
75	NT_187087	GCG	2	6	8510	8515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
76	NT_187087	CAC	2	6	8523	8528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249447
77	NT_187087	CCG	2	6	8680	8685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
78	NT_187087	CTG	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249447
79	NT_187087	GGC	2	6	8779	8784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
80	NT_187087	CAT	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249447
81	NT_187087	ATA	2	6	8801	8806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249447
82	NT_187087	CTG	2	6	8919	8924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249447
83	NT_187087	CGC	2	6	8934	8939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
84	NT_187087	CGC	2	6	9002	9007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249448
85	NT_187087	TGA	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249448
86	NT_187087	TAT	2	6	9132	9137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249448
87	NT_187087	TCG	2	6	9155	9160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249448
88	NT_187087	GAA	2	6	9229	9234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249448
89	NT_187087	TGA	2	6	9278	9283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249448
90	NT_187087	ATC	2	6	9338	9343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249448
91	NT_187087	CGC	2	6	9408	9413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249448
92	NT_187087	GTC	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249448
93	NT_187087	CGG	2	6	9429	9434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249448
94	NT_187087	ATT	2	6	9571	9576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249448
95	NT_187087	CTG	2	6	9679	9684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249448
96	NT_187087	AGA	2	6	9690	9695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249448
97	NT_187087	AGA	2	6	9708	9713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249448
98	NT_187087	GAA	2	6	9751	9756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249448
99	NT_187087	CGT	2	6	9829	9834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249448
100	NT_187087	AAC	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249448
101	NT_187087	GCG	2	6	9986	9991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249448
102	NT_187087	CGG	2	6	10281	10286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249448
103	NT_187087	CTG	3	9	10300	10308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249448
104	NT_187087	AGA	2	6	10392	10397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249448
105	NT_187087	TAC	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249448
106	NT_187087	ATA	2	6	10457	10462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249448
107	NT_187087	GCG	2	6	10490	10495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249448
108	NT_187087	CGG	2	6	10515	10520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249448
109	NT_187087	ATG	2	6	10526	10531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249448
110	NT_187087	GCA	2	6	10539	10544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249448
111	NT_187087	AGC	2	6	10547	10552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249448
112	NT_187087	CGA	2	6	10559	10564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249448
113	NT_187087	TGC	2	6	10895	10900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249449
114	NT_187087	TGG	2	6	10933	10938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249449
115	NT_187087	AGC	2	6	10967	10972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249449
116	NT_187087	GCG	2	6	10984	10989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249449
117	NT_187087	TGC	2	6	11062	11067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249449
118	NT_187087	TAT	2	6	11188	11193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249449
119	NT_187087	TCC	2	6	11296	11301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249449
120	NT_187087	CGC	2	6	11454	11459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249449
121	NT_187087	GAT	2	6	11469	11474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249449
122	NT_187087	GCA	2	6	11498	11503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249449
123	NT_187087	CTG	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249449
124	NT_187087	TTA	2	6	11652	11657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249449
125	NT_187087	GGC	2	6	11789	11794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249449
126	NT_187087	TAT	2	6	11813	11818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249449
127	NT_187087	TTG	2	6	11855	11860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249449
128	NT_187087	AGT	2	6	11915	11920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249449
129	NT_187087	GTC	2	6	12042	12047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249449
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374	NT_187087	ACG	3	9	31445	31453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249472
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376	NT_187087	AGC	2	6	31518	31523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249472
377	NT_187087	ACC	2	6	31543	31548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249472
378	NT_187087	CTG	2	6	31578	31583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249472
379	NT_187087	GCA	2	6	31737	31742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249472
380	NT_187087	GAT	2	6	31856	31861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249472
381	NT_187087	CGT	2	6	32009	32014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249473
382	NT_187087	GGC	2	6	32055	32060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249473
383	NT_187087	AAT	2	6	32554	32559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249474
384	NT_187087	ACA	2	6	32573	32578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249474
385	NT_187087	GAT	2	6	32589	32594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249474
386	NT_187087	TCT	2	6	32597	32602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249474
387	NT_187087	ATC	2	6	32707	32712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249474
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389	NT_187087	CAT	2	6	32826	32831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249474
390	NT_187087	TCA	2	6	32856	32861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249474

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.