MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 2724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022525	AGGTA	2	10	2554	2563	40 %	20 %	40 %	0 %	549478130
2	NC_022525	CGCTG	2	10	3113	3122	0 %	20 %	40 %	40 %	549481666
3	NC_022525	ATTGC	2	10	3397	3406	20 %	40 %	20 %	20 %	549481666
4	NC_022525	CCGCG	2	10	7185	7194	0 %	0 %	40 %	60 %	549478133
5	NC_022525	TCTTT	2	10	11324	11333	0 %	80 %	0 %	20 %	549481667
6	NC_022525	GCGTG	2	10	13992	14001	0 %	20 %	60 %	20 %	549478140
7	NC_022525	AATCA	2	10	15509	15518	60 %	20 %	0 %	20 %	549478141
8	NC_022525	GGCTG	2	10	18854	18863	0 %	20 %	60 %	20 %	549478145
9	NC_022525	AGAGC	2	10	19375	19384	40 %	0 %	40 %	20 %	549478145
10	NC_022525	CCTGA	2	10	19916	19925	20 %	20 %	20 %	40 %	549478145
11	NC_022525	TACCG	2	10	21053	21062	20 %	20 %	20 %	40 %	549478146
12	NC_022525	GGCCG	2	10	21677	21686	0 %	0 %	60 %	40 %	549478146
13	NC_022525	CTTTT	2	10	23396	23405	0 %	80 %	0 %	20 %	549478147
14	NC_022525	CGGTA	2	10	24564	24573	20 %	20 %	40 %	20 %	549478148
15	NC_022525	CTGTT	2	10	24603	24612	0 %	60 %	20 %	20 %	549478148
16	NC_022525	TATTT	2	10	25437	25446	20 %	80 %	0 %	0 %	549478149
17	NC_022525	ATCTG	2	10	30968	30977	20 %	40 %	20 %	20 %	549478154
18	NC_022525	TTACG	2	10	31023	31032	20 %	40 %	20 %	20 %	549478154
19	NC_022525	GGGCG	2	10	31791	31800	0 %	0 %	80 %	20 %	549478155
20	NC_022525	TGCGT	2	10	32170	32179	0 %	40 %	40 %	20 %	549481668
21	NC_022525	AAAAG	2	10	32564	32573	80 %	0 %	20 %	0 %	549478156
22	NC_022525	TATAA	2	10	34167	34176	60 %	40 %	0 %	0 %	549481669
23	NC_022525	AGCGA	2	10	35593	35602	40 %	0 %	40 %	20 %	549481670
24	NC_022525	TCCTG	2	10	35803	35812	0 %	40 %	20 %	40 %	549481670
25	NC_022525	GGTCA	2	10	38038	38047	20 %	20 %	40 %	20 %	549478158
26	NC_022525	TTCAT	2	10	39310	39319	20 %	60 %	0 %	20 %	549478159
27	NC_022525	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	549478160
28	NC_022525	TAAAA	2	10	44192	44201	80 %	20 %	0 %	0 %	549478162
29	NC_022525	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	549481672
30	NC_022525	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	549481672
31	NC_022525	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	549478163
32	NC_022525	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	549478165
33	NC_022525	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	549478165
34	NC_022525	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	549478165
35	NC_022525	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	549478165
36	NC_022525	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	549478166
37	NC_022525	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	549478167
38	NC_022525	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	549478167
39	NC_022525	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	549478168
40	NC_022525	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	549478169
41	NC_022525	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	549478171
42	NC_022525	GGAAA	2	10	59739	59748	60 %	0 %	40 %	0 %	549478171
