MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022525	TGCCGA	2	12	130746	130757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549478227
2502	NC_022525	GTGG	2	8	130780	130787	0 %	25 %	75 %	0 %	549478227
2503	NC_022525	CGC	2	6	130800	130805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478227
2504	NC_022525	GC	4	8	131043	131050	0 %	0 %	50 %	50 %	549478227
2505	NC_022525	CAG	2	6	131107	131112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478227
2506	NC_022525	CGTTT	2	10	131116	131125	0 %	60 %	20 %	20 %	549478227
2507	NC_022525	AAT	2	6	131153	131158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478227
2508	NC_022525	ATA	2	6	131212	131217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478228
2509	NC_022525	ACTG	2	8	131235	131242	25 %	25 %	25 %	25 %	549478228
2510	NC_022525	GCA	3	9	131348	131356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478228
2511	NC_022525	GCC	2	6	131421	131426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478228
2512	NC_022525	TCG	2	6	131509	131514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478228
2513	NC_022525	CAG	2	6	131544	131549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478228
2514	NC_022525	TGG	2	6	131585	131590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478228
2515	NC_022525	CAT	2	6	131642	131647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478228
2516	NC_022525	CGG	2	6	131713	131718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478228
2517	NC_022525	CCG	2	6	131848	131853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478228
2518	NC_022525	CGCA	2	8	131863	131870	25 %	0 %	25 %	50 %	549478228
2519	NC_022525	GCG	2	6	131890	131895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478228
2520	NC_022525	GC	3	6	131902	131907	0 %	0 %	50 %	50 %	549478228
2521	NC_022525	AAT	2	6	131962	131967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478228
2522	NC_022525	GCA	2	6	131987	131992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478228
2523	NC_022525	GGCT	2	8	132007	132014	0 %	25 %	50 %	25 %	549478228
2524	NC_022525	GCC	2	6	132042	132047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478228
2525	NC_022525	CCG	2	6	132136	132141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478228
2526	NC_022525	TGG	2	6	132155	132160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478228
2527	NC_022525	TTC	2	6	132265	132270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478228
2528	NC_022525	TTG	2	6	132288	132293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478229
2529	NC_022525	CGG	2	6	132337	132342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478229
2530	NC_022525	GGA	2	6	132383	132388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478229
2531	NC_022525	CGA	2	6	132391	132396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478229
2532	NC_022525	GCG	2	6	132425	132430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478229
2533	NC_022525	ATG	2	6	132434	132439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478229
2534	NC_022525	ACG	2	6	132444	132449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478229
2535	NC_022525	CGT	2	6	132517	132522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478229
2536	NC_022525	GCCGTT	2	12	132566	132577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478229
2537	NC_022525	CGC	2	6	132578	132583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478229
2538	NC_022525	CAC	2	6	132601	132606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478229
2539	NC_022525	TTC	2	6	132686	132691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478229
2540	NC_022525	TAA	2	6	132703	132708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478229
2541	NC_022525	T	6	6	132746	132751	0 %	100 %	0 %	0 %	549478229
2542	NC_022525	CGT	2	6	132772	132777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478229
2543	NC_022525	GGT	2	6	132781	132786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478229
2544	NC_022525	TGT	2	6	132790	132795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478229
2545	NC_022525	CGG	2	6	132838	132843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478229
2546	NC_022525	TGG	2	6	132945	132950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478229
2547	NC_022525	TTG	2	6	132993	132998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478229
2548	NC_022525	CTGG	2	8	133034	133041	0 %	25 %	50 %	25 %	549478229
2549	NC_022525	GTG	2	6	133055	133060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478229
2550	NC_022525	GT	3	6	133071	133076	0 %	50 %	50 %	0 %	549478229
2551	NC_022525	ATG	2	6	133083	133088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478229
2552	NC_022525	CTT	2	6	133117	133122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478229
2553	NC_022525	GCC	2	6	133197	133202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478229
2554	NC_022525	TCG	2	6	133230	133235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478229
2555	NC_022525	GAT	2	6	133250	133255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478229
2556	NC_022525	CCA	2	6	133381	133386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478229
2557	NC_022525	CG	3	6	133387	133392	0 %	0 %	50 %	50 %	549478229
2558	NC_022525	TCA	2	6	133443	133448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478229
2559	NC_022525	CG	3	6	133481	133486	0 %	0 %	50 %	50 %	549478229
2560	NC_022525	TGC	2	6	133507	133512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478229
2561	NC_022525	TGG	2	6	133519	133524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478229
2562	NC_022525	AAT	2	6	133826	133831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478229
2563	NC_022525	ATG	2	6	133845	133850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478229
2564	NC_022525	CG	3	6	134795	134800	0 %	0 %	50 %	50 %	549478230
2565	NC_022525	CAG	2	6	135000	135005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478230
2566	NC_022525	ATA	2	6	135044	135049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478230
2567	NC_022525	A	6	6	135080	135085	100 %	0 %	0 %	0 %	549478230
2568	NC_022525	CGT	2	6	135116	135121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478230
2569	NC_022525	TTA	2	6	135170	135175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478230
2570	NC_022525	GAA	2	6	135181	135186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478230
