MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022655	TAGA	2	8	94846	94853	50 %	25 %	25 %	0 %	556560140
1502	NC_022655	TGA	2	6	94944	94949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560140
1503	NC_022655	T	6	6	95047	95052	0 %	100 %	0 %	0 %	556560140
1504	NC_022655	TCT	2	6	95135	95140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560140
1505	NC_022655	GTG	2	6	95152	95157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560140
1506	NC_022655	AAAT	2	8	95185	95192	75 %	25 %	0 %	0 %	556560140
1507	NC_022655	ATA	2	6	95213	95218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560140
1508	NC_022655	AT	3	6	95282	95287	50 %	50 %	0 %	0 %	556560140
1509	NC_022655	GAA	2	6	95322	95327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560140
1510	NC_022655	GA	3	6	95390	95395	50 %	0 %	50 %	0 %	556560140
1511	NC_022655	CTT	2	6	95412	95417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560140
1512	NC_022655	A	7	7	95946	95952	100 %	0 %	0 %	0 %	556560141
1513	NC_022655	TCAG	2	8	95976	95983	25 %	25 %	25 %	25 %	556560141
1514	NC_022655	TGC	2	6	95988	95993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560141
1515	NC_022655	GTT	2	6	95998	96003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560141
1516	NC_022655	ATCA	2	8	96036	96043	50 %	25 %	0 %	25 %	556560141
1517	NC_022655	ATT	2	6	96058	96063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560141
1518	NC_022655	TTC	2	6	96188	96193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560141
1519	NC_022655	AAT	2	6	96275	96280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560141
1520	NC_022655	A	7	7	96423	96429	100 %	0 %	0 %	0 %	556560142
1521	NC_022655	TAA	2	6	96431	96436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560142
1522	NC_022655	GCA	3	9	96478	96486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560142
1523	NC_022655	TAC	2	6	96528	96533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560142
1524	NC_022655	AGG	2	6	96583	96588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560142
1525	NC_022655	TA	3	6	96622	96627	50 %	50 %	0 %	0 %	556560142
1526	NC_022655	T	6	6	96686	96691	0 %	100 %	0 %	0 %	556560142
1527	NC_022655	ATT	2	6	96732	96737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560142
1528	NC_022655	TAT	2	6	96903	96908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560143
1529	NC_022655	GAT	2	6	96909	96914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560143
1530	NC_022655	TTG	2	6	96932	96937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560143
1531	NC_022655	CAA	2	6	96969	96974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560143
1532	NC_022655	T	6	6	97038	97043	0 %	100 %	0 %	0 %	556560143
1533	NC_022655	TAT	2	6	97082	97087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560143
1534	NC_022655	T	6	6	97092	97097	0 %	100 %	0 %	0 %	556560143
1535	NC_022655	A	7	7	97098	97104	100 %	0 %	0 %	0 %	556560143
1536	NC_022655	ATA	2	6	97116	97121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560143
1537	NC_022655	TGAA	2	8	98277	98284	50 %	25 %	25 %	0 %	556560144
1538	NC_022655	GAT	2	6	98286	98291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560144
1539	NC_022655	TTA	2	6	98301	98306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560144
1540	NC_022655	ATTTT	2	10	98336	98345	20 %	80 %	0 %	0 %	556560144
1541	NC_022655	ATTG	2	8	98348	98355	25 %	50 %	25 %	0 %	556560144
1542	NC_022655	TCAT	2	8	98428	98435	25 %	50 %	0 %	25 %	556560144
1543	NC_022655	A	7	7	98459	98465	100 %	0 %	0 %	0 %	556560144
1544	NC_022655	ATG	2	6	98500	98505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560144
1545	NC_022655	GA	3	6	98555	98560	50 %	0 %	50 %	0 %	556560144
1546	NC_022655	A	6	6	98618	98623	100 %	0 %	0 %	0 %	556560144
1547	NC_022655	GA	3	6	98650	98655	50 %	0 %	50 %	0 %	556560144
1548	NC_022655	CTA	2	6	98671	98676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560144
1549	NC_022655	T	7	7	98687	98693	0 %	100 %	0 %	0 %	556560144
1550	NC_022655	GGT	2	6	98769	98774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560144
1551	NC_022655	AGA	2	6	98796	98801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560144
1552	NC_022655	TAA	2	6	98803	98808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560144
