MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 4380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NT_187072	GTG	2	6	157952	157957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248613
3002	NT_187072	GTC	2	6	158009	158014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3003	NT_187072	CG	3	6	158047	158052	0 %	0 %	50 %	50 %	409248613
3004	NT_187072	TCAG	2	8	158085	158092	25 %	25 %	25 %	25 %	409248613
3005	NT_187072	GC	3	6	158107	158112	0 %	0 %	50 %	50 %	409248613
3006	NT_187072	GC	3	6	158116	158121	0 %	0 %	50 %	50 %	409248613
3007	NT_187072	GAC	2	6	158124	158129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3008	NT_187072	CTG	2	6	158153	158158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3009	NT_187072	GCGG	2	8	158176	158183	0 %	0 %	75 %	25 %	409248613
3010	NT_187072	TTG	2	6	158228	158233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248613
3011	NT_187072	CTGG	2	8	158278	158285	0 %	25 %	50 %	25 %	409248613
3012	NT_187072	GCC	2	6	158290	158295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248613
3013	NT_187072	GCC	2	6	158312	158317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248613
3014	NT_187072	TAT	2	6	158325	158330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248613
3015	NT_187072	GC	3	6	158340	158345	0 %	0 %	50 %	50 %	409248613
3016	NT_187072	GCGA	2	8	158352	158359	25 %	0 %	50 %	25 %	409248613
3017	NT_187072	GC	3	6	158364	158369	0 %	0 %	50 %	50 %	409248613
3018	NT_187072	GGC	2	6	158383	158388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248613
3019	NT_187072	GGC	2	6	158410	158415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248613
3020	NT_187072	CGA	2	6	158431	158436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3021	NT_187072	GCC	2	6	158447	158452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248613
3022	NT_187072	CCG	2	6	158454	158459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248613
3023	NT_187072	CGC	2	6	158487	158492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248613
3024	NT_187072	GCG	3	9	158493	158501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248613
3025	NT_187072	GCA	2	6	158545	158550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3026	NT_187072	CAG	2	6	158558	158563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3027	NT_187072	GC	3	6	158604	158609	0 %	0 %	50 %	50 %	409248613
3028	NT_187072	TTA	2	6	158610	158615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248613
3029	NT_187072	CG	3	6	158650	158655	0 %	0 %	50 %	50 %	409248613
3030	NT_187072	CGT	2	6	158657	158662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3031	NT_187072	CGC	2	6	158751	158756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248613
3032	NT_187072	TGC	2	6	158760	158765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3033	NT_187072	TTG	2	6	158795	158800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248613
3034	NT_187072	TCA	2	6	158974	158979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248613
3035	NT_187072	GCG	2	6	159068	159073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248613
3036	NT_187072	GCT	2	6	159118	159123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3037	NT_187072	TGC	2	6	159144	159149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3038	NT_187072	TGC	2	6	159234	159239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248613
3039	NT_187072	CCCG	2	8	159319	159326	0 %	0 %	25 %	75 %	409248613
3040	NT_187072	GCGAA	2	10	159357	159366	40 %	0 %	40 %	20 %	409248613
3041	NT_187072	GAA	2	6	159565	159570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248613
3042	NT_187072	CGT	2	6	159793	159798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3043	NT_187072	GCA	2	6	159801	159806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3044	NT_187072	GAC	2	6	159808	159813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3045	NT_187072	ATG	3	9	159818	159826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248614
3046	NT_187072	GAA	2	6	159838	159843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248614
3047	NT_187072	GGCT	2	8	159895	159902	0 %	25 %	50 %	25 %	409248614
3048	NT_187072	A	6	6	159971	159976	100 %	0 %	0 %	0 %	409248614
3049	NT_187072	CGG	3	9	160013	160021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3050	NT_187072	GAT	2	6	160164	160169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248614
3051	NT_187072	CGT	2	6	160171	160176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3052	NT_187072	AAG	2	6	160199	160204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248614
3053	NT_187072	GC	4	8	160212	160219	0 %	0 %	50 %	50 %	409248614
3054	NT_187072	AAC	2	6	160267	160272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248614
3055	NT_187072	CTT	2	6	160284	160289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248614
