MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022665	TCCAA	2	10	213406	213415	40 %	20 %	0 %	40 %	556587812
3502	NC_022665	AAG	2	6	213428	213433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587812
3503	NC_022665	AG	3	6	213473	213478	50 %	0 %	50 %	0 %	556587812
3504	NC_022665	CTA	2	6	213479	213484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587812
3505	NC_022665	CCA	2	6	213562	213567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587812
3506	NC_022665	ACC	2	6	213681	213686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587812
3507	NC_022665	TTG	2	6	213916	213921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587812
3508	NC_022665	GCTC	2	8	214399	214406	0 %	25 %	25 %	50 %	556587813
3509	NC_022665	GGA	2	6	214537	214542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587813
3510	NC_022665	CCT	2	6	214585	214590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587813
3511	NC_022665	ATAG	2	8	214599	214606	50 %	25 %	25 %	0 %	556587813
3512	NC_022665	AGAC	2	8	214626	214633	50 %	0 %	25 %	25 %	556587813
3513	NC_022665	TCC	2	6	214771	214776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587813
3514	NC_022665	A	6	6	214779	214784	100 %	0 %	0 %	0 %	556587813
3515	NC_022665	CAT	2	6	214838	214843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587813
3516	NC_022665	ATTG	2	8	214981	214988	25 %	50 %	25 %	0 %	556587813
3517	NC_022665	ATTT	2	8	217073	217080	25 %	75 %	0 %	0 %	556587814
3518	NC_022665	CTT	2	6	217110	217115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587814
3519	NC_022665	TCTCT	2	10	217119	217128	0 %	60 %	0 %	40 %	556587814
3520	NC_022665	GCT	2	6	217145	217150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587814
3521	NC_022665	TCA	2	6	217193	217198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587814
3522	NC_022665	TTGGT	2	10	217299	217308	0 %	60 %	40 %	0 %	556587814
3523	NC_022665	AGG	2	6	217311	217316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587814
3524	NC_022665	GA	3	6	217349	217354	50 %	0 %	50 %	0 %	556587814
3525	NC_022665	TC	3	6	217429	217434	0 %	50 %	0 %	50 %	556587814
3526	NC_022665	CTT	2	6	217443	217448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587814
3527	NC_022665	GGTC	2	8	217467	217474	0 %	25 %	50 %	25 %	556587814
3528	NC_022665	ATCA	2	8	217522	217529	50 %	25 %	0 %	25 %	556587814
3529	NC_022665	TGCC	2	8	217540	217547	0 %	25 %	25 %	50 %	556587814
3530	NC_022665	CTG	2	6	217765	217770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587814
3531	NC_022665	ATA	2	6	217801	217806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587814
3532	NC_022665	GAG	2	6	217807	217812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587814
3533	NC_022665	TCA	2	6	217838	217843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587814
3534	NC_022665	TAGA	2	8	217849	217856	50 %	25 %	25 %	0 %	556587814
3535	NC_022665	TGTT	2	8	217873	217880	0 %	75 %	25 %	0 %	556587814
3536	NC_022665	GAG	2	6	217882	217887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587814
3537	NC_022665	GTC	2	6	217898	217903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587814
3538	NC_022665	AAC	2	6	217983	217988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587814
3539	NC_022665	TTTC	2	8	218004	218011	0 %	75 %	0 %	25 %	556587814
3540	NC_022665	T	7	7	218060	218066	0 %	100 %	0 %	0 %	556587815
3541	NC_022665	CCA	2	6	218182	218187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587815
3542	NC_022665	TCT	2	6	218210	218215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587815
3543	NC_022665	CAA	2	6	218293	218298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587815
3544	NC_022665	CAAGG	2	10	218308	218317	40 %	0 %	40 %	20 %	556587815
3545	NC_022665	AGA	2	6	218360	218365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587815
3546	NC_022665	CAC	2	6	218397	218402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587815
3547	NC_022665	CCA	2	6	218407	218412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587815
3548	NC_022665	TCT	2	6	218444	218449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587815
3549	NC_022665	GTA	2	6	218452	218457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587815
3550	NC_022665	AAG	2	6	218693	218698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587815
3551	NC_022665	TAA	2	6	218741	218746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587815
3552	NC_022665	CTA	2	6	218753	218758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587815
3553	NC_022665	TTA	2	6	218804	218809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587815
3554	NC_022665	CAT	2	6	218859	218864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587815
3555	NC_022665	AGA	2	6	218875	218880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587815
3556	NC_022665	CGA	2	6	218914	218919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587815
3557	NC_022665	CT	3	6	218973	218978	0 %	50 %	0 %	50 %	556587815
3558	NC_022665	CTGTG	2	10	219031	219040	0 %	40 %	40 %	20 %	556587815
3559	NC_022665	TCT	2	6	219101	219106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587815