43	NC_022525	CGGCG	2	10	63995	64004	0 %	0 %	60 %	40 %	549478175
44	NC_022525	GCCTG	2	10	64788	64797	0 %	20 %	40 %	40 %	549478175
45	NC_022525	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	549478176
46	NC_022525	CGTGC	2	10	71357	71366	0 %	20 %	40 %	40 %	549478181
47	NC_022525	TTGAT	2	10	71527	71536	20 %	60 %	20 %	0 %	549478181
48	NC_022525	ACCGC	2	10	72087	72096	20 %	0 %	20 %	60 %	549478181
49	NC_022525	CGATG	2	10	77749	77758	20 %	20 %	40 %	20 %	549478186
50	NC_022525	GCGAA	2	10	78690	78699	40 %	0 %	40 %	20 %	549478186
51	NC_022525	CGTAC	2	10	79580	79589	20 %	20 %	20 %	40 %	549478186
52	NC_022525	TTGCC	2	10	81217	81226	0 %	40 %	20 %	40 %	549478188
53	NC_022525	TCAGC	2	10	84445	84454	20 %	20 %	20 %	40 %	549481676
54	NC_022525	GGCCA	2	10	84593	84602	20 %	0 %	40 %	40 %	549481676
55	NC_022525	GTACG	2	10	87164	87173	20 %	20 %	40 %	20 %	549478192
56	NC_022525	CAGAA	2	10	87877	87886	60 %	0 %	20 %	20 %	549478192
57	NC_022525	CCGCA	2	10	89996	90005	20 %	0 %	20 %	60 %	549478194
58	NC_022525	CGGTT	2	10	90501	90510	0 %	40 %	40 %	20 %	549478195
59	NC_022525	GCTCC	2	10	91637	91646	0 %	20 %	20 %	60 %	549478195
60	NC_022525	TGGCG	2	10	92281	92290	0 %	20 %	60 %	20 %	549478197
61	NC_022525	TTTCC	2	10	96193	96202	0 %	60 %	0 %	40 %	549478201
62	NC_022525	GTGGC	2	10	96762	96771	0 %	20 %	60 %	20 %	549478201
63	NC_022525	TGCAC	2	10	98678	98687	20 %	20 %	20 %	40 %	549478202
64	NC_022525	GCGCT	2	10	99383	99392	0 %	20 %	40 %	40 %	549478203
65	NC_022525	GGCGC	2	10	99797	99806	0 %	0 %	60 %	40 %	549478203
66	NC_022525	GCGAC	2	10	100110	100119	20 %	0 %	40 %	40 %	549478203
67	NC_022525	AACGT	2	10	102567	102576	40 %	20 %	20 %	20 %	549478206
68	NC_022525	CCCAA	2	10	104717	104726	40 %	0 %	0 %	60 %	549478209
69	NC_022525	TTGTT	2	10	105424	105433	0 %	80 %	20 %	0 %	549478209
70	NC_022525	GCTTC	2	10	106804	106813	0 %	40 %	20 %	40 %	549478210
71	NC_022525	TGCGT	2	10	107091	107100	0 %	40 %	40 %	20 %	549478210
72	NC_022525	TGATC	2	10	108791	108800	20 %	40 %	20 %	20 %	549478211
73	NC_022525	GCTGA	2	10	110301	110310	20 %	20 %	40 %	20 %	549478213
74	NC_022525	TGGCG	2	10	111951	111960	0 %	20 %	60 %	20 %	549478213
75	NC_022525	AGCGC	2	10	112511	112520	20 %	0 %	40 %	40 %	549478213
76	NC_022525	ACGTT	2	10	113328	113337	20 %	40 %	20 %	20 %	549478214
77	NC_022525	CCGCG	2	10	113596	113605	0 %	0 %	40 %	60 %	549478214
78	NC_022525	GGGGT	2	10	114992	115001	0 %	20 %	80 %	0 %	549478214
79	NC_022525	ACAGA	2	10	116722	116731	60 %	0 %	20 %	20 %	549478216
80	NC_022525	CAGCG	2	10	117897	117906	20 %	0 %	40 %	40 %	549478218
81	NC_022525	GCCGG	2	10	118197	118206	0 %	0 %	60 %	40 %	549478218
82	NC_022525	CGAGC	2	10	118322	118331	20 %	0 %	40 %	40 %	549478218
83	NC_022525	ATTTG	2	10	118765	118774	20 %	60 %	20 %	0 %	549478218
84	NC_022525	TTGCC	2	10	123269	123278	0 %	40 %	20 %	40 %	549478222
85	NC_022525	AGCAG	2	10	123946	123955	40 %	0 %	40 %	20 %	549478223
86	NC_022525	AGTTT	2	10	126176	126185	20 %	60 %	20 %	0 %	549478224
87	NC_022525	TCGAT	2	10	128024	128033	20 %	40 %	20 %	20 %	549478225