3056	NT_187072	TTC	2	6	160320	160325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248614
3057	NT_187072	AGC	2	6	160337	160342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3058	NT_187072	CTG	2	6	160375	160380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3059	NT_187072	ATG	2	6	160424	160429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248614
3060	NT_187072	CGG	2	6	160475	160480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3061	NT_187072	CAG	2	6	160513	160518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3062	NT_187072	GAA	2	6	160524	160529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248614
3063	NT_187072	GTC	2	6	160712	160717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3064	NT_187072	CAG	2	6	160741	160746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3065	NT_187072	TGG	2	6	160754	160759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248614
3066	NT_187072	CGT	2	6	160819	160824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3067	NT_187072	CAG	3	9	160846	160854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3068	NT_187072	ATC	2	6	160858	160863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248614
3069	NT_187072	GC	3	6	160889	160894	0 %	0 %	50 %	50 %	409248614
3070	NT_187072	CG	3	6	160913	160918	0 %	0 %	50 %	50 %	409248614
3071	NT_187072	GCG	3	9	160916	160924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3072	NT_187072	CAGC	2	8	160936	160943	25 %	0 %	25 %	50 %	409248614
3073	NT_187072	TC	3	6	161001	161006	0 %	50 %	0 %	50 %	409248614
3074	NT_187072	CAC	2	6	161022	161027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248614
3075	NT_187072	GAA	2	6	161088	161093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248614
3076	NT_187072	TGG	4	12	161126	161137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248614
3077	NT_187072	GCG	2	6	161147	161152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3078	NT_187072	GC	3	6	161157	161162	0 %	0 %	50 %	50 %	409248614
3079	NT_187072	GGCGG	2	10	161170	161179	0 %	0 %	80 %	20 %	409248614
3080	NT_187072	GC	3	6	161215	161220	0 %	0 %	50 %	50 %	409248614
3081	NT_187072	CGC	2	6	161351	161356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248614
3082	NT_187072	ACG	2	6	161360	161365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3083	NT_187072	TCG	2	6	161367	161372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3084	NT_187072	TGG	2	6	161399	161404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248614
3085	NT_187072	CGG	2	6	161465	161470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3086	NT_187072	GCG	2	6	161594	161599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3087	NT_187072	CG	3	6	161605	161610	0 %	0 %	50 %	50 %	409248614
3088	NT_187072	GGC	2	6	161700	161705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3089	NT_187072	GCA	2	6	161727	161732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3090	NT_187072	GTC	2	6	161734	161739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3091	NT_187072	GAC	2	6	161805	161810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3092	NT_187072	ACA	2	6	161813	161818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248614
3093	NT_187072	AAC	2	6	161884	161889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248614
3094	NT_187072	CGA	2	6	161894	161899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3095	NT_187072	GCG	2	6	161915	161920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3096	NT_187072	GACGCC	2	12	161955	161966	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248614
3097	NT_187072	CGC	2	6	161978	161983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248614
3098	NT_187072	TGG	2	6	161993	161998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248614
3099	NT_187072	ACG	2	6	162014	162019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3100	NT_187072	GCG	2	6	162035	162040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3101	NT_187072	GGAC	2	8	162062	162069	25 %	0 %	50 %	25 %	409248614
3102	NT_187072	CAG	2	6	162088	162093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3103	NT_187072	GAT	2	6	162099	162104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248614
3104	NT_187072	GCA	3	9	162105	162113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3105	NT_187072	CAG	2	6	162115	162120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3106	NT_187072	GTC	2	6	162144	162149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3107	NT_187072	GCA	2	6	162156	162161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3108	NT_187072	GCA	2	6	162168	162173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248614
3109	NT_187072	GCC	2	6	162177	162182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248614
