MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 224707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022785	GAC	2	6	558	563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683038
2	NC_022785	TGG	2	6	565	570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683038
3	NC_022785	CGG	2	6	682	687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683038
4	NC_022785	TGG	2	6	700	705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683038
5	NC_022785	GCG	2	6	728	733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683038
6	NC_022785	CGG	2	6	734	739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683038
7	NC_022785	GCT	2	6	753	758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683038
8	NC_022785	GAC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683038
9	NC_022785	CGG	2	6	1019	1024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683038
10	NC_022785	GCC	2	6	1279	1284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
11	NC_022785	AGC	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
12	NC_022785	CAC	3	9	1452	1460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683039
13	NC_022785	GCA	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
14	NC_022785	GGA	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
15	NC_022785	GCT	2	6	1992	1997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
16	NC_022785	GCT	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
17	NC_022785	AGA	2	6	2027	2032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683039
18	NC_022785	GAG	2	6	2068	2073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
19	NC_022785	CCG	3	9	2105	2113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
20	NC_022785	GGA	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
21	NC_022785	CTC	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683039
22	NC_022785	GGA	2	6	2202	2207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
23	NC_022785	GTC	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
24	NC_022785	CCG	2	6	2221	2226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
25	NC_022785	CGG	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683039
26	NC_022785	TCG	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
27	NC_022785	ATC	3	9	2506	2514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683039
28	NC_022785	TCC	2	6	2588	2593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683039
29	NC_022785	AGC	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
30	NC_022785	GCC	2	6	2666	2671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
31	NC_022785	GGA	2	6	2724	2729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683039
32	NC_022785	TGA	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683039
33	NC_022785	GCA	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
34	NC_022785	CGC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
35	NC_022785	CGC	2	6	2814	2819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
36	NC_022785	TCA	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683039
37	NC_022785	CTG	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
38	NC_022785	CAG	2	6	2989	2994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
39	NC_022785	GCT	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
40	NC_022785	CGC	2	6	3099	3104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
41	NC_022785	CGG	2	6	3118	3123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683039
42	NC_022785	ACC	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683039
43	NC_022785	CGC	2	6	3140	3145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
44	NC_022785	GGC	2	6	3220	3225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683039
45	NC_022785	TCG	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
46	NC_022785	CGT	2	6	3384	3389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683039
47	NC_022785	CGA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
48	NC_022785	AGC	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
49	NC_022785	CGG	2	6	3524	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683039
50	NC_022785	CGA	2	6	3539	3544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
51	NC_022785	GCA	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683039
52	NC_022785	CGC	2	6	3753	3758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683039
53	NC_022785	AGC	2	6	3888	3893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683040
54	NC_022785	CCA	2	6	3993	3998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683040
55	NC_022785	GCC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683040
56	NC_022785	GGA	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683040
57	NC_022785	GAC	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683040
58	NC_022785	TGC	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683040
59	NC_022785	GGA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683041
60	NC_022785	CGC	2	6	5258	5263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683042
61	NC_022785	AGC	3	9	5284	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683042
62	NC_022785	GCC	2	6	5344	5349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683042
63	NC_022785	CGT	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683043
64	NC_022785	GCG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
65	NC_022785	GGC	2	6	5561	5566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
66	NC_022785	GCA	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683043
67	NC_022785	GCG	2	6	5627	5632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
68	NC_022785	GGT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
69	NC_022785	GCA	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683043
70	NC_022785	TCG	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683043
71	NC_022785	CGC	2	6	5875	5880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683043
72	NC_022785	GCC	2	6	5943	5948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683043
73	NC_022785	GAT	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683043
74	NC_022785	GCG	2	6	5961	5966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
75	NC_022785	CGG	2	6	6051	6056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
76	NC_022785	GGC	2	6	6102	6107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
77	NC_022785	AGT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683043
78	NC_022785	AGG	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683043
79	NC_022785	GCG	2	6	6247	6252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
80	NC_022785	GGC	2	6	6319	6324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
81	NC_022785	GCC	2	6	6343	6348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683043
82	NC_022785	AAG	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683043
83	NC_022785	TGG	2	6	6420	6425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
84	NC_022785	CGG	2	6	6460	6465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
85	NC_022785	GTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
86	NC_022785	CGT	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683043
87	NC_022785	GCG	2	6	6534	6539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
88	NC_022785	GCG	2	6	6545	6550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683043
89	NC_022785	TGG	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683043
90	NC_022785	GCA	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683044
91	NC_022785	GGC	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683044
92	NC_022785	GCG	2	6	6693	6698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683044
93	NC_022785	GTC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683044
94	NC_022785	TGC	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683044
95	NC_022785	GAG	2	6	6822	6827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683044
96	NC_022785	GCA	2	6	6844	6849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683044
97	NC_022785	CGC	2	6	6865	6870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683044
98	NC_022785	CGA	2	6	6871	6876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683044
99	NC_022785	GAT	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683044
100	NC_022785	TCG	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683044
101	NC_022785	CAG	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683044
102	NC_022785	CGG	2	6	7129	7134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683044
103	NC_022785	GCC	2	6	7187	7192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683044
104	NC_022785	CAT	2	6	7202	7207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683044
105	NC_022785	GGC	2	6	7214	7219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683044
106	NC_022785	GTG	2	6	7263	7268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683044
107	NC_022785	TCG	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683045
108	NC_022785	GTG	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683045
109	NC_022785	CGT	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683045
110	NC_022785	GCG	2	6	7478	7483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683045
111	NC_022785	GCC	2	6	7578	7583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683045
112	NC_022785	GCG	3	9	7604	7612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683045
113	NC_022785	CTT	2	6	7642	7647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683045
114	NC_022785	CGG	2	6	7652	7657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683045
115	NC_022785	GGC	2	6	7747	7752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683045
116	NC_022785	GGT	2	6	7770	7775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683045
117	NC_022785	TGG	2	6	7778	7783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683045
118	NC_022785	GGT	2	6	7870	7875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683045
119	NC_022785	TCC	2	6	7895	7900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683045
120	NC_022785	CCA	2	6	8014	8019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683045
121	NC_022785	AGC	2	6	8063	8068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683045
122	NC_022785	TCC	2	6	8210	8215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683045
123	NC_022785	AGG	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683045
124	NC_022785	CGG	2	6	8241	8246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683045
125	NC_022785	GCC	2	6	8302	8307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683045
126	NC_022785	TGG	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683045
127	NC_022785	GCC	2	6	8558	8563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683045
128	NC_022785	CCG	2	6	8694	8699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683045
129	NC_022785	CAG	2	6	8722	8727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683045
130	NC_022785	GCG	2	6	8728	8733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683045
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132	NC_022785	GCG	2	6	8792	8797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683045
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250	NC_022785	CGA	2	6	20911	20916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683056
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252	NC_022785	TGG	2	6	20971	20976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683056
253	NC_022785	CGG	2	6	21064	21069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683056
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255	NC_022785	GCC	2	6	21327	21332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683057
256	NC_022785	TCG	2	6	21353	21358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683057
257	NC_022785	CAT	2	6	21364	21369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683057
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259	NC_022785	GAT	2	6	21442	21447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683057
260	NC_022785	GTC	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683057
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