88	NC_022525	CGGCG	2	10	130654	130663	0 %	0 %	60 %	40 %	549478227
89	NC_022525	CGTTT	2	10	131116	131125	0 %	60 %	20 %	20 %	549478227
90	NC_022525	ATTCC	2	10	136217	136226	20 %	40 %	0 %	40 %	549478231
91	NC_022525	GCTGA	2	10	138157	138166	20 %	20 %	40 %	20 %	549478232
92	NC_022525	AAAGC	2	10	138514	138523	60 %	0 %	20 %	20 %	549478233
93	NC_022525	AGTTC	2	10	141418	141427	20 %	40 %	20 %	20 %	549478235
94	NC_022525	TGCCT	2	10	141518	141527	0 %	40 %	20 %	40 %	549481679
95	NC_022525	AAGCG	2	10	146171	146180	40 %	0 %	40 %	20 %	549478238
96	NC_022525	GTTTG	2	10	148074	148083	0 %	60 %	40 %	0 %	549481680
97	NC_022525	CGTAT	2	10	149545	149554	20 %	40 %	20 %	20 %	549478240
98	NC_022525	ATCAG	2	10	151381	151390	40 %	20 %	20 %	20 %	549478242
99	NC_022525	CTGCC	2	10	153390	153399	0 %	20 %	20 %	60 %	549478243
100	NC_022525	CGGCG	2	10	156120	156129	0 %	0 %	60 %	40 %	549478246
101	NC_022525	CCGGC	2	10	159473	159482	0 %	0 %	40 %	60 %	549478249
102	NC_022525	GATCA	2	10	164520	164529	40 %	20 %	20 %	20 %	549478252
103	NC_022525	CGTCA	2	10	165266	165275	20 %	20 %	20 %	40 %	549478253
104	NC_022525	ATCCC	2	10	166966	166975	20 %	20 %	0 %	60 %	549478255
105	NC_022525	AGCGC	2	10	167674	167683	20 %	0 %	40 %	40 %	549478255
106	NC_022525	TGAGC	2	10	169523	169532	20 %	20 %	40 %	20 %	549478256
107	NC_022525	CGCAT	2	10	169785	169794	20 %	20 %	20 %	40 %	549478257
108	NC_022525	CGAAC	2	10	170514	170523	40 %	0 %	20 %	40 %	549478258
109	NC_022525	GTTCA	2	10	170780	170789	20 %	40 %	20 %	20 %	549478258
110	NC_022525	ATGAC	2	10	171746	171755	40 %	20 %	20 %	20 %	549478259
111	NC_022525	CTGGA	2	10	172336	172345	20 %	20 %	40 %	20 %	549478260
112	NC_022525	CAGAA	2	10	174455	174464	60 %	0 %	20 %	20 %	549478262
113	NC_022525	CGAAG	2	10	177326	177335	40 %	0 %	40 %	20 %	549478264
114	NC_022525	AGCAA	2	10	179539	179548	60 %	0 %	20 %	20 %	549478265
115	NC_022525	GGCAT	2	10	184606	184615	20 %	20 %	40 %	20 %	549478268
116	NC_022525	GGCCA	2	10	185028	185037	20 %	0 %	40 %	40 %	549478269
117	NC_022525	GCGCC	2	10	185041	185050	0 %	0 %	40 %	60 %	549478269
118	NC_022525	CGTTT	2	10	185543	185552	0 %	60 %	20 %	20 %	549478269
119	NC_022525	GGGGA	2	10	185595	185604	20 %	0 %	80 %	0 %	549478269
120	NC_022525	TCTGG	2	10	189228	189237	0 %	40 %	40 %	20 %	549478270
121	NC_022525	AGTAC	2	10	194815	194824	40 %	20 %	20 %	20 %	549481689
122	NC_022525	CCGCT	2	10	198112	198121	0 %	20 %	20 %	60 %	549478272
123	NC_022525	GCCCA	2	10	200664	200673	20 %	0 %	20 %	60 %	549478275
124	NC_022525	GCGCA	2	10	201069	201078	20 %	0 %	40 %	40 %	549478275
125	NC_022525	ATCGG	2	10	202460	202469	20 %	20 %	40 %	20 %	549478277
126	NC_022525	GCCGC	2	10	203670	203679	0 %	0 %	40 %	60 %	549478279
127	NC_022525	ATCCA	2	10	209020	209029	40 %	20 %	0 %	40 %	549478282
128	NC_022525	CGGCG	2	10	211137	211146	0 %	0 %	60 %	40 %	549478285
129	NC_022525	TGGTC	2	10	212003	212012	0 %	40 %	40 %	20 %	549478285
130	NC_022525	CGTCA	2	10	213701	213710	20 %	20 %	20 %	40 %	549478286
131	NC_022525	AGCGC	2	10	214652	214661	20 %	0 %	40 %	40 %	549478286
