MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022655	A	6	6	190841	190846	100 %	0 %	0 %	0 %	556560244
3002	NC_022655	ATA	2	6	190885	190890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560244
3003	NC_022655	AAT	2	6	190922	190927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560245
3004	NC_022655	TTG	2	6	190938	190943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560245
3005	NC_022655	GACAA	2	10	190967	190976	60 %	0 %	20 %	20 %	556560245
3006	NC_022655	ACC	2	6	191004	191009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560245
3007	NC_022655	ACT	2	6	191031	191036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560245
3008	NC_022655	A	6	6	191039	191044	100 %	0 %	0 %	0 %	556560245
3009	NC_022655	ATG	2	6	191055	191060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560245
3010	NC_022655	AAG	2	6	191076	191081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560245
3011	NC_022655	CGTA	2	8	191089	191096	25 %	25 %	25 %	25 %	556560245
3012	NC_022655	GTT	2	6	191147	191152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560245
3013	NC_022655	GAA	2	6	191153	191158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560245
3014	NC_022655	TCA	2	6	191163	191168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560245
3015	NC_022655	ACA	2	6	191233	191238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560246
3016	NC_022655	TGG	2	6	191273	191278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560246
3017	NC_022655	TGG	2	6	191342	191347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560246
3018	NC_022655	A	6	6	191355	191360	100 %	0 %	0 %	0 %	556560246
3019	NC_022655	GTT	2	6	191367	191372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560246
3020	NC_022655	TCGT	2	8	191383	191390	0 %	50 %	25 %	25 %	556560246
3021	NC_022655	TCG	2	6	191405	191410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560246
3022	NC_022655	GCA	2	6	191445	191450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560246
3023	NC_022655	ATC	2	6	191454	191459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560246
3024	NC_022655	CTC	2	6	191473	191478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560246
3025	NC_022655	A	7	7	191653	191659	100 %	0 %	0 %	0 %	556560247
3026	NC_022655	TGT	2	6	191707	191712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560247
3027	NC_022655	GGT	2	6	191804	191809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560247
3028	NC_022655	ATC	2	6	191810	191815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560247
3029	NC_022655	AGC	2	6	191824	191829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560247
3030	NC_022655	A	6	6	191906	191911	100 %	0 %	0 %	0 %	556560247
3031	NC_022655	ACA	2	6	191919	191924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560247
3032	NC_022655	A	6	6	191924	191929	100 %	0 %	0 %	0 %	556560247
3033	NC_022655	AGT	2	6	192009	192014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560248
3034	NC_022655	ACT	2	6	192038	192043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560248
3035	NC_022655	GCT	2	6	192133	192138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560248
3036	NC_022655	GAA	2	6	192139	192144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560248
3037	NC_022655	A	6	6	192187	192192	100 %	0 %	0 %	0 %	556560248
3038	NC_022655	GTG	2	6	192251	192256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560248
3039	NC_022655	CAA	2	6	192329	192334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560248
3040	NC_022655	AC	3	6	192359	192364	50 %	0 %	0 %	50 %	556560248
3041	NC_022655	AAC	2	6	192447	192452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560248
3042	NC_022655	ATA	2	6	192513	192518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560248
3043	NC_022655	A	6	6	192540	192545	100 %	0 %	0 %	0 %	556560249
3044	NC_022655	AG	3	6	192558	192563	50 %	0 %	50 %	0 %	556560249
3045	NC_022655	A	6	6	192574	192579	100 %	0 %	0 %	0 %	556560249
3046	NC_022655	TTG	2	6	192580	192585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560249
3047	NC_022655	TGC	2	6	192605	192610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560249
3048	NC_022655	GGC	2	6	192617	192622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560249
3049	NC_022655	TGAC	2	8	193095	193102	25 %	25 %	25 %	25 %	556560250
3050	NC_022655	A	6	6	193184	193189	100 %	0 %	0 %	0 %	556560250
3051	NC_022655	A	6	6	193225	193230	100 %	0 %	0 %	0 %	556560250
3052	NC_022655	ACAA	2	8	193251	193258	75 %	0 %	0 %	25 %	556560250
3053	NC_022655	A	6	6	193352	193357	100 %	0 %	0 %	0 %	556560250
3054	NC_022655	AAG	2	6	193434	193439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560250
3055	NC_022655	TGG	2	6	193456	193461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560250
3056	NC_022655	TAA	2	6	193692	193697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560251
3057	NC_022655	CTG	2	6	193712	193717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560251
3058	NC_022655	ACT	2	6	193876	193881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560251
3059	NC_022655	AAC	2	6	193894	193899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560251
3060	NC_022655	GTT	2	6	193903	193908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560251
3061	NC_022655	AAGA	2	8	193927	193934	75 %	0 %	25 %	0 %	556560251
