MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 plasmid pDT104

Total Repeats: 1578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022570	CA	3	6	89749	89754	50 %	0 %	0 %	50 %	550904028
1502	NC_022570	CTG	2	6	89841	89846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1503	NC_022570	GCC	2	6	89934	89939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550904028
1504	NC_022570	CAG	2	6	89966	89971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1505	NC_022570	GGT	2	6	89992	89997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904028
1506	NC_022570	TCAG	2	8	90018	90025	25 %	25 %	25 %	25 %	550904028
1507	NC_022570	CTG	2	6	90032	90037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1508	NC_022570	TGC	2	6	90055	90060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1509	NC_022570	ATGTGG	2	12	90129	90140	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	550904028
1510	NC_022570	CTG	2	6	90161	90166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1511	NC_022570	CGT	2	6	90177	90182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1512	NC_022570	CAT	2	6	90206	90211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550904028
1513	NC_022570	AGG	2	6	90225	90230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550904028
1514	NC_022570	GCC	2	6	90296	90301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550904028
1515	NC_022570	CGAAA	2	10	90316	90325	60 %	0 %	20 %	20 %	550904028
1516	NC_022570	ACC	2	6	90368	90373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550904028
1517	NC_022570	CTG	2	6	90404	90409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1518	NC_022570	CGT	2	6	90430	90435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1519	NC_022570	GACC	2	8	90444	90451	25 %	0 %	25 %	50 %	550904028
1520	NC_022570	GCA	2	6	90529	90534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1521	NC_022570	TCC	2	6	90573	90578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550904028
1522	NC_022570	TGA	2	6	90580	90585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550904028
1523	NC_022570	TGG	2	6	90594	90599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904028
1524	NC_022570	GGT	3	9	90641	90649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904028
1525	NC_022570	GCA	2	6	90715	90720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1526	NC_022570	CAT	2	6	90745	90750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550904028
1527	NC_022570	AGG	2	6	90948	90953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550904028
1528	NC_022570	AGC	2	6	91131	91136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1529	NC_022570	ACC	2	6	91157	91162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550904028
1530	NC_022570	TGG	2	6	91230	91235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904028
1531	NC_022570	AGG	2	6	91269	91274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550904028
1532	NC_022570	C	6	6	91323	91328	0 %	0 %	0 %	100 %	550904028
1533	NC_022570	AGC	2	6	91333	91338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1534	NC_022570	CGG	2	6	91458	91463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550904028
1535	NC_022570	GTG	2	6	91508	91513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904028
1536	NC_022570	AGC	2	6	91683	91688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1537	NC_022570	CGA	2	6	91705	91710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1538	NC_022570	GGGTT	2	10	91717	91726	0 %	40 %	60 %	0 %	550904028
1539	NC_022570	GAA	2	6	91798	91803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550904028
1540	NC_022570	GCC	2	6	91847	91852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550904028
1541	NC_022570	GCCGT	2	10	91854	91863	0 %	20 %	40 %	40 %	550904028
1542	NC_022570	CCG	2	6	91977	91982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550904028
1543	NC_022570	CTG	2	6	92111	92116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1544	NC_022570	GCG	2	6	92166	92171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550904028
1545	NC_022570	TGG	2	6	92172	92177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904028
1546	NC_022570	CGG	2	6	92224	92229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550904028
1547	NC_022570	GGCA	2	8	92316	92323	25 %	0 %	50 %	25 %	550904028
1548	NC_022570	CCG	2	6	92335	92340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550904028
1549	NC_022570	GGA	2	6	92404	92409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550904028
1550	NC_022570	TGC	2	6	92499	92504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1551	NC_022570	GCA	2	6	92572	92577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904028
1552	NC_022570	ACGATG	2	12	92652	92663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550904029
1553	NC_022570	CTG	2	6	92721	92726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904029
1554	NC_022570	AG	3	6	92743	92748	50 %	0 %	50 %	0 %	550904029
1555	NC_022570	TCA	2	6	92752	92757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550904029
1556	NC_022570	GCT	3	9	92768	92776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904029
1557	NC_022570	TGG	2	6	92779	92784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904029
1558	NC_022570	GTG	2	6	93032	93037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904029
1559	NC_022570	AGC	2	6	93040	93045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904029
1560	NC_022570	CTG	2	6	93078	93083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550904029
1561	NC_022570	GTGCTG	2	12	93129	93140	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	550904029
1562	NC_022570	GAA	2	6	93177	93182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550904029
1563	NC_022570	GCCT	2	8	93198	93205	0 %	25 %	25 %	50 %	550904029
1564	NC_022570	GTG	2	6	93207	93212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904029
1565	NC_022570	CGG	2	6	93250	93255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550904029
1566	NC_022570	T	6	6	93338	93343	0 %	100 %	0 %	0 %	550904029
1567	NC_022570	ATT	2	6	93528	93533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550904030
1568	NC_022570	CAC	2	6	93539	93544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550904030
1569	NC_022570	GAA	2	6	93563	93568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550904030
1570	NC_022570	CAG	2	6	93570	93575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550904030
1571	NC_022570	A	8	8	93613	93620	100 %	0 %	0 %	0 %	550904030
1572	NC_022570	TCAG	2	8	93659	93666	25 %	25 %	25 %	25 %	550904030
1573	NC_022570	GGA	2	6	93668	93673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550904030
1574	NC_022570	TGG	2	6	93696	93701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550904030
1575	NC_022570	GCGT	2	8	93745	93752	0 %	25 %	50 %	25 %	550904030
1576	NC_022570	CA	3	6	93796	93801	50 %	0 %	0 %	50 %	550904030
1577	NC_022570	GGA	2	6	93917	93922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550904030
1578	NC_022570	CG	3	6	93987	93992	0 %	0 %	50 %	50 %	550904030

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