3110	NT_187072	AGA	2	6	162186	162191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248614
3111	NT_187072	CGG	2	6	162231	162236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248614
3112	NT_187072	TTA	2	6	162379	162384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248615
3113	NT_187072	CCTT	2	8	162387	162394	0 %	50 %	0 %	50 %	409248615
3114	NT_187072	CGA	2	6	162454	162459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248615
3115	NT_187072	TGC	2	6	162474	162479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248615
3116	NT_187072	TAA	3	9	162485	162493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248615
3117	NT_187072	TCA	2	6	162519	162524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248615
3118	NT_187072	CTC	2	6	162565	162570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248616
3119	NT_187072	GTA	2	6	162590	162595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248616
3120	NT_187072	TGTC	2	8	162615	162622	0 %	50 %	25 %	25 %	409248616
3121	NT_187072	GGC	2	6	162631	162636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248616
3122	NT_187072	AGA	2	6	162649	162654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248616
3123	NT_187072	CGC	2	6	162718	162723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248616
3124	NT_187072	CCA	4	12	162735	162746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248616
3125	NT_187072	A	6	6	162765	162770	100 %	0 %	0 %	0 %	409248616
3126	NT_187072	GGT	2	6	162787	162792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248616
3127	NT_187072	AGATGC	2	12	162804	162815	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248616
3128	NT_187072	CAGT	2	8	162824	162831	25 %	25 %	25 %	25 %	409248616
3129	NT_187072	AAG	2	6	162834	162839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248616
3130	NT_187072	AGC	2	6	162869	162874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248616
3131	NT_187072	GTTGA	2	10	163019	163028	20 %	40 %	40 %	0 %	409248616
3132	NT_187072	CGTC	2	8	163041	163048	0 %	25 %	25 %	50 %	409248616
3133	NT_187072	ACT	2	6	163103	163108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248616
3134	NT_187072	GAAA	2	8	163117	163124	75 %	0 %	25 %	0 %	409248616
3135	NT_187072	TTCAA	2	10	163125	163134	40 %	40 %	0 %	20 %	409248616
3136	NT_187072	AGC	2	6	163242	163247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248616
3137	NT_187072	TGA	2	6	163303	163308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248616
3138	NT_187072	GAAC	2	8	163342	163349	50 %	0 %	25 %	25 %	409248616
3139	NT_187072	CTA	2	6	163360	163365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248616
3140	NT_187072	GGCT	2	8	163367	163374	0 %	25 %	50 %	25 %	409248616
3141	NT_187072	ACA	2	6	163449	163454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248616
3142	NT_187072	TGG	2	6	163476	163481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248616
3143	NT_187072	A	6	6	163560	163565	100 %	0 %	0 %	0 %	409248616
3144	NT_187072	GCG	2	6	163586	163591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248616
3145	NT_187072	ATGCGT	2	12	163724	163735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248616
3146	NT_187072	GC	3	6	163761	163766	0 %	0 %	50 %	50 %	409248616
3147	NT_187072	CGG	2	6	163813	163818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248616
3148	NT_187072	AAAC	2	8	163847	163854	75 %	0 %	0 %	25 %	409248616
3149	NT_187072	GGAAT	2	10	163879	163888	40 %	20 %	40 %	0 %	409248616
3150	NT_187072	CGG	2	6	163906	163911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248616
3151	NT_187072	AT	3	6	163975	163980	50 %	50 %	0 %	0 %	409248616
3152	NT_187072	ACC	2	6	163992	163997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248616
3153	NT_187072	GTT	3	9	164180	164188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248616
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3155	NT_187072	CCAA	2	8	164237	164244	50 %	0 %	0 %	50 %	409248616
3156	NT_187072	CAG	2	6	164262	164267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248616
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3159	NT_187072	GCAGC	2	10	164538	164547	20 %	0 %	40 %	40 %	409248616
3160	NT_187072	GATG	2	8	164551	164558	25 %	25 %	50 %	0 %	409248616
3161	NT_187072	GTC	2	6	164561	164566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248616
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3200	NT_187072	ATCG	2	8	166240	166247	25 %	25 %	25 %	25 %	409248618
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3210	NT_187072	CAT	2	6	166673	166678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248619
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3212	NT_187072	CTG	2	6	166704	166709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248619