3062	NC_022655	GGTT	2	8	193950	193957	0 %	50 %	50 %	0 %	556560251
3063	NC_022655	CAA	3	9	194060	194068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560251
3064	NC_022655	GTT	2	6	194071	194076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560251
3065	NC_022655	AGT	2	6	194094	194099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560251
3066	NC_022655	GCT	2	6	194110	194115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560251
3067	NC_022655	TACG	2	8	194116	194123	25 %	25 %	25 %	25 %	556560251
3068	NC_022655	TAAAGG	2	12	194148	194159	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556560251
3069	NC_022655	TTCG	2	8	194179	194186	0 %	50 %	25 %	25 %	556560251
3070	NC_022655	AAG	2	6	194192	194197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560251
3071	NC_022655	AAT	2	6	194210	194215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560251
3072	NC_022655	AAAC	2	8	194318	194325	75 %	0 %	0 %	25 %	556560252
3073	NC_022655	CT	3	6	194361	194366	0 %	50 %	0 %	50 %	556560252
3074	NC_022655	CTG	2	6	194371	194376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560252
3075	NC_022655	TGAT	2	8	194428	194435	25 %	50 %	25 %	0 %	556560252
3076	NC_022655	AAG	2	6	194479	194484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560252
3077	NC_022655	GTG	2	6	194568	194573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560252
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3079	NC_022655	GTT	2	6	194738	194743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560253
3080	NC_022655	CGT	2	6	194753	194758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560253
3081	NC_022655	TTG	4	12	194775	194786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560253
3082	NC_022655	AAG	2	6	194829	194834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560253
3083	NC_022655	GAT	2	6	194861	194866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560253
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3085	NC_022655	TTG	2	6	194951	194956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560253
3086	NC_022655	CTG	2	6	194961	194966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560253
3087	NC_022655	TGG	2	6	194989	194994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560253
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3089	NC_022655	TGC	2	6	195127	195132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560253
3090	NC_022655	AAATTA	2	12	195187	195198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561946
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3092	NC_022655	ACTTGG	2	12	195254	195265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556561946
3093	NC_022655	TTA	2	6	195283	195288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561946
3094	NC_022655	AAG	2	6	195289	195294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561946
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3096	NC_022655	CAG	2	6	195322	195327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561946
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3098	NC_022655	TCA	2	6	195576	195581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560254
3099	NC_022655	CGT	2	6	195681	195686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560254
3100	NC_022655	GTT	2	6	195786	195791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560254
3101	NC_022655	AGC	2	6	195878	195883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560254
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3103	NC_022655	GGT	2	6	195924	195929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560254
3104	NC_022655	AG	3	6	195947	195952	50 %	0 %	50 %	0 %	556560254
3105	NC_022655	T	6	6	195963	195968	0 %	100 %	0 %	0 %	556560255
3106	NC_022655	ATT	2	6	195971	195976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560255
3107	NC_022655	TTTA	2	8	196016	196023	25 %	75 %	0 %	0 %	556560255
3108	NC_022655	CTT	2	6	196115	196120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560255
3109	NC_022655	A	6	6	196154	196159	100 %	0 %	0 %	0 %	556560255
3110	NC_022655	TTG	2	6	196207	196212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560255
3111	NC_022655	GAA	2	6	196279	196284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560255
3112	NC_022655	ATC	2	6	196425	196430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560255
3113	NC_022655	GTA	2	6	196441	196446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560255
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3115	NC_022655	GAT	2	6	196544	196549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560255
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3119	NC_022655	ATT	2	6	196647	196652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560255
3120	NC_022655	CAA	2	6	196671	196676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560255
3121	NC_022655	TCCAA	2	10	196691	196700	40 %	20 %	0 %	40 %	556560255
3122	NC_022655	CTG	2	6	196759	196764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560255
3123	NC_022655	TTC	2	6	196816	196821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560255
3124	NC_022655	ACT	2	6	196884	196889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560255
3125	NC_022655	ATT	2	6	196923	196928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560255