1553	NC_022655	GAT	2	6	98811	98816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560144
1554	NC_022655	A	6	6	98824	98829	100 %	0 %	0 %	0 %	556560144
1555	NC_022655	TA	3	6	98847	98852	50 %	50 %	0 %	0 %	556560144
1556	NC_022655	ATC	2	6	98861	98866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560144
1557	NC_022655	T	6	6	98992	98997	0 %	100 %	0 %	0 %	556560144
1558	NC_022655	ATT	2	6	99064	99069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560144
1559	NC_022655	TA	3	6	99073	99078	50 %	50 %	0 %	0 %	556560144
1560	NC_022655	TAG	2	6	99217	99222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560144
1561	NC_022655	T	7	7	99282	99288	0 %	100 %	0 %	0 %	556560144
1562	NC_022655	T	6	6	99307	99312	0 %	100 %	0 %	0 %	556560144
1563	NC_022655	T	7	7	99671	99677	0 %	100 %	0 %	0 %	556560145
1564	NC_022655	TAA	2	6	99688	99693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560145
1565	NC_022655	ATTT	2	8	99876	99883	25 %	75 %	0 %	0 %	556560145
1566	NC_022655	AAC	2	6	99992	99997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560145
1567	NC_022655	TAC	2	6	100017	100022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560145
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1569	NC_022655	T	6	6	100055	100060	0 %	100 %	0 %	0 %	556560145
1570	NC_022655	TAT	2	6	100112	100117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560145
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1572	NC_022655	AAG	2	6	100203	100208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560145
1573	NC_022655	AG	3	6	100319	100324	50 %	0 %	50 %	0 %	556560145
1574	NC_022655	CGTG	2	8	100325	100332	0 %	25 %	50 %	25 %	556560145
1575	NC_022655	TTA	2	6	100344	100349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560145
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1577	NC_022655	ATC	2	6	100375	100380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560145
1578	NC_022655	A	7	7	100444	100450	100 %	0 %	0 %	0 %	556560145
1579	NC_022655	TAAA	2	8	100468	100475	75 %	25 %	0 %	0 %	556560145
1580	NC_022655	TGA	2	6	100520	100525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560145
1581	NC_022655	TTATCT	2	12	100548	100559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556560145
1582	NC_022655	AAT	2	6	100638	100643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560146
1583	NC_022655	GTAT	2	8	100679	100686	25 %	50 %	25 %	0 %	556560146
1584	NC_022655	ATA	2	6	100709	100714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560146
1585	NC_022655	TTTA	2	8	100731	100738	25 %	75 %	0 %	0 %	556560146
1586	NC_022655	A	8	8	100778	100785	100 %	0 %	0 %	0 %	556560146
1587	NC_022655	AAAT	2	8	101002	101009	75 %	25 %	0 %	0 %	556560147
1588	NC_022655	TGT	2	6	101034	101039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560147
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1591	NC_022655	GGA	2	6	101140	101145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560147
1592	NC_022655	GCG	2	6	101187	101192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560147
1593	NC_022655	AGC	2	6	101214	101219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560147
1594	NC_022655	ACA	2	6	101320	101325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560147
1595	NC_022655	CAA	2	6	101334	101339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560147
1596	NC_022655	GA	3	6	101352	101357	50 %	0 %	50 %	0 %	556560147
1597	NC_022655	A	6	6	101405	101410	100 %	0 %	0 %	0 %	556560148
1598	NC_022655	TTA	2	6	101417	101422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560148
1599	NC_022655	T	8	8	101423	101430	0 %	100 %	0 %	0 %	556560148
1600	NC_022655	TTTA	2	8	101436	101443	25 %	75 %	0 %	0 %	556560148
1601	NC_022655	ATC	2	6	101445	101450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560148
1602	NC_022655	T	6	6	101457	101462	0 %	100 %	0 %	0 %	556560148
1603	NC_022655	GAA	2	6	101482	101487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560148
1604	NC_022655	A	6	6	101490	101495	100 %	0 %	0 %	0 %	556560148
1605	NC_022655	ATT	2	6	101500	101505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560148
1606	NC_022655	T	7	7	101519	101525	0 %	100 %	0 %	0 %	556560148
