MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 10290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022785	CGGCG	2	10	868	877	0 %	0 %	60 %	40 %	557683038
2	NC_022785	GTCGG	2	10	1373	1382	0 %	20 %	60 %	20 %	557683039
3	NC_022785	GCCGC	2	10	1771	1780	0 %	0 %	40 %	60 %	557683039
4	NC_022785	AACTC	2	10	3017	3026	40 %	20 %	0 %	40 %	557683039
5	NC_022785	GCTCC	2	10	3105	3114	0 %	20 %	20 %	60 %	557683039
6	NC_022785	GTGCG	2	10	4228	4237	0 %	20 %	60 %	20 %	557683040
7	NC_022785	GGGCA	2	10	6295	6304	20 %	0 %	60 %	20 %	557683043
8	NC_022785	AGGCG	2	10	6574	6583	20 %	0 %	60 %	20 %	557683044
9	NC_022785	GGGCC	2	10	7091	7100	0 %	0 %	60 %	40 %	557683044
10	NC_022785	GCGGG	3	15	7410	7424	0 %	0 %	80 %	20 %	557683045
11	NC_022785	GTCCA	2	10	8024	8033	20 %	20 %	20 %	40 %	557683045
12	NC_022785	AGCGC	2	10	8343	8352	20 %	0 %	40 %	40 %	557683045
13	NC_022785	CCCGC	2	10	9496	9505	0 %	0 %	20 %	80 %	557683046
14	NC_022785	CCGGG	2	10	9597	9606	0 %	0 %	60 %	40 %	557683046
15	NC_022785	CGGCC	2	10	9873	9882	0 %	0 %	40 %	60 %	557683046
16	NC_022785	GCCCG	2	10	9910	9919	0 %	0 %	40 %	60 %	557683046
17	NC_022785	ATCCC	2	10	10369	10378	20 %	20 %	0 %	60 %	557683047
18	NC_022785	ACTCC	2	10	10647	10656	20 %	20 %	0 %	60 %	557683048
19	NC_022785	AGCCC	2	10	12022	12031	20 %	0 %	20 %	60 %	557683049
20	NC_022785	CGGAC	2	10	13441	13450	20 %	0 %	40 %	40 %	557683050
21	NC_022785	CTGGG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	557683050
22	NC_022785	GCCAA	2	10	14088	14097	40 %	0 %	20 %	40 %	557683050
23	NC_022785	GGCCA	2	10	14327	14336	20 %	0 %	40 %	40 %	557683050
24	NC_022785	CTGGG	2	10	14351	14360	0 %	20 %	60 %	20 %	557683050
25	NC_022785	GTGAA	2	10	15458	15467	40 %	20 %	40 %	0 %	557683051
26	NC_022785	ATCGA	2	10	28639	28648	40 %	20 %	20 %	20 %	557683062
27	NC_022785	CCCGC	2	10	36917	36926	0 %	0 %	20 %	80 %	557683065
28	NC_022785	CGGTC	2	10	39239	39248	0 %	20 %	40 %	40 %	557683069
29	NC_022785	CGGTG	2	10	39434	39443	0 %	20 %	60 %	20 %	557683069
30	NC_022785	GCGGG	2	10	39733	39742	0 %	0 %	80 %	20 %	557683069
31	NC_022785	GCCCG	2	10	40172	40181	0 %	0 %	40 %	60 %	557683070
32	NC_022785	GCCGG	2	10	40233	40242	0 %	0 %	60 %	40 %	557683070
33	NC_022785	GCATG	2	10	46449	46458	20 %	20 %	40 %	20 %	557683075
34	NC_022785	CGGAC	2	10	48070	48079	20 %	0 %	40 %	40 %	557683076
35	NC_022785	CGGAT	2	10	49692	49701	20 %	20 %	40 %	20 %	557683076
36	NC_022785	CAGAA	2	10	50102	50111	60 %	0 %	20 %	20 %	557683076
37	NC_022785	GGGCC	2	10	50913	50922	0 %	0 %	60 %	40 %	557683077
38	NC_022785	AGTCC	2	10	51172	51181	20 %	20 %	20 %	40 %	557683077
39	NC_022785	CCCCG	2	10	53498	53507	0 %	0 %	20 %	80 %	557683077
40	NC_022785	CGGCT	2	10	53789	53798	0 %	20 %	40 %	40 %	557683078
41	NC_022785	ATGGA	2	10	53855	53864	40 %	20 %	40 %	0 %	557683078
42	NC_022785	CTCGG	2	10	56488	56497	0 %	20 %	40 %	40 %	557683080
43	NC_022785	ACCGC	2	10	56600	56609	20 %	0 %	20 %	60 %	557683080
