MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022655	GGAA	2	8	219580	219587	50 %	0 %	50 %	0 %	556560276
3502	NC_022655	TC	3	6	219710	219715	0 %	50 %	0 %	50 %	556560276
3503	NC_022655	TGC	2	6	219757	219762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560276
3504	NC_022655	ATTG	2	8	219811	219818	25 %	50 %	25 %	0 %	556560276
3505	NC_022655	AGA	2	6	219841	219846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560276
3506	NC_022655	TGAAAT	2	12	219931	219942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556560276
3507	NC_022655	GTC	2	6	219944	219949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560276
3508	NC_022655	GAA	2	6	220004	220009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560276
3509	NC_022655	TGA	2	6	220030	220035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560276
3510	NC_022655	TCG	2	6	220107	220112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560276
3511	NC_022655	GAAT	2	8	220257	220264	50 %	25 %	25 %	0 %	556560277
3512	NC_022655	TAT	2	6	220299	220304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560277
3513	NC_022655	TAT	2	6	220315	220320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560277
3514	NC_022655	ATT	2	6	220365	220370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560277
3515	NC_022655	CT	3	6	220425	220430	0 %	50 %	0 %	50 %	556560277
3516	NC_022655	CTTT	2	8	220446	220453	0 %	75 %	0 %	25 %	556560277
3517	NC_022655	TTTA	2	8	220537	220544	25 %	75 %	0 %	0 %	556560277
3518	NC_022655	ATT	2	6	220589	220594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560277
3519	NC_022655	ATT	2	6	220596	220601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560277
3520	NC_022655	TATTT	2	10	220703	220712	20 %	80 %	0 %	0 %	556560277
3521	NC_022655	AT	3	6	220735	220740	50 %	50 %	0 %	0 %	556560277
3522	NC_022655	ATTAT	2	10	220752	220761	40 %	60 %	0 %	0 %	556560277
3523	NC_022655	AAT	2	6	220774	220779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560277
3524	NC_022655	A	6	6	220832	220837	100 %	0 %	0 %	0 %	556560277
3525	NC_022655	AT	3	6	220846	220851	50 %	50 %	0 %	0 %	556560277
3526	NC_022655	GTC	2	6	220869	220874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560277
3527	NC_022655	TTC	2	6	220902	220907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560277
3528	NC_022655	GAT	2	6	220916	220921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560277
3529	NC_022655	GAG	2	6	220926	220931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560277
3530	NC_022655	TAAA	2	8	221037	221044	75 %	25 %	0 %	0 %	556560277
3531	NC_022655	A	6	6	221078	221083	100 %	0 %	0 %	0 %	556560277
3532	NC_022655	GAT	2	6	221180	221185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560278
3533	NC_022655	CT	3	6	221266	221271	0 %	50 %	0 %	50 %	556560278
3534	NC_022655	GGA	2	6	221288	221293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560278
3535	NC_022655	CTC	2	6	221320	221325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560278
3536	NC_022655	TC	3	6	221469	221474	0 %	50 %	0 %	50 %	556560278
3537	NC_022655	GAG	2	6	221592	221597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560278
3538	NC_022655	TCG	2	6	221606	221611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560278
3539	NC_022655	GGT	2	6	221702	221707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560278
3540	NC_022655	GA	3	6	221723	221728	50 %	0 %	50 %	0 %	556560278
3541	NC_022655	TGAT	2	8	221746	221753	25 %	50 %	25 %	0 %	556560278
3542	NC_022655	CAG	2	6	221823	221828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560278
3543	NC_022655	GA	3	6	221840	221845	50 %	0 %	50 %	0 %	556560278
3544	NC_022655	GAT	2	6	221863	221868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560279
3545	NC_022655	CATT	2	8	221981	221988	25 %	50 %	0 %	25 %	556560279
3546	NC_022655	TGG	2	6	222021	222026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560279
3547	NC_022655	TTGG	2	8	222038	222045	0 %	50 %	50 %	0 %	556560279
3548	NC_022655	TCA	2	6	222056	222061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560279
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3550	NC_022655	A	7	7	222189	222195	100 %	0 %	0 %	0 %	556560279
3551	NC_022655	GAA	2	6	223130	223135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560280
3552	NC_022655	GAT	2	6	223158	223163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560280
3553	NC_022655	CAT	2	6	223182	223187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560280
