MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022525	GAC	2	6	183712	183717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478267
3502	NC_022525	TCG	2	6	183785	183790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478267
3503	NC_022525	GAA	2	6	183855	183860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478267
3504	NC_022525	ACT	2	6	183863	183868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478267
3505	NC_022525	GAAA	2	8	183945	183952	75 %	0 %	25 %	0 %	549478267
3506	NC_022525	CGG	2	6	184071	184076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478267
3507	NC_022525	CGG	2	6	184095	184100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478267
3508	NC_022525	GCT	2	6	184104	184109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478267
3509	NC_022525	GCT	2	6	184207	184212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478267
3510	NC_022525	GTA	2	6	184226	184231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478267
3511	NC_022525	GAA	3	9	184257	184265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478267
3512	NC_022525	GCA	2	6	184398	184403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481683
3513	NC_022525	TGTC	2	8	184441	184448	0 %	50 %	25 %	25 %	549481683
3514	NC_022525	AT	3	6	184554	184559	50 %	50 %	0 %	0 %	549478268
3515	NC_022525	ACA	2	6	184573	184578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478268
3516	NC_022525	GGCAT	2	10	184606	184615	20 %	20 %	40 %	20 %	549478268
3517	NC_022525	GGT	2	6	184654	184659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478268
3518	NC_022525	GCA	2	6	184704	184709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478268
3519	NC_022525	CAG	2	6	184711	184716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478268
3520	NC_022525	GGC	2	6	184743	184748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478268
3521	NC_022525	GCA	2	6	184757	184762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478268
3522	NC_022525	TGA	2	6	184770	184775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478268
3523	NC_022525	CAA	2	6	184791	184796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478268
3524	NC_022525	GCC	2	6	184797	184802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478268
3525	NC_022525	TCA	2	6	184999	185004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478269
3526	NC_022525	GGCCA	2	10	185028	185037	20 %	0 %	40 %	40 %	549478269
3527	NC_022525	GCGCC	2	10	185041	185050	0 %	0 %	40 %	60 %	549478269
3528	NC_022525	CGT	2	6	185056	185061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478269
3529	NC_022525	ATA	2	6	185070	185075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478269
3530	NC_022525	TTGG	2	8	185157	185164	0 %	50 %	50 %	0 %	549478269
3531	NC_022525	CTG	2	6	185240	185245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478269
3532	NC_022525	GCAT	2	8	185259	185266	25 %	25 %	25 %	25 %	549478269
3533	NC_022525	GCC	2	6	185328	185333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478269
3534	NC_022525	GCC	2	6	185348	185353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478269
3535	NC_022525	TCT	2	6	185388	185393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478269
3536	NC_022525	CGG	2	6	185495	185500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478269
3537	NC_022525	GCC	2	6	185509	185514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478269
3538	NC_022525	CGTTT	2	10	185543	185552	0 %	60 %	20 %	20 %	549478269
3539	NC_022525	T	6	6	185550	185555	0 %	100 %	0 %	0 %	549478269
3540	NC_022525	CCG	2	6	185563	185568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478269
3541	NC_022525	GGC	2	6	185582	185587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478269
3542	NC_022525	GGGGA	2	10	185595	185604	20 %	0 %	80 %	0 %	549478269
3543	NC_022525	ATG	2	6	185702	185707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481684
3544	NC_022525	CG	3	6	185724	185729	0 %	0 %	50 %	50 %	549481684
3545	NC_022525	GCG	3	9	185727	185735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481684
3546	NC_022525	GCG	2	6	185872	185877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481684
3547	NC_022525	GGCG	2	8	185896	185903	0 %	0 %	75 %	25 %	549481684
3548	NC_022525	TC	3	6	185907	185912	0 %	50 %	0 %	50 %	549481684
3549	NC_022525	TGT	2	6	185916	185921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481684
3550	NC_022525	TGC	2	6	185931	185936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3551	NC_022525	TGC	3	9	185964	185972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3552	NC_022525	GTG	2	6	185973	185978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481684
3553	NC_022525	CTG	2	6	185993	185998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3554	NC_022525	CGC	2	6	185999	186004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481684
3555	NC_022525	CGA	2	6	186009	186014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3556	NC_022525	CTG	2	6	186015	186020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3557	NC_022525	ATT	2	6	186047	186052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481684
3558	NC_022525	CTG	2	6	186074	186079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3559	NC_022525	GCC	2	6	186168	186173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481684
3560	NC_022525	TGC	2	6	186204	186209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3561	NC_022525	CGC	2	6	186223	186228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481684
3562	NC_022525	TGG	2	6	186235	186240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481684
3563	NC_022525	TAT	2	6	186262	186267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481684
3564	NC_022525	TGC	2	6	186303	186308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3565	NC_022525	ATT	2	6	186356	186361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481684
3566	NC_022525	ACC	2	6	186404	186409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481684
3567	NC_022525	ATG	2	6	186410	186415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481684
3568	NC_022525	ATC	3	9	186419	186427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481684
3569	NC_022525	ATG	2	6	186428	186433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481684