44	NC_022785	CACCC	2	10	57591	57600	20 %	0 %	0 %	80 %	557683080
45	NC_022785	CAGGT	2	10	61718	61727	20 %	20 %	40 %	20 %	557683086
46	NC_022785	GCGCC	2	10	64007	64016	0 %	0 %	40 %	60 %	557683088
47	NC_022785	GTGGG	2	10	65351	65360	0 %	20 %	80 %	0 %	557683090
48	NC_022785	GTACG	2	10	65552	65561	20 %	20 %	40 %	20 %	557683090
49	NC_022785	GTCCG	2	10	67123	67132	0 %	20 %	40 %	40 %	557683092
50	NC_022785	TGGCC	2	10	67532	67541	0 %	20 %	40 %	40 %	557683092
51	NC_022785	AGCCG	2	10	68015	68024	20 %	0 %	40 %	40 %	557683092
52	NC_022785	GGACG	2	10	68084	68093	20 %	0 %	60 %	20 %	557683092
53	NC_022785	CGGGC	2	10	68156	68165	0 %	0 %	60 %	40 %	557683092
54	NC_022785	ACCGG	2	10	68928	68937	20 %	0 %	40 %	40 %	557683092
55	NC_022785	CCGAG	2	10	70904	70913	20 %	0 %	40 %	40 %	557683094
56	NC_022785	GTCGG	2	10	71544	71553	0 %	20 %	60 %	20 %	557683095
57	NC_022785	GCCGT	2	10	73402	73411	0 %	20 %	40 %	40 %	557683096
58	NC_022785	GCCAC	2	10	73673	73682	20 %	0 %	20 %	60 %	557683096
59	NC_022785	GCGGT	2	10	74488	74497	0 %	20 %	60 %	20 %	557683096
60	NC_022785	GAGCA	2	10	77329	77338	40 %	0 %	40 %	20 %	557683097
61	NC_022785	TCCGG	2	10	77787	77796	0 %	20 %	40 %	40 %	557683097
62	NC_022785	GCCCC	2	10	78833	78842	0 %	0 %	20 %	80 %	557683097
63	NC_022785	CGGCG	2	10	79706	79715	0 %	0 %	60 %	40 %	557683097
64	NC_022785	CCGCG	2	10	79917	79926	0 %	0 %	40 %	60 %	557683097
65	NC_022785	CGGCG	2	10	83183	83192	0 %	0 %	60 %	40 %	557683097
66	NC_022785	CGGCC	2	10	83691	83700	0 %	0 %	40 %	60 %	557683097
67	NC_022785	GCCGC	2	10	83741	83750	0 %	0 %	40 %	60 %	557683097
68	NC_022785	CCGGT	2	10	84343	84352	0 %	20 %	40 %	40 %	557683097
69	NC_022785	TTCCA	2	10	85507	85516	20 %	40 %	0 %	40 %	557683097
70	NC_022785	GACGG	2	10	85563	85572	20 %	0 %	60 %	20 %	557683097
71	NC_022785	GCGCG	2	10	86570	86579	0 %	0 %	60 %	40 %	557683097
72	NC_022785	CGGCC	2	10	86919	86928	0 %	0 %	40 %	60 %	557683097
73	NC_022785	GCCGC	2	10	86969	86978	0 %	0 %	40 %	60 %	557683097
74	NC_022785	GGTCC	2	10	91134	91143	0 %	20 %	40 %	40 %	557683097
75	NC_022785	ACCGC	2	10	91556	91565	20 %	0 %	20 %	60 %	557683097
76	NC_022785	TCGGC	2	10	91646	91655	0 %	20 %	40 %	40 %	557683097
77	NC_022785	ACCGC	2	10	93469	93478	20 %	0 %	20 %	60 %	557683097
78	NC_022785	CCGGT	2	10	94054	94063	0 %	20 %	40 %	40 %	557683097
79	NC_022785	CCAGC	2	10	94145	94154	20 %	0 %	20 %	60 %	557683097
80	NC_022785	CCGCG	2	10	96204	96213	0 %	0 %	40 %	60 %	557683097
81	NC_022785	GGACC	2	10	97364	97373	20 %	0 %	40 %	40 %	557683098
82	NC_022785	GGCCC	2	10	98771	98780	0 %	0 %	40 %	60 %	557683099
83	NC_022785	CGGTG	2	10	100027	100036	0 %	20 %	60 %	20 %	557683100
84	NC_022785	GGCTC	2	10	100251	100260	0 %	20 %	40 %	40 %	557683101
85	NC_022785	CACCG	2	10	104054	104063	20 %	0 %	20 %	60 %	557683104
86	NC_022785	GGTCC	2	10	104360	104369	0 %	20 %	40 %	40 %	557683104
87	NC_022785	CGCGT	2	10	106779	106788	0 %	20 %	40 %	40 %	557683106
88	NC_022785	CTCGT	2	10	108582	108591	0 %	40 %	20 %	40 %	557683106