3554	NC_022655	GAG	2	6	223357	223362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560281
3555	NC_022655	TAG	2	6	223364	223369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560281
3556	NC_022655	ACGC	2	8	223371	223378	25 %	0 %	25 %	50 %	556560281
3557	NC_022655	AT	3	6	223401	223406	50 %	50 %	0 %	0 %	556560281
3558	NC_022655	AAC	2	6	223515	223520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560281
3559	NC_022655	GAA	2	6	223678	223683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560281
3560	NC_022655	GGA	2	6	223701	223706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560281
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3562	NC_022655	CGA	2	6	223790	223795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560281
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3570	NC_022655	AAGA	2	8	225118	225125	75 %	0 %	25 %	0 %	556560282
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3573	NC_022655	CAA	2	6	225279	225284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560282
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3578	NC_022655	GATT	2	8	225515	225522	25 %	50 %	25 %	0 %	556560282
3579	NC_022655	TGG	2	6	225543	225548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560282
3580	NC_022655	ATTG	2	8	225633	225640	25 %	50 %	25 %	0 %	556560282
3581	NC_022655	TTCC	2	8	225730	225737	0 %	50 %	0 %	50 %	556560282
3582	NC_022655	TCG	2	6	225831	225836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560282
3583	NC_022655	GGA	2	6	225850	225855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560282
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3587	NC_022655	CT	3	6	226282	226287	0 %	50 %	0 %	50 %	556560283
3588	NC_022655	GACA	2	8	226310	226317	50 %	0 %	25 %	25 %	556560283
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3591	NC_022655	TAA	2	6	226379	226384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560283
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3593	NC_022655	ACAGT	2	10	226453	226462	40 %	20 %	20 %	20 %	556560283
3594	NC_022655	TGG	2	6	226601	226606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560283
3595	NC_022655	ATT	2	6	226731	226736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560284
3596	NC_022655	GTG	2	6	226740	226745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560284
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3598	NC_022655	TGA	2	6	226961	226966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560284
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3601	NC_022655	CCCT	2	8	227017	227024	0 %	25 %	0 %	75 %	556560284
3602	NC_022655	GAA	3	9	227082	227090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560284
3603	NC_022655	A	6	6	227089	227094	100 %	0 %	0 %	0 %	556560284
3604	NC_022655	GTT	2	6	227247	227252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560284
3605	NC_022655	T	6	6	227251	227256	0 %	100 %	0 %	0 %	556560284
3606	NC_022655	GTG	2	6	227278	227283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560284
3607	NC_022655	ACAA	2	8	227485	227492	75 %	0 %	0 %	25 %	556560284
3608	NC_022655	GGT	2	6	227580	227585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560284
3609	NC_022655	CTG	3	9	227593	227601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560284
3610	NC_022655	TC	3	6	227618	227623	0 %	50 %	0 %	50 %	556560284
3611	NC_022655	AGT	2	6	227694	227699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560284
3612	NC_022655	TGC	2	6	227702	227707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560284
3613	NC_022655	CTT	2	6	227735	227740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560284
3614	NC_022655	TGG	2	6	227798	227803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560284
3615	NC_022655	CCG	2	6	227834	227839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556560284
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3619	NC_022655	CAG	2	6	228073	228078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560285
3620	NC_022655	CAT	2	6	228131	228136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560285
3621	NC_022655	CTT	2	6	228186	228191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560285
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3623	NC_022655	TGA	2	6	228386	228391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560285
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3865	NC_022655	TGA	2	6	242316	242321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560293
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