MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022525	CAAA	2	8	157048	157055	75 %	0 %	0 %	25 %	549478247
3002	NC_022525	AC	3	6	157096	157101	50 %	0 %	0 %	50 %	549478247
3003	NC_022525	A	6	6	157106	157111	100 %	0 %	0 %	0 %	549478247
3004	NC_022525	TCG	2	6	157159	157164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478247
3005	NC_022525	ATG	2	6	157251	157256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478247
3006	NC_022525	GCT	2	6	157286	157291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478247
3007	NC_022525	ATGG	2	8	157352	157359	25 %	25 %	50 %	0 %	549478247
3008	NC_022525	CTG	2	6	157382	157387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478247
3009	NC_022525	TGA	2	6	157402	157407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478247
3010	NC_022525	A	6	6	157421	157426	100 %	0 %	0 %	0 %	549478247
3011	NC_022525	CGAT	2	8	157536	157543	25 %	25 %	25 %	25 %	549478247
3012	NC_022525	CAG	2	6	157546	157551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478247
3013	NC_022525	GGC	2	6	157667	157672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478247
3014	NC_022525	GTT	2	6	157691	157696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478247
3015	NC_022525	TTCG	2	8	157745	157752	0 %	50 %	25 %	25 %	549478247
3016	NC_022525	TG	3	6	157788	157793	0 %	50 %	50 %	0 %	549478247
3017	NC_022525	ATT	2	6	157802	157807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478247
3018	NC_022525	GAC	2	6	157907	157912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478247
3019	NC_022525	TTA	2	6	158298	158303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478248
3020	NC_022525	CGC	2	6	158345	158350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478248
3021	NC_022525	GAC	2	6	158372	158377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478248
3022	NC_022525	CGT	2	6	158436	158441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478248
3023	NC_022525	CTTT	2	8	158499	158506	0 %	75 %	0 %	25 %	549478248
3024	NC_022525	CAT	2	6	158562	158567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478248
3025	NC_022525	AGG	2	6	158605	158610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478248
3026	NC_022525	CGC	2	6	158614	158619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478248
3027	NC_022525	TCG	2	6	158630	158635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478248
3028	NC_022525	TAT	2	6	158793	158798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478249
3029	NC_022525	ATT	2	6	158808	158813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478249
3030	NC_022525	CGT	2	6	158851	158856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478249
3031	NC_022525	TTA	2	6	158876	158881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478249
3032	NC_022525	AG	3	6	158976	158981	50 %	0 %	50 %	0 %	549478249
3033	NC_022525	GGT	2	6	159003	159008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478249
3034	NC_022525	GGT	2	6	159064	159069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478249
3035	NC_022525	AAC	2	6	159220	159225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478249
3036	NC_022525	GCCA	2	8	159285	159292	25 %	0 %	25 %	50 %	549478249
3037	NC_022525	AAC	2	6	159331	159336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478249
3038	NC_022525	ACA	2	6	159362	159367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478249
3039	NC_022525	TGG	2	6	159416	159421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478249
3040	NC_022525	CGC	2	6	159458	159463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478249
3041	NC_022525	ATT	2	6	159466	159471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478249
3042	NC_022525	CCGGC	2	10	159473	159482	0 %	0 %	40 %	60 %	549478249
3043	NC_022525	A	6	6	159505	159510	100 %	0 %	0 %	0 %	549478249
3044	NC_022525	AGA	2	6	159549	159554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478249
3045	NC_022525	TGA	2	6	159591	159596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478249
3046	NC_022525	GC	3	6	159601	159606	0 %	0 %	50 %	50 %	549478249
3047	NC_022525	AAG	2	6	159659	159664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478249
3048	NC_022525	CCG	2	6	159728	159733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478249
3049	NC_022525	GC	4	8	159738	159745	0 %	0 %	50 %	50 %	549478249
3050	NC_022525	TCA	2	6	159794	159799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478249
3051	NC_022525	TTG	2	6	159800	159805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478249
3052	NC_022525	AAG	2	6	159875	159880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478249
3053	NC_022525	ACT	2	6	159932	159937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478249
3054	NC_022525	CGG	2	6	159974	159979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478249
3055	NC_022525	CTAT	2	8	160004	160011	25 %	50 %	0 %	25 %	549478249
3056	NC_022525	CGT	2	6	160023	160028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478249
3057	NC_022525	GAT	2	6	160047	160052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478249