89	NC_022785	GCGCG	2	10	108827	108836	0 %	0 %	60 %	40 %	557683106
90	NC_022785	CACCC	2	10	109097	109106	20 %	0 %	0 %	80 %	557683106
91	NC_022785	ACACC	2	10	109579	109588	40 %	0 %	0 %	60 %	557683106
92	NC_022785	CCACC	2	10	109891	109900	20 %	0 %	0 %	80 %	557683106
93	NC_022785	CGTCC	2	10	110363	110372	0 %	20 %	20 %	60 %	557683106
94	NC_022785	ACCGC	2	10	110509	110518	20 %	0 %	20 %	60 %	557683106
95	NC_022785	GCCCG	2	10	110746	110755	0 %	0 %	40 %	60 %	557683106
96	NC_022785	GCGTG	2	10	111301	111310	0 %	20 %	60 %	20 %	557683106
97	NC_022785	CCCCA	2	10	112742	112751	20 %	0 %	0 %	80 %	557683106
98	NC_022785	CACCG	2	10	113450	113459	20 %	0 %	20 %	60 %	557683106
99	NC_022785	TCCGC	2	10	115633	115642	0 %	20 %	20 %	60 %	557683106
100	NC_022785	ACGCG	2	10	118683	118692	20 %	0 %	40 %	40 %	557683107
101	NC_022785	CACTC	2	10	118702	118711	20 %	20 %	0 %	60 %	557683107
102	NC_022785	GCTCA	2	10	119274	119283	20 %	20 %	20 %	40 %	557683107
103	NC_022785	CGCGC	2	10	119669	119678	0 %	0 %	40 %	60 %	557683107
104	NC_022785	CACCG	2	10	123732	123741	20 %	0 %	20 %	60 %	557683107
105	NC_022785	GCCGC	2	10	124264	124273	0 %	0 %	40 %	60 %	557683107
106	NC_022785	CGGCG	2	10	124284	124293	0 %	0 %	60 %	40 %	557683107
107	NC_022785	CGCGC	2	10	124346	124355	0 %	0 %	40 %	60 %	557683107
108	NC_022785	TCCAC	2	10	124379	124388	20 %	20 %	0 %	60 %	557683107
109	NC_022785	GCACT	2	10	124534	124543	20 %	20 %	20 %	40 %	557683107
110	NC_022785	CCCCG	2	10	125942	125951	0 %	0 %	20 %	80 %	557683107
111	NC_022785	GAGGC	2	10	127075	127084	20 %	0 %	60 %	20 %	557683107
112	NC_022785	CACCG	2	10	128472	128481	20 %	0 %	20 %	60 %	557683107
113	NC_022785	CCCCG	2	10	128557	128566	0 %	0 %	20 %	80 %	557683107
114	NC_022785	CGACC	2	10	129054	129063	20 %	0 %	20 %	60 %	557683107
115	NC_022785	TGGTG	2	10	129647	129656	0 %	40 %	60 %	0 %	557683107
116	NC_022785	GCTCA	2	10	130700	130709	20 %	20 %	20 %	40 %	557683108
117	NC_022785	CGACC	2	10	130786	130795	20 %	0 %	20 %	60 %	557683108
118	NC_022785	CACGA	2	10	131249	131258	40 %	0 %	20 %	40 %	557683108
119	NC_022785	CCAGC	2	10	131603	131612	20 %	0 %	20 %	60 %	557683109
120	NC_022785	TGGCC	2	10	132879	132888	0 %	20 %	40 %	40 %	557683110
121	NC_022785	GTGGG	2	10	133139	133148	0 %	20 %	80 %	0 %	557683111
122	NC_022785	GTGCC	2	10	133358	133367	0 %	20 %	40 %	40 %	557683111
123	NC_022785	GGTCG	2	10	133973	133982	0 %	20 %	60 %	20 %	557683111
124	NC_022785	GTCCT	2	10	138326	138335	0 %	40 %	20 %	40 %	557683116
125	NC_022785	GCACG	2	10	138589	138598	20 %	0 %	40 %	40 %	557683116
126	NC_022785	GGGGC	2	10	139523	139532	0 %	0 %	80 %	20 %	557683117
127	NC_022785	CGATC	2	10	144574	144583	20 %	20 %	20 %	40 %	557683121
128	NC_022785	CCGCG	2	10	147366	147375	0 %	0 %	40 %	60 %	557683123
129	NC_022785	CCGGC	2	10	147594	147603	0 %	0 %	40 %	60 %	557683124
130	NC_022785	TCGCG	2	10	150417	150426	0 %	20 %	40 %	40 %	557683127
131	NC_022785	CGCGA	2	10	150634	150643	20 %	0 %	40 %	40 %	557683127
