MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	TGCTTA	2	12	1782	1793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248907
2	NT_187076	TGCCGA	2	12	2208	2219	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248907
3	NT_187076	GCTGGC	2	12	2584	2595	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248907
4	NT_187076	GATTTT	2	12	3989	4000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409248908
5	NT_187076	ATTGAT	2	12	4497	4508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409248908
6	NT_187076	TGGCGC	2	12	4930	4941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248908
7	NT_187076	GTTGGC	2	12	6741	6752	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409248911
8	NT_187076	ACATCC	2	12	9753	9764	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409248915
9	NT_187076	TAGCGG	2	12	16428	16439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248921
10	NT_187076	CTGAAC	2	12	17020	17031	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248921
11	NT_187076	GGACTG	2	12	20885	20896	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248924
12	NT_187076	CAGGCG	2	12	25098	25109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248929
13	NT_187076	AGGCGA	2	12	29343	29354	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409248934
14	NT_187076	CGCCAG	2	12	36444	36455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248940
15	NT_187076	GATCGT	2	12	40935	40946	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248943
16	NT_187076	CAGATG	2	12	41893	41904	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248944
17	NT_187076	TCGCCT	2	12	44416	44427	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409248946
18	NT_187076	TGGTCA	2	12	47120	47131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248949
19	NT_187076	TGCAAC	2	12	49313	49324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248952
20	NT_187076	ATCCTG	2	12	49453	49464	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248952
21	NT_187076	TGACGT	2	12	53539	53550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248955
22	NT_187076	CGGCAA	2	12	55576	55587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248957
23	NT_187076	CGTCAA	2	12	57287	57298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248959
24	NT_187076	ACGCCG	2	12	63236	63247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248965
25	NT_187076	GGGCTG	2	12	63306	63317	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409248965
26	NT_187076	ACGATA	2	12	64496	64507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409248966
27	NT_187076	GCGCTG	2	12	66001	66012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248967
28	NT_187076	CAAACC	2	12	66819	66830	50 %	0 %	0 %	50 %	409248968
29	NT_187076	ATCGAT	2	12	74121	74132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409248974
30	NT_187076	ATCCTG	2	12	75222	75233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248975
31	NT_187076	AGCGGT	2	12	77990	78001	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248976
32	NT_187076	CGGATG	2	12	80889	80900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248979
33	NT_187076	TCAGAT	2	12	81266	81277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409248980
34	NT_187076	CGCCTG	2	12	81609	81620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248980
35	NT_187076	ATGGTG	2	12	85016	85027	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409248984
36	NT_187076	CAACCG	2	12	91797	91808	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409248991
37	NT_187076	GTAGCA	2	12	91892	91903	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248991
38	NT_187076	CAGCGC	2	12	91917	91928	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248991
39	NT_187076	GGCGGG	2	12	93242	93253	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	409248992
40	NT_187076	CAATTA	2	12	94103	94114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	409248993
41	NT_187076	GAAAGT	2	12	96725	96736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409248997
42	NT_187076	ATCACC	2	12	98179	98190	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409249001
43	NT_187076	CTGGCG	2	12	105536	105547	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409249007
44	NT_187076	CGCTGG	2	12	106050	106061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409249008
45	NT_187076	TTTAAA	2	12	110232	110243	50 %	50 %	0 %	0 %	409249009
46	NT_187076	ATATTA	2	12	110278	110289	50 %	50 %	0 %	0 %	409249009
47	NT_187076	ATTCAG	2	12	112213	112224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409249011
48	NT_187076	CAGCGC	2	12	112498	112509	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249011
49	NT_187076	CGGCGA	2	12	112626	112637	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409249011
50	NT_187076	GCGATG	2	12	114057	114068	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249013
51	NT_187076	GTGACG	2	12	115388	115399	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249015
52	NT_187076	ATCGGC	2	12	121531	121542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409249023
53	NT_187076	TGGTAT	2	12	124667	124678	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	409249026
54	NT_187076	GTGGCG	2	12	125801	125812	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409249026
55	NT_187076	CTGCCG	2	12	127151	127162	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409249026
56	NT_187076	TGACGA	2	12	127411	127422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409249026
57	NT_187076	TGAACG	2	12	127852	127863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409249026
58	NT_187076	CGGCAT	2	12	130027	130038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409249028
59	NT_187076	GCATCA	2	12	130668	130679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409249029
60	NT_187076	GATATG	2	12	135069	135080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249033
61	NT_187076	TGACGG	2	12	135415	135426	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249033
62	NT_187076	CGGGGG	2	12	159238	159249	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	409249057
63	NT_187076	ACCAGT	2	12	160027	160038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409249058
64	NT_187076	CGCTTC	2	12	161563	161574	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409249059
65	NT_187076	CTGTTG	2	12	167409	167420	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409249065
66	NT_187076	TTCGGC	2	12	189631	189642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249090
67	NT_187076	CGGCGC	2	12	190216	190227	0 %	0 %	50 %	50 %	409249090
68	NT_187076	TTGTGG	2	12	191351	191362	0 %	50 %	50 %	0 %	409249093
69	NT_187076	ATATTG	2	12	192113	192124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409249093
70	NT_187076	GTGATT	2	12	196491	196502	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	409249097

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.