MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022544	ATG	2	6	51779	51784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722771
1002	NC_022544	TTG	2	6	52290	52295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722772
1003	NC_022544	AGC	2	6	52355	52360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722772
1004	NC_022544	GCA	2	6	52404	52409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722772
1005	NC_022544	TGA	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722772
1006	NC_022544	CAT	2	6	52460	52465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722772
1007	NC_022544	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	549722772
1008	NC_022544	GCA	2	6	52651	52656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722773
1009	NC_022544	GCG	2	6	52737	52742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722773
1010	NC_022544	TCT	2	6	52782	52787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722773
1011	NC_022544	TCA	2	6	52795	52800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722773
1012	NC_022544	TTAACC	2	12	52814	52825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722773
1013	NC_022544	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	549722774
1014	NC_022544	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	549722774
1015	NC_022544	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	549722774
1016	NC_022544	GAA	2	6	52989	52994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722774
1017	NC_022544	GGT	3	9	53015	53023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722774
1018	NC_022544	GCG	2	6	53122	53127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722774
1019	NC_022544	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	549722774
1020	NC_022544	CGC	2	6	53157	53162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722774
1021	NC_022544	CTG	2	6	53199	53204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722774
1022	NC_022544	GAT	2	6	53241	53246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722774
1023	NC_022544	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	549722774
1024	NC_022544	TTA	2	6	53283	53288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722774
1025	NC_022544	GGC	2	6	53346	53351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722774
1026	NC_022544	AGT	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722774
1027	NC_022544	CTG	2	6	53418	53423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722774
1028	NC_022544	CGA	2	6	53462	53467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722774
1029	NC_022544	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	549722774
1030	NC_022544	CAA	2	6	53628	53633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722774
1031	NC_022544	CTG	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722774
1032	NC_022544	AGC	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722774
1033	NC_022544	TGA	2	6	53735	53740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722774
1034	NC_022544	T	6	6	53784	53789	0 %	100 %	0 %	0 %	549722774
1035	NC_022544	TGA	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1036	NC_022544	GCG	2	6	53907	53912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722775
1037	NC_022544	GAT	3	9	53954	53962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1038	NC_022544	CAT	2	6	53971	53976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722775
1039	NC_022544	A	6	6	53987	53992	100 %	0 %	0 %	0 %	549722775
1040	NC_022544	A	7	7	53996	54002	100 %	0 %	0 %	0 %	549722775
1041	NC_022544	ATG	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1042	NC_022544	GCA	2	6	54039	54044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1043	NC_022544	CAT	2	6	54346	54351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722775
1044	NC_022544	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
1045	NC_022544	GCGGAA	2	12	54440	54451	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549722775
1046	NC_022544	ACC	2	6	54575	54580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722775
1047	NC_022544	CTG	2	6	54761	54766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1048	NC_022544	CTG	2	6	55010	55015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1049	NC_022544	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
1050	NC_022544	A	6	6	55044	55049	100 %	0 %	0 %	0 %	549722775
1051	NC_022544	GCA	2	6	55051	55056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1052	NC_022544	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
1053	NC_022544	AAG	2	6	55134	55139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722775
1054	NC_022544	GCT	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1055	NC_022544	GGC	2	6	55330	55335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722775
1056	NC_022544	GTG	2	6	55381	55386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722775
1057	NC_022544	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	549722775
1058	NC_022544	CCA	2	6	55476	55481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722775
1059	NC_022544	TGC	2	6	55522	55527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1060	NC_022544	TCC	2	6	55574	55579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722775
1061	NC_022544	TGA	2	6	55581	55586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1062	NC_022544	TGA	2	6	55707	55712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1063	NC_022544	TGC	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1064	NC_022544	TCG	2	6	55816	55821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1065	NC_022544	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
1066	NC_022544	CTG	2	6	55844	55849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1067	NC_022544	TGG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722775
1068	NC_022544	GCA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1069	NC_022544	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	549722775
1070	NC_022544	CAT	2	6	56047	56052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722775
1071	NC_022544	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
1072	NC_022544	TGA	2	6	56173	56178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1073	NC_022544	ACG	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1074	NC_022544	GTT	2	6	56242	56247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722775
1075	NC_022544	GAA	2	6	56264	56269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722775
1076	NC_022544	CAA	2	6	56317	56322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722775
1077	NC_022544	AAG	2	6	56414	56419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722775
1078	NC_022544	G	6	6	56488	56493	0 %	0 %	100 %	0 %	549722775
1079	NC_022544	TGA	3	9	56497	56505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1080	NC_022544	GCT	2	6	56580	56585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1081	NC_022544	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	549722775
1082	NC_022544	AAC	2	6	56670	56675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722775
1083	NC_022544	TGA	2	6	56687	56692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1084	NC_022544	GTA	2	6	56734	56739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722776
1085	NC_022544	GCA	2	6	56762	56767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722776
1086	NC_022544	TCC	2	6	56777	56782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722776
1087	NC_022544	GCG	2	6	56879	56884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722776
1088	NC_022544	TGA	2	6	56942	56947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722776
1089	NC_022544	ATC	2	6	56998	57003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722776
1090	NC_022544	GGC	2	6	57004	57009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722776
1091	NC_022544	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	549722776
1092	NC_022544	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722776
1093	NC_022544	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	549722776
1094	NC_022544	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	549722777
1095	NC_022544	GAT	2	6	57401	57406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722777
1096	NC_022544	CGG	2	6	57414	57419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722777
1097	NC_022544	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	549722777
1098	NC_022544	AGC	3	9	57489	57497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722777
1099	NC_022544	AAG	2	6	57510	57515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722777
1100	NC_022544	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	549722777
1101	NC_022544	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722777
1102	NC_022544	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722777
1103	NC_022544	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	549722777
1104	NC_022544	TTG	2	6	57857	57862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722778
1105	NC_022544	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	549722778
1106	NC_022544	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	549722778
1107	NC_022544	G	6	6	58210	58215	0 %	0 %	100 %	0 %	549722778
1108	NC_022544	TGG	2	6	58223	58228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722778
1109	NC_022544	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	549722778
1110	NC_022544	TCG	2	6	58358	58363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722778
1111	NC_022544	TGG	2	6	58448	58453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722778
1112	NC_022544	TCTAAC	2	12	58471	58482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722778
1113	NC_022544	GAA	2	6	58511	58516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722778
1114	NC_022544	CGA	2	6	58530	58535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722778
1115	NC_022544	GCG	2	6	58537	58542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722778
1116	NC_022544	AGG	2	6	58550	58555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722778
1117	NC_022544	GCC	2	6	58570	58575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722778
1118	NC_022544	GGC	3	9	58651	58659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722778
1119	NC_022544	GAA	2	6	58684	58689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722778
1120	NC_022544	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	549722779
1121	NC_022544	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	549722779
1122	NC_022544	CAA	2	6	59004	59009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722779
1123	NC_022544	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	549722779
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1125	NC_022544	GAA	2	6	59198	59203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722779
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