MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 3852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187076	CTG	2	6	178716	178721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249080
3502	NT_187076	CTG	2	6	178740	178745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249080
3503	NT_187076	GAC	2	6	178779	178784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249080
3504	NT_187076	CGC	2	6	178797	178802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249080
3505	NT_187076	GGC	2	6	178803	178808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249080
3506	NT_187076	GC	3	6	178811	178816	0 %	0 %	50 %	50 %	409249080
3507	NT_187076	GCA	2	6	178843	178848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249080
3508	NT_187076	GC	3	6	178850	178855	0 %	0 %	50 %	50 %	409249080
3509	NT_187076	CTGT	2	8	178904	178911	0 %	50 %	25 %	25 %	409249080
3510	NT_187076	GC	3	6	178964	178969	0 %	0 %	50 %	50 %	409249080
3511	NT_187076	GGT	2	6	179001	179006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249080
3512	NT_187076	GAA	2	6	179039	179044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249080
3513	NT_187076	CCG	2	6	179089	179094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249080
3514	NT_187076	CGT	2	6	179139	179144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249080
3515	NT_187076	ATA	2	6	179188	179193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249080
3516	NT_187076	TAT	2	6	179213	179218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249080
3517	NT_187076	CCG	3	9	179237	179245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249080
3518	NT_187076	CG	3	6	179244	179249	0 %	0 %	50 %	50 %	409249080
3519	NT_187076	ACG	2	6	179302	179307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249080
3520	NT_187076	GCG	2	6	179371	179376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249080
3521	NT_187076	CAT	2	6	179435	179440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249080
3522	NT_187076	GGCCA	2	10	179448	179457	20 %	0 %	40 %	40 %	409249080
3523	NT_187076	TCCGC	2	10	179557	179566	0 %	20 %	20 %	60 %	409249080
3524	NT_187076	GCG	2	6	179603	179608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249080
3525	NT_187076	GGT	2	6	179613	179618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249080
3526	NT_187076	TGC	2	6	179620	179625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249080
3527	NT_187076	CCG	2	6	179629	179634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249080
3528	NT_187076	AGT	2	6	179653	179658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249080
3529	NT_187076	ACA	2	6	179727	179732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249081
3530	NT_187076	AAT	2	6	179882	179887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249081
3531	NT_187076	GCCA	2	8	179902	179909	25 %	0 %	25 %	50 %	409249081
3532	NT_187076	GGC	2	6	179938	179943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249081
3533	NT_187076	ATT	2	6	179960	179965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249081
3534	NT_187076	CCA	2	6	180000	180005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249081
3535	NT_187076	AGCC	2	8	180089	180096	25 %	0 %	25 %	50 %	409249081
3536	NT_187076	GCC	2	6	180109	180114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249081
3537	NT_187076	AAT	2	6	180139	180144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249081
3538	NT_187076	CAT	2	6	180187	180192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249081
3539	NT_187076	CAGAC	2	10	180289	180298	40 %	0 %	20 %	40 %	409249081
3540	NT_187076	GCG	2	6	180359	180364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249081
3541	NT_187076	CAG	2	6	180367	180372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249081
3542	NT_187076	GGGC	2	8	180421	180428	0 %	0 %	75 %	25 %	409249081
3543	NT_187076	TAA	2	6	180441	180446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249081
3544	NT_187076	GC	3	6	180528	180533	0 %	0 %	50 %	50 %	409249081
3545	NT_187076	CAG	2	6	180568	180573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249081
3546	NT_187076	CG	3	6	180618	180623	0 %	0 %	50 %	50 %	409249081
3547	NT_187076	CAC	2	6	180640	180645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249081
3548	NT_187076	ACC	2	6	180650	180655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249081
3549	NT_187076	CAT	2	6	180688	180693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249081
3550	NT_187076	CAG	2	6	180751	180756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249081
3551	NT_187076	T	7	7	180801	180807	0 %	100 %	0 %	0 %	409249081
3552	NT_187076	ATT	2	6	180827	180832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249082
3553	NT_187076	TCC	2	6	180835	180840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249082
3554	NT_187076	ACC	2	6	180850	180855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249082
3555	NT_187076	GTT	2	6	180879	180884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249082
3556	NT_187076	ATG	2	6	180895	180900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249082
3557	NT_187076	GCC	2	6	180945	180950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249082
3558	NT_187076	GAT	2	6	180960	180965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249082
3559	NT_187076	CGC	2	6	181101	181106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249082
