MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 2726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022544	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	549722730
2	NC_022544	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	549722731
3	NC_022544	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	549722732
4	NC_022544	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	549722734
5	NC_022544	GATGA	2	10	8915	8924	40 %	20 %	40 %	0 %	549722736
6	NC_022544	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	549722741
7	NC_022544	AATCA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	549722742
8	NC_022544	GGCTG	2	10	18851	18860	0 %	20 %	60 %	20 %	549722746
9	NC_022544	AGAGC	2	10	19372	19381	40 %	0 %	40 %	20 %	549722746
10	NC_022544	CCTGA	2	10	19913	19922	20 %	20 %	20 %	40 %	549722746
11	NC_022544	TACCG	2	10	21050	21059	20 %	20 %	20 %	40 %	549722747
12	NC_022544	GGCCG	2	10	21674	21683	0 %	0 %	60 %	40 %	549722747
13	NC_022544	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	549722748
14	NC_022544	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	549722749
15	NC_022544	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	549722749
16	NC_022544	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	549722750
17	NC_022544	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	549722751
18	NC_022544	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	549722755
19	NC_022544	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	549722755
20	NC_022544	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	549722756
21	NC_022544	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	549722757
22	NC_022544	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	549722758
23	NC_022544	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	549722759
24	NC_022544	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	549722761
25	NC_022544	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	549722761
26	NC_022544	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	549722762
27	NC_022544	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	549722763
28	NC_022544	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	549722764
29	NC_022544	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	549722767
30	NC_022544	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	549722767
31	NC_022544	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	549722768
32	NC_022544	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	549722770
33	NC_022544	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	549722770
34	NC_022544	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	549722770
35	NC_022544	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	549722770
36	NC_022544	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	549722774
37	NC_022544	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	549722775
38	NC_022544	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	549722775
39	NC_022544	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	549722776
40	NC_022544	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	549722777
41	NC_022544	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	549722779
42	NC_022544	GGAAA	2	10	59739	59748	60 %	0 %	40 %	0 %	549722779
43	NC_022544	CGCTG	2	10	60229	60238	0 %	20 %	40 %	40 %	549722780
44	NC_022544	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	549722783
45	NC_022544	CGTGC	2	10	71365	71374	0 %	20 %	40 %	40 %	549722789
46	NC_022544	TTGAT	2	10	71535	71544	20 %	60 %	20 %	0 %	549722789
47	NC_022544	ACCGC	2	10	72095	72104	20 %	0 %	20 %	60 %	549722789
48	NC_022544	CGATG	2	10	77759	77768	20 %	20 %	40 %	20 %	549722794
49	NC_022544	GCGAA	2	10	78700	78709	40 %	0 %	40 %	20 %	549722794
50	NC_022544	CGTAC	2	10	79590	79599	20 %	20 %	20 %	40 %	549722794
