MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022665	A	6	6	86684	86689	100 %	0 %	0 %	0 %	556587704
1502	NC_022665	ATTA	2	8	86723	86730	50 %	50 %	0 %	0 %	556587704
1503	NC_022665	TGCT	2	8	94371	94378	0 %	50 %	25 %	25 %	556587705
1504	NC_022665	GTT	2	6	94410	94415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587705
1505	NC_022665	CTTT	2	8	94434	94441	0 %	75 %	0 %	25 %	556587705
1506	NC_022665	AAT	2	6	94450	94455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587705
1507	NC_022665	TGGT	2	8	95134	95141	0 %	50 %	50 %	0 %	556587706
1508	NC_022665	TGG	2	6	95299	95304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587706
1509	NC_022665	GAT	2	6	95313	95318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587706
1510	NC_022665	GCT	2	6	95355	95360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587706
1511	NC_022665	TGC	2	6	95369	95374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587706
1512	NC_022665	TCA	3	9	95384	95392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587706
1513	NC_022665	TAC	2	6	95535	95540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587707
1514	NC_022665	ATT	2	6	95569	95574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587707
1515	NC_022665	AAG	2	6	95709	95714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587707
1516	NC_022665	GGTT	2	8	95814	95821	0 %	50 %	50 %	0 %	556587707
1517	NC_022665	TCG	2	6	95822	95827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587707
1518	NC_022665	ATG	2	6	95839	95844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587707
1519	NC_022665	GTG	2	6	95917	95922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587707
1520	NC_022665	AGC	2	6	95929	95934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587707
1521	NC_022665	ACA	2	6	95994	95999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587707
1522	NC_022665	GATG	2	8	96002	96009	25 %	25 %	50 %	0 %	556587707
1523	NC_022665	AAG	2	6	96054	96059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587707
1524	NC_022665	TGA	2	6	96076	96081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587707
1525	NC_022665	TGA	2	6	96095	96100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587707
1526	NC_022665	CAG	2	6	96144	96149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587707
1527	NC_022665	GTT	2	6	96160	96165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587707
1528	NC_022665	GAG	2	6	96186	96191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587707
1529	NC_022665	ATCT	2	8	96206	96213	25 %	50 %	0 %	25 %	556587707
1530	NC_022665	TTTGG	2	10	96361	96370	0 %	60 %	40 %	0 %	556587708
1531	NC_022665	TGG	2	6	96531	96536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587708
1532	NC_022665	TTG	2	6	96646	96651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587708
1533	NC_022665	CAA	2	6	96800	96805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587708
1534	NC_022665	ATTGC	2	10	96826	96835	20 %	40 %	20 %	20 %	556587708
1535	NC_022665	T	6	6	96886	96891	0 %	100 %	0 %	0 %	556587708
1536	NC_022665	CTT	2	6	96914	96919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587708
1537	NC_022665	TGT	2	6	96987	96992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587708
1538	NC_022665	A	6	6	97003	97008	100 %	0 %	0 %	0 %	556587708
1539	NC_022665	A	6	6	97024	97029	100 %	0 %	0 %	0 %	556587709
1540	NC_022665	TAT	2	6	97037	97042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587709
1541	NC_022665	TGTC	2	8	97046	97053	0 %	50 %	25 %	25 %	556587709
1542	NC_022665	GCTTT	2	10	97057	97066	0 %	60 %	20 %	20 %	556587709
1543	NC_022665	GGT	2	6	97155	97160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587709
1544	NC_022665	TGA	2	6	97164	97169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587709
1545	NC_022665	ATGAAA	2	12	97271	97282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556587709
1546	NC_022665	ATG	2	6	97301	97306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587709
1547	NC_022665	ACA	2	6	97324	97329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587709
1548	NC_022665	GAG	2	6	97381	97386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587709
1549	NC_022665	AGAAA	2	10	97515	97524	80 %	0 %	20 %	0 %	556587709
1550	NC_022665	CTG	2	6	97601	97606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587709
1551	NC_022665	ACA	2	6	97629	97634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587709
1552	NC_022665	TGC	2	6	97695	97700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587709
1553	NC_022665	TAA	2	6	97749	97754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587709
1554	NC_022665	GAA	2	6	97780	97785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587709
1555	NC_022665	A	6	6	97934	97939	100 %	0 %	0 %	0 %	556587709
1556	NC_022665	AAG	2	6	97949	97954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587709
1557	NC_022665	AGA	2	6	97971	97976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587709
1558	NC_022665	CTTG	2	8	98085	98092	0 %	50 %	25 %	25 %	556587709
1559	NC_022665	GGT	2	6	98137	98142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587709
1560	NC_022665	TTA	2	6	98166	98171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587709
1561	NC_022665	ATA	2	6	98216	98221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587709
1562	NC_022665	AAGA	2	8	98245	98252	75 %	0 %	25 %	0 %	556587709
1563	NC_022665	A	6	6	98296	98301	100 %	0 %	0 %	0 %	556587709
1564	NC_022665	GTG	2	6	98309	98314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587709
1565	NC_022665	TGG	2	6	98424	98429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587709
1566	NC_022665	AG	3	6	98430	98435	50 %	0 %	50 %	0 %	556587709
1567	NC_022665	TAC	2	6	98476	98481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587709
1568	NC_022665	TG	3	6	98633	98638	0 %	50 %	50 %	0 %	556587710
1569	NC_022665	CTG	2	6	98652	98657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587710
1570	NC_022665	ATT	2	6	98714	98719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587710
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1572	NC_022665	GGC	2	6	98775	98780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556587710
