MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022665	ATCT	2	8	59879	59886	25 %	50 %	0 %	25 %	556587661
1002	NC_022665	TAC	2	6	59917	59922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587661
1003	NC_022665	GAC	2	6	59945	59950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587661
1004	NC_022665	AT	3	6	59966	59971	50 %	50 %	0 %	0 %	556587661
1005	NC_022665	GTC	2	6	60002	60007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587661
1006	NC_022665	GAAT	2	8	60103	60110	50 %	25 %	25 %	0 %	556587661
1007	NC_022665	T	6	6	60128	60133	0 %	100 %	0 %	0 %	556587662
1008	NC_022665	AGG	2	6	60153	60158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587662
1009	NC_022665	ATT	2	6	60204	60209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587662
1010	NC_022665	ATG	2	6	60227	60232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587662
1011	NC_022665	ATT	2	6	60239	60244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587662
1012	NC_022665	CCAG	2	8	60299	60306	25 %	0 %	25 %	50 %	556587663
1013	NC_022665	TGG	2	6	60321	60326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587663
1014	NC_022665	TGA	2	6	60427	60432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587663
1015	NC_022665	CCG	2	6	60448	60453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556587663
1016	NC_022665	CCA	2	6	60459	60464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587663
1017	NC_022665	GTCA	2	8	60545	60552	25 %	25 %	25 %	25 %	556587663
1018	NC_022665	ATT	2	6	60579	60584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587663
1019	NC_022665	GGT	2	6	60611	60616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587663
1020	NC_022665	GTC	2	6	60642	60647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587663
1021	NC_022665	CA	3	6	60655	60660	50 %	0 %	0 %	50 %	556587663
1022	NC_022665	ATTT	2	8	60675	60682	25 %	75 %	0 %	0 %	556587663
1023	NC_022665	TTG	2	6	60741	60746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587663
1024	NC_022665	TGT	2	6	60748	60753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587663
1025	NC_022665	AATT	2	8	60813	60820	50 %	50 %	0 %	0 %	556587663
1026	NC_022665	CAGGGA	2	12	60828	60839	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	556587663
1027	NC_022665	A	7	7	60884	60890	100 %	0 %	0 %	0 %	556587663
1028	NC_022665	AGA	2	6	60907	60912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587663
1029	NC_022665	TCA	2	6	60987	60992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587663
1030	NC_022665	T	6	6	61012	61017	0 %	100 %	0 %	0 %	556587663
1031	NC_022665	AG	3	6	61301	61306	50 %	0 %	50 %	0 %	556587663
1032	NC_022665	TAT	2	6	61316	61321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587663
1033	NC_022665	CTT	3	9	61339	61347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587663
1034	NC_022665	TTG	2	6	61404	61409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587663
1035	NC_022665	AGA	2	6	61471	61476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587663
1036	NC_022665	GGA	2	6	61537	61542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587663
1037	NC_022665	TATT	2	8	61592	61599	25 %	75 %	0 %	0 %	556587663
1038	NC_022665	GCAAG	2	10	61603	61612	40 %	0 %	40 %	20 %	556587663
1039	NC_022665	AG	3	6	61648	61653	50 %	0 %	50 %	0 %	556587663
1040	NC_022665	TAC	2	6	61667	61672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587663
1041	NC_022665	ATG	2	6	61746	61751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587663
1042	NC_022665	AGA	2	6	61804	61809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587663
1043	NC_022665	GAAG	2	8	61855	61862	50 %	0 %	50 %	0 %	556587663
1044	NC_022665	TCAA	2	8	61922	61929	50 %	25 %	0 %	25 %	556587663
1045	NC_022665	ATG	2	6	61955	61960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587663
1046	NC_022665	GAT	2	6	61997	62002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587663
1047	NC_022665	GCC	2	6	62067	62072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556587663
1048	NC_022665	A	6	6	62106	62111	100 %	0 %	0 %	0 %	556587663
1049	NC_022665	AAG	2	6	62330	62335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587664
1050	NC_022665	TCA	2	6	62349	62354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587664
1051	NC_022665	CAA	2	6	62450	62455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587664
1052	NC_022665	TAT	2	6	62466	62471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587664
1053	NC_022665	TGA	2	6	62478	62483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587664
1054	NC_022665	ATG	2	6	62486	62491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587664
1055	NC_022665	AGA	2	6	62513	62518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587664
1056	NC_022665	TACC	2	8	62523	62530	25 %	25 %	0 %	50 %	556587664
1057	NC_022665	CAG	2	6	62566	62571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587664
1058	NC_022665	GAA	2	6	62608	62613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587664
1059	NC_022665	CAA	2	6	62626	62631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587664
1060	NC_022665	GAA	2	6	62662	62667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587664
1061	NC_022665	TGA	2	6	62786	62791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587664