3058	NC_022525	A	6	6	160094	160099	100 %	0 %	0 %	0 %	549478249
3059	NC_022525	AG	3	6	160195	160200	50 %	0 %	50 %	0 %	549478249
3060	NC_022525	GCG	2	6	160288	160293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478249
3061	NC_022525	CGC	2	6	160365	160370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478249
3062	NC_022525	GAA	2	6	160387	160392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478249
3063	NC_022525	CGG	2	6	160449	160454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478249
3064	NC_022525	CCG	2	6	160488	160493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478249
3065	NC_022525	TTC	2	6	160542	160547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478249
3066	NC_022525	ATG	2	6	160612	160617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478249
3067	NC_022525	CTG	2	6	160729	160734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478249
3068	NC_022525	ATG	3	9	160739	160747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478249
3069	NC_022525	CTG	2	6	160792	160797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478249
3070	NC_022525	CCG	2	6	160873	160878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478249
3071	NC_022525	GAG	2	6	160990	160995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478249
3072	NC_022525	AGA	2	6	161046	161051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478249
3073	NC_022525	GGT	2	6	161052	161057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478249
3074	NC_022525	ATG	2	6	161068	161073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478249
3075	NC_022525	TGC	2	6	161096	161101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478249
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3078	NC_022525	GCA	2	6	161358	161363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478249
3079	NC_022525	GCC	2	6	161386	161391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478249
3080	NC_022525	GCC	2	6	161407	161412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478249
3081	NC_022525	CCTTGC	2	12	161446	161457	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549478249
3082	NC_022525	A	6	6	161661	161666	100 %	0 %	0 %	0 %	549478250
3083	NC_022525	ACG	2	6	161701	161706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478250
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3088	NC_022525	AAG	2	6	161947	161952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478250
3089	NC_022525	CCG	2	6	162003	162008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478250
3090	NC_022525	ATT	2	6	162021	162026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478250
3091	NC_022525	TTA	2	6	162084	162089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481681
3092	NC_022525	GCCG	2	8	162129	162136	0 %	0 %	50 %	50 %	549481681
3093	NC_022525	CGT	2	6	162140	162145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481681
3094	NC_022525	GCC	2	6	162166	162171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481681
3095	NC_022525	CAG	2	6	162273	162278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481681
3096	NC_022525	GCA	2	6	162409	162414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481681
3097	NC_022525	TCT	2	6	162418	162423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481681
3098	NC_022525	CGA	2	6	162473	162478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481681
3099	NC_022525	TCT	2	6	162673	162678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481681
3100	NC_022525	TCG	2	6	162836	162841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481681
3101	NC_022525	CGA	2	6	162859	162864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481681
3102	NC_022525	CATA	2	8	162908	162915	50 %	25 %	0 %	25 %	549481681
3103	NC_022525	GTC	2	6	162981	162986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481681
3104	NC_022525	TAC	2	6	163076	163081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481681
3105	NC_022525	TAA	2	6	163175	163180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481682
3106	NC_022525	ATG	2	6	163187	163192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481682
3107	NC_022525	GCG	2	6	163252	163257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481682
3108	NC_022525	GGA	2	6	163305	163310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481682
3109	NC_022525	TTG	2	6	163327	163332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481682
3110	NC_022525	ACC	2	6	163339	163344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481682
3111	NC_022525	TGA	2	6	163413	163418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481682
3112	NC_022525	CGG	2	6	163487	163492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481682
3113	NC_022525	AACG	2	8	163591	163598	50 %	0 %	25 %	25 %	549481682
3114	NC_022525	CGC	2	6	163718	163723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481682
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3117	NC_022525	CGC	2	6	163878	163883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481682