1573	NC_022665	GAA	2	6	98785	98790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587710
1574	NC_022665	TAT	2	6	98831	98836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587710
1575	NC_022665	A	6	6	98955	98960	100 %	0 %	0 %	0 %	556587710
1576	NC_022665	CAT	3	9	99056	99064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587710
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1578	NC_022665	GACTT	2	10	99095	99104	20 %	40 %	20 %	20 %	556587710
1579	NC_022665	TTGAAA	2	12	99286	99297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556587711
1580	NC_022665	CTTGGA	2	12	99342	99353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556587711
1581	NC_022665	CAG	2	6	99385	99390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587711
1582	NC_022665	GAT	2	6	99448	99453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587711
1583	NC_022665	AAG	2	6	99915	99920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587712
1584	NC_022665	CAG	2	6	99949	99954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587712
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1587	NC_022665	TGG	2	6	100080	100085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587712
1588	NC_022665	A	6	6	100087	100092	100 %	0 %	0 %	0 %	556587712
1589	NC_022665	T	6	6	100182	100187	0 %	100 %	0 %	0 %	556587713
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1592	NC_022665	AAAC	2	8	100353	100360	75 %	0 %	0 %	25 %	556587713
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1595	NC_022665	GTG	2	6	100469	100474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587713
1596	NC_022665	CAT	2	6	100486	100491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587713
1597	NC_022665	TTGAA	2	10	100535	100544	40 %	40 %	20 %	0 %	556587713
1598	NC_022665	AGA	2	6	100635	100640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587713
1599	NC_022665	CAT	2	6	100705	100710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587713
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1603	NC_022665	T	6	6	100963	100968	0 %	100 %	0 %	0 %	556587714
1604	NC_022665	ACG	2	6	100975	100980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587714
1605	NC_022665	TCT	2	6	101313	101318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587714
1606	NC_022665	CAT	2	6	101415	101420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587714
1607	NC_022665	CCAA	2	8	101478	101485	50 %	0 %	0 %	50 %	556587714
1608	NC_022665	TGA	2	6	101532	101537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587714
1609	NC_022665	TCA	2	6	101547	101552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587714
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1611	NC_022665	ACC	2	6	101623	101628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587714
1612	NC_022665	T	6	6	101731	101736	0 %	100 %	0 %	0 %	556587714
1613	NC_022665	TCA	2	6	101751	101756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587714
1614	NC_022665	GTA	2	6	101770	101775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587714
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1616	NC_022665	GTT	2	6	101830	101835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587714
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1619	NC_022665	GA	3	6	101880	101885	50 %	0 %	50 %	0 %	556587714
1620	NC_022665	GAAG	2	8	101956	101963	50 %	0 %	50 %	0 %	556587714
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1622	NC_022665	TAA	2	6	102098	102103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587714
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1624	NC_022665	TTC	2	6	102181	102186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587714
1625	NC_022665	GTA	2	6	102415	102420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587715
1626	NC_022665	ATT	3	9	102444	102452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587715
1627	NC_022665	TGA	2	6	102531	102536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587715
1628	NC_022665	TGCG	2	8	102761	102768	0 %	25 %	50 %	25 %	556587715
1629	NC_022665	GGT	2	6	102802	102807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587715
1630	NC_022665	GCA	2	6	102819	102824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587715
1631	NC_022665	AAT	2	6	102967	102972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587715
1632	NC_022665	GCT	2	6	103054	103059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587715
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1634	NC_022665	GAA	2	6	103309	103314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587715
1635	NC_022665	ATG	2	6	103379	103384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587715
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1643	NC_022665	GGT	2	6	103591	103596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587715
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1645	NC_022665	TTCG	2	8	103640	103647	0 %	50 %	25 %	25 %	556587715
1646	NC_022665	TATG	2	8	103764	103771	25 %	50 %	25 %	0 %	556587715
1647	NC_022665	ATG	2	6	103792	103797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587715
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1654	NC_022665	TAC	2	6	104160	104165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587715
1655	NC_022665	GCA	2	6	104203	104208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587715
1656	NC_022665	TCG	2	6	104219	104224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587715
1657	NC_022665	CTGGG	2	10	104298	104307	0 %	20 %	60 %	20 %	556587715
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1660	NC_022665	AAT	2	6	104350	104355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587715
1661	NC_022665	AGT	2	6	104434	104439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587715
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1862	NC_022665	AGT	2	6	116164	116169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587722
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1992	NC_022665	AGGTG	2	10	122922	122931	20 %	20 %	60 %	0 %	556587731
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2000	NC_022665	TTC	3	9	123283	123291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587731

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