MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 4380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187072	A	7	7	26270	26276	100 %	0 %	0 %	0 %	409248488
502	NT_187072	GAA	2	6	26290	26295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248488
503	NT_187072	TCA	2	6	26304	26309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248488
504	NT_187072	TGA	2	6	26313	26318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248488
505	NT_187072	TAT	2	6	26343	26348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248488
506	NT_187072	CAT	2	6	26418	26423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248489
507	NT_187072	CGG	2	6	26477	26482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248489
508	NT_187072	GAC	2	6	26500	26505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248489
509	NT_187072	CGTT	2	8	26511	26518	0 %	50 %	25 %	25 %	409248489
510	NT_187072	TAA	2	6	26632	26637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248489
511	NT_187072	GCA	2	6	26783	26788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248490
512	NT_187072	TGA	2	6	26801	26806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248490
513	NT_187072	TCC	2	6	26817	26822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248490
514	NT_187072	GCG	2	6	26851	26856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248490
515	NT_187072	TGGCG	2	10	26891	26900	0 %	20 %	60 %	20 %	409248490
516	NT_187072	AAC	2	6	26905	26910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248490
517	NT_187072	CGC	2	6	26914	26919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248490
518	NT_187072	GC	3	6	26947	26952	0 %	0 %	50 %	50 %	409248490
519	NT_187072	GTT	2	6	26993	26998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248490
520	NT_187072	GCG	2	6	27023	27028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248490
521	NT_187072	TGTT	2	8	27082	27089	0 %	75 %	25 %	0 %	409248490
522	NT_187072	CGC	2	6	27094	27099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248490
523	NT_187072	GC	3	6	27197	27202	0 %	0 %	50 %	50 %	409248490
524	NT_187072	CGC	2	6	27221	27226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248490
525	NT_187072	TGG	2	6	27259	27264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248490
526	NT_187072	GGC	2	6	27288	27293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248490
527	NT_187072	ATG	2	6	27414	27419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248490
528	NT_187072	GCC	2	6	27458	27463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248490
529	NT_187072	CCG	2	6	27494	27499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248490
530	NT_187072	CTAT	2	8	27562	27569	25 %	50 %	0 %	25 %	409248490
531	NT_187072	TCG	2	6	27586	27591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248490
532	NT_187072	T	6	6	27651	27656	0 %	100 %	0 %	0 %	409248490
533	NT_187072	ATG	2	6	27732	27737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248490
534	NT_187072	GCT	2	6	27752	27757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248490
535	NT_187072	CAT	2	6	27779	27784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248490
536	NT_187072	GTG	2	6	27792	27797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248490
537	NT_187072	CTT	2	6	27815	27820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248490
538	NT_187072	CGG	2	6	27824	27829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248490
539	NT_187072	TCA	2	6	27901	27906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248490
540	NT_187072	TTA	2	6	27958	27963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248490
541	NT_187072	TAA	2	6	27977	27982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248490
542	NT_187072	GCA	2	6	28243	28248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248491
543	NT_187072	CGC	2	6	28371	28376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248491
544	NT_187072	GAGC	2	8	28422	28429	25 %	0 %	50 %	25 %	409248491
545	NT_187072	TAAT	2	8	28434	28441	50 %	50 %	0 %	0 %	409248491
546	NT_187072	GCC	2	6	28766	28771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248492
547	NT_187072	CGC	2	6	28860	28865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248492
548	NT_187072	TG	3	6	28889	28894	0 %	50 %	50 %	0 %	409248492
549	NT_187072	TGG	2	6	29011	29016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248492
550	NT_187072	CAGG	2	8	29122	29129	25 %	0 %	50 %	25 %	409248492
551	NT_187072	CAT	2	6	29145	29150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248492
552	NT_187072	ATT	2	6	29366	29371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248493
553	NT_187072	TCG	2	6	29372	29377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248493
554	NT_187072	ATA	2	6	29434	29439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248493
555	NT_187072	TGAA	2	8	29606	29613	50 %	25 %	25 %	0 %	409248493
556	NT_187072	GCG	2	6	29632	29637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248493
557	NT_187072	AAT	2	6	29640	29645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248493
558	NT_187072	T	6	6	29649	29654	0 %	100 %	0 %	0 %	409248493
559	NT_187072	TAA	2	6	30560	30565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248494
560	NT_187072	A	8	8	30564	30571	100 %	0 %	0 %	0 %	409248494
561	NT_187072	AGA	2	6	30581	30586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248494
562	NT_187072	GCC	2	6	30633	30638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248494
563	NT_187072	TGA	2	6	30668	30673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248494
564	NT_187072	ATA	2	6	30751	30756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248494
565	NT_187072	GACC	2	8	30770	30777	25 %	0 %	25 %	50 %	409248494
566	NT_187072	T	7	7	30785	30791	0 %	100 %	0 %	0 %	409248494
567	NT_187072	TTTCC	2	10	30798	30807	0 %	60 %	0 %	40 %	409248494
568	NT_187072	AG	3	6	30819	30824	50 %	0 %	50 %	0 %	409248494
569	NT_187072	ATC	2	6	30856	30861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248494
570	NT_187072	ATG	2	6	31002	31007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248494
571	NT_187072	ACC	2	6	31221	31226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248494
572	NT_187072	GTGGC	2	10	31367	31376	0 %	20 %	60 %	20 %	409248494
573	NT_187072	GAT	2	6	31389	31394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248494