3126	NC_022655	TTC	2	6	196938	196943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560255
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3132	NC_022655	CTT	2	6	197055	197060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560255
3133	NC_022655	CGT	2	6	197061	197066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560255
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3223	NC_022655	GTTG	2	8	201778	201785	0 %	50 %	50 %	0 %	556560263
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3225	NC_022655	TGGTG	2	10	201883	201892	0 %	40 %	60 %	0 %	556560263
3226	NC_022655	GTA	2	6	201932	201937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560263
3227	NC_022655	TTGG	2	8	201986	201993	0 %	50 %	50 %	0 %	556560263
3228	NC_022655	GA	3	6	202007	202012	50 %	0 %	50 %	0 %	556560263
3229	NC_022655	ACG	2	6	202127	202132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560263
3230	NC_022655	GGT	2	6	202196	202201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560263
3231	NC_022655	TGC	2	6	202246	202251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560263
3232	NC_022655	CT	3	6	202264	202269	0 %	50 %	0 %	50 %	556560263
3233	NC_022655	TCTGT	2	10	202302	202311	0 %	60 %	20 %	20 %	556560263
3234	NC_022655	TGGAT	2	10	202312	202321	20 %	40 %	40 %	0 %	556560263
3235	NC_022655	AGA	2	6	202336	202341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560263
3236	NC_022655	CTG	2	6	202347	202352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560263
3237	NC_022655	AGC	2	6	202381	202386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560263
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3239	NC_022655	TGG	2	6	202462	202467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560263
3240	NC_022655	TC	3	6	202524	202529	0 %	50 %	0 %	50 %	556560263
3241	NC_022655	TTTTA	2	10	202769	202778	20 %	80 %	0 %	0 %	556560264
3242	NC_022655	TCAT	2	8	202779	202786	25 %	50 %	0 %	25 %	556560264
3243	NC_022655	ATA	2	6	202790	202795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560264
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3246	NC_022655	CTG	2	6	202908	202913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560264
3247	NC_022655	GC	3	6	202975	202980	0 %	0 %	50 %	50 %	556560264
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3350	NC_022655	GATG	2	8	211492	211499	25 %	25 %	50 %	0 %	556560272
3351	NC_022655	GAT	2	6	211519	211524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560272
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3353	NC_022655	TAT	2	6	211717	211722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560272
3354	NC_022655	TATCTG	2	12	211800	211811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	556560272
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3361	NC_022655	TA	3	6	212067	212072	50 %	50 %	0 %	0 %	556560272
3362	NC_022655	TGG	2	6	212204	212209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560272
3363	NC_022655	GTA	2	6	212231	212236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560272
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3474	NC_022655	TAC	2	6	218356	218361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560276
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3479	NC_022655	A	6	6	218520	218525	100 %	0 %	0 %	0 %	556560276
3480	NC_022655	TGCC	2	8	218637	218644	0 %	25 %	25 %	50 %	556560276
3481	NC_022655	TCG	2	6	218691	218696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560276
3482	NC_022655	GAA	2	6	218720	218725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560276
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3484	NC_022655	GAA	2	6	218819	218824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560276
3485	NC_022655	TACC	2	8	218848	218855	25 %	25 %	0 %	50 %	556560276
3486	NC_022655	CCAATT	2	12	218900	218911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560276
3487	NC_022655	GTC	2	6	219069	219074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560276
3488	NC_022655	TAC	2	6	219116	219121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560276
3489	NC_022655	TGA	2	6	219160	219165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560276
3490	NC_022655	CCT	2	6	219169	219174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560276
3491	NC_022655	GTGG	2	8	219203	219210	0 %	25 %	75 %	0 %	556560276
3492	NC_022655	GTT	2	6	219278	219283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560276
3493	NC_022655	GAT	2	6	219322	219327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560276
3494	NC_022655	ACC	2	6	219348	219353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560276
3495	NC_022655	GTG	2	6	219354	219359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560276
3496	NC_022655	CTT	2	6	219400	219405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560276
3497	NC_022655	GCCA	2	8	219439	219446	25 %	0 %	25 %	50 %	556560276
3498	NC_022655	GTT	2	6	219470	219475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560276
3499	NC_022655	TGG	2	6	219489	219494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560276
3500	NC_022655	AGA	2	6	219568	219573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560276

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