MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_022665	TCT	2	6	2229781	2229786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589789
38502	NC_022665	ACGA	2	8	2229947	2229954	50 %	0 %	25 %	25 %	556589789
38503	NC_022665	CCG	2	6	2230030	2230035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556589789
38504	NC_022665	A	6	6	2230056	2230061	100 %	0 %	0 %	0 %	556589789
38505	NC_022665	GTA	2	6	2230154	2230159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589789
38506	NC_022665	CAA	2	6	2230267	2230272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589789
38507	NC_022665	TTG	2	6	2230307	2230312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589789
38508	NC_022665	TAA	2	6	2230355	2230360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589789
38509	NC_022665	TTGT	2	8	2230629	2230636	0 %	75 %	25 %	0 %	556589790
38510	NC_022665	ACCA	2	8	2230641	2230648	50 %	0 %	0 %	50 %	556589790
38511	NC_022665	CT	3	6	2230653	2230658	0 %	50 %	0 %	50 %	556589790
38512	NC_022665	TAC	2	6	2230673	2230678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589790
38513	NC_022665	TCT	2	6	2230679	2230684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589790
38514	NC_022665	GATT	2	8	2230685	2230692	25 %	50 %	25 %	0 %	556589790
38515	NC_022665	TAT	2	6	2230695	2230700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589790
38516	NC_022665	A	6	6	2230707	2230712	100 %	0 %	0 %	0 %	556589790
38517	NC_022665	ATA	2	6	2230761	2230766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589790
38518	NC_022665	AT	3	6	2230798	2230803	50 %	50 %	0 %	0 %	556589790
38519	NC_022665	T	7	7	2230873	2230879	0 %	100 %	0 %	0 %	556589791
38520	NC_022665	AAT	2	6	2230886	2230891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589791
38521	NC_022665	TGG	2	6	2230900	2230905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589791
38522	NC_022665	ATC	2	6	2230991	2230996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589791
38523	NC_022665	ATC	2	6	2231048	2231053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589791
38524	NC_022665	CAG	2	6	2231076	2231081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589791
38525	NC_022665	GCT	2	6	2231114	2231119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589791
38526	NC_022665	TTC	2	6	2231173	2231178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589791
38527	NC_022665	TGG	2	6	2231182	2231187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589791
38528	NC_022665	TAT	2	6	2231251	2231256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589791
38529	NC_022665	TAT	2	6	2231263	2231268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589791
38530	NC_022665	TTG	2	6	2231283	2231288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589791
38531	NC_022665	GATACT	2	12	2231294	2231305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556589791
38532	NC_022665	ATT	2	6	2231318	2231323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589791
38533	NC_022665	ATG	2	6	2231357	2231362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589791
38534	NC_022665	TCT	2	6	2231375	2231380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589791
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38538	NC_022665	TGA	2	6	2231505	2231510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589791
38539	NC_022665	TGA	2	6	2231563	2231568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589791
38540	NC_022665	GTT	2	6	2231582	2231587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589791
38541	NC_022665	ATG	2	6	2231646	2231651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589791
38542	NC_022665	TCGCT	2	10	2231760	2231769	0 %	40 %	20 %	40 %	556589792
38543	NC_022665	ATT	2	6	2231783	2231788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589792
38544	NC_022665	CAG	2	6	2231812	2231817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589792
38545	NC_022665	TAC	2	6	2231941	2231946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589792
38546	NC_022665	GTT	2	6	2231988	2231993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589792
38547	NC_022665	CAT	2	6	2232020	2232025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589792
38548	NC_022665	GAAA	2	8	2232026	2232033	75 %	0 %	25 %	0 %	556589792
38549	NC_022665	GAAG	2	8	2232050	2232057	50 %	0 %	50 %	0 %	556589792
38550	NC_022665	TGA	2	6	2232065	2232070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589792
38551	NC_022665	TGC	2	6	2232083	2232088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589792
38552	NC_022665	TGG	2	6	2232116	2232121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589792
38553	NC_022665	AGA	2	6	2232173	2232178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589792
38554	NC_022665	TTC	2	6	2232265	2232270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589792
38555	NC_022665	CCAA	2	8	2232282	2232289	50 %	0 %	0 %	50 %	556589792
38556	NC_022665	TTGA	2	8	2232330	2232337	25 %	50 %	25 %	0 %	556589792
38557	NC_022665	TCG	2	6	2232355	2232360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589792
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38562	NC_022665	AAGC	2	8	2232576	2232583	50 %	0 %	25 %	25 %	556589792
38563	NC_022665	AAG	2	6	2232594	2232599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589792
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38599	NC_022665	TGG	2	6	2234274	2234279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589793
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38604	NC_022665	A	6	6	2234497	2234502	100 %	0 %	0 %	0 %	556589793
38605	NC_022665	ACA	2	6	2234522	2234527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589793
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38640	NC_022665	TAAT	2	8	2236696	2236703	50 %	50 %	0 %	0 %	556589794
38641	NC_022665	AT	3	6	2236702	2236707	50 %	50 %	0 %	0 %	556589794
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38645	NC_022665	TCA	3	9	2236895	2236903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589794
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.