3118	NC_022525	GAG	2	6	163966	163971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481682
3119	NC_022525	CTGC	2	8	163975	163982	0 %	25 %	25 %	50 %	549481682
3120	NC_022525	TAT	2	6	164002	164007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481682
3121	NC_022525	CG	3	6	164014	164019	0 %	0 %	50 %	50 %	549481682
3122	NC_022525	TATT	2	8	164042	164049	25 %	75 %	0 %	0 %	549481682
3123	NC_022525	ATT	2	6	164051	164056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481682
3124	NC_022525	GTC	2	6	164118	164123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478251
3125	NC_022525	CGC	2	6	164138	164143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478251
3126	NC_022525	CGG	2	6	164165	164170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478251
3127	NC_022525	C	6	6	164234	164239	0 %	0 %	0 %	100 %	549478251
3128	NC_022525	GAC	2	6	164241	164246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478251
3129	NC_022525	ACG	2	6	164272	164277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478251
3130	NC_022525	GCA	2	6	164441	164446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3131	NC_022525	CGT	2	6	164453	164458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3132	NC_022525	GATCA	2	10	164520	164529	40 %	20 %	20 %	20 %	549478252
3133	NC_022525	TGT	2	6	164605	164610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478252
3134	NC_022525	GCC	2	6	164655	164660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478252
3135	NC_022525	GCT	2	6	164711	164716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3136	NC_022525	CCG	2	6	164750	164755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478252
3137	NC_022525	CTG	2	6	164763	164768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3138	NC_022525	GCT	2	6	164831	164836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3139	NC_022525	CAG	2	6	164853	164858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478252
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3141	NC_022525	TCT	2	6	165002	165007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478252
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3143	NC_022525	GC	3	6	165170	165175	0 %	0 %	50 %	50 %	549478253
3144	NC_022525	CG	3	6	165217	165222	0 %	0 %	50 %	50 %	549478253
3145	NC_022525	CAT	2	6	165226	165231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478253
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3148	NC_022525	CAG	2	6	165320	165325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478253
3149	NC_022525	CTG	2	6	165383	165388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478253
3150	NC_022525	TTC	2	6	165425	165430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478253
3151	NC_022525	A	6	6	165439	165444	100 %	0 %	0 %	0 %	549478253
3152	NC_022525	CGG	2	6	165481	165486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478253
3153	NC_022525	GGGC	2	8	165526	165533	0 %	0 %	75 %	25 %	549478253
3154	NC_022525	GC	3	6	165554	165559	0 %	0 %	50 %	50 %	549478253
3155	NC_022525	ATA	2	6	165561	165566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478253
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3160	NC_022525	A	6	6	166221	166226	100 %	0 %	0 %	0 %	549478254
3161	NC_022525	TCG	2	6	166311	166316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478254
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3173	NC_022525	CCGC	2	8	166800	166807	0 %	0 %	25 %	75 %	549478254
3174	NC_022525	GGC	2	6	166817	166822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
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3177	NC_022525	CCA	3	9	167017	167025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478255
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3187	NC_022525	AGA	2	6	167562	167567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478255
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3192	NC_022525	AGCGC	2	10	167674	167683	20 %	0 %	40 %	40 %	549478255
3193	NC_022525	AGC	2	6	167740	167745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478255
3194	NC_022525	ATC	2	6	167781	167786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478255
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3197	NC_022525	TGA	2	6	167970	167975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478255
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3200	NC_022525	TGA	2	6	168067	168072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478255
3201	NC_022525	TGCC	2	8	168396	168403	0 %	25 %	25 %	50 %	549478256
3202	NC_022525	GC	3	6	168413	168418	0 %	0 %	50 %	50 %	549478256
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3211	NC_022525	GC	3	6	168836	168841	0 %	0 %	50 %	50 %	549478256
3212	NC_022525	CAA	2	6	168987	168992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478256
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3218	NC_022525	ACC	2	6	169453	169458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478256
3219	NC_022525	TGA	2	6	169501	169506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478256
