MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022544	TCC	2	6	186010	186015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722883
3502	NC_022544	GCT	2	6	186056	186061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3503	NC_022544	ACC	2	6	186077	186082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722883
3504	NC_022544	CTG	2	6	186116	186121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3505	NC_022544	ACA	2	6	186141	186146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722883
3506	NC_022544	TGAT	2	8	186156	186163	25 %	50 %	25 %	0 %	549722883
3507	NC_022544	TGC	2	6	186193	186198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3508	NC_022544	CTG	2	6	186218	186223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3509	NC_022544	ACG	2	6	186240	186245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3510	NC_022544	AGA	2	6	186247	186252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722883
3511	NC_022544	CCG	2	6	186329	186334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722883
3512	NC_022544	A	6	6	186342	186347	100 %	0 %	0 %	0 %	549722883
3513	NC_022544	TCACCG	2	12	186348	186359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549722883
3514	NC_022544	CGA	2	6	186388	186393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3515	NC_022544	TC	4	8	186394	186401	0 %	50 %	0 %	50 %	549722883
3516	NC_022544	CAAA	2	8	186511	186518	75 %	0 %	0 %	25 %	549722883
3517	NC_022544	A	6	6	186533	186538	100 %	0 %	0 %	0 %	549722883
3518	NC_022544	GTG	2	6	186566	186571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722883
3519	NC_022544	TTC	2	6	186580	186585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722883
3520	NC_022544	GCG	3	9	186654	186662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722883
3521	NC_022544	CGG	2	6	186673	186678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722883
3522	NC_022544	TCT	2	6	186693	186698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722883
3523	NC_022544	GC	3	6	186720	186725	0 %	0 %	50 %	50 %	549722883
3524	NC_022544	GTGC	2	8	186866	186873	0 %	25 %	50 %	25 %	549722883
3525	NC_022544	GGT	2	6	186875	186880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722883
3526	NC_022544	ACC	2	6	186911	186916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722883
3527	NC_022544	AGC	2	6	186983	186988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3528	NC_022544	GGTC	2	8	187015	187022	0 %	25 %	50 %	25 %	549722883
3529	NC_022544	TCCG	2	8	187044	187051	0 %	25 %	25 %	50 %	549722883
3530	NC_022544	TAC	2	6	187096	187101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722883
3531	NC_022544	CGA	2	6	187117	187122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3532	NC_022544	CCG	2	6	187152	187157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722883
3533	NC_022544	CAC	2	6	187213	187218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722883
3534	NC_022544	CAC	2	6	187220	187225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722883
3535	NC_022544	TC	3	6	187260	187265	0 %	50 %	0 %	50 %	549722883
3536	NC_022544	TGC	3	9	187308	187316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3537	NC_022544	CGG	2	6	187333	187338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722883
3538	NC_022544	CGG	2	6	187377	187382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722883
3539	NC_022544	TCTGG	2	10	187385	187394	0 %	40 %	40 %	20 %	549722883
3540	NC_022544	GCC	2	6	187403	187408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722883
3541	NC_022544	CTG	2	6	187535	187540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3542	NC_022544	GAA	2	6	187549	187554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722883
3543	NC_022544	TCT	2	6	187569	187574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722883
3544	NC_022544	CCG	2	6	187647	187652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722883
3545	NC_022544	TTG	2	6	187698	187703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722883
3546	NC_022544	CTG	2	6	187727	187732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3547	NC_022544	GAT	2	6	187738	187743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722883
3548	NC_022544	CCG	2	6	187762	187767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722883
3549	NC_022544	CGT	2	6	187778	187783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3550	NC_022544	TGGC	2	8	187802	187809	0 %	25 %	50 %	25 %	549722883
3551	NC_022544	GCT	2	6	187819	187824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3552	NC_022544	CGG	2	6	187851	187856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722883
