MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022525	CCT	2	6	78075	78080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478186
1502	NC_022525	ACC	2	6	78161	78166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478186
1503	NC_022525	TCGG	2	8	78176	78183	0 %	25 %	50 %	25 %	549478186
1504	NC_022525	CAG	2	6	78209	78214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1505	NC_022525	CGA	2	6	78283	78288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1506	NC_022525	CCG	2	6	78310	78315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478186
1507	NC_022525	CTGG	2	8	78551	78558	0 %	25 %	50 %	25 %	549478186
1508	NC_022525	GCG	2	6	78635	78640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1509	NC_022525	GCGAA	2	10	78690	78699	40 %	0 %	40 %	20 %	549478186
1510	NC_022525	CCGT	2	8	78701	78708	0 %	25 %	25 %	50 %	549478186
1511	NC_022525	CGG	3	9	78733	78741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1512	NC_022525	ACT	2	6	78774	78779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478186
1513	NC_022525	CAT	2	6	78826	78831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478186
1514	NC_022525	CGG	2	6	78964	78969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1515	NC_022525	GC	5	10	78989	78998	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
1516	NC_022525	TGAAGC	2	12	79092	79103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549478186
1517	NC_022525	TGG	2	6	79173	79178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478186
1518	NC_022525	CTT	2	6	79185	79190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478186
1519	NC_022525	GGC	2	6	79199	79204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1520	NC_022525	TGC	2	6	79287	79292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1521	NC_022525	TGA	2	6	79306	79311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478186
1522	NC_022525	GTGGAC	2	12	79322	79333	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549478186
1523	NC_022525	GGCG	2	8	79390	79397	0 %	0 %	75 %	25 %	549478186
1524	NC_022525	CAG	2	6	79469	79474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1525	NC_022525	TGA	2	6	79512	79517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