MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022544	GCG	2	6	436013	436018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723096
8002	NC_022544	CGG	2	6	436023	436028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723096
8003	NC_022544	GGC	2	6	436039	436044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723096
8004	NC_022544	GCGG	2	8	436068	436075	0 %	0 %	75 %	25 %	549723096
8005	NC_022544	TGG	2	6	436100	436105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723096
8006	NC_022544	TTAA	2	8	436129	436136	50 %	50 %	0 %	0 %	549723096
8007	NC_022544	GCGT	2	8	436142	436149	0 %	25 %	50 %	25 %	549723096
8008	NC_022544	TCA	2	6	436154	436159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723096
8009	NC_022544	CGT	2	6	436196	436201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723096
8010	NC_022544	GTTT	2	8	436226	436233	0 %	75 %	25 %	0 %	549723096
8011	NC_022544	T	6	6	436231	436236	0 %	100 %	0 %	0 %	549723096
8012	NC_022544	ATCAA	2	10	436294	436303	60 %	20 %	0 %	20 %	549723096
8013	NC_022544	TAA	2	6	436317	436322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723096
8014	NC_022544	CGCCT	2	10	436382	436391	0 %	20 %	20 %	60 %	549723096
8015	NC_022544	TGC	2	6	436454	436459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723096
8016	NC_022544	TTC	2	6	436462	436467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723096
8017	NC_022544	CAC	2	6	436482	436487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723096
8018	NC_022544	CCG	2	6	436547	436552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723096
8019	NC_022544	CGG	2	6	436706	436711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723096
8020	NC_022544	CGT	2	6	436753	436758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723096
8021	NC_022544	GTT	2	6	437108	437113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723097
8022	NC_022544	AGA	3	9	437132	437140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723097
8023	NC_022544	TGC	2	6	437302	437307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723097
8024	NC_022544	A	6	6	437318	437323	100 %	0 %	0 %	0 %	549723097
8025	NC_022544	ACTTT	2	10	437721	437730	20 %	60 %	0 %	20 %	549723098
8026	NC_022544	CCG	2	6	437749	437754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723098
8027	NC_022544	CGC	2	6	437779	437784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723098
8028	NC_022544	CAG	2	6	437787	437792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723098
8029	NC_022544	GAC	2	6	437798	437803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723098
8030	NC_022544	CAG	2	6	437811	437816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723098
8031	NC_022544	ACCT	2	8	437853	437860	25 %	25 %	0 %	50 %	549723098
8032	NC_022544	CAGT	2	8	437879	437886	25 %	25 %	25 %	25 %	549723098
8033	NC_022544	CGC	2	6	437911	437916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723098
8034	NC_022544	CAG	2	6	437919	437924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723098
8035	NC_022544	GCCT	2	8	437997	438004	0 %	25 %	25 %	50 %	549723098
8036	NC_022544	A	6	6	438006	438011	100 %	0 %	0 %	0 %	549723098
8037	NC_022544	GCG	2	6	438012	438017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723098
8038	NC_022544	AATG	2	8	438126	438133	50 %	25 %	25 %	0 %	549723099
8039	NC_022544	GCC	2	6	438174	438179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723099
8040	NC_022544	TGA	2	6	438189	438194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723099
8041	NC_022544	G	6	6	438256	438261	0 %	0 %	100 %	0 %	549723099
8042	NC_022544	GCC	2	6	438277	438282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723099
8043	NC_022544	GGC	2	6	438307	438312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723099
8044	NC_022544	TGG	2	6	438313	438318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723099
8045	NC_022544	TGGCA	2	10	438356	438365	20 %	20 %	40 %	20 %	549723099
8046	NC_022544	GCG	2	6	438370	438375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723099
8047	NC_022544	TGCC	2	8	438470	438477	0 %	25 %	25 %	50 %	549723099
8048	NC_022544	ATG	3	9	438490	438498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723099
8049	NC_022544	GGCG	2	8	438520	438527	0 %	0 %	75 %	25 %	549723099
8050	NC_022544	TCG	2	6	438616	438621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723099
8051	NC_022544	CT	3	6	438634	438639	0 %	50 %	0 %	50 %	549723099
8052	NC_022544	TGT	2	6	438653	438658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723099
8053	NC_022544	TTA	2	6	438787	438792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723099
8054	NC_022544	CCA	2	6	438819	438824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723099
8055	NC_022544	TTG	2	6	438838	438843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723099
