MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022544	CTG	2	6	321712	321717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723000
6002	NC_022544	GAC	2	6	321788	321793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723000
6003	NC_022544	GCG	2	6	321795	321800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
6004	NC_022544	GGAT	2	8	321881	321888	25 %	25 %	50 %	0 %	549723000
6005	NC_022544	ACA	2	6	321906	321911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723000
6006	NC_022544	GCC	4	12	321939	321950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723000
6007	NC_022544	CTG	2	6	321982	321987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723000
6008	NC_022544	CTG	2	6	322009	322014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723000
6009	NC_022544	GGT	2	6	322044	322049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723000
6010	NC_022544	GTGA	2	8	322090	322097	25 %	25 %	50 %	0 %	549723000
6011	NC_022544	GCG	2	6	322123	322128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
6012	NC_022544	GCG	2	6	322148	322153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
6013	NC_022544	CAGC	2	8	322179	322186	25 %	0 %	25 %	50 %	549723000
6014	NC_022544	CATT	2	8	322188	322195	25 %	50 %	0 %	25 %	549723000
6015	NC_022544	GCG	2	6	322237	322242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
6016	NC_022544	GCG	2	6	322249	322254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
6017	NC_022544	CGG	2	6	322266	322271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
6018	NC_022544	TCG	2	6	322295	322300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723000
6019	NC_022544	CGGG	2	8	322344	322351	0 %	0 %	75 %	25 %	549723000
6020	NC_022544	TGAA	2	8	322387	322394	50 %	25 %	25 %	0 %	549723000
6021	NC_022544	TGA	2	6	322395	322400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723001
6022	NC_022544	A	6	6	322400	322405	100 %	0 %	0 %	0 %	549723001
6023	NC_022544	ATG	2	6	322413	322418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723001
6024	NC_022544	TCA	2	6	322423	322428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723001
6025	NC_022544	ATT	2	6	322455	322460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723001
6026	NC_022544	T	7	7	322503	322509	0 %	100 %	0 %	0 %	549723001
6027	NC_022544	ATC	2	6	322511	322516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723001
6028	NC_022544	A	6	6	322643	322648	100 %	0 %	0 %	0 %	549723001
6029	NC_022544	GGA	2	6	322678	322683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723001
6030	NC_022544	CTC	2	6	322852	322857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723001
6031	NC_022544	T	6	6	322931	322936	0 %	100 %	0 %	0 %	549723001
6032	NC_022544	GGA	2	6	322999	323004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723001
6033	NC_022544	TGTGG	2	10	323022	323031	0 %	40 %	60 %	0 %	549723001
6034	NC_022544	TTTA	2	8	323038	323045	25 %	75 %	0 %	0 %	549723001
6035	NC_022544	CG	3	6	323114	323119	0 %	0 %	50 %	50 %	549723001
6036	NC_022544	ATAA	2	8	323132	323139	75 %	25 %	0 %	0 %	549723001
6037	NC_022544	AT	3	6	323160	323165	50 %	50 %	0 %	0 %	549723001
6038	NC_022544	GTCT	2	8	323373	323380	0 %	50 %	25 %	25 %	549723002
6039	NC_022544	TGG	2	6	323383	323388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723002
6040	NC_022544	TCA	2	6	323451	323456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723002
6041	NC_022544	A	6	6	323471	323476	100 %	0 %	0 %	0 %	549723002
6042	NC_022544	CTA	2	6	323497	323502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723002
6043	NC_022544	GGAT	2	8	323578	323585	25 %	25 %	50 %	0 %	549723002
6044	NC_022544	A	6	6	323628	323633	100 %	0 %	0 %	0 %	549723002
6045	NC_022544	TGA	2	6	323747	323752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723002
6046	NC_022544	T	6	6	323857	323862	0 %	100 %	0 %	0 %	549723003
6047	NC_022544	GC	4	8	323867	323874	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6048	NC_022544	GTTCTG	2	12	323889	323900	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	549723003
6049	NC_022544	GCT	2	6	323903	323908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6050	NC_022544	TGC	2	6	324001	324006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6051	NC_022544	ATC	2	6	324039	324044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723003
6052	NC_022544	GCT	2	6	324086	324091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6053	NC_022544	CTG	2	6	324156	324161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6054	NC_022544	AAC	2	6	324214	324219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723003
6055	NC_022544	TGC	2	6	324220	324225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6056	NC_022544	CG	3	6	324241	324246	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6057	NC_022544	CTGG	2	8	324352	324359	0 %	25 %	50 %	25 %	549723003
6058	NC_022544	TGG	2	6	324409	324414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723003
6059	NC_022544	CTG	2	6	324447	324452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6060	NC_022544	GGC	2	6	324522	324527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
6061	NC_022544	TGG	2	6	324543	324548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723003
6062	NC_022544	TTGA	2	8	324567	324574	25 %	50 %	25 %	0 %	549723003
6063	NC_022544	CCG	2	6	324577	324582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723003
6064	NC_022544	CGCC	2	8	324590	324597	0 %	0 %	25 %	75 %	549723003
6065	NC_022544	GGT	2	6	324606	324611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723003
6066	NC_022544	AGCG	2	8	324614	324621	25 %	0 %	50 %	25 %	549723003
6067	NC_022544	CTG	2	6	324663	324668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6068	NC_022544	GC	3	6	324685	324690	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6069	NC_022544	CGG	2	6	324745	324750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
6070	NC_022544	GGC	2	6	324758	324763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
6071	NC_022544	TGG	2	6	324832	324837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723003
