MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022655	T	6	6	62940	62945	0 %	100 %	0 %	0 %	556560110
1002	NC_022655	A	6	6	62955	62960	100 %	0 %	0 %	0 %	556560110
1003	NC_022655	CGT	2	6	63063	63068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560110
1004	NC_022655	GAA	2	6	63215	63220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560110
1005	NC_022655	TGA	2	6	63240	63245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560110
1006	NC_022655	GAG	2	6	63395	63400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560110
1007	NC_022655	T	6	6	63406	63411	0 %	100 %	0 %	0 %	556560110
1008	NC_022655	TTGA	2	8	63509	63516	25 %	50 %	25 %	0 %	556560110
1009	NC_022655	GA	3	6	63521	63526	50 %	0 %	50 %	0 %	556560110
1010	NC_022655	GTG	2	6	63656	63661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560110
1011	NC_022655	GGT	2	6	63788	63793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560110
1012	NC_022655	TGGG	2	8	63837	63844	0 %	25 %	75 %	0 %	556560110
1013	NC_022655	CAG	2	6	63856	63861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560110
1014	NC_022655	CT	3	6	63902	63907	0 %	50 %	0 %	50 %	556560110
1015	NC_022655	TCG	2	6	64158	64163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560111
1016	NC_022655	TACAGG	2	12	64179	64190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556560111
1017	NC_022655	CGT	2	6	64204	64209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560111
1018	NC_022655	ACA	2	6	64224	64229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560111
1019	NC_022655	AAC	2	6	64237	64242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560111
1020	NC_022655	AAAAAC	2	12	64280	64291	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	556560111
1021	NC_022655	CTT	2	6	64387	64392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560111
1022	NC_022655	CGT	2	6	64399	64404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560111
1023	NC_022655	GTT	2	6	64414	64419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560111
1024	NC_022655	ACT	2	6	64438	64443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560111
1025	NC_022655	CGT	2	6	64444	64449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560111
1026	NC_022655	TTG	2	6	64484	64489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560111
1027	NC_022655	CAT	2	6	64511	64516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560111
1028	NC_022655	CGA	2	6	64671	64676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560111
1029	NC_022655	ACA	2	6	64718	64723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560111
1030	NC_022655	TGT	2	6	64727	64732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560111
1031	NC_022655	GGA	2	6	66244	66249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560112
1032	NC_022655	GA	3	6	66277	66282	50 %	0 %	50 %	0 %	556560112
1033	NC_022655	ATTCT	2	10	66329	66338	20 %	60 %	0 %	20 %	556560112
1034	NC_022655	ATAG	2	8	66404	66411	50 %	25 %	25 %	0 %	556560112
1035	NC_022655	TAT	2	6	66478	66483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560112
1036	NC_022655	TGT	2	6	66609	66614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560112
1037	NC_022655	CTT	2	6	66622	66627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560112
1038	NC_022655	ATC	2	6	66638	66643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560112
1039	NC_022655	ATC	2	6	66690	66695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560112
1040	NC_022655	AAG	2	6	66717	66722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560112
1041	NC_022655	CGA	2	6	66816	66821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560112
1042	NC_022655	CTA	2	6	66841	66846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560112
1043	NC_022655	AGC	2	6	66850	66855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560112
1044	NC_022655	TCT	2	6	66978	66983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560112
1045	NC_022655	CA	3	6	66993	66998	50 %	0 %	0 %	50 %	556560112
1046	NC_022655	CAG	2	6	67065	67070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560112
1047	NC_022655	GCA	2	6	67085	67090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560112
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1049	NC_022655	CTTG	2	8	67141	67148	0 %	50 %	25 %	25 %	556560112
1050	NC_022655	A	6	6	67202	67207	100 %	0 %	0 %	0 %	556560113
1051	NC_022655	A	6	6	67215	67220	100 %	0 %	0 %	0 %	556560113
1052	NC_022655	A	6	6	67222	67227	100 %	0 %	0 %	0 %	556560113
1053	NC_022655	TCT	2	6	67270	67275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560113
1054	NC_022655	CT	3	6	67302	67307	0 %	50 %	0 %	50 %	556560113
1055	NC_022655	ATT	2	6	67335	67340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560113
1056	NC_022655	CCT	2	6	67361	67366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560113
1057	NC_022655	CTT	2	6	67382	67387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560113
1058	NC_022655	CAA	2	6	67510	67515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560113
1059	NC_022655	T	6	6	67560	67565	0 %	100 %	0 %	0 %	556560113
1060	NC_022655	TGT	2	6	67588	67593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560113
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1062	NC_022655	ATC	2	6	67698	67703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560113
1063	NC_022655	CTT	2	6	67715	67720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560113
1064	NC_022655	AAG	2	6	67722	67727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560113
1065	NC_022655	TTC	2	6	67788	67793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560113
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1067	NC_022655	CAA	2	6	67938	67943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560113
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1073	NC_022655	TGC	2	6	70190	70195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560114
