MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022544	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722750
502	NC_022544	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	549722751
503	NC_022544	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
504	NC_022544	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
505	NC_022544	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
506	NC_022544	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	549722751
507	NC_022544	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
508	NC_022544	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722751
509	NC_022544	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
510	NC_022544	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
511	NC_022544	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
512	NC_022544	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722751
513	NC_022544	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
514	NC_022544	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
515	NC_022544	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
516	NC_022544	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722751
517	NC_022544	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	549722751
518	NC_022544	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
519	NC_022544	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722751
520	NC_022544	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722751
521	NC_022544	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722751
522	NC_022544	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
523	NC_022544	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722751
524	NC_022544	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
525	NC_022544	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
526	NC_022544	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
527	NC_022544	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	549722751
528	NC_022544	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
529	NC_022544	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722751
530	NC_022544	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
531	NC_022544	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722751
532	NC_022544	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722751
533	NC_022544	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722751
534	NC_022544	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	549722751
535	NC_022544	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722751
536	NC_022544	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
537	NC_022544	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
538	NC_022544	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722751
539	NC_022544	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722751
540	NC_022544	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
541	NC_022544	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722751
542	NC_022544	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722751
543	NC_022544	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
544	NC_022544	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
545	NC_022544	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
546	NC_022544	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722751
547	NC_022544	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
548	NC_022544	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
549	NC_022544	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722751
550	NC_022544	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722751
551	NC_022544	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
552	NC_022544	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
553	NC_022544	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
554	NC_022544	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
555	NC_022544	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
556	NC_022544	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549722751
557	NC_022544	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722751
558	NC_022544	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	549722751
559	NC_022544	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722751
560	NC_022544	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	549722751
561	NC_022544	TCC	2	6	28380	28385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722751
562	NC_022544	ACA	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722751
563	NC_022544	CTG	2	6	28449	28454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722752
564	NC_022544	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	549722752
565	NC_022544	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	549722752
566	NC_022544	A	6	6	28591	28596	100 %	0 %	0 %	0 %	549722752
567	NC_022544	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	549722752
568	NC_022544	CCG	2	6	28627	28632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722752
569	NC_022544	TTC	2	6	28760	28765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722752
570	NC_022544	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	549722752
571	NC_022544	ATG	2	6	28810	28815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722752
572	NC_022544	TCG	2	6	28891	28896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722752
573	NC_022544	CCG	2	6	28945	28950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722752
574	NC_022544	A	6	6	29118	29123	100 %	0 %	0 %	0 %	549722752
575	NC_022544	ATG	2	6	29284	29289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722752
576	NC_022544	ACA	2	6	29364	29369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722752
577	NC_022544	GAC	2	6	29502	29507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722753
578	NC_022544	AAC	2	6	29630	29635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722753
579	NC_022544	ATG	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722753
580	NC_022544	AAT	2	6	29838	29843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722753
581	NC_022544	GGT	2	6	29852	29857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722753
582	NC_022544	CGG	2	6	29944	29949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722753
583	NC_022544	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	549722753
584	NC_022544	TGC	2	6	30025	30030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722754
585	NC_022544	GGC	2	6	30032	30037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722754
586	NC_022544	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	549722754
587	NC_022544	GCA	2	6	30223	30228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722754
588	NC_022544	GCG	2	6	30235	30240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722754
589	NC_022544	GCG	2	6	30261	30266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722754
590	NC_022544	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	549722754
591	NC_022544	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	549722754
592	NC_022544	GGC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722754
593	NC_022544	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	549722755
594	NC_022544	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	549722755
595	NC_022544	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	549722755
596	NC_022544	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	549722755
597	NC_022544	TGG	2	6	30684	30689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722755
598	NC_022544	CGC	2	6	30740	30745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722755
599	NC_022544	ATT	2	6	30747	30752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722755
600	NC_022544	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	549722755
601	NC_022544	GGT	2	6	30786	30791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722755
602	NC_022544	CCG	2	6	30812	30817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722755
603	NC_022544	CGC	2	6	30846	30851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722755
604	NC_022544	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	549722755
605	NC_022544	GCA	2	6	30948	30953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722755
606	NC_022544	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	549722755
607	NC_022544	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	549722755
608	NC_022544	TTA	2	6	31036	31041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722755
609	NC_022544	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	549722755
610	NC_022544	TAT	2	6	31270	31275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722756
611	NC_022544	TAT	2	6	31277	31282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722756
612	NC_022544	CGC	2	6	31351	31356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722756
613	NC_022544	CGG	2	6	31389	31394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722756
614	NC_022544	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	549722756
615	NC_022544	CGC	2	6	31474	31479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722756
616	NC_022544	CAG	2	6	31502	31507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722756
617	NC_022544	CAA	2	6	31514	31519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722756
618	NC_022544	AGC	2	6	31568	31573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722756
619	NC_022544	GCG	2	6	31604	31609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722756
620	NC_022544	GTG	2	6	31610	31615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722756
621	NC_022544	GTG	2	6	31639	31644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722756
622	NC_022544	T	6	6	31722	31727	0 %	100 %	0 %	0 %	549722756
623	NC_022544	GGC	2	6	31753	31758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722756
624	NC_022544	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	549722756
625	NC_022544	GCC	2	6	31910	31915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722756
626	NC_022544	AAG	2	6	31920	31925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722756
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628	NC_022544	ATG	2	6	31947	31952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722756
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751	NC_022544	T	6	6	38072	38077	0 %	100 %	0 %	0 %	549722762
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753	NC_022544	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	549722762
754	NC_022544	A	6	6	38242	38247	100 %	0 %	0 %	0 %	549722762
755	NC_022544	CAA	2	6	38255	38260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722762
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757	NC_022544	CGT	2	6	38341	38346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722762
758	NC_022544	AAT	2	6	38369	38374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722762
759	NC_022544	TCTTTC	2	12	38445	38456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722762
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762	NC_022544	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	549722762
763	NC_022544	TAT	2	6	38832	38837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722763
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765	NC_022544	TGT	2	6	38927	38932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722763
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788	NC_022544	GTG	2	6	40665	40670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722764
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792	NC_022544	ATA	2	6	40765	40770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722764
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