MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 3852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187076	ATCCTG	2	12	49453	49464	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248952
1002	NT_187076	AG	3	6	49561	49566	50 %	0 %	50 %	0 %	409248952
1003	NT_187076	CCT	2	6	49611	49616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248952
1004	NT_187076	TTG	2	6	49633	49638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248952
1005	NT_187076	CTT	2	6	49650	49655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248952
1006	NT_187076	CAG	2	6	49675	49680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248952
1007	NT_187076	GC	3	6	49763	49768	0 %	0 %	50 %	50 %	409248952
1008	NT_187076	GCG	2	6	49781	49786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248952
1009	NT_187076	ATC	2	6	49787	49792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248952
1010	NT_187076	CTG	2	6	49945	49950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248952
1011	NT_187076	CCGGC	2	10	50079	50088	0 %	0 %	40 %	60 %	409248953
1012	NT_187076	CTA	2	6	50183	50188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248953
1013	NT_187076	GCG	2	6	50215	50220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248953
1014	NT_187076	TG	3	6	50322	50327	0 %	50 %	50 %	0 %	409248953
1015	NT_187076	GGC	2	6	50379	50384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248953
1016	NT_187076	GCGCC	2	10	50389	50398	0 %	0 %	40 %	60 %	409248953
1017	NT_187076	TCA	2	6	50432	50437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248953
1018	NT_187076	GC	3	6	50495	50500	0 %	0 %	50 %	50 %	409248953
1019	NT_187076	GAA	2	6	50502	50507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248953
1020	NT_187076	TGG	2	6	50546	50551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248953
1021	NT_187076	CGG	2	6	50630	50635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248953
1022	NT_187076	GATC	2	8	50663	50670	25 %	25 %	25 %	25 %	409248953
1023	NT_187076	CAT	2	6	50708	50713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248953
1024	NT_187076	GC	3	6	50765	50770	0 %	0 %	50 %	50 %	409248953
1025	NT_187076	TTA	2	6	50801	50806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248953
1026	NT_187076	ATT	2	6	50972	50977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248954
1027	NT_187076	GA	3	6	50981	50986	50 %	0 %	50 %	0 %	409248954
1028	NT_187076	A	6	6	51097	51102	100 %	0 %	0 %	0 %	409248954
1029	NT_187076	CGG	2	6	51222	51227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248954
1030	NT_187076	GCC	2	6	51301	51306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248954
1031	NT_187076	CCA	2	6	51312	51317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248954
1032	NT_187076	CTG	2	6	51370	51375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248954
1033	NT_187076	CGAC	2	8	51405	51412	25 %	0 %	25 %	50 %	409248954
1034	NT_187076	GTTTT	2	10	51413	51422	0 %	80 %	20 %	0 %	409248954
1035	NT_187076	GGC	2	6	51460	51465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248954
1036	NT_187076	TAA	2	6	51502	51507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248954
1037	NT_187076	GCG	3	9	51515	51523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248954
1038	NT_187076	ATT	2	6	52290	52295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248955
1039	NT_187076	CTGG	2	8	52298	52305	0 %	25 %	50 %	25 %	409248955
1040	NT_187076	CGC	2	6	52522	52527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1041	NT_187076	CTG	2	6	52623	52628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1042	NT_187076	GCT	2	6	52646	52651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1043	NT_187076	GTG	2	6	52713	52718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248955
1044	NT_187076	TGA	3	9	52765	52773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248955
1045	NT_187076	CGG	2	6	52841	52846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248955
1046	NT_187076	CGC	2	6	52849	52854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1047	NT_187076	GCTG	2	8	52876	52883	0 %	25 %	50 %	25 %	409248955
1048	NT_187076	GCA	2	6	52964	52969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1049	NT_187076	TGC	2	6	52975	52980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1050	NT_187076	TTA	2	6	52989	52994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248955
1051	NT_187076	CTG	2	6	53001	53006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1052	NT_187076	TGG	2	6	53062	53067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248955
1053	NT_187076	CGGGC	2	10	53089	53098	0 %	0 %	60 %	40 %	409248955
1054	NT_187076	ATC	2	6	53115	53120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248955
1055	NT_187076	CCG	2	6	53149	53154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1056	NT_187076	TTG	2	6	53193	53198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248955
1057	NT_187076	TGC	2	6	53200	53205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1058	NT_187076	CCG	2	6	53221	53226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1059	NT_187076	GCC	2	6	53231	53236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1060	NT_187076	TC	3	6	53284	53289	0 %	50 %	0 %	50 %	409248955
1061	NT_187076	TTG	2	6	53316	53321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248955
1062	NT_187076	TGC	2	6	53344	53349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1063	NT_187076	TGT	2	6	53357	53362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248955