1607	NC_022655	T	7	7	101609	101615	0 %	100 %	0 %	0 %	556560149
1608	NC_022655	AAGA	2	8	101788	101795	75 %	0 %	25 %	0 %	556560149
1609	NC_022655	TTA	2	6	101801	101806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560149
1610	NC_022655	TTTTAT	2	12	101817	101828	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	556560149
1611	NC_022655	GAA	2	6	101835	101840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560149
1612	NC_022655	TGA	2	6	101895	101900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560149
1613	NC_022655	TAT	2	6	101943	101948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560149
1614	NC_022655	TATT	2	8	101954	101961	25 %	75 %	0 %	0 %	556560149
1615	NC_022655	TCA	2	6	101978	101983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560149
1616	NC_022655	TAC	2	6	101991	101996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560149
1617	NC_022655	T	7	7	102001	102007	0 %	100 %	0 %	0 %	556560149
1618	NC_022655	ATCA	2	8	102022	102029	50 %	25 %	0 %	25 %	556560149
1619	NC_022655	TAA	2	6	102039	102044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560149
1620	NC_022655	TCAA	2	8	102059	102066	50 %	25 %	0 %	25 %	556560149
1621	NC_022655	AGA	2	6	102081	102086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560149
1622	NC_022655	ATG	2	6	102176	102181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560149
1623	NC_022655	AATC	2	8	102187	102194	50 %	25 %	0 %	25 %	556560149
1624	NC_022655	CTG	2	6	102289	102294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560149
1625	NC_022655	TAACAA	2	12	102312	102323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556560149
1626	NC_022655	TCA	2	6	102359	102364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560149
1627	NC_022655	AATC	2	8	102366	102373	50 %	25 %	0 %	25 %	556560149
1628	NC_022655	T	6	6	102381	102386	0 %	100 %	0 %	0 %	556560149
1629	NC_022655	TAT	2	6	102388	102393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560149
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1632	NC_022655	TAA	2	6	102474	102479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560149
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1640	NC_022655	TAA	2	6	102720	102725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560150
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1645	NC_022655	CAT	2	6	102930	102935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561962
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1648	NC_022655	T	6	6	102993	102998	0 %	100 %	0 %	0 %	556561962
1649	NC_022655	T	7	7	103004	103010	0 %	100 %	0 %	0 %	556561962
1650	NC_022655	TATC	2	8	103067	103074	25 %	50 %	0 %	25 %	556561962
1651	NC_022655	T	6	6	103143	103148	0 %	100 %	0 %	0 %	556561962
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1657	NC_022655	CTTA	2	8	103493	103500	25 %	50 %	0 %	25 %	556561962
1658	NC_022655	CTT	2	6	103555	103560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561962
1659	NC_022655	T	6	6	103559	103564	0 %	100 %	0 %	0 %	556561962
1660	NC_022655	CAAAG	2	10	103587	103596	60 %	0 %	20 %	20 %	556561962
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1665	NC_022655	AT	4	8	104190	104197	50 %	50 %	0 %	0 %	556560151
1666	NC_022655	A	7	7	105559	105565	100 %	0 %	0 %	0 %	556560152
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1720	NC_022655	CCAGCT	2	12	106975	106986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556560152
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1744	NC_022655	TTGA	2	8	109199	109206	25 %	50 %	25 %	0 %	556560153
1745	NC_022655	CAA	2	6	109393	109398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560154
1746	NC_022655	GTGAA	2	10	109556	109565	40 %	20 %	40 %	0 %	556560154
1747	NC_022655	GAA	2	6	109567	109572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560154
1748	NC_022655	AGCT	2	8	109598	109605	25 %	25 %	25 %	25 %	556560154
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1750	NC_022655	GAA	2	6	109870	109875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560155
1751	NC_022655	ATT	2	6	109882	109887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560155
1752	NC_022655	GGT	2	6	110011	110016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560155