51	NC_022544	TTGCC	2	10	81226	81235	0 %	40 %	20 %	40 %	549722796
52	NC_022544	CGTCC	2	10	81336	81345	0 %	20 %	20 %	60 %	549722796
53	NC_022544	TTCAG	2	10	84453	84462	20 %	40 %	20 %	20 %	549722799
54	NC_022544	GGCCA	2	10	84602	84611	20 %	0 %	40 %	40 %	549722799
55	NC_022544	GTACG	2	10	87173	87182	20 %	20 %	40 %	20 %	549722801
56	NC_022544	CAGAA	2	10	87886	87895	60 %	0 %	20 %	20 %	549722801
57	NC_022544	CCGCA	2	10	90005	90014	20 %	0 %	20 %	60 %	549722803
58	NC_022544	CGGTT	2	10	90510	90519	0 %	40 %	40 %	20 %	549722804
59	NC_022544	GCTCC	2	10	91646	91655	0 %	20 %	20 %	60 %	549722804
60	NC_022544	TGGCG	2	10	92290	92299	0 %	20 %	60 %	20 %	549722806
61	NC_022544	TTTCC	2	10	96204	96213	0 %	60 %	0 %	40 %	549722810
62	NC_022544	GTGGC	2	10	96773	96782	0 %	20 %	60 %	20 %	549722810
63	NC_022544	TGCAC	2	10	98690	98699	20 %	20 %	20 %	40 %	549722811
64	NC_022544	TGGCA	2	10	98759	98768	20 %	20 %	40 %	20 %	549722811
65	NC_022544	TCTGT	2	10	99085	99094	0 %	60 %	20 %	20 %	549722812
66	NC_022544	GCGCT	2	10	99395	99404	0 %	20 %	40 %	40 %	549722812
67	NC_022544	GGCGC	2	10	99809	99818	0 %	0 %	60 %	40 %	549722812
68	NC_022544	GCGAC	2	10	100122	100131	20 %	0 %	40 %	40 %	549722812
69	NC_022544	AACGT	2	10	102579	102588	40 %	20 %	20 %	20 %	549722815
70	NC_022544	CCCAA	2	10	104729	104738	40 %	0 %	0 %	60 %	549722818
71	NC_022544	TTGTT	2	10	105436	105445	0 %	80 %	20 %	0 %	549722818
72	NC_022544	GCTTC	2	10	106816	106825	0 %	40 %	20 %	40 %	549722819
73	NC_022544	TGCGT	2	10	107103	107112	0 %	40 %	40 %	20 %	549722819
74	NC_022544	TGATC	2	10	108803	108812	20 %	40 %	20 %	20 %	549722820
75	NC_022544	TGGCG	2	10	111963	111972	0 %	20 %	60 %	20 %	549722822
76	NC_022544	AGCGC	2	10	112523	112532	20 %	0 %	40 %	40 %	549722822
77	NC_022544	ACGTT	2	10	113340	113349	20 %	40 %	20 %	20 %	549722823
78	NC_022544	CCGCG	2	10	113608	113617	0 %	0 %	40 %	60 %	549722823
79	NC_022544	ACAGA	2	10	116935	116944	60 %	0 %	20 %	20 %	549722825
80	NC_022544	CAGCG	2	10	118110	118119	20 %	0 %	40 %	40 %	549722827
81	NC_022544	GCCGG	2	10	118410	118419	0 %	0 %	60 %	40 %	549722827
82	NC_022544	CGAGC	2	10	118535	118544	20 %	0 %	40 %	40 %	549722827
83	NC_022544	ATTTG	2	10	118978	118987	20 %	60 %	20 %	0 %	549722827
84	NC_022544	TTGCC	2	10	123482	123491	0 %	40 %	20 %	40 %	549722831
85	NC_022544	AGCAG	2	10	124159	124168	40 %	0 %	40 %	20 %	549722832
86	NC_022544	AGTTT	2	10	126389	126398	20 %	60 %	20 %	0 %	549722833
87	NC_022544	TCGAT	2	10	128237	128246	20 %	40 %	20 %	20 %	549722834
88	NC_022544	CGGCG	2	10	130548	130557	0 %	0 %	60 %	40 %	549722836
89	NC_022544	CGTTT	2	10	131010	131019	0 %	60 %	20 %	20 %	549722836
90	NC_022544	GACCG	2	10	132454	132463	20 %	0 %	40 %	40 %	549722838
91	NC_022544	ATTCC	2	10	136111	136120	20 %	40 %	0 %	40 %	549722841
92	NC_022544	AAAGC	2	10	138408	138417	60 %	0 %	20 %	20 %	549722843
93	NC_022544	CCGCA	2	10	138941	138950	20 %	0 %	20 %	60 %	549722843
94	NC_022544	AGTTC	2	10	141312	141321	20 %	40 %	20 %	20 %	549722845
95	NC_022544	TGCCT	2	10	141412	141421	0 %	40 %	20 %	40 %	549722846
96	NC_022544	AAGCG	2	10	146065	146074	40 %	0 %	40 %	20 %	549722849
97	NC_022544	GTTTG	2	10	147968	147977	0 %	60 %	40 %	0 %	549722851
98	NC_022544	CGTAT	2	10	149439	149448	20 %	40 %	20 %	20 %	549722852
99	NC_022544	ATCAG	2	10	151275	151284	40 %	20 %	20 %	20 %	549722854
100	NC_022544	CTGCC	2	10	153284	153293	0 %	20 %	20 %	60 %	549722855
101	NC_022544	CGGCG	2	10	156014	156023	0 %	0 %	60 %	40 %	549722858
102	NC_022544	CCGGC	2	10	159368	159377	0 %	0 %	40 %	60 %	549722861
103	NC_022544	GATCA	2	10	162686	162695	40 %	20 %	20 %	20 %	549722864
104	NC_022544	CGTCA	2	10	163432	163441	20 %	20 %	20 %	40 %	549722865
105	NC_022544	ATCCC	2	10	165132	165141	20 %	20 %	0 %	60 %	549722867
106	NC_022544	AGCGC	2	10	165840	165849	20 %	0 %	40 %	40 %	549722867