3553	NC_022544	GAC	2	6	187916	187921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3554	NC_022544	CTG	2	6	187928	187933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3555	NC_022544	CGA	2	6	187957	187962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3556	NC_022544	GCT	2	6	188017	188022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3557	NC_022544	GCC	2	6	188065	188070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722883
3558	NC_022544	CGC	2	6	188083	188088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722883
3559	NC_022544	GAA	2	6	188099	188104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722883
3560	NC_022544	TAC	2	6	188108	188113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722883
3561	NC_022544	GGT	2	6	188203	188208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722883
3562	NC_022544	GGC	2	6	188281	188286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722883
3563	NC_022544	GCG	2	6	188291	188296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722883
3564	NC_022544	CGG	2	6	188358	188363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722883
3565	NC_022544	TATTTT	2	12	188531	188542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549722884
3566	NC_022544	CTT	2	6	188545	188550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722884
3567	NC_022544	CT	3	6	188567	188572	0 %	50 %	0 %	50 %	549722884
3568	NC_022544	TA	3	6	188577	188582	50 %	50 %	0 %	0 %	549722884
3569	NC_022544	GTAT	2	8	188655	188662	25 %	50 %	25 %	0 %	549722884
3570	NC_022544	TGG	2	6	188673	188678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722884
3571	NC_022544	TAT	2	6	188765	188770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722884
3572	NC_022544	TCA	2	6	188850	188855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722884
3573	NC_022544	T	6	6	188896	188901	0 %	100 %	0 %	0 %	549722884
3574	NC_022544	GGTT	2	8	189006	189013	0 %	50 %	50 %	0 %	549722884
3575	NC_022544	ATG	2	6	189048	189053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722884
3576	NC_022544	TGC	2	6	189059	189064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722884
3577	NC_022544	T	6	6	189088	189093	0 %	100 %	0 %	0 %	549722884
3578	NC_022544	ATT	2	6	189095	189100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722884
3579	NC_022544	CAT	2	6	189109	189114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722884
3580	NC_022544	TAT	2	6	189140	189145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722884
3581	NC_022544	TTG	2	6	189188	189193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722884
3582	NC_022544	GT	3	6	189196	189201	0 %	50 %	50 %	0 %	549722884
3583	NC_022544	T	6	6	189245	189250	0 %	100 %	0 %	0 %	549722884
3584	NC_022544	TGTT	2	8	189279	189286	0 %	75 %	25 %	0 %	549722884
3585	NC_022544	AAG	2	6	189311	189316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722884
3586	NC_022544	GGT	2	6	189663	189668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722885
3587	NC_022544	CG	3	6	189732	189737	0 %	0 %	50 %	50 %	549722885
3588	NC_022544	TGGA	2	8	189793	189800	25 %	25 %	50 %	0 %	549722885
3589	NC_022544	GAA	2	6	189805	189810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722885
3590	NC_022544	TGA	2	6	189812	189817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722885
3591	NC_022544	TTA	2	6	189870	189875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722885
3592	NC_022544	AG	3	6	189882	189887	50 %	0 %	50 %	0 %	549722885
3593	NC_022544	GGA	2	6	189906	189911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722885
3594	NC_022544	GTC	2	6	189922	189927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722885
3595	NC_022544	A	6	6	190204	190209	100 %	0 %	0 %	0 %	549722886
3596	NC_022544	CGG	2	6	190227	190232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722886
3597	NC_022544	ATG	2	6	190234	190239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722886
3598	NC_022544	CGG	2	6	190299	190304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722886
3599	NC_022544	CTG	2	6	190357	190362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722886
3600	NC_022544	GCG	2	6	190508	190513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722886
3601	NC_022544	TGC	2	6	190557	190562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722886
3602	NC_022544	ATG	2	6	190622	190627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722886
3603	NC_022544	CTTT	2	8	190631	190638	0 %	75 %	0 %	25 %	549722886
3604	NC_022544	GAT	2	6	190641	190646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722886