1064	NT_187076	ATTT	2	8	53385	53392	25 %	75 %	0 %	0 %	409248955
1065	NT_187076	CGT	2	6	53408	53413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1066	NT_187076	TCG	2	6	53425	53430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1067	NT_187076	TGT	2	6	53452	53457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248955
1068	NT_187076	GGCG	2	8	53468	53475	0 %	0 %	75 %	25 %	409248955
1069	NT_187076	GCT	2	6	53489	53494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1070	NT_187076	TGG	2	6	53503	53508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248955
1071	NT_187076	TGC	2	6	53515	53520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1072	NT_187076	TGC	2	6	53527	53532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1073	NT_187076	TGACGT	2	12	53539	53550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248955
1074	NT_187076	TGC	2	6	53638	53643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1075	NT_187076	TGC	2	6	53659	53664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1076	NT_187076	GCG	2	6	53665	53670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248955
1077	NT_187076	CCT	2	6	53672	53677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248955
1078	NT_187076	CAG	2	6	53691	53696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1079	NT_187076	CCG	2	6	53700	53705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1080	NT_187076	CGC	2	6	53752	53757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1081	NT_187076	CAG	2	6	53856	53861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1082	NT_187076	GCC	2	6	53942	53947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1083	NT_187076	TTC	2	6	54102	54107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248955
1084	NT_187076	TTCC	2	8	54112	54119	0 %	50 %	0 %	50 %	409248955
1085	NT_187076	TGG	2	6	54376	54381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248955
1086	NT_187076	GAAA	2	8	54403	54410	75 %	0 %	25 %	0 %	409248955
1087	NT_187076	CGC	2	6	54470	54475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248955
1088	NT_187076	GCG	2	6	54571	54576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248955
1089	NT_187076	GCT	3	9	54578	54586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248955
1090	NT_187076	GCG	2	6	54595	54600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248955
1091	NT_187076	CGTT	2	8	54611	54618	0 %	50 %	25 %	25 %	409248955
1092	NT_187076	GAT	2	6	54655	54660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248955
1093	NT_187076	ATG	2	6	54663	54668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248956
1094	NT_187076	AAT	2	6	54671	54676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248956
1095	NT_187076	T	6	6	54706	54711	0 %	100 %	0 %	0 %	409248956
1096	NT_187076	TAG	2	6	54742	54747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248956
1097	NT_187076	A	6	6	54759	54764	100 %	0 %	0 %	0 %	409248956
1098	NT_187076	GGC	2	6	54868	54873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248957
1099	NT_187076	ATCG	2	8	54874	54881	25 %	25 %	25 %	25 %	409248957
1100	NT_187076	CGG	2	6	54985	54990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248957
1101	NT_187076	CGC	2	6	55084	55089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248957
1102	NT_187076	ATT	2	6	55092	55097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248957
1103	NT_187076	TGA	2	6	55105	55110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248957
1104	NT_187076	AACAG	2	10	55263	55272	60 %	0 %	20 %	20 %	409248957
1105	NT_187076	TTA	2	6	55276	55281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248957
1106	NT_187076	TGG	2	6	55287	55292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248957
1107	NT_187076	CGA	2	6	55447	55452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248957
1108	NT_187076	GGC	2	6	55490	55495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248957
1109	NT_187076	CGA	2	6	55525	55530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248957
1110	NT_187076	CGGCAA	2	12	55576	55587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248957
1111	NT_187076	CGC	2	6	55651	55656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248957
1112	NT_187076	GGC	2	6	55658	55663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248957
1113	NT_187076	GAC	2	6	55684	55689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248957
1114	NT_187076	A	6	6	55691	55696	100 %	0 %	0 %	0 %	409248957
1115	NT_187076	GCA	2	6	56467	56472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248958
1116	NT_187076	ACCG	2	8	56558	56565	25 %	0 %	25 %	50 %	409248958
1117	NT_187076	A	6	6	56613	56618	100 %	0 %	0 %	0 %	409248958
1118	NT_187076	ATT	2	6	56625	56630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248958
1119	NT_187076	GC	3	6	56658	56663	0 %	0 %	50 %	50 %	409248958
1120	NT_187076	GC	3	6	56821	56826	0 %	0 %	50 %	50 %	409248958
1121	NT_187076	GGC	2	6	56849	56854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248958
1122	NT_187076	TC	3	6	56864	56869	0 %	50 %	0 %	50 %	409248958
1123	NT_187076	CG	3	6	56991	56996	0 %	0 %	50 %	50 %	409248958
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1125	NT_187076	CCG	2	6	57136	57141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248959
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1248	NT_187076	CAC	2	6	63759	63764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248965
1249	NT_187076	TGC	2	6	63797	63802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248965
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