MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 plasmid pDT104

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022570	A	6	6	1455	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	550903931
2	NC_022570	T	6	6	4134	4139	0 %	100 %	0 %	0 %	550903937
3	NC_022570	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	550903937
4	NC_022570	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	550903937
5	NC_022570	A	7	7	4696	4702	100 %	0 %	0 %	0 %	550903937
6	NC_022570	T	7	7	5539	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	550903938
7	NC_022570	T	6	6	5977	5982	0 %	100 %	0 %	0 %	550903939
8	NC_022570	A	6	6	7265	7270	100 %	0 %	0 %	0 %	550903940
9	NC_022570	C	6	6	9382	9387	0 %	0 %	0 %	100 %	550903943
10	NC_022570	C	6	6	9913	9918	0 %	0 %	0 %	100 %	550903944
11	NC_022570	C	6	6	11009	11014	0 %	0 %	0 %	100 %	550903946
12	NC_022570	T	6	6	12279	12284	0 %	100 %	0 %	0 %	550903946
13	NC_022570	A	6	6	15739	15744	100 %	0 %	0 %	0 %	550903949
14	NC_022570	T	6	6	17626	17631	0 %	100 %	0 %	0 %	550903951
15	NC_022570	A	6	6	19021	19026	100 %	0 %	0 %	0 %	550903953
16	NC_022570	A	6	6	21420	21425	100 %	0 %	0 %	0 %	550903957
17	NC_022570	G	6	6	22700	22705	0 %	0 %	100 %	0 %	550903959
18	NC_022570	T	6	6	25470	25475	0 %	100 %	0 %	0 %	550903963
19	NC_022570	T	7	7	26323	26329	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
20	NC_022570	T	6	6	26392	26397	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
21	NC_022570	T	6	6	26858	26863	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
22	NC_022570	A	7	7	31689	31695	100 %	0 %	0 %	0 %	550903969
23	NC_022570	T	6	6	31794	31799	0 %	100 %	0 %	0 %	550903969
24	NC_022570	T	6	6	31952	31957	0 %	100 %	0 %	0 %	550903969
25	NC_022570	T	6	6	31990	31995	0 %	100 %	0 %	0 %	550903969
26	NC_022570	T	6	6	32289	32294	0 %	100 %	0 %	0 %	550903969
27	NC_022570	T	6	6	34753	34758	0 %	100 %	0 %	0 %	550903971
28	NC_022570	T	6	6	37653	37658	0 %	100 %	0 %	0 %	550903974
29	NC_022570	T	6	6	43053	43058	0 %	100 %	0 %	0 %	550903980
30	NC_022570	G	6	6	46613	46618	0 %	0 %	100 %	0 %	550903983
31	NC_022570	T	7	7	47207	47213	0 %	100 %	0 %	0 %	550903983
32	NC_022570	A	6	6	49664	49669	100 %	0 %	0 %	0 %	550903987
33	NC_022570	A	6	6	52306	52311	100 %	0 %	0 %	0 %	550903990
34	NC_022570	A	6	6	52739	52744	100 %	0 %	0 %	0 %	550903991
35	NC_022570	A	6	6	53584	53589	100 %	0 %	0 %	0 %	550903992
36	NC_022570	T	7	7	53651	53657	0 %	100 %	0 %	0 %	550903992
37	NC_022570	A	6	6	57128	57133	100 %	0 %	0 %	0 %	550903995
38	NC_022570	T	6	6	57574	57579	0 %	100 %	0 %	0 %	550903996
39	NC_022570	T	6	6	57957	57962	0 %	100 %	0 %	0 %	550903997
40	NC_022570	C	6	6	60351	60356	0 %	0 %	0 %	100 %	550903998
41	NC_022570	T	7	7	62050	62056	0 %	100 %	0 %	0 %	550904000
42	NC_022570	T	6	6	62138	62143	0 %	100 %	0 %	0 %	550904000
43	NC_022570	A	6	6	63282	63287	100 %	0 %	0 %	0 %	550904002
44	NC_022570	T	6	6	63803	63808	0 %	100 %	0 %	0 %	550904003
45	NC_022570	A	6	6	63981	63986	100 %	0 %	0 %	0 %	550904003
46	NC_022570	G	6	6	65521	65526	0 %	0 %	100 %	0 %	550904005
47	NC_022570	A	6	6	66691	66696	100 %	0 %	0 %	0 %	550904006
48	NC_022570	T	6	6	67411	67416	0 %	100 %	0 %	0 %	550904008
49	NC_022570	A	6	6	67826	67831	100 %	0 %	0 %	0 %	550904010
50	NC_022570	A	8	8	69176	69183	100 %	0 %	0 %	0 %	550904011
51	NC_022570	A	6	6	70427	70432	100 %	0 %	0 %	0 %	550904011
52	NC_022570	T	6	6	71467	71472	0 %	100 %	0 %	0 %	550904012
53	NC_022570	A	6	6	71488	71493	100 %	0 %	0 %	0 %	550904012
54	NC_022570	G	6	6	73368	73373	0 %	0 %	100 %	0 %	550904015
55	NC_022570	A	6	6	77067	77072	100 %	0 %	0 %	0 %	550904019
56	NC_022570	T	7	7	77843	77849	0 %	100 %	0 %	0 %	550904020
57	NC_022570	A	6	6	78754	78759	100 %	0 %	0 %	0 %	550904022
58	NC_022570	T	6	6	78902	78907	0 %	100 %	0 %	0 %	550904022
59	NC_022570	G	6	6	79028	79033	0 %	0 %	100 %	0 %	550904022
60	NC_022570	T	6	6	80492	80497	0 %	100 %	0 %	0 %	550904023
61	NC_022570	G	6	6	80516	80521	0 %	0 %	100 %	0 %	550904023
62	NC_022570	A	6	6	82494	82499	100 %	0 %	0 %	0 %	550904023
63	NC_022570	A	8	8	82918	82925	100 %	0 %	0 %	0 %	550904024
64	NC_022570	T	6	6	84778	84783	0 %	100 %	0 %	0 %	550904026
65	NC_022570	A	6	6	84889	84894	100 %	0 %	0 %	0 %	550904026
66	NC_022570	A	6	6	85391	85396	100 %	0 %	0 %	0 %	550904026
67	NC_022570	A	6	6	86395	86400	100 %	0 %	0 %	0 %	550904026
68	NC_022570	C	6	6	86491	86496	0 %	0 %	0 %	100 %	550904026
69	NC_022570	T	6	6	86921	86926	0 %	100 %	0 %	0 %	550904027
70	NC_022570	T	6	6	87019	87024	0 %	100 %	0 %	0 %	550904027
71	NC_022570	C	6	6	91323	91328	0 %	0 %	0 %	100 %	550904028
72	NC_022570	T	6	6	93338	93343	0 %	100 %	0 %	0 %	550904029
73	NC_022570	A	8	8	93613	93620	100 %	0 %	0 %	0 %	550904030

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.