8056	NC_022544	TATCGA	2	12	438846	438857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549723099
8057	NC_022544	ATG	2	6	438890	438895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723099
8058	NC_022544	TAT	2	6	438909	438914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723099
8059	NC_022544	GGC	2	6	438973	438978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723099
8060	NC_022544	GC	3	6	439076	439081	0 %	0 %	50 %	50 %	549723099
8061	NC_022544	GCGTGG	2	12	439103	439114	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549723099
8062	NC_022544	CAAAG	2	10	439179	439188	60 %	0 %	20 %	20 %	549723099
8063	NC_022544	GGC	2	6	439215	439220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723099
8064	NC_022544	TTC	2	6	439314	439319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723100
8065	NC_022544	TCG	2	6	439340	439345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723100
8066	NC_022544	GCG	2	6	439435	439440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723100
8067	NC_022544	ACC	2	6	439543	439548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723100
8068	NC_022544	GGAT	2	8	439549	439556	25 %	25 %	50 %	0 %	549723100
8069	NC_022544	CCGCC	2	10	439577	439586	0 %	0 %	20 %	80 %	549723100
8070	NC_022544	AGC	2	6	439589	439594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723100
8071	NC_022544	GC	5	10	439724	439733	0 %	0 %	50 %	50 %	549723100
8072	NC_022544	GCG	2	6	439756	439761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723100
8073	NC_022544	ACC	2	6	439768	439773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723100
8074	NC_022544	GGA	2	6	439794	439799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723100
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8076	NC_022544	GC	3	6	439877	439882	0 %	0 %	50 %	50 %	549723100
8077	NC_022544	GCG	2	6	439918	439923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723100
8078	NC_022544	TCT	2	6	440039	440044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723100
8079	NC_022544	GGATGC	2	12	440202	440213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549723101
8080	NC_022544	CGC	2	6	440247	440252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723101
8081	NC_022544	GCC	2	6	440304	440309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723101
8082	NC_022544	GCC	2	6	440338	440343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723101
8083	NC_022544	GGC	2	6	440421	440426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723101
8084	NC_022544	GCG	2	6	440540	440545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723101
8085	NC_022544	G	7	7	440553	440559	0 %	0 %	100 %	0 %	549723101
8086	NC_022544	CT	3	6	440567	440572	0 %	50 %	0 %	50 %	549723101
8087	NC_022544	CGC	2	6	440573	440578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723101
8088	NC_022544	GCC	2	6	440596	440601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723101
8089	NC_022544	GTG	2	6	440613	440618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723101
8090	NC_022544	A	6	6	440635	440640	100 %	0 %	0 %	0 %	549723101
8091	NC_022544	ATG	2	6	440828	440833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723102
8092	NC_022544	TTG	2	6	440847	440852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723102
8093	NC_022544	ACC	2	6	440873	440878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723102
8094	NC_022544	TGGCGC	2	12	440886	440897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549723102
8095	NC_022544	ACCG	2	8	440924	440931	25 %	0 %	25 %	50 %	549723102
8096	NC_022544	AAG	2	6	440979	440984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723102
8097	NC_022544	GC	3	6	441033	441038	0 %	0 %	50 %	50 %	549723102
8098	NC_022544	TAT	2	6	441067	441072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723102
8099	NC_022544	GC	3	6	441129	441134	0 %	0 %	50 %	50 %	549723102
8100	NC_022544	AGC	2	6	441237	441242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723102
8101	NC_022544	CATTA	2	10	441269	441278	40 %	40 %	0 %	20 %	549723102
8102	NC_022544	CGA	2	6	441285	441290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723102
8103	NC_022544	ATT	2	6	441317	441322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723102
8104	NC_022544	GCG	2	6	441323	441328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723102
8105	NC_022544	GCC	2	6	441331	441336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723102
8106	NC_022544	ACC	2	6	441411	441416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723103
8107	NC_022544	TCA	2	6	441518	441523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723103
8108	NC_022544	AGA	2	6	441540	441545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723103
8109	NC_022544	GATG	2	8	441549	441556	25 %	25 %	50 %	0 %	549723103