3560	NT_187076	GC	3	6	181118	181123	0 %	0 %	50 %	50 %	409249082
3561	NT_187076	GCCGT	2	10	181141	181150	0 %	20 %	40 %	40 %	409249082
3562	NT_187076	CGG	2	6	181221	181226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249082
3563	NT_187076	CGT	2	6	181304	181309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249082
3564	NT_187076	TAA	2	6	181310	181315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249082
3565	NT_187076	ATC	2	6	181318	181323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249082
3566	NT_187076	T	6	6	181407	181412	0 %	100 %	0 %	0 %	409249082
3567	NT_187076	CCAT	2	8	181505	181512	25 %	25 %	0 %	50 %	409249082
3568	NT_187076	CGAT	2	8	181522	181529	25 %	25 %	25 %	25 %	409249082
3569	NT_187076	AGA	2	6	181553	181558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249082
3570	NT_187076	CCG	2	6	181565	181570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249082
3571	NT_187076	T	6	6	181614	181619	0 %	100 %	0 %	0 %	409249082
3572	NT_187076	CCA	2	6	181656	181661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249082
3573	NT_187076	TGA	2	6	181691	181696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249082
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3575	NT_187076	CG	3	6	181767	181772	0 %	0 %	50 %	50 %	409249082
3576	NT_187076	AGC	2	6	181801	181806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249082
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3578	NT_187076	CCG	2	6	181913	181918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249082
3579	NT_187076	CG	3	6	181917	181922	0 %	0 %	50 %	50 %	409249082
3580	NT_187076	CTGC	2	8	181924	181931	0 %	25 %	25 %	50 %	409249082
3581	NT_187076	CAG	2	6	181932	181937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249082
3582	NT_187076	CTG	2	6	181950	181955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249082
3583	NT_187076	GCG	2	6	181997	182002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249082
3584	NT_187076	GTT	2	6	182037	182042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249082
3585	NT_187076	TAG	2	6	182089	182094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249082
3586	NT_187076	GGC	2	6	182127	182132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249082
3587	NT_187076	GTTT	2	8	182144	182151	0 %	75 %	25 %	0 %	409249082
3588	NT_187076	ATA	2	6	182232	182237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249082
3589	NT_187076	GCG	2	6	182238	182243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249082
3590	NT_187076	GC	3	6	182295	182300	0 %	0 %	50 %	50 %	409249082
3591	NT_187076	GTTT	2	8	182319	182326	0 %	75 %	25 %	0 %	409249082
3592	NT_187076	GC	3	6	182359	182364	0 %	0 %	50 %	50 %	409249082
3593	NT_187076	T	6	6	182367	182372	0 %	100 %	0 %	0 %	409249082
3594	NT_187076	GGC	2	6	182376	182381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249082
3595	NT_187076	TCG	3	9	182386	182394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249082
3596	NT_187076	CAT	2	6	182457	182462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249082
3597	NT_187076	GATA	2	8	182471	182478	50 %	25 %	25 %	0 %	409249082
3598	NT_187076	TTCG	2	8	182562	182569	0 %	50 %	25 %	25 %	409249082
3599	NT_187076	CAG	2	6	182637	182642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249082
3600	NT_187076	TCAC	2	8	182760	182767	25 %	25 %	0 %	50 %	409249083
3601	NT_187076	TGGT	2	8	182779	182786	0 %	50 %	50 %	0 %	409249083
3602	NT_187076	GCC	2	6	182916	182921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249083
3603	NT_187076	GCG	2	6	182981	182986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249083
3604	NT_187076	CGG	3	9	183035	183043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249083
3605	NT_187076	ACG	2	6	183150	183155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249083
3606	NT_187076	GGC	2	6	183260	183265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249084
3607	NT_187076	TTC	2	6	183270	183275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249084
3608	NT_187076	CGA	2	6	183308	183313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249084
3609	NT_187076	GCA	2	6	183353	183358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249084
3610	NT_187076	CG	4	8	183366	183373	0 %	0 %	50 %	50 %	409249084
3611	NT_187076	CAC	2	6	183381	183386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249084
3612	NT_187076	AAT	2	6	183432	183437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249084
3613	NT_187076	GAT	2	6	183480	183485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249084
3614	NT_187076	TCA	2	6	183502	183507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249084
3615	NT_187076	TCA	2	6	183874	183879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249085
3616	NT_187076	GCC	2	6	183885	183890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249085
3617	NT_187076	GGC	2	6	183988	183993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249085
3618	NT_187076	CAG	2	6	184051	184056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249085
3619	NT_187076	GGC	2	6	184171	184176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249085
3620	NT_187076	GC	5	10	184309	184318	0 %	0 %	50 %	50 %	409249085
3621	NT_187076	T	7	7	184543	184549	0 %	100 %	0 %	0 %	409249086
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3623	NT_187076	CG	3	6	184711	184716	0 %	0 %	50 %	50 %	409249087
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.