MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 4380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187072	GC	3	6	54796	54801	0 %	0 %	50 %	50 %	409248514
1002	NT_187072	GCCA	2	8	54803	54810	25 %	0 %	25 %	50 %	409248514
1003	NT_187072	GCG	2	6	54892	54897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248514
1004	NT_187072	CAG	2	6	54923	54928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248514
1005	NT_187072	CGA	2	6	54961	54966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248514
1006	NT_187072	GCCGG	2	10	54969	54978	0 %	0 %	60 %	40 %	409248514
1007	NT_187072	GCC	2	6	55016	55021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248514
1008	NT_187072	AC	3	6	55076	55081	50 %	0 %	0 %	50 %	409248514
1009	NT_187072	CGAGC	2	10	55094	55103	20 %	0 %	40 %	40 %	409248514
1010	NT_187072	TCC	2	6	55140	55145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248514
1011	NT_187072	GCC	2	6	55157	55162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248514
1012	NT_187072	GCG	2	6	55203	55208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248514
1013	NT_187072	TGC	2	6	55245	55250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248514
1014	NT_187072	GTA	2	6	55308	55313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248514
1015	NT_187072	GCC	2	6	55328	55333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248514
1016	NT_187072	CGC	2	6	55370	55375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248514
1017	NT_187072	GTC	2	6	55419	55424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248514
1018	NT_187072	GCT	2	6	55433	55438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248514
1019	NT_187072	CAC	2	6	55487	55492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248514
1020	NT_187072	ATTTG	2	10	55537	55546	20 %	60 %	20 %	0 %	409248514
1021	NT_187072	GTCA	2	8	55565	55572	25 %	25 %	25 %	25 %	409248514
1022	NT_187072	GAC	2	6	55700	55705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248514
1023	NT_187072	TGC	2	6	55710	55715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248514
1024	NT_187072	CG	3	6	55725	55730	0 %	0 %	50 %	50 %	409248514
1025	NT_187072	GCC	2	6	55751	55756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248514
1026	NT_187072	GGTTCA	2	12	55768	55779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248514
1027	NT_187072	GCG	2	6	55812	55817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248514
1028	NT_187072	AGT	2	6	55839	55844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248514
1029	NT_187072	ACC	2	6	55908	55913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248514
1030	NT_187072	GCTG	2	8	56092	56099	0 %	25 %	50 %	25 %	409248514
1031	NT_187072	TGT	2	6	56215	56220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248515
1032	NT_187072	CTG	2	6	56238	56243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248515
1033	NT_187072	GCG	2	6	56247	56252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1034	NT_187072	GGC	2	6	56331	56336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1035	NT_187072	CGG	2	6	56366	56371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1036	NT_187072	GCG	2	6	56380	56385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1037	NT_187072	CGA	2	6	56411	56416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248515
1038	NT_187072	GCA	2	6	56442	56447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248515
1039	NT_187072	GCC	2	6	56481	56486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248515
1040	NT_187072	GC	5	10	56542	56551	0 %	0 %	50 %	50 %	409248515
1041	NT_187072	GCG	2	6	56655	56660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1042	NT_187072	CAC	2	6	56679	56684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248515
1043	NT_187072	GCT	2	6	56741	56746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248515
1044	NT_187072	CTGG	2	8	56748	56755	0 %	25 %	50 %	25 %	409248515
1045	NT_187072	TGC	2	6	56782	56787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248515
1046	NT_187072	GTT	2	6	56795	56800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248515
1047	NT_187072	CAC	2	6	56886	56891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248515
1048	NT_187072	CGC	2	6	57047	57052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248515
1049	NT_187072	CAC	2	6	57060	57065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248515
1050	NT_187072	CGG	2	6	57125	57130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1051	NT_187072	TCA	2	6	57187	57192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248515
1052	NT_187072	A	6	6	57192	57197	100 %	0 %	0 %	0 %	409248515
1053	NT_187072	GGC	2	6	57205	57210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1054	NT_187072	CGG	2	6	57265	57270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1055	NT_187072	GTG	2	6	57286	57291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248515
1056	NT_187072	CA	3	6	57317	57322	50 %	0 %	0 %	50 %	409248515
1057	NT_187072	CGG	2	6	57338	57343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1058	NT_187072	GCC	2	6	57414	57419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248515
1059	NT_187072	AGT	2	6	57431	57436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248515
1060	NT_187072	TCG	2	6	57472	57477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248515
1061	NT_187072	CGG	2	6	57488	57493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248515