132	NC_022525	CGGCG	2	10	216566	216575	0 %	0 %	60 %	40 %	549478289
133	NC_022525	TTCGG	2	10	217446	217455	0 %	40 %	40 %	20 %	549478290
134	NC_022525	GCTTT	2	10	218173	218182	0 %	60 %	20 %	20 %	549481693
135	NC_022525	GAATG	2	10	218528	218537	40 %	20 %	40 %	0 %	549481693
136	NC_022525	GCGCC	2	10	219378	219387	0 %	0 %	40 %	60 %	549481694
137	NC_022525	CCAGA	2	10	220494	220503	40 %	0 %	20 %	40 %	549481696
138	NC_022525	GGCCT	2	10	221137	221146	0 %	20 %	40 %	40 %	549481697
139	NC_022525	CGGTA	2	10	221287	221296	20 %	20 %	40 %	20 %	549481697
140	NC_022525	TCATA	2	10	223032	223041	40 %	40 %	0 %	20 %	549481697
141	NC_022525	CTTGC	2	10	225718	225727	0 %	40 %	20 %	40 %	549478292
142	NC_022525	TGAGC	2	10	226130	226139	20 %	20 %	40 %	20 %	549478293
143	NC_022525	CGGCA	2	10	227215	227224	20 %	0 %	40 %	40 %	549478294
144	NC_022525	GCACG	2	10	227394	227403	20 %	0 %	40 %	40 %	549478294
145	NC_022525	AGATC	2	10	227799	227808	40 %	20 %	20 %	20 %	549478295
146	NC_022525	CGCGG	2	10	228221	228230	0 %	0 %	60 %	40 %	549478296
147	NC_022525	CGCGG	2	10	228405	228414	0 %	0 %	60 %	40 %	549478296
148	NC_022525	AGGCC	2	10	228584	228593	20 %	0 %	40 %	40 %	549478296
149	NC_022525	GCCAG	2	10	230389	230398	20 %	0 %	40 %	40 %	549478297
150	NC_022525	GCGCG	2	10	230955	230964	0 %	0 %	60 %	40 %	549478298
151	NC_022525	CGGGG	2	10	232773	232782	0 %	0 %	80 %	20 %	549478301
152	NC_022525	GCGAA	2	10	234893	234902	40 %	0 %	40 %	20 %	549478301
153	NC_022525	CAGCG	2	10	234956	234965	20 %	0 %	40 %	40 %	549478301
154	NC_022525	GGCGG	2	10	236706	236715	0 %	0 %	80 %	20 %	549481699
155	NC_022525	GTTGA	2	10	238555	238564	20 %	40 %	40 %	0 %	549478302
156	NC_022525	TTCAA	2	10	238661	238670	40 %	40 %	0 %	20 %	549478302
157	NC_022525	GGAAT	2	10	239415	239424	40 %	20 %	40 %	0 %	549478302
158	NC_022525	GCAGC	2	10	240074	240083	20 %	0 %	40 %	40 %	549478302
159	NC_022525	TGGCG	2	10	241277	241286	0 %	20 %	60 %	20 %	549478303
160	NC_022525	TGGTC	2	10	241405	241414	0 %	40 %	40 %	20 %	549478303
161	NC_022525	GGCGT	2	10	242468	242477	0 %	20 %	60 %	20 %	549478304
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164	NC_022525	CAGGT	2	10	252041	252050	20 %	20 %	40 %	20 %	549478311
165	NC_022525	CGGCG	2	10	253534	253543	0 %	0 %	60 %	40 %	549478312
166	NC_022525	TGCTT	2	10	254028	254037	0 %	60 %	20 %	20 %	549478312
167	NC_022525	CCGGG	2	10	261169	261178	0 %	0 %	60 %	40 %	549481702
168	NC_022525	CGGCG	2	10	264399	264408	0 %	0 %	60 %	40 %	549478321
169	NC_022525	AAAGT	2	10	266756	266765	60 %	20 %	20 %	0 %	549478322
170	NC_022525	CTGAA	2	10	268795	268804	40 %	20 %	20 %	20 %	549478324
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172	NC_022525	TGGTG	2	10	270763	270772	0 %	40 %	60 %	0 %	549478326
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174	NC_022525	ACTTT	2	10	274325	274334	20 %	60 %	0 %	20 %	549478329
175	NC_022525	TACGG	2	10	278238	278247	20 %	20 %	40 %	20 %	549478332
176	NC_022525	TCCAG	2	10	280254	280263	20 %	20 %	20 %	40 %	549478334
177	NC_022525	GTGAA	2	10	281535	281544	40 %	20 %	40 %	0 %	549478336