2571	NC_022525	CGT	2	6	135190	135195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478230
2572	NC_022525	AAC	2	6	135302	135307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478230
2573	NC_022525	GTT	2	6	135313	135318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478230
2574	NC_022525	TC	3	6	135319	135324	0 %	50 %	0 %	50 %	549478230
2575	NC_022525	GCTG	2	8	135458	135465	0 %	25 %	50 %	25 %	549478230
2576	NC_022525	ATGG	2	8	135582	135589	25 %	25 %	50 %	0 %	549478230
2577	NC_022525	TTA	2	6	135595	135600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478230
2578	NC_022525	GTC	2	6	135970	135975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478231
2579	NC_022525	ATG	2	6	136043	136048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478231
2580	NC_022525	GATC	2	8	136068	136075	25 %	25 %	25 %	25 %	549478231
2581	NC_022525	GTG	2	6	136150	136155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478231
2582	NC_022525	ATTCC	2	10	136217	136226	20 %	40 %	0 %	40 %	549478231
2583	NC_022525	ATTG	2	8	136260	136267	25 %	50 %	25 %	0 %	549478231
2584	NC_022525	ATG	2	6	136271	136276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478231
2585	NC_022525	TGG	2	6	136295	136300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478231
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2587	NC_022525	CTGG	2	8	136380	136387	0 %	25 %	50 %	25 %	549478231
2588	NC_022525	GGT	2	6	136410	136415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478231
2589	NC_022525	A	7	7	136450	136456	100 %	0 %	0 %	0 %	549478231
2590	NC_022525	A	6	6	136560	136565	100 %	0 %	0 %	0 %	549478231
2591	NC_022525	GGT	2	6	136569	136574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478231
2592	NC_022525	CAT	2	6	136626	136631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478231
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2594	NC_022525	GAC	2	6	136792	136797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478231
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2598	NC_022525	TGG	2	6	136990	136995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478231
2599	NC_022525	CAG	2	6	136996	137001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478231
2600	NC_022525	GC	3	6	137013	137018	0 %	0 %	50 %	50 %	549478231
2601	NC_022525	ACA	2	6	137130	137135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478231
2602	NC_022525	GCC	2	6	137146	137151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478231
2603	NC_022525	CGG	2	6	137193	137198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478231
2604	NC_022525	GAAA	2	8	137256	137263	75 %	0 %	25 %	0 %	549478231
2605	NC_022525	TGG	2	6	137264	137269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478231
2606	NC_022525	AAC	2	6	137362	137367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478231
2607	NC_022525	TAA	2	6	137550	137555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478231
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2611	NC_022525	TGC	2	6	137878	137883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478232
2612	NC_022525	ACGG	2	8	137956	137963	25 %	0 %	50 %	25 %	549478232
2613	NC_022525	ATT	2	6	138003	138008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478232
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2615	NC_022525	CGT	2	6	138122	138127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478232
2616	NC_022525	CG	3	6	138136	138141	0 %	0 %	50 %	50 %	549478232
2617	NC_022525	GCTGA	2	10	138157	138166	20 %	20 %	40 %	20 %	549478232
2618	NC_022525	AAAGC	2	10	138514	138523	60 %	0 %	20 %	20 %	549478233
2619	NC_022525	CTG	2	6	138724	138729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478233
2620	NC_022525	CCG	2	6	138826	138831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478233
2621	NC_022525	TCG	2	6	138875	138880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478233
2622	NC_022525	CG	3	6	138889	138894	0 %	0 %	50 %	50 %	549478233
2623	NC_022525	GAT	2	6	138937	138942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478233
2624	NC_022525	CGG	2	6	138977	138982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478233
2625	NC_022525	GC	3	6	139001	139006	0 %	0 %	50 %	50 %	549478233
2626	NC_022525	GCC	2	6	139114	139119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478233
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2634	NC_022525	CTG	2	6	140187	140192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478234
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2740	NC_022525	CG	3	6	144585	144590	0 %	0 %	50 %	50 %	549478237
2741	NC_022525	GGT	3	9	144645	144653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478237
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2851	NC_022525	CGTAT	2	10	149545	149554	20 %	40 %	20 %	20 %	549478240
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2985	NC_022525	TGA	2	6	156404	156409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478246
2986	NC_022525	ATG	2	6	156460	156465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478246
2987	NC_022525	GAA	2	6	156499	156504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478246
2988	NC_022525	TCT	2	6	156523	156528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478246
2989	NC_022525	GCT	2	6	156531	156536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478246
2990	NC_022525	GC	4	8	156557	156564	0 %	0 %	50 %	50 %	549478246
2991	NC_022525	CGG	2	6	156584	156589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478246
2992	NC_022525	CG	3	6	156637	156642	0 %	0 %	50 %	50 %	549478246
2993	NC_022525	ACG	2	6	156698	156703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478246
2994	NC_022525	GTT	2	6	156718	156723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478246
2995	NC_022525	GCA	2	6	156783	156788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478246
2996	NC_022525	CAG	2	6	156808	156813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478246
2997	NC_022525	A	6	6	156842	156847	100 %	0 %	0 %	0 %	549478246
2998	NC_022525	GGC	2	6	156882	156887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478246
2999	NC_022525	AAGC	2	8	156928	156935	50 %	0 %	25 %	25 %	549478246
3000	NC_022525	GAT	2	6	157042	157047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478247

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