MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022544	TGG	2	6	288630	288635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722972
5502	NC_022544	GGC	2	6	288658	288663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722972
5503	NC_022544	GCG	2	6	288665	288670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722972
5504	NC_022544	GCAGAA	2	12	288719	288730	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549722972
5505	NC_022544	CGG	2	6	288735	288740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722972
5506	NC_022544	A	6	6	288781	288786	100 %	0 %	0 %	0 %	549722972
5507	NC_022544	GCA	2	6	288787	288792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722972
5508	NC_022544	GAC	2	6	295100	295105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722973
5509	NC_022544	GCG	2	6	295212	295217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722973
5510	NC_022544	CAC	2	6	295240	295245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722973
5511	NC_022544	AG	3	6	295297	295302	50 %	0 %	50 %	0 %	549722973
5512	NC_022544	A	6	6	295307	295312	100 %	0 %	0 %	0 %	549722973
5513	NC_022544	GAA	2	6	295379	295384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722973
5514	NC_022544	A	6	6	295409	295414	100 %	0 %	0 %	0 %	549722973
5515	NC_022544	CCA	2	6	295503	295508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722973
5516	NC_022544	GGT	2	6	295546	295551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722973
5517	NC_022544	GC	3	6	295634	295639	0 %	0 %	50 %	50 %	549722973
5518	NC_022544	CCA	2	6	295722	295727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722973
5519	NC_022544	GCAA	2	8	295742	295749	50 %	0 %	25 %	25 %	549722973
5520	NC_022544	CTG	2	6	295751	295756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722973
5521	NC_022544	CCTG	2	8	295847	295854	0 %	25 %	25 %	50 %	549722973
5522	NC_022544	ATTA	2	8	295857	295864	50 %	50 %	0 %	0 %	549722973
5523	NC_022544	TA	3	6	295918	295923	50 %	50 %	0 %	0 %	549722974
5524	NC_022544	GTA	2	6	295978	295983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722974
5525	NC_022544	CAG	2	6	296026	296031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722974
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5527	NC_022544	CG	3	6	296048	296053	0 %	0 %	50 %	50 %	549722974
5528	NC_022544	ATCA	2	8	296062	296069	50 %	25 %	0 %	25 %	549722974
5529	NC_022544	GTT	2	6	296112	296117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722974
5530	NC_022544	GAA	2	6	296138	296143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722974
5531	NC_022544	GGCGA	2	10	296288	296297	20 %	0 %	60 %	20 %	549722974
5532	NC_022544	GC	5	10	296326	296335	0 %	0 %	50 %	50 %	549722974
5533	NC_022544	TGA	2	6	296397	296402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722974
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5535	NC_022544	GCA	2	6	296481	296486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722974
5536	NC_022544	CG	3	6	296520	296525	0 %	0 %	50 %	50 %	549722974
5537	NC_022544	GCG	2	6	296558	296563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722974
5538	NC_022544	CTG	2	6	296581	296586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722974
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5540	NC_022544	GCT	2	6	296718	296723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722974
5541	NC_022544	GCC	2	6	296726	296731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722974
5542	NC_022544	TTC	2	6	296776	296781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722974
5543	NC_022544	TATG	2	8	296896	296903	25 %	50 %	25 %	0 %	549722975
5544	NC_022544	CAA	2	6	296991	296996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722975
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5546	NC_022544	GC	3	6	297061	297066	0 %	0 %	50 %	50 %	549722975
5547	NC_022544	CGG	2	6	297136	297141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722975
5548	NC_022544	TGGCA	2	10	297151	297160	20 %	20 %	40 %	20 %	549722975
5549	NC_022544	TCG	2	6	297184	297189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722975
5550	NC_022544	CTG	2	6	297195	297200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722975
5551	NC_022544	TTC	2	6	297222	297227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722975
5552	NC_022544	TAT	2	6	297290	297295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722975
5553	NC_022544	TGG	2	6	297299	297304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722975
5554	NC_022544	TGGC	2	8	297362	297369	0 %	25 %	50 %	25 %	549722975
5555	NC_022544	CCTT	2	8	297376	297383	0 %	50 %	0 %	50 %	549722975
5556	NC_022544	TGA	2	6	297412	297417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722975
5557	NC_022544	GCC	2	6	297459	297464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722975
5558	NC_022544	CGG	2	6	297539	297544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722975
5559	NC_022544	ATG	2	6	297576	297581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722975
5560	NC_022544	GTGCC	2	10	297691	297700	0 %	20 %	40 %	40 %	549722975
5561	NC_022544	CGC	2	6	297719	297724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722975