132	NC_022785	TGCGC	2	10	151935	151944	0 %	20 %	40 %	40 %	557683128
133	NC_022785	TGCCC	2	10	153470	153479	0 %	20 %	20 %	60 %	557683130
134	NC_022785	CCGGC	2	10	153819	153828	0 %	0 %	40 %	60 %	557683131
135	NC_022785	CGGCC	2	10	156818	156827	0 %	0 %	40 %	60 %	557683134
136	NC_022785	GCCCG	2	10	158721	158730	0 %	0 %	40 %	60 %	557683136
137	NC_022785	TGCCA	2	10	160586	160595	20 %	20 %	20 %	40 %	557683139
138	NC_022785	CGGTG	2	10	160690	160699	0 %	20 %	60 %	20 %	557683139
139	NC_022785	TCGAC	2	10	161211	161220	20 %	20 %	20 %	40 %	557683139
140	NC_022785	AGTGC	2	10	161274	161283	20 %	20 %	40 %	20 %	557683139
141	NC_022785	CTCCC	2	10	161383	161392	0 %	20 %	0 %	80 %	557683139
142	NC_022785	TCCGC	2	10	162146	162155	0 %	20 %	20 %	60 %	557683140
143	NC_022785	CCCGG	2	10	163988	163997	0 %	0 %	40 %	60 %	557683141
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147	NC_022785	TCCGC	2	10	172534	172543	0 %	20 %	20 %	60 %	557683149
148	NC_022785	TGAGC	2	10	172564	172573	20 %	20 %	40 %	20 %	557683149
149	NC_022785	CGCGG	2	10	173049	173058	0 %	0 %	60 %	40 %	557683150
150	NC_022785	AGCGG	2	10	173366	173375	20 %	0 %	60 %	20 %	557683150
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153	NC_022785	CCCTG	2	10	177052	177061	0 %	20 %	20 %	60 %	557683153
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167	NC_022785	CCCCG	2	10	204226	204235	0 %	0 %	20 %	80 %	557683180
168	NC_022785	CCGAG	2	10	209247	209256	20 %	0 %	40 %	40 %	557683184
169	NC_022785	CCCGG	2	10	209410	209419	0 %	0 %	40 %	60 %	557683184
170	NC_022785	CCGGC	2	10	210366	210375	0 %	0 %	40 %	60 %	557683186
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174	NC_022785	GCCCG	2	10	211823	211832	0 %	0 %	40 %	60 %	557683187
175	NC_022785	TCGCT	2	10	212640	212649	0 %	40 %	20 %	40 %	557683188
176	NC_022785	CCGGC	2	10	213125	213134	0 %	0 %	40 %	60 %	557683190
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250	NC_022785	GCCGT	2	10	319618	319627	0 %	20 %	40 %	40 %	557683291
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252	NC_022785	CGCGG	2	10	320939	320948	0 %	0 %	60 %	40 %	557683292
253	NC_022785	CCGCC	2	10	321684	321693	0 %	0 %	20 %	80 %	557683293
254	NC_022785	GCGCG	2	10	326293	326302	0 %	0 %	60 %	40 %	557683296
255	NC_022785	GGCAA	2	10	327376	327385	40 %	0 %	40 %	20 %	557683297
256	NC_022785	GGCCG	2	10	328924	328933	0 %	0 %	60 %	40 %	557683300
257	NC_022785	TGTCG	2	10	329359	329368	0 %	40 %	40 %	20 %	557683300
258	NC_022785	TGAGC	2	10	330225	330234	20 %	20 %	40 %	20 %	557683301
259	NC_022785	GGCGA	2	10	331403	331412	20 %	0 %	60 %	20 %	557683302
260	NC_022785	CACAC	2	10	333939	333948	40 %	0 %	0 %	60 %	557683305
261	NC_022785	GCGCG	2	10	334106	334115	0 %	0 %	60 %	40 %	557683305
262	NC_022785	AGGTC	2	10	334864	334873	20 %	20 %	40 %	20 %	557683306
263	NC_022785	CTTCG	2	10	336423	336432	0 %	40 %	20 %	40 %	557683307
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