107	NC_022544	TGAGC	2	10	167689	167698	20 %	20 %	40 %	20 %	549722868
108	NC_022544	CGCAT	2	10	167951	167960	20 %	20 %	20 %	40 %	549722869
109	NC_022544	CGAAC	2	10	168680	168689	40 %	0 %	20 %	40 %	549722870
110	NC_022544	GTTCA	2	10	168946	168955	20 %	40 %	20 %	20 %	549722870
111	NC_022544	ATGAC	2	10	169912	169921	40 %	20 %	20 %	20 %	549722871
112	NC_022544	CTGGA	2	10	170502	170511	20 %	20 %	40 %	20 %	549722872
113	NC_022544	CAGAA	2	10	172621	172630	60 %	0 %	20 %	20 %	549722874
114	NC_022544	CGAAG	2	10	175492	175501	40 %	0 %	40 %	20 %	549722876
115	NC_022544	GGCAT	2	10	182771	182780	20 %	20 %	40 %	20 %	549722880
116	NC_022544	GGCCA	2	10	183193	183202	20 %	0 %	40 %	40 %	549722881
117	NC_022544	GCGCC	2	10	183206	183215	0 %	0 %	40 %	60 %	549722881
118	NC_022544	CGTTT	2	10	183708	183717	0 %	60 %	20 %	20 %	549722881
119	NC_022544	GGGGA	2	10	183760	183769	20 %	0 %	80 %	0 %	549722881
120	NC_022544	TCTGG	2	10	187385	187394	0 %	40 %	40 %	20 %	549722883
121	NC_022544	CCGCT	2	10	191036	191045	0 %	20 %	20 %	60 %	549722886
122	NC_022544	GCCCA	2	10	193588	193597	20 %	0 %	20 %	60 %	549722889
123	NC_022544	GCGCA	2	10	193993	194002	20 %	0 %	40 %	40 %	549722889
124	NC_022544	ATCGG	2	10	195384	195393	20 %	20 %	40 %	20 %	549722891
125	NC_022544	GCCGC	2	10	196594	196603	0 %	0 %	40 %	60 %	549722893
126	NC_022544	ATCCA	2	10	201944	201953	40 %	20 %	0 %	40 %	549722896
127	NC_022544	CGGCG	2	10	204061	204070	0 %	0 %	60 %	40 %	549722898
128	NC_022544	TGGTC	2	10	204927	204936	0 %	40 %	40 %	20 %	549722898
129	NC_022544	CGTCA	2	10	206625	206634	20 %	20 %	20 %	40 %	549722899
130	NC_022544	AGCGC	2	10	207576	207585	20 %	0 %	40 %	40 %	549722899
131	NC_022544	CGGCG	2	10	209490	209499	0 %	0 %	60 %	40 %	549722902
132	NC_022544	TTCGG	2	10	210370	210379	0 %	40 %	40 %	20 %	549722903
133	NC_022544	CTTGC	2	10	211379	211388	0 %	40 %	20 %	40 %	549722904
134	NC_022544	TGAGC	2	10	211791	211800	20 %	20 %	40 %	20 %	549722905
135	NC_022544	AGATC	2	10	213460	213469	40 %	20 %	20 %	20 %	549722907
136	NC_022544	CGCGG	2	10	213882	213891	0 %	0 %	60 %	40 %	549722908
137	NC_022544	CGCGG	2	10	214066	214075	0 %	0 %	60 %	40 %	549722908
138	NC_022544	GCCAG	2	10	216050	216059	20 %	0 %	40 %	40 %	549722909
139	NC_022544	GCGCG	2	10	216616	216625	0 %	0 %	60 %	40 %	549722910
140	NC_022544	CGGGG	2	10	218434	218443	0 %	0 %	80 %	20 %	549722913
141	NC_022544	GCGAA	2	10	220554	220563	40 %	0 %	40 %	20 %	549722913
142	NC_022544	CAGCG	2	10	220617	220626	20 %	0 %	40 %	40 %	549722913
143	NC_022544	GGCGG	2	10	222367	222376	0 %	0 %	80 %	20 %	549722914
144	NC_022544	GTTGA	2	10	224216	224225	20 %	40 %	40 %	0 %	549722915
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146	NC_022544	GGAAT	2	10	225076	225085	40 %	20 %	40 %	0 %	549722915
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150	NC_022544	GGCGT	2	10	228129	228138	0 %	20 %	60 %	20 %	549722918
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152	NC_022544	GCCGC	2	10	234863	234872	0 %	0 %	40 %	60 %	549722922
153	NC_022544	CAGTT	2	10	236716	236725	20 %	40 %	20 %	20 %	549722925
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156	NC_022544	TGCTT	2	10	239688	239697	0 %	60 %	20 %	20 %	549722927
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252	NC_022544	ATTAC	2	10	413859	413868	40 %	40 %	0 %	20 %	549723078
253	NC_022544	GCCAG	2	10	416360	416369	20 %	0 %	40 %	40 %	549723081
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259	NC_022544	ATCGT	2	10	426352	426361	20 %	40 %	20 %	20 %	549723087
260	NC_022544	TGGCG	2	10	428394	428403	0 %	20 %	60 %	20 %	549723088
261	NC_022544	ATATT	2	10	428959	428968	40 %	60 %	0 %	0 %	549723089
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263	NC_022544	GCGCC	2	10	429542	429551	0 %	0 %	40 %	60 %	549723089
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