6072	NC_022544	TTG	2	6	324852	324857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723003
6073	NC_022544	CGC	2	6	324971	324976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723003
6074	NC_022544	GC	3	6	324979	324984	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6075	NC_022544	GC	3	6	324993	324998	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6076	NC_022544	GCC	2	6	325060	325065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723003
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6078	NC_022544	CGCAGG	2	12	325207	325218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549723003
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6080	NC_022544	CT	3	6	325298	325303	0 %	50 %	0 %	50 %	549723003
6081	NC_022544	CTG	2	6	325350	325355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6082	NC_022544	TGG	2	6	325384	325389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723003
6083	NC_022544	CTG	2	6	325422	325427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6084	NC_022544	CGG	2	6	325433	325438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
6085	NC_022544	CTG	2	6	325443	325448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6086	NC_022544	TGT	2	6	325468	325473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723003
6087	NC_022544	CCAG	2	8	325489	325496	25 %	0 %	25 %	50 %	549723003
6088	NC_022544	TGAA	2	8	325516	325523	50 %	25 %	25 %	0 %	549723003
6089	NC_022544	CG	3	6	325533	325538	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6090	NC_022544	TCCCG	2	10	325589	325598	0 %	20 %	20 %	60 %	549723003
6091	NC_022544	CTG	2	6	325602	325607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
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6093	NC_022544	CCG	2	6	325692	325697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723003
6094	NC_022544	CTG	2	6	325731	325736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6095	NC_022544	CTG	3	9	325743	325751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6096	NC_022544	CCG	2	6	325752	325757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723003
6097	NC_022544	ATCT	2	8	325836	325843	25 %	50 %	0 %	25 %	549723003
6098	NC_022544	CGG	2	6	325885	325890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
6099	NC_022544	ACAGCG	2	12	325924	325935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6100	NC_022544	CGG	2	6	325946	325951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
6101	NC_022544	GC	3	6	325952	325957	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6102	NC_022544	GTG	2	6	326001	326006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723003
6103	NC_022544	CAG	2	6	326069	326074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723003
6104	NC_022544	CG	3	6	326090	326095	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6105	NC_022544	GGC	2	6	326102	326107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
6106	NC_022544	GC	3	6	326191	326196	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6107	NC_022544	GGC	3	9	326276	326284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
6108	NC_022544	A	6	6	326327	326332	100 %	0 %	0 %	0 %	549723003
6109	NC_022544	CTGA	2	8	326334	326341	25 %	25 %	25 %	25 %	549723003
6110	NC_022544	CCG	2	6	326393	326398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723003
6111	NC_022544	CGC	2	6	326421	326426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723003
6112	NC_022544	GGCCT	2	10	326487	326496	0 %	20 %	40 %	40 %	549723003
6113	NC_022544	TGC	2	6	326509	326514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
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6118	NC_022544	GC	3	6	326627	326632	0 %	0 %	50 %	50 %	549723003
6119	NC_022544	GAA	2	6	326691	326696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723003
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6121	NC_022544	TGG	2	6	326713	326718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723003
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6123	NC_022544	CGGA	2	8	326757	326764	25 %	0 %	50 %	25 %	549723003
6124	NC_022544	CGG	2	6	326765	326770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723003
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6132	NC_022544	CTG	2	6	326949	326954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723003
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6239	NC_022544	GGC	2	6	331983	331988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723007
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6241	NC_022544	C	6	6	332014	332019	0 %	0 %	0 %	100 %	549723007
6242	NC_022544	CCTG	2	8	332098	332105	0 %	25 %	25 %	50 %	549723008
6243	NC_022544	GAAC	2	8	332153	332160	50 %	0 %	25 %	25 %	549723008
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6245	NC_022544	TGA	2	6	332241	332246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723008
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6488	NC_022544	TACT	2	8	346194	346201	25 %	50 %	0 %	25 %	549723019
6489	NC_022544	GATGG	2	10	346222	346231	20 %	20 %	60 %	0 %	549723019
6490	NC_022544	TGC	2	6	346325	346330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723019
6491	NC_022544	AGG	2	6	346529	346534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723019
6492	NC_022544	TGGC	2	8	347050	347057	0 %	25 %	50 %	25 %	549723020
6493	NC_022544	CTGG	2	8	347063	347070	0 %	25 %	50 %	25 %	549723020
6494	NC_022544	CTG	2	6	347081	347086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723020
6495	NC_022544	GGC	2	6	347152	347157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723020
6496	NC_022544	TGC	2	6	347189	347194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723020
6497	NC_022544	TCTT	2	8	347219	347226	0 %	75 %	0 %	25 %	549723020
6498	NC_022544	ATG	2	6	347288	347293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723020
6499	NC_022544	TGA	2	6	347325	347330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723020
6500	NC_022544	TGC	2	6	347336	347341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723020

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