574	NT_187072	GCC	2	6	31415	31420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248494
575	NT_187072	ATCA	2	8	31477	31484	50 %	25 %	0 %	25 %	409248494
576	NT_187072	CCG	2	6	31503	31508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248494
577	NT_187072	GC	4	8	31530	31537	0 %	0 %	50 %	50 %	409248494
578	NT_187072	TGA	2	6	31559	31564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248494
579	NT_187072	TCG	2	6	31568	31573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248494
580	NT_187072	ACT	2	6	31591	31596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248494
581	NT_187072	TTG	2	6	31681	31686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248494
582	NT_187072	GAT	2	6	31775	31780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248494
583	NT_187072	TAA	2	6	31805	31810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248494
584	NT_187072	GAA	2	6	31878	31883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248494
585	NT_187072	A	6	6	31937	31942	100 %	0 %	0 %	0 %	409248494
586	NT_187072	A	6	6	32059	32064	100 %	0 %	0 %	0 %	409248494
587	NT_187072	GAT	2	6	32132	32137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248494
588	NT_187072	ATA	2	6	32185	32190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248494
589	NT_187072	TTA	2	6	32212	32217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248494
590	NT_187072	TGC	2	6	32276	32281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248494
591	NT_187072	ATGA	2	8	32316	32323	50 %	25 %	25 %	0 %	409248494
592	NT_187072	ATT	2	6	33007	33012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248495
593	NT_187072	CAT	2	6	33031	33036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248495
594	NT_187072	CAGG	2	8	33064	33071	25 %	0 %	50 %	25 %	409248495
595	NT_187072	GCC	2	6	33136	33141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248495
596	NT_187072	AGG	2	6	33146	33151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248495
597	NT_187072	CG	4	8	33158	33165	0 %	0 %	50 %	50 %	409248495
598	NT_187072	GCA	2	6	33180	33185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248495
599	NT_187072	CCT	2	6	33208	33213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248495
600	NT_187072	ATGG	2	8	33225	33232	25 %	25 %	50 %	0 %	409248495
601	NT_187072	CGG	2	6	33315	33320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248495
602	NT_187072	GCC	2	6	33417	33422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248495
603	NT_187072	TGCAC	2	10	33431	33440	20 %	20 %	20 %	40 %	409248495
604	NT_187072	GAC	2	6	33454	33459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248495
605	NT_187072	CAGGCG	2	12	33466	33477	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248495
606	NT_187072	AGG	2	6	33509	33514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248495
607	NT_187072	ATCT	2	8	33551	33558	25 %	50 %	0 %	25 %	409248496
608	NT_187072	CGG	2	6	33564	33569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248496
609	NT_187072	GACG	2	8	33667	33674	25 %	0 %	50 %	25 %	409248496
610	NT_187072	CGT	2	6	33706	33711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248496
611	NT_187072	TGT	2	6	33717	33722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248496
612	NT_187072	GC	3	6	33766	33771	0 %	0 %	50 %	50 %	409248496
613	NT_187072	GGC	3	9	33782	33790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248496
614	NT_187072	TGG	2	6	33801	33806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248496
615	NT_187072	GCG	2	6	33810	33815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248496
616	NT_187072	AATG	2	8	33919	33926	50 %	25 %	25 %	0 %	409248496
617	NT_187072	TGG	2	6	34005	34010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248496
618	NT_187072	GAT	2	6	34012	34017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248496
619	NT_187072	GCT	2	6	34021	34026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248496
620	NT_187072	GCC	2	6	34028	34033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248496
621	NT_187072	GCG	2	6	34035	34040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248496
622	NT_187072	CCA	2	6	34044	34049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248496
623	NT_187072	TGG	2	6	34101	34106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248496
624	NT_187072	GCGCT	2	10	34136	34145	0 %	20 %	40 %	40 %	409248496
625	NT_187072	CG	3	6	34150	34155	0 %	0 %	50 %	50 %	409248496
626	NT_187072	GGCG	2	8	34261	34268	0 %	0 %	75 %	25 %	409248496
627	NT_187072	CTG	2	6	34271	34276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248496
628	NT_187072	TGC	2	6	34332	34337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248496
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652	NT_187072	TAAA	2	8	35688	35695	75 %	25 %	0 %	0 %	409248497
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752	NT_187072	TGT	2	6	41644	41649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248503
753	NT_187072	GTA	2	6	41717	41722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248503
754	NT_187072	GCT	2	6	41753	41758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248503
755	NT_187072	TGCGT	2	10	41844	41853	0 %	40 %	40 %	20 %	409248503
756	NT_187072	TACT	2	8	41874	41881	25 %	50 %	0 %	25 %	409248503
757	NT_187072	TGC	2	6	41964	41969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248503
758	NT_187072	GCCT	2	8	42065	42072	0 %	25 %	25 %	50 %	409248503
759	NT_187072	ATA	2	6	42102	42107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248503
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762	NT_187072	TTC	2	6	42335	42340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248503
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771	NT_187072	TGA	2	6	42852	42857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248503
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775	NT_187072	TGA	2	6	43207	43212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248504
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788	NT_187072	ACC	2	6	43803	43808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248504
789	NT_187072	ACC	2	6	43818	43823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248504
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