3605	NC_022544	TGG	2	6	190691	190696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722886
3606	NC_022544	T	6	6	190758	190763	0 %	100 %	0 %	0 %	549722886
3607	NC_022544	GGC	2	6	190771	190776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722886
3608	NC_022544	GCT	2	6	190779	190784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722886
3609	NC_022544	CTTT	2	8	190790	190797	0 %	75 %	0 %	25 %	549722886
3610	NC_022544	GGGC	2	8	190811	190818	0 %	0 %	75 %	25 %	549722886
3611	NC_022544	CGTT	2	8	190880	190887	0 %	50 %	25 %	25 %	549722886
3612	NC_022544	GCG	2	6	190945	190950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722886
3613	NC_022544	CGC	2	6	190982	190987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722886
3614	NC_022544	TCGC	2	8	191011	191018	0 %	25 %	25 %	50 %	549722886
3615	NC_022544	GCT	2	6	191029	191034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722886
3616	NC_022544	CCGCT	2	10	191036	191045	0 %	20 %	20 %	60 %	549722886
3617	NC_022544	GCC	2	6	191050	191055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722886
3618	NC_022544	CAC	2	6	191064	191069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722886
3619	NC_022544	CCT	2	6	191093	191098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722886
3620	NC_022544	A	6	6	191107	191112	100 %	0 %	0 %	0 %	549722886
3621	NC_022544	CTT	2	6	191126	191131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722886
3622	NC_022544	GAT	2	6	191166	191171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722887
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3851	NC_022544	CCTG	2	8	204899	204906	0 %	25 %	25 %	50 %	549722898
3852	NC_022544	TGGTC	2	10	204927	204936	0 %	40 %	40 %	20 %	549722898
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3859	NC_022544	CAG	3	9	205170	205178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722899
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3969	NC_022544	CTTGC	2	10	211379	211388	0 %	40 %	20 %	40 %	549722904
3970	NC_022544	GGC	2	6	211554	211559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722905
3971	NC_022544	CAG	2	6	211599	211604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722905
3972	NC_022544	GTC	2	6	211629	211634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722905
3973	NC_022544	TTCA	2	8	211650	211657	25 %	50 %	0 %	25 %	549722905
3974	NC_022544	GGCAAT	2	12	211668	211679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549722905
3975	NC_022544	TCA	2	6	211730	211735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722905
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3977	NC_022544	TGAGC	2	10	211791	211800	20 %	20 %	40 %	20 %	549722905
3978	NC_022544	AAT	2	6	211821	211826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722905
3979	NC_022544	CGA	2	6	211835	211840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722905
3980	NC_022544	CCA	2	6	211865	211870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722905
3981	NC_022544	CGC	2	6	211967	211972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722905
3982	NC_022544	AG	3	6	212010	212015	50 %	0 %	50 %	0 %	549722905
3983	NC_022544	ACGT	2	8	212029	212036	25 %	25 %	25 %	25 %	549722905
3984	NC_022544	CAC	2	6	212202	212207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722905
3985	NC_022544	CGT	2	6	212249	212254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722905
3986	NC_022544	TGG	2	6	212267	212272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722905
3987	NC_022544	GAC	2	6	212306	212311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722905
3988	NC_022544	GCA	2	6	212324	212329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722905
3989	NC_022544	CAA	2	6	212354	212359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722905
3990	NC_022544	TTC	2	6	212495	212500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722906
3991	NC_022544	CTG	2	6	212537	212542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722906
3992	NC_022544	CGG	2	6	212545	212550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722906
3993	NC_022544	CCG	2	6	212604	212609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722906
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3995	NC_022544	GCAC	2	8	212725	212732	25 %	0 %	25 %	50 %	549722906
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3999	NC_022544	CCAG	2	8	212914	212921	25 %	0 %	25 %	50 %	549722906
4000	NC_022544	GCC	2	6	212924	212929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722906

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