8110	NC_022544	CGT	2	6	441849	441854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723104
8111	NC_022544	CGA	2	6	441919	441924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723104
8112	NC_022544	ACA	2	6	441925	441930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723104
8113	NC_022544	CAT	2	6	441938	441943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723104
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8115	NC_022544	CGA	2	6	442003	442008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723104
8116	NC_022544	TGA	2	6	442128	442133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723104
8117	NC_022544	TAT	2	6	442192	442197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723104
8118	NC_022544	TGGA	2	8	442221	442228	25 %	25 %	50 %	0 %	549723104
8119	NC_022544	GGC	2	6	442267	442272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723104
8120	NC_022544	A	6	6	442280	442285	100 %	0 %	0 %	0 %	549723104
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8122	NC_022544	TCA	2	6	442420	442425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723104
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8245	NC_022544	GC	3	6	447898	447903	0 %	0 %	50 %	50 %	549723109
8246	NC_022544	TGA	3	9	448004	448012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723109
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8248	NC_022544	GCG	2	6	448076	448081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723109
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8250	NC_022544	CTG	2	6	448201	448206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723109
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8253	NC_022544	CGT	2	6	448296	448301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723109
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8333	NC_022544	CGTAT	2	10	452285	452294	20 %	40 %	20 %	20 %	549723112
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8347	NC_022544	ATC	2	6	453268	453273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723113
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8352	NC_022544	CTG	2	6	453490	453495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723113
8353	NC_022544	CGC	2	6	453536	453541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723113
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8357	NC_022544	GC	3	6	453901	453906	0 %	0 %	50 %	50 %	549723113
8358	NC_022544	GGCC	2	8	453930	453937	0 %	0 %	50 %	50 %	549723113
8359	NC_022544	GGCG	2	8	453942	453949	0 %	0 %	75 %	25 %	549723113
8360	NC_022544	GCT	2	6	453960	453965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723113
8361	NC_022544	CCTTG	2	10	453969	453978	0 %	40 %	20 %	40 %	549723113
8362	NC_022544	TCAG	2	8	454014	454021	25 %	25 %	25 %	25 %	549723113
8363	NC_022544	CGGCG	2	10	454026	454035	0 %	0 %	60 %	40 %	549723113
8364	NC_022544	TTC	2	6	454037	454042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723113
8365	NC_022544	GGC	2	6	454066	454071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723113
8366	NC_022544	CTG	2	6	454084	454089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723113
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8368	NC_022544	CGG	2	6	454121	454126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723113
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8370	NC_022544	CGG	2	6	454203	454208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723113
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8472	NC_022544	GCG	2	6	459095	459100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723117
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8475	NC_022544	A	6	6	459196	459201	100 %	0 %	0 %	0 %	549723117
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8480	NC_022544	GAGTCA	2	12	459532	459543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549723118
8481	NC_022544	GC	3	6	459649	459654	0 %	0 %	50 %	50 %	549723118
8482	NC_022544	AAT	2	6	459717	459722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723118
8483	NC_022544	GCG	2	6	459763	459768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723118
8484	NC_022544	GAT	2	6	459801	459806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723118
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8486	NC_022544	CGA	3	9	459872	459880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723118
8487	NC_022544	CG	3	6	459902	459907	0 %	0 %	50 %	50 %	549723118
8488	NC_022544	GCC	2	6	459989	459994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723118
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8490	NC_022544	TGA	2	6	460097	460102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723118
8491	NC_022544	GCT	2	6	460106	460111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723118
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