3220	NC_022525	TGAGC	2	10	169523	169532	20 %	20 %	40 %	20 %	549478256
3221	NC_022525	TGT	2	6	169588	169593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478257
3222	NC_022525	GGCG	2	8	169659	169666	0 %	0 %	75 %	25 %	549478257
3223	NC_022525	ATG	2	6	169669	169674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478257
3224	NC_022525	TGA	2	6	169712	169717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478257
3225	NC_022525	TGA	2	6	169754	169759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478257
3226	NC_022525	CGCAT	2	10	169785	169794	20 %	20 %	20 %	40 %	549478257
3227	NC_022525	CCA	2	6	169804	169809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478257
3228	NC_022525	CGG	2	6	169832	169837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478257
3229	NC_022525	GAT	2	6	169932	169937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478257
3230	NC_022525	GTT	2	6	169976	169981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478257
3231	NC_022525	GA	3	6	170226	170231	50 %	0 %	50 %	0 %	549478258
3232	NC_022525	GC	4	8	170236	170243	0 %	0 %	50 %	50 %	549478258
3233	NC_022525	GC	3	6	170257	170262	0 %	0 %	50 %	50 %	549478258
3234	NC_022525	ATA	2	6	170406	170411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478258
3235	NC_022525	CGAAC	2	10	170514	170523	40 %	0 %	20 %	40 %	549478258
3236	NC_022525	ATA	2	6	170532	170537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478258
3237	NC_022525	GAT	2	6	170578	170583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478258
3238	NC_022525	GCC	3	9	170588	170596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478258
3239	NC_022525	GCCA	2	8	170672	170679	25 %	0 %	25 %	50 %	549478258
3240	NC_022525	GCG	2	6	170693	170698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478258
3241	NC_022525	GTTCA	2	10	170780	170789	20 %	40 %	20 %	20 %	549478258
3242	NC_022525	TTGG	2	8	170798	170805	0 %	50 %	50 %	0 %	549478258
3243	NC_022525	CAT	2	6	170848	170853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478258
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3245	NC_022525	CGG	2	6	171025	171030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478258
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3365	NC_022525	GCG	2	6	177630	177635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478264
3366	NC_022525	TGC	2	6	177733	177738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478264
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3369	NC_022525	CGT	2	6	177873	177878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478264
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3372	NC_022525	GGC	2	6	178215	178220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478265
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3383	NC_022525	CG	3	6	178527	178532	0 %	0 %	50 %	50 %	549478265
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3386	NC_022525	AAAC	2	8	178740	178747	75 %	0 %	0 %	25 %	549478265
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3389	NC_022525	GCTG	2	8	178932	178939	0 %	25 %	50 %	25 %	549478265
3390	NC_022525	CTG	2	6	178980	178985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478265
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3393	NC_022525	CTT	2	6	179087	179092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478265
3394	NC_022525	TGG	2	6	179119	179124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478265
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3403	NC_022525	AGCAA	2	10	179539	179548	60 %	0 %	20 %	20 %	549478265
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3484	NC_022525	GTTT	2	8	182974	182981	0 %	75 %	25 %	0 %	549478267
3485	NC_022525	GCT	2	6	183009	183014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478267
3486	NC_022525	GAA	2	6	183034	183039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478267
3487	NC_022525	GCTG	2	8	183048	183055	0 %	25 %	50 %	25 %	549478267
3488	NC_022525	CGG	2	6	183138	183143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478267
3489	NC_022525	TGGAAG	2	12	183218	183229	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549478267
3490	NC_022525	ATC	2	6	183268	183273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478267
3491	NC_022525	GCG	2	6	183274	183279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478267
3492	NC_022525	CG	3	6	183323	183328	0 %	0 %	50 %	50 %	549478267
3493	NC_022525	AAG	2	6	183359	183364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478267
3494	NC_022525	GCG	2	6	183389	183394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478267
3495	NC_022525	ATC	2	6	183397	183402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478267
3496	NC_022525	CGG	2	6	183479	183484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478267
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3498	NC_022525	A	6	6	183607	183612	100 %	0 %	0 %	0 %	549478267
3499	NC_022525	ATG	2	6	183635	183640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478267
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