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1079	NC_022655	AAGA	2	8	70401	70408	75 %	0 %	25 %	0 %	556560114
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1081	NC_022655	CTT	2	6	70509	70514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560114
1082	NC_022655	AC	3	6	70537	70542	50 %	0 %	0 %	50 %	556560114
1083	NC_022655	ACA	2	6	70633	70638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560114
1084	NC_022655	GGT	2	6	70680	70685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560114
1085	NC_022655	GGA	2	6	70752	70757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560114
1086	NC_022655	TGGGA	2	10	70800	70809	20 %	20 %	60 %	0 %	556560114
1087	NC_022655	CAACC	2	10	70856	70865	40 %	0 %	0 %	60 %	556560114
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1092	NC_022655	ATG	2	6	72670	72675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560115
1093	NC_022655	ATT	2	6	72692	72697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560115
1094	NC_022655	TAA	2	6	72707	72712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560115
1095	NC_022655	TACT	2	8	72713	72720	25 %	50 %	0 %	25 %	556560115
1096	NC_022655	A	6	6	72774	72779	100 %	0 %	0 %	0 %	556560115
1097	NC_022655	AT	3	6	72788	72793	50 %	50 %	0 %	0 %	556560115
1098	NC_022655	A	8	8	72969	72976	100 %	0 %	0 %	0 %	556560116
1099	NC_022655	TTCC	2	8	72992	72999	0 %	50 %	0 %	50 %	556560116
1100	NC_022655	TAG	2	6	73125	73130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560116
1101	NC_022655	TAT	2	6	73144	73149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560116
1102	NC_022655	TAA	2	6	73161	73166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560116
1103	NC_022655	AT	3	6	73169	73174	50 %	50 %	0 %	0 %	556560116
1104	NC_022655	AT	4	8	73205	73212	50 %	50 %	0 %	0 %	556560116
1105	NC_022655	AAAG	2	8	73273	73280	75 %	0 %	25 %	0 %	556560116
1106	NC_022655	AAC	2	6	73288	73293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560116
1107	NC_022655	T	6	6	73320	73325	0 %	100 %	0 %	0 %	556560116
1108	NC_022655	ATT	2	6	73363	73368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560116
1109	NC_022655	CTTAG	2	10	73403	73412	20 %	40 %	20 %	20 %	556560116
1110	NC_022655	T	6	6	73428	73433	0 %	100 %	0 %	0 %	556560116
1111	NC_022655	T	6	6	73447	73452	0 %	100 %	0 %	0 %	556560116
1112	NC_022655	A	6	6	73460	73465	100 %	0 %	0 %	0 %	556560116
1113	NC_022655	A	7	7	73494	73500	100 %	0 %	0 %	0 %	556560116
1114	NC_022655	AAAG	2	8	73506	73513	75 %	0 %	25 %	0 %	556560116
1115	NC_022655	ATC	2	6	73539	73544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560116
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1117	NC_022655	T	6	6	73616	73621	0 %	100 %	0 %	0 %	556560116
1118	NC_022655	T	6	6	73629	73634	0 %	100 %	0 %	0 %	556560116
1119	NC_022655	CGC	2	6	73688	73693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556560116
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1122	NC_022655	GCTT	2	8	73825	73832	0 %	50 %	25 %	25 %	556560116
1123	NC_022655	TTTC	2	8	73853	73860	0 %	75 %	0 %	25 %	556560116
1124	NC_022655	GCAA	2	8	73989	73996	50 %	0 %	25 %	25 %	556560116
1125	NC_022655	ATC	2	6	74037	74042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560116
1126	NC_022655	A	6	6	74220	74225	100 %	0 %	0 %	0 %	556560116
1127	NC_022655	TAC	2	6	74234	74239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560116
1128	NC_022655	TCCC	2	8	74288	74295	0 %	25 %	0 %	75 %	556560116
1129	NC_022655	CT	3	6	74349	74354	0 %	50 %	0 %	50 %	556560116
1130	NC_022655	CGT	2	6	74381	74386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560116
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1132	NC_022655	TC	3	6	74438	74443	0 %	50 %	0 %	50 %	556560116
1133	NC_022655	TCA	2	6	74517	74522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560116
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1137	NC_022655	GTG	2	6	74699	74704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560116
1138	NC_022655	AGC	2	6	74730	74735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560116
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1142	NC_022655	ATG	2	6	74858	74863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560116
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1148	NC_022655	TA	3	6	75180	75185	50 %	50 %	0 %	0 %	556560117
1149	NC_022655	T	6	6	75198	75203	0 %	100 %	0 %	0 %	556560117
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1152	NC_022655	T	6	6	75241	75246	0 %	100 %	0 %	0 %	556560117
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1159	NC_022655	TA	3	6	75364	75369	50 %	50 %	0 %	0 %	556560117
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1243	NC_022655	ATT	2	6	79742	79747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560124
1244	NC_022655	AGATA	2	10	79880	79889	60 %	20 %	20 %	0 %	556560124
1245	NC_022655	GGTA	2	8	79940	79947	25 %	25 %	50 %	0 %	556560124
1246	NC_022655	ATA	2	6	79995	80000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560124
1247	NC_022655	TTA	2	6	80016	80021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560124
1248	NC_022655	T	6	6	80041	80046	0 %	100 %	0 %	0 %	556560124
1249	NC_022655	GTTTG	2	10	80047	80056	0 %	60 %	40 %	0 %	556560124
1250	NC_022655	A	6	6	80100	80105	100 %	0 %	0 %	0 %	556560124
1251	NC_022655	GAG	3	9	80126	80134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560124
1252	NC_022655	GGT	2	6	80225	80230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560124
1253	NC_022655	TGA	2	6	80287	80292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560124
1254	NC_022655	TAGA	2	8	80324	80331	50 %	25 %	25 %	0 %	556560124
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1256	NC_022655	AAG	3	9	80373	80381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560124
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