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3227	NT_187072	GC	3	6	167355	167360	0 %	0 %	50 %	50 %	409248619
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3229	NT_187072	GC	3	6	167476	167481	0 %	0 %	50 %	50 %	409248619
3230	NT_187072	GCT	2	6	167483	167488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248619
3231	NT_187072	GCT	2	6	167495	167500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248619
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3233	NT_187072	GGC	2	6	167552	167557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248619
3234	NT_187072	GC	3	6	167596	167601	0 %	0 %	50 %	50 %	409248619
3235	NT_187072	TGC	2	6	167605	167610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248619
3236	NT_187072	GC	3	6	167623	167628	0 %	0 %	50 %	50 %	409248619
3237	NT_187072	GCT	2	6	167675	167680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248619
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3239	NT_187072	GGC	2	6	167717	167722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248619
3240	NT_187072	GGCG	2	8	167729	167736	0 %	0 %	75 %	25 %	409248619
3241	NT_187072	TGGCGG	2	12	167743	167754	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409248619
3242	NT_187072	ATT	2	6	167760	167765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248619
3243	NT_187072	GTG	2	6	167835	167840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248619
3244	NT_187072	CTA	2	6	167880	167885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248619
3245	NT_187072	GCG	3	9	167904	167912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248619
3246	NT_187072	CTG	2	6	167916	167921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248619
3247	NT_187072	ATT	2	6	167922	167927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248619
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3262	NT_187072	A	9	9	168514	168522	100 %	0 %	0 %	0 %	409248619
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3270	NT_187072	A	8	8	169025	169032	100 %	0 %	0 %	0 %	409248620
3271	NT_187072	T	6	6	169045	169050	0 %	100 %	0 %	0 %	409248620
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3352	NT_187072	TGG	3	9	174041	174049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248624
3353	NT_187072	A	7	7	174060	174066	100 %	0 %	0 %	0 %	409248624
3354	NT_187072	TAA	2	6	174082	174087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248625
3355	NT_187072	GCA	2	6	174088	174093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248625
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3359	NT_187072	CGG	3	9	174334	174342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248625
3360	NT_187072	AAC	2	6	174384	174389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248625
3361	NT_187072	CCA	2	6	174409	174414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248625
3362	NT_187072	TGAA	2	8	174421	174428	50 %	25 %	25 %	0 %	409248625
3363	NT_187072	GGC	2	6	174489	174494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248625
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3366	NT_187072	TCG	2	6	174695	174700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248626
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3482	NT_187072	CTGC	2	8	180457	180464	0 %	25 %	25 %	50 %	409248632
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3484	NT_187072	CCAC	2	8	180541	180548	25 %	0 %	0 %	75 %	409248632
3485	NT_187072	CCG	2	6	180600	180605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248632
3486	NT_187072	CGA	2	6	180613	180618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248632
3487	NT_187072	ATTC	2	8	180653	180660	25 %	50 %	0 %	25 %	409248632
3488	NT_187072	T	6	6	180685	180690	0 %	100 %	0 %	0 %	409248632
3489	NT_187072	CGGG	2	8	180697	180704	0 %	0 %	75 %	25 %	409248632
3490	NT_187072	GCT	2	6	180716	180721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248632
3491	NT_187072	CGG	2	6	180742	180747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248632
3492	NT_187072	AAGC	2	8	180751	180758	50 %	0 %	25 %	25 %	409248632
3493	NT_187072	GA	3	6	180772	180777	50 %	0 %	50 %	0 %	409248632
3494	NT_187072	CG	3	6	180787	180792	0 %	0 %	50 %	50 %	409248632
3495	NT_187072	AGC	2	6	180822	180827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248632
3496	NT_187072	CGC	2	6	180909	180914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248633
3497	NT_187072	ACC	2	6	180979	180984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248633
3498	NT_187072	TAA	2	6	181097	181102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248633
3499	NT_187072	CGC	2	6	181109	181114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248633
3500	NT_187072	CGG	2	6	181169	181174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248633

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