1062	NC_022665	AAT	2	6	63453	63458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587665
1063	NC_022665	ATG	2	6	63478	63483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587665
1064	NC_022665	TTTG	2	8	63518	63525	0 %	75 %	25 %	0 %	556587665
1065	NC_022665	TTGCT	2	10	63528	63537	0 %	60 %	20 %	20 %	556587665
1066	NC_022665	T	7	7	63605	63611	0 %	100 %	0 %	0 %	556587665
1067	NC_022665	TGC	2	6	63632	63637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587665
1068	NC_022665	TCT	2	6	63662	63667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587665
1069	NC_022665	CAT	2	6	63680	63685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587665
1070	NC_022665	TTC	2	6	63733	63738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587665
1071	NC_022665	AGG	2	6	63745	63750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587665
1072	NC_022665	AGA	2	6	63854	63859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587665
1073	NC_022665	A	6	6	63876	63881	100 %	0 %	0 %	0 %	556587665
1074	NC_022665	TTG	2	6	63895	63900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587665
1075	NC_022665	CTGT	2	8	63904	63911	0 %	50 %	25 %	25 %	556587665
1076	NC_022665	GCAG	2	8	63926	63933	25 %	0 %	50 %	25 %	556587665
1077	NC_022665	TCA	2	6	63940	63945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587665
1078	NC_022665	GGTAA	2	10	63977	63986	40 %	20 %	40 %	0 %	556587665
1079	NC_022665	AGC	2	6	64082	64087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587666
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1081	NC_022665	TGCC	2	8	64181	64188	0 %	25 %	25 %	50 %	556587666
1082	NC_022665	A	6	6	64201	64206	100 %	0 %	0 %	0 %	556587666
1083	NC_022665	GAA	2	6	64213	64218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587666
1084	NC_022665	TCTCTT	2	12	64323	64334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587666
1085	NC_022665	AG	3	6	64344	64349	50 %	0 %	50 %	0 %	556587666
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1088	NC_022665	TCT	2	6	64477	64482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587667
1089	NC_022665	TGC	2	6	64553	64558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587667
1090	NC_022665	GGA	2	6	64594	64599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587667
1091	NC_022665	GA	3	6	64598	64603	50 %	0 %	50 %	0 %	556587667
1092	NC_022665	GGCA	2	8	64607	64614	25 %	0 %	50 %	25 %	556587667
1093	NC_022665	AGCTG	2	10	64615	64624	20 %	20 %	40 %	20 %	556587667
1094	NC_022665	CTT	2	6	64662	64667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587667
1095	NC_022665	GGT	2	6	64737	64742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587667
1096	NC_022665	GAT	2	6	64802	64807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587667
1097	NC_022665	GTT	2	6	64847	64852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587667
1098	NC_022665	TGC	2	6	64931	64936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587667
1099	NC_022665	GTTT	2	8	65014	65021	0 %	75 %	25 %	0 %	556587667
1100	NC_022665	TCC	2	6	65056	65061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587667
1101	NC_022665	CAG	2	6	65075	65080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587667
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1103	NC_022665	TAT	2	6	65398	65403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587668
1104	NC_022665	GGT	2	6	65451	65456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587668
1105	NC_022665	GAC	2	6	65472	65477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587668
1106	NC_022665	CTT	2	6	65501	65506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587668
1107	NC_022665	TGA	2	6	65525	65530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587668
1108	NC_022665	AAT	2	6	65592	65597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587668
1109	NC_022665	TGG	2	6	65660	65665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587668
1110	NC_022665	CCA	2	6	65709	65714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587668
1111	NC_022665	CAG	2	6	65769	65774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587668
1112	NC_022665	T	6	6	65799	65804	0 %	100 %	0 %	0 %	556587668
1113	NC_022665	TTGA	2	8	65844	65851	25 %	50 %	25 %	0 %	556587668
1114	NC_022665	CAGA	2	8	65856	65863	50 %	0 %	25 %	25 %	556587668
1115	NC_022665	CCA	2	6	65914	65919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587668
1116	NC_022665	AAG	3	9	65932	65940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587668
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1120	NC_022665	GGT	2	6	66099	66104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587668
1121	NC_022665	GGA	2	6	66156	66161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587668
1122	NC_022665	ACA	2	6	66289	66294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587668
1123	NC_022665	GGT	2	6	66360	66365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587668
1124	NC_022665	GCTT	2	8	66389	66396	0 %	50 %	25 %	25 %	556587668
1125	NC_022665	AGA	2	6	66512	66517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587669
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1127	NC_022665	GAT	2	6	66558	66563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587669
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