178	NC_022525	ATGCC	2	10	282626	282635	20 %	20 %	20 %	40 %	549478337
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194	NC_022525	CGATT	2	10	313837	313846	20 %	40 %	20 %	20 %	549478356
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196	NC_022525	CGCGG	2	10	317757	317766	0 %	0 %	60 %	40 %	549478361
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199	NC_022525	CCCTG	2	10	321948	321957	0 %	20 %	20 %	60 %	549481708
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202	NC_022525	GCACA	2	10	324699	324708	40 %	0 %	20 %	40 %	549478366
203	NC_022525	GCGGT	2	10	329514	329523	0 %	20 %	60 %	20 %	549478369
204	NC_022525	ATGAT	2	10	332006	332015	40 %	40 %	20 %	0 %	549478371
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211	NC_022525	AACAA	2	10	344614	344623	80 %	0 %	0 %	20 %	549481712
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220	NC_022525	CTGGA	2	10	356379	356388	20 %	20 %	40 %	20 %	549481719
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230	NC_022525	GCGTG	2	10	367196	367205	0 %	20 %	60 %	20 %	549478384
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232	NC_022525	TTACT	2	10	371799	371808	20 %	60 %	0 %	20 %	549478387
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234	NC_022525	TTTCA	2	10	373645	373654	20 %	60 %	0 %	20 %	549478388
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240	NC_022525	CGCGC	2	10	386863	386872	0 %	0 %	40 %	60 %	549478399
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242	NC_022525	GTAAG	2	10	388509	388518	40 %	20 %	40 %	0 %	549478400
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244	NC_022525	AGCGA	2	10	390588	390597	40 %	0 %	40 %	20 %	549478402
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246	NC_022525	ATTTT	2	10	395166	395175	20 %	80 %	0 %	0 %	549478405
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248	NC_022525	TTTCA	2	10	395665	395674	20 %	60 %	0 %	20 %	549478405
249	NC_022525	CAACG	2	10	397862	397871	40 %	0 %	20 %	40 %	549478407
250	NC_022525	GACTG	2	10	405138	405147	20 %	20 %	40 %	20 %	549478413
251	NC_022525	ATTTT	2	10	407277	407286	20 %	80 %	0 %	0 %	549481737
252	NC_022525	ATCGG	2	10	409715	409724	20 %	20 %	40 %	20 %	549478415
253	NC_022525	TCCTG	2	10	411783	411792	0 %	40 %	20 %	40 %	549481739
254	NC_022525	TTGGC	2	10	411948	411957	0 %	40 %	40 %	20 %	549481739
255	NC_022525	AAGCC	2	10	418714	418723	40 %	0 %	20 %	40 %	549478422
256	NC_022525	ACCAA	2	10	419206	419215	60 %	0 %	0 %	40 %	549478422
257	NC_022525	CACGA	2	10	421928	421937	40 %	0 %	20 %	40 %	549481742
258	NC_022525	TGTCG	2	10	423361	423370	0 %	40 %	40 %	20 %	549481742
259	NC_022525	CCGAT	2	10	423606	423615	20 %	20 %	20 %	40 %	549481742
260	NC_022525	GCGTC	2	10	425593	425602	0 %	20 %	40 %	40 %	549478425
261	NC_022525	ATGTG	2	10	427374	427383	20 %	40 %	40 %	0 %	549478426
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263	NC_022525	TAAAG	2	10	429022	429031	60 %	20 %	20 %	0 %	549481743
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