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5563	NC_022544	TGC	2	6	297773	297778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722975
5564	NC_022544	GCG	2	6	297906	297911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722975
5565	NC_022544	TGG	2	6	298009	298014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722975
5566	NC_022544	CTG	2	6	298020	298025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722975
5567	NC_022544	ATGCG	2	10	298224	298233	20 %	20 %	40 %	20 %	549722976
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5570	NC_022544	CCG	2	6	298305	298310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722976
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5580	NC_022544	TTA	2	6	298652	298657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722976
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5582	NC_022544	GCC	2	6	298791	298796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722976
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5587	NC_022544	CG	3	6	298947	298952	0 %	0 %	50 %	50 %	549722976
5588	NC_022544	CCA	2	6	299100	299105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722977
5589	NC_022544	GCG	2	6	299338	299343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722977
5590	NC_022544	GAA	2	6	299344	299349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722977
5591	NC_022544	GGT	2	6	299421	299426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722977
5592	NC_022544	ACG	2	6	299456	299461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722977
5593	NC_022544	ATGTC	2	10	299525	299534	20 %	40 %	20 %	20 %	549722977
5594	NC_022544	TGGC	2	8	299623	299630	0 %	25 %	50 %	25 %	549722977
5595	NC_022544	GTTG	2	8	299730	299737	0 %	50 %	50 %	0 %	549722977
5596	NC_022544	CGATT	2	10	299741	299750	20 %	40 %	20 %	20 %	549722977
5597	NC_022544	AGC	2	6	299815	299820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722977
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5602	NC_022544	CTG	2	6	300170	300175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722978
5603	NC_022544	TGT	2	6	300509	300514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722978
5604	NC_022544	AAAG	2	8	300603	300610	75 %	0 %	25 %	0 %	549722978
5605	NC_022544	TTTG	2	8	300641	300648	0 %	75 %	25 %	0 %	549722978
5606	NC_022544	CGC	2	6	300676	300681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722978
5607	NC_022544	CAT	2	6	300740	300745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722978
5608	NC_022544	CGG	2	6	300754	300759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722978
5609	NC_022544	ACA	2	6	300771	300776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722978
5610	NC_022544	CG	3	6	300783	300788	0 %	0 %	50 %	50 %	549722978
5611	NC_022544	GTA	3	9	300907	300915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722978
5612	NC_022544	TTCTGT	2	12	301023	301034	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549722978
5613	NC_022544	TCG	2	6	301074	301079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722978
5614	NC_022544	CGT	2	6	301123	301128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722978
5615	NC_022544	CCAT	2	8	301129	301136	25 %	25 %	0 %	50 %	549722978
5616	NC_022544	GTGC	2	8	301192	301199	0 %	25 %	50 %	25 %	549722978
5617	NC_022544	TG	4	8	301279	301286	0 %	50 %	50 %	0 %	549722978
5618	NC_022544	TCTT	2	8	301361	301368	0 %	75 %	0 %	25 %	549722979
5619	NC_022544	GTT	2	6	301398	301403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722979
5620	NC_022544	TTAA	2	8	301430	301437	50 %	50 %	0 %	0 %	549722979
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5622	NC_022544	T	7	7	301510	301516	0 %	100 %	0 %	0 %	549722979
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5745	NC_022544	CGG	2	6	308137	308142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722985
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5988	NC_022544	CAGC	2	8	321186	321193	25 %	0 %	25 %	50 %	549723000
5989	NC_022544	GGCT	2	8	321242	321249	0 %	25 %	50 %	25 %	549723000
5990	NC_022544	GCG	2	6	321259	321264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
5991	NC_022544	CGC	2	6	321279	321284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723000
5992	NC_022544	CTG	2	6	321361	321366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723000
5993	NC_022544	GCG	2	6	321414	321419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
5994	NC_022544	TGA	2	6	321462	321467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723000
5995	NC_022544	GCC	2	6	321469	321474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723000
5996	NC_022544	CGGCG	2	10	321493	321502	0 %	0 %	60 %	40 %	549723000
5997	NC_022544	CTG	2	6	321520	321525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723000
5998	NC_022544	ATC	2	6	321571	321576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723000
5999	NC_022544	GGC	2	6	321585	321590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723000
6000	NC_022544	ACC	2	6	321629	321634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723000

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