1753	NC_022655	CGTG	2	8	110034	110041	0 %	25 %	50 %	25 %	556560155
1754	NC_022655	TGAT	2	8	110228	110235	25 %	50 %	25 %	0 %	556560155
1755	NC_022655	TGG	2	6	110243	110248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560155
1756	NC_022655	TGC	2	6	110295	110300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560155
1757	NC_022655	GAC	2	6	110316	110321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560155
1758	NC_022655	ATC	2	6	110347	110352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560155
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1761	NC_022655	TGA	2	6	110553	110558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560155
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1763	NC_022655	GAT	2	6	110865	110870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560155
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1765	NC_022655	TGCG	2	8	110918	110925	0 %	25 %	50 %	25 %	556560155
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1775	NC_022655	GAA	2	6	111556	111561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560155
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1778	NC_022655	CAG	2	6	111686	111691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560155
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1781	NC_022655	TTC	2	6	112121	112126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560157
1782	NC_022655	ATC	2	6	112140	112145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560157
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1785	NC_022655	CAGA	2	8	112348	112355	50 %	0 %	25 %	25 %	556560157
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1787	NC_022655	AGAT	2	8	112409	112416	50 %	25 %	25 %	0 %	556560157
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1792	NC_022655	TAG	2	6	112777	112782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560157
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1836	NC_022655	GATG	2	8	115699	115706	25 %	25 %	50 %	0 %	556560162
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1842	NC_022655	TCAGGG	2	12	116283	116294	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556560163
1843	NC_022655	GACA	2	8	116325	116332	50 %	0 %	25 %	25 %	556560163
1844	NC_022655	AAGA	2	8	116386	116393	75 %	0 %	25 %	0 %	556560163
1845	NC_022655	CTA	2	6	116424	116429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560163
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1852	NC_022655	GAG	2	6	116660	116665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560164
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1854	NC_022655	CA	3	6	116894	116899	50 %	0 %	0 %	50 %	556560164
1855	NC_022655	TTG	2	6	116937	116942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560164
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1859	NC_022655	CTTC	2	8	117192	117199	0 %	50 %	0 %	50 %	556560164
1860	NC_022655	AGC	2	6	117202	117207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560164
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1863	NC_022655	AGC	2	6	117319	117324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560164
1864	NC_022655	ATC	2	6	117347	117352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560164
1865	NC_022655	C	6	6	117352	117357	0 %	0 %	0 %	100 %	556560164
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1867	NC_022655	TCT	2	6	119550	119555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560165
1868	NC_022655	AG	3	6	119559	119564	50 %	0 %	50 %	0 %	556560165
1869	NC_022655	CTGC	2	8	119570	119577	0 %	25 %	25 %	50 %	556560165
1870	NC_022655	ATAAAT	2	12	119627	119638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560165
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1995	NC_022655	TTCC	2	8	128612	128619	0 %	50 %	0 %	50 %	556560172
1996	NC_022655	TGCT	2	8	128626	128633	0 %	50 %	25 %	25 %	556560172
1997	NC_022655	TGT	2	6	128636	128641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560172
1998	NC_022655	T	6	6	128658	128663	0 %	100 %	0 %	0 %	556560172
1999	NC_022655	GAAAT	2	10	128680	128689	60 %	20 %	20 %	0 %	556560172
2000	NC_022655	TGC	2	6	128702	128707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560172

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