MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 25897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022665	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587608
2	NC_022665	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587608
3	NC_022665	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
4	NC_022665	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587608
5	NC_022665	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587608
6	NC_022665	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587608
7	NC_022665	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587608
8	NC_022665	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587608
9	NC_022665	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587608
10	NC_022665	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587608
11	NC_022665	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587608
12	NC_022665	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
13	NC_022665	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
14	NC_022665	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587608
15	NC_022665	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587608
16	NC_022665	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587608
17	NC_022665	TAA	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
18	NC_022665	TTA	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587609
19	NC_022665	AAG	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587609
20	NC_022665	GTC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587609
21	NC_022665	TGA	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587609
22	NC_022665	TGT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587609
23	NC_022665	GAT	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587609
24	NC_022665	TCT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
25	NC_022665	AAT	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
26	NC_022665	TTA	2	6	2258	2263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587609
27	NC_022665	AAC	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587609
28	NC_022665	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
29	NC_022665	TAA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
30	NC_022665	TGT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587609
31	NC_022665	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
32	NC_022665	AAT	2	6	2612	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
33	NC_022665	AGT	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587610
34	NC_022665	TTA	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
35	NC_022665	ATT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
36	NC_022665	TGA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587610
37	NC_022665	TGG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587610
38	NC_022665	TTA	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
39	NC_022665	TCT	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587610
40	NC_022665	ATT	3	9	3557	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
41	NC_022665	AGG	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587610
42	NC_022665	TCA	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587611
43	NC_022665	TAA	2	6	3722	3727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587611
44	NC_022665	ATG	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587611
45	NC_022665	TGG	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587612
46	NC_022665	AAC	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587612
47	NC_022665	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587612
48	NC_022665	TGT	2	6	4248	4253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587612
49	NC_022665	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587612
50	NC_022665	ATT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587612
51	NC_022665	CAG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
52	NC_022665	TCG	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587613
53	NC_022665	TCA	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587613
54	NC_022665	CAA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587613
55	NC_022665	AGA	2	6	4932	4937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
56	NC_022665	GAA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
57	NC_022665	TGA	2	6	5040	5045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587613
58	NC_022665	GCA	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
59	NC_022665	GTG	3	9	5122	5130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587613
60	NC_022665	GAA	3	9	5146	5154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
61	NC_022665	CGA	2	6	5166	5171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
62	NC_022665	CAG	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
63	NC_022665	AGG	2	6	5288	5293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587613
64	NC_022665	CTC	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587613
65	NC_022665	GAT	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587613
66	NC_022665	AAG	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
67	NC_022665	GAA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
68	NC_022665	CAT	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587613
69	NC_022665	TGC	2	6	5748	5753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587614
70	NC_022665	TTA	2	6	5911	5916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587614
71	NC_022665	TAG	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587614
72	NC_022665	GAC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587614
73	NC_022665	TGG	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587614
74	NC_022665	GAA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587614
75	NC_022665	GAT	2	6	6206	6211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587614
76	NC_022665	TTA	3	9	6322	6330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587615
77	NC_022665	ATG	2	6	6419	6424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
78	NC_022665	ATT	2	6	6454	6459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587615
79	NC_022665	GAT	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
80	NC_022665	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587615
81	NC_022665	TAG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
82	NC_022665	TTG	2	6	7105	7110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
83	NC_022665	GAT	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
84	NC_022665	TTG	2	6	7201	7206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
85	NC_022665	GAT	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
86	NC_022665	CTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587615
87	NC_022665	CCA	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587615
88	NC_022665	GTT	2	6	7441	7446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
89	NC_022665	GCA	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587615
90	NC_022665	TAG	2	6	7538	7543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
91	NC_022665	TCA	2	6	7613	7618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587615
92	NC_022665	TGT	2	6	7725	7730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
93	NC_022665	ATT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587615
94	NC_022665	TCT	2	6	7860	7865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587615
95	NC_022665	TAA	2	6	7905	7910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587615
96	NC_022665	GGA	2	6	7962	7967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587615
97	NC_022665	GAT	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
98	NC_022665	TGA	3	9	8034	8042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
99	NC_022665	ACT	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587615
100	NC_022665	TGA	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
101	NC_022665	TAG	2	6	8156	8161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
102	NC_022665	ATG	2	6	8219	8224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
103	NC_022665	TGT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
104	NC_022665	CTA	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587615
105	NC_022665	CAA	2	6	8882	8887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587615
106	NC_022665	GTG	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587615
107	NC_022665	TGC	2	6	9159	9164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587615
108	NC_022665	AGA	2	6	9260	9265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587615
109	NC_022665	AAG	2	6	9395	9400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587615
110	NC_022665	GTA	2	6	9433	9438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
111	NC_022665	GAC	2	6	9506	9511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587615
112	NC_022665	TGT	2	6	9636	9641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587615
113	NC_022665	TAA	2	6	9943	9948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587616
114	NC_022665	ACT	2	6	9949	9954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587616
115	NC_022665	GAA	2	6	10049	10054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587616
116	NC_022665	AAT	2	6	10074	10079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587617
117	NC_022665	CAA	2	6	10131	10136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587617
118	NC_022665	TTG	2	6	10204	10209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587617
119	NC_022665	CAG	3	9	10227	10235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587617
120	NC_022665	GAA	2	6	10269	10274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587617
121	NC_022665	GCA	2	6	10335	10340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587617
122	NC_022665	AAG	2	6	10372	10377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587617
123	NC_022665	TGA	2	6	10459	10464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587618
124	NC_022665	AGA	2	6	10471	10476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587618
125	NC_022665	AGA	2	6	10507	10512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587618
126	NC_022665	GGT	2	6	10588	10593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587619
127	NC_022665	AAG	2	6	10629	10634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587619
128	NC_022665	GAA	2	6	10727	10732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587619
129	NC_022665	CTA	2	6	10859	10864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587619
130	NC_022665	TGA	2	6	10867	10872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587619
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377	NC_022665	CCA	2	6	33450	33455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587634
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380	NC_022665	TGC	2	6	33576	33581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587634
381	NC_022665	TGG	2	6	33611	33616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587634
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384	NC_022665	GGC	2	6	33876	33881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556587634
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489	NC_022665	ACC	2	6	41439	41444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587640
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499	NC_022665	TGA	2	6	42342	42347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587641
500	NC_022665	CTC	2	6	42464	42469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587641

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