3570	NC_022525	GTC	3	9	186434	186442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3571	NC_022525	TGG	2	6	186444	186449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481684
3572	NC_022525	TGA	2	6	186450	186455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481684
3573	NC_022525	TCG	2	6	186456	186461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3574	NC_022525	TGC	2	6	186475	186480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
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3577	NC_022525	CTG	2	6	186548	186553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3578	NC_022525	CGG	2	6	186578	186583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481684
3579	NC_022525	ACC	2	6	186642	186647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481684
3580	NC_022525	TGA	2	6	186670	186675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481684
3581	NC_022525	TGG	2	6	186709	186714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481684
3582	NC_022525	GTC	2	6	186717	186722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3583	NC_022525	CGG	2	6	186727	186732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481684
3584	NC_022525	GAGC	2	8	186802	186809	25 %	0 %	50 %	25 %	549481684
3585	NC_022525	CATC	2	8	186829	186836	25 %	25 %	0 %	50 %	549481684
3586	NC_022525	TGGC	2	8	186957	186964	0 %	25 %	50 %	25 %	549481684
3587	NC_022525	CG	3	6	187006	187011	0 %	0 %	50 %	50 %	549481684
3588	NC_022525	GCC	2	6	187191	187196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481684
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3590	NC_022525	TCG	2	6	187690	187695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3591	NC_022525	AGA	2	6	187700	187705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478270
3592	NC_022525	TGC	2	6	187730	187735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3593	NC_022525	GCT	2	6	187790	187795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3594	NC_022525	GAA	3	9	187815	187823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478270
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3596	NC_022525	GCT	2	6	187899	187904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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3598	NC_022525	CTG	2	6	187959	187964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3599	NC_022525	ACA	2	6	187984	187989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478270
3600	NC_022525	TGAT	2	8	187999	188006	25 %	50 %	25 %	0 %	549478270
3601	NC_022525	TGC	2	6	188036	188041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3602	NC_022525	CTG	2	6	188061	188066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3603	NC_022525	ACG	2	6	188083	188088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3604	NC_022525	AGA	2	6	188090	188095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478270
3605	NC_022525	CCG	2	6	188172	188177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478270
3606	NC_022525	A	6	6	188185	188190	100 %	0 %	0 %	0 %	549478270
3607	NC_022525	TCACCG	2	12	188191	188202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549478270
3608	NC_022525	CGA	2	6	188231	188236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3609	NC_022525	TC	4	8	188237	188244	0 %	50 %	0 %	50 %	549478270
3610	NC_022525	CAAA	2	8	188354	188361	75 %	0 %	0 %	25 %	549478270
3611	NC_022525	A	6	6	188376	188381	100 %	0 %	0 %	0 %	549478270
3612	NC_022525	GTG	2	6	188409	188414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478270
3613	NC_022525	TTC	2	6	188423	188428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478270
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3615	NC_022525	CGG	2	6	188516	188521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478270
3616	NC_022525	TCT	2	6	188536	188541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478270
3617	NC_022525	CGA	2	6	188702	188707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
3618	NC_022525	GTGC	2	8	188709	188716	0 %	25 %	50 %	25 %	549478270
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3620	NC_022525	ACC	2	6	188754	188759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478270
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3734	NC_022525	CAAA	2	8	193571	193578	75 %	0 %	0 %	25 %	549481688
3735	NC_022525	T	6	6	193828	193833	0 %	100 %	0 %	0 %	549481689
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3737	NC_022525	TGA	2	6	193894	193899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481689
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3739	NC_022525	CG	3	6	193992	193997	0 %	0 %	50 %	50 %	549481689
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3741	NC_022525	AGATGA	2	12	194050	194061	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549481689
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3746	NC_022525	TGCC	2	8	194243	194250	0 %	25 %	25 %	50 %	549481689
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3986	NC_022525	CGG	2	6	207210	207215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478280
3987	NC_022525	AGCC	2	8	207264	207271	25 %	0 %	25 %	50 %	549478280
3988	NC_022525	GCC	2	6	207283	207288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478280
3989	NC_022525	CAG	2	6	207295	207300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478280
3990	NC_022525	GCC	2	6	207314	207319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478280
3991	NC_022525	GGAA	2	8	207331	207338	50 %	0 %	50 %	0 %	549478280
3992	NC_022525	CCA	2	6	207339	207344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478280
3993	NC_022525	CAG	3	9	207463	207471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478280
3994	NC_022525	GGC	2	6	207472	207477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478280
3995	NC_022525	GTA	2	6	207553	207558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478280
3996	NC_022525	CCAG	2	8	207579	207586	25 %	0 %	25 %	50 %	549478280
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3998	NC_022525	TGC	2	6	207619	207624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478280
3999	NC_022525	GTC	2	6	207951	207956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478281
4000	NC_022525	TTTATG	2	12	208022	208033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549478281

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