MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022655	TGA	2	6	277142	277147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560328
4502	NC_022655	GAAT	2	8	277260	277267	50 %	25 %	25 %	0 %	556560329
4503	NC_022655	TAA	2	6	277305	277310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560329
4504	NC_022655	A	6	6	277309	277314	100 %	0 %	0 %	0 %	556560329
4505	NC_022655	AATT	2	8	277392	277399	50 %	50 %	0 %	0 %	556560329
4506	NC_022655	ATT	2	6	277412	277417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560329
4507	NC_022655	T	6	6	277463	277468	0 %	100 %	0 %	0 %	556560329
4508	NC_022655	GAA	2	6	277514	277519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560329
4509	NC_022655	TGA	2	6	277549	277554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
4510	NC_022655	TAAA	2	8	277572	277579	75 %	25 %	0 %	0 %	556560329
4511	NC_022655	TTA	2	6	277580	277585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560329
4512	NC_022655	TGA	2	6	277609	277614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
4513	NC_022655	TGA	2	6	277621	277626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
4514	NC_022655	ACG	2	6	277756	277761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560329
4515	NC_022655	ATT	2	6	277773	277778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560329
4516	NC_022655	T	6	6	277793	277798	0 %	100 %	0 %	0 %	556560329
4517	NC_022655	T	6	6	277829	277834	0 %	100 %	0 %	0 %	556560329
4518	NC_022655	AGA	2	6	277852	277857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560329
4519	NC_022655	TAC	2	6	277917	277922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560329
4520	NC_022655	TAG	2	6	277929	277934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
4521	NC_022655	A	6	6	277981	277986	100 %	0 %	0 %	0 %	556560329
4522	NC_022655	TGA	2	6	278005	278010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
4523	NC_022655	AG	3	6	278017	278022	50 %	0 %	50 %	0 %	556560329
4524	NC_022655	TTCT	2	8	278040	278047	0 %	75 %	0 %	25 %	556560329
4525	NC_022655	CAA	2	6	278126	278131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560329
4526	NC_022655	A	7	7	278136	278142	100 %	0 %	0 %	0 %	556560329
4527	NC_022655	AGA	2	6	278145	278150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560329
4528	NC_022655	GAA	2	6	278159	278164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560329
4529	NC_022655	A	7	7	278170	278176	100 %	0 %	0 %	0 %	556560329
4530	NC_022655	TTTA	2	8	278179	278186	25 %	75 %	0 %	0 %	556560329
4531	NC_022655	GAT	2	6	278210	278215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
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4533	NC_022655	AT	3	6	278349	278354	50 %	50 %	0 %	0 %	556560329
4534	NC_022655	GAT	2	6	278414	278419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
4535	NC_022655	GCT	2	6	278450	278455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560329
4536	NC_022655	AG	3	6	278470	278475	50 %	0 %	50 %	0 %	556560329
4537	NC_022655	GTT	2	6	278573	278578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560329
4538	NC_022655	TAT	2	6	278591	278596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560329
4539	NC_022655	GT	3	6	278691	278696	0 %	50 %	50 %	0 %	556560329
4540	NC_022655	TGA	2	6	278707	278712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
4541	NC_022655	ATC	2	6	278767	278772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560329
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4543	NC_022655	T	6	6	278827	278832	0 %	100 %	0 %	0 %	556560329
4544	NC_022655	CTTTA	2	10	278919	278928	20 %	60 %	0 %	20 %	556560329
4545	NC_022655	GAA	2	6	278945	278950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560329
4546	NC_022655	GTT	2	6	278960	278965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560329
4547	NC_022655	T	6	6	278964	278969	0 %	100 %	0 %	0 %	556560329
4548	NC_022655	A	6	6	278973	278978	100 %	0 %	0 %	0 %	556560329
4549	NC_022655	TCT	2	6	279091	279096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560329
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4551	NC_022655	TC	3	6	279150	279155	0 %	50 %	0 %	50 %	556560329
4552	NC_022655	ATG	2	6	279165	279170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560329
4553	NC_022655	TTA	2	6	279213	279218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560329
4554	NC_022655	AGG	2	6	279240	279245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560329
4555	NC_022655	GCA	2	6	279275	279280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560330
4556	NC_022655	GA	3	6	279343	279348	50 %	0 %	50 %	0 %	556560330
4557	NC_022655	TGA	2	6	279358	279363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560330
4558	NC_022655	TAAAT	2	10	279373	279382	60 %	40 %	0 %	0 %	556560330
4559	NC_022655	CAT	2	6	279410	279415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560330
4560	NC_022655	CAAAC	2	10	279419	279428	60 %	0 %	0 %	40 %	556560330
4561	NC_022655	AGTGG	2	10	279446	279455	20 %	20 %	60 %	0 %	556560330
4562	NC_022655	ATT	2	6	279514	279519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560330
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4564	NC_022655	AAC	3	9	279624	279632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560331
4565	NC_022655	GA	3	6	279636	279641	50 %	0 %	50 %	0 %	556560331
4566	NC_022655	CTAA	2	8	279647	279654	50 %	25 %	0 %	25 %	556560331
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4571	NC_022655	TTA	2	6	279738	279743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560331
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4591	NC_022655	TG	3	6	280741	280746	0 %	50 %	50 %	0 %	556560332
4592	NC_022655	TTA	2	6	280762	280767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560332
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4601	NC_022655	TAT	2	6	281255	281260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560332
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4603	NC_022655	CTA	2	6	281311	281316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560332
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4606	NC_022655	CAG	2	6	281410	281415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560332
4607	NC_022655	GCA	2	6	281454	281459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560332
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4610	NC_022655	TAGATA	2	12	281916	281927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556560333
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4617	NC_022655	GA	4	8	282921	282928	50 %	0 %	50 %	0 %	556560334
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4620	NC_022655	TGG	2	6	283044	283049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560334
4621	NC_022655	TATC	2	8	283123	283130	25 %	50 %	0 %	25 %	556560334
4622	NC_022655	GT	3	6	283132	283137	0 %	50 %	50 %	0 %	556560334
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4747	NC_022655	CTT	2	6	291609	291614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560340
4748	NC_022655	AGC	2	6	291622	291627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560340
4749	NC_022655	TCA	2	6	291632	291637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560340
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4751	NC_022655	TCA	2	6	291726	291731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560340
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4862	NC_022655	TGC	2	6	296872	296877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560346
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4864	NC_022655	AAAGA	2	10	296993	297002	80 %	0 %	20 %	0 %	556560346
4865	NC_022655	ACA	2	6	297008	297013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560346
4866	NC_022655	ATC	2	6	297038	297043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560346
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4991	NC_022655	CCT	2	6	303273	303278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560354
4992	NC_022655	GCTC	2	8	303337	303344	0 %	25 %	25 %	50 %	556560354
4993	NC_022655	GAA	2	6	303346	303351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560354
4994	NC_022655	GAGAA	2	10	303391	303400	60 %	0 %	40 %	0 %	556560354
4995	NC_022655	AGA	2	6	303437	303442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560354
4996	NC_022655	A	6	6	303451	303456	100 %	0 %	0 %	0 %	556560354
4997	NC_022655	ATAGT	2	10	303496	303505	40 %	40 %	20 %	0 %	556560354
4998	NC_022655	CTTT	2	8	303512	303519	0 %	75 %	0 %	25 %	556560354
4999	NC_022655	T	7	7	303558	303564	0 %	100 %	0 %	0 %	556560354
5000	NC_022655	CAG	2	6	303585	303590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560354

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