1062	NT_187072	CG	3	6	57695	57700	0 %	0 %	50 %	50 %	409248515
1063	NT_187072	GAT	2	6	57701	57706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248515
1064	NT_187072	GTT	2	6	57717	57722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248515
1065	NT_187072	CTT	2	6	57743	57748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248515
1066	NT_187072	TGG	2	6	57773	57778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248515
1067	NT_187072	TCG	2	6	57784	57789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248515
1068	NT_187072	GC	3	6	57814	57819	0 %	0 %	50 %	50 %	409248515
1069	NT_187072	CAATTG	2	12	57845	57856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409248515
1070	NT_187072	T	7	7	58299	58305	0 %	100 %	0 %	0 %	409248516
1071	NT_187072	ATCG	2	8	58306	58313	25 %	25 %	25 %	25 %	409248516
1072	NT_187072	AT	3	6	58332	58337	50 %	50 %	0 %	0 %	409248516
1073	NT_187072	TAA	3	9	58371	58379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248516
1074	NT_187072	TGTC	2	8	58392	58399	0 %	50 %	25 %	25 %	409248516
1075	NT_187072	AT	3	6	58409	58414	50 %	50 %	0 %	0 %	409248516
1076	NT_187072	CCG	2	6	58423	58428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248516
1077	NT_187072	TCA	2	6	58437	58442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248516
1078	NT_187072	GC	3	6	58573	58578	0 %	0 %	50 %	50 %	409248516
1079	NT_187072	ATC	2	6	58609	58614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248516
1080	NT_187072	CTG	2	6	58663	58668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248516
1081	NT_187072	GTT	2	6	58674	58679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248516
1082	NT_187072	TAAT	2	8	58697	58704	50 %	50 %	0 %	0 %	409248516
1083	NT_187072	CCG	2	6	58717	58722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248516
1084	NT_187072	TGCC	2	8	58743	58750	0 %	25 %	25 %	50 %	409248516
1085	NT_187072	CAG	2	6	58849	58854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248516
1086	NT_187072	CAC	2	6	58920	58925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248516
1087	NT_187072	A	6	6	58996	59001	100 %	0 %	0 %	0 %	409248516
1088	NT_187072	CTG	2	6	59174	59179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248517
1089	NT_187072	CGCTGG	2	12	59247	59258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248517
1090	NT_187072	GC	3	6	59301	59306	0 %	0 %	50 %	50 %	409248517
1091	NT_187072	GCG	2	6	59316	59321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248517
1092	NT_187072	CTGG	2	8	59341	59348	0 %	25 %	50 %	25 %	409248517
1093	NT_187072	TAT	2	6	59353	59358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248517
1094	NT_187072	CTGG	2	8	59389	59396	0 %	25 %	50 %	25 %	409248517
1095	NT_187072	GCT	2	6	59452	59457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248517
1096	NT_187072	CGA	2	6	59526	59531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248517
1097	NT_187072	TGG	2	6	59547	59552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248517
1098	NT_187072	GCC	2	6	59617	59622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248517
1099	NT_187072	TTCC	2	8	59667	59674	0 %	50 %	0 %	50 %	409248517
1100	NT_187072	GCT	3	9	59701	59709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248517
1101	NT_187072	TGC	2	6	59721	59726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248517
1102	NT_187072	GGCT	2	8	59738	59745	0 %	25 %	50 %	25 %	409248517
1103	NT_187072	GGC	2	6	59751	59756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248517
1104	NT_187072	TGG	2	6	59862	59867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248517
1105	NT_187072	TA	3	6	59895	59900	50 %	50 %	0 %	0 %	409248517
1106	NT_187072	TAG	2	6	60025	60030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248518
1107	NT_187072	TTGCC	2	10	60041	60050	0 %	40 %	20 %	40 %	409248518
1108	NT_187072	CGTC	2	8	60059	60066	0 %	25 %	25 %	50 %	409248518
1109	NT_187072	ACG	2	6	60071	60076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248518
1110	NT_187072	CGC	2	6	60097	60102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248518
1111	NT_187072	TCGC	2	8	60142	60149	0 %	25 %	25 %	50 %	409248518
1112	NT_187072	CAG	3	9	60220	60228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248518
1113	NT_187072	GC	3	6	60253	60258	0 %	0 %	50 %	50 %	409248518
1114	NT_187072	CGCTGA	2	12	60269	60280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248518
1115	NT_187072	CCG	2	6	60281	60286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248518
1116	NT_187072	GCTG	2	8	60360	60367	0 %	25 %	50 %	25 %	409248518
1117	NT_187072	TGC	2	6	60410	60415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248518
1118	NT_187072	ATT	2	6	60436	60441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248518
1119	NT_187072	GCG	2	6	60477	60482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248518
1120	NT_187072	CAA	2	6	60553	60558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248518
1121	NT_187072	CGC	2	6	60573	60578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248518
1122	NT_187072	CGC	2	6	60603	60608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248518
1123	NT_187072	ATG	2	6	60640	60645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248518
1124	NT_187072	ATCA	2	8	60661	60668	50 %	25 %	0 %	25 %	409248518
1125	NT_187072	AGCAG	2	10	60718	60727	40 %	0 %	40 %	20 %	409248519
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