3560	NC_022665	TTC	2	6	219118	219123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587815
3561	NC_022665	CTT	2	6	219135	219140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587815
3562	NC_022665	TTC	2	6	219205	219210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587815
3563	NC_022665	ACC	2	6	219371	219376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587815
3564	NC_022665	AGC	2	6	219412	219417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587815
3565	NC_022665	T	6	6	219420	219425	0 %	100 %	0 %	0 %	556587815
3566	NC_022665	AAAT	2	8	219497	219504	75 %	25 %	0 %	0 %	556587815
3567	NC_022665	GCT	2	6	219527	219532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587815
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3569	NC_022665	T	6	6	219793	219798	0 %	100 %	0 %	0 %	556587816
3570	NC_022665	TCA	2	6	219854	219859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587816
3571	NC_022665	CATC	2	8	219861	219868	25 %	25 %	0 %	50 %	556587816
3572	NC_022665	CAA	2	6	219966	219971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587816
3573	NC_022665	CTT	2	6	219981	219986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587816
3574	NC_022665	TAA	2	6	220014	220019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587816
3575	NC_022665	TTTC	2	8	220309	220316	0 %	75 %	0 %	25 %	556587817
3576	NC_022665	TTG	2	6	220322	220327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587817
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3578	NC_022665	CAAT	2	8	220375	220382	50 %	25 %	0 %	25 %	556587817
3579	NC_022665	CAT	2	6	220399	220404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587817
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3583	NC_022665	ATAG	2	8	220475	220482	50 %	25 %	25 %	0 %	556587817
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3585	NC_022665	TCG	2	6	220525	220530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587817
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3589	NC_022665	GTCTC	2	10	220788	220797	0 %	40 %	20 %	40 %	556587818
3590	NC_022665	CTT	2	6	220822	220827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587818
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3592	NC_022665	TTC	2	6	220868	220873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587818
3593	NC_022665	GTT	2	6	220915	220920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587818
3594	NC_022665	TCC	2	6	220932	220937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587818
3595	NC_022665	TTC	2	6	220950	220955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587818
3596	NC_022665	CTG	2	6	221162	221167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587819
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3602	NC_022665	TGG	2	6	221429	221434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587819
3603	NC_022665	AAT	2	6	221445	221450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587819
3604	NC_022665	GTT	2	6	221451	221456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587819
3605	NC_022665	GAA	2	6	221465	221470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587819
3606	NC_022665	CCTT	2	8	221471	221478	0 %	50 %	0 %	50 %	556587819
3607	NC_022665	ACC	2	6	221512	221517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587819
3608	NC_022665	CGTC	2	8	221715	221722	0 %	25 %	25 %	50 %	556587819
3609	NC_022665	CATT	2	8	221808	221815	25 %	50 %	0 %	25 %	556587819
3610	NC_022665	GATAT	2	10	221927	221936	40 %	40 %	20 %	0 %	556587819
3611	NC_022665	CCAA	2	8	221961	221968	50 %	0 %	0 %	50 %	556587819
3612	NC_022665	CTG	2	6	221970	221975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587819
3613	NC_022665	TCC	2	6	221984	221989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587819
3614	NC_022665	ATTT	2	8	222115	222122	25 %	75 %	0 %	0 %	556587819
3615	NC_022665	AAC	2	6	222124	222129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587819
3616	NC_022665	AAT	2	6	222141	222146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587819
3617	NC_022665	TA	3	6	222189	222194	50 %	50 %	0 %	0 %	556587819
3618	NC_022665	TAA	2	6	222218	222223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587820
3619	NC_022665	TTC	2	6	222266	222271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587820
3620	NC_022665	CAT	3	9	222310	222318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587820
3621	NC_022665	TTA	2	6	222319	222324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587820
3622	NC_022665	T	6	6	222354	222359	0 %	100 %	0 %	0 %	556587820
3623	NC_022665	AGT	2	6	222370	222375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587820
3624	NC_022665	TGAG	2	8	222405	222412	25 %	25 %	50 %	0 %	556587820
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3865	NC_022665	CTA	2	6	237035	237040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587836
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3991	NC_022665	ATCA	2	8	245936	245943	50 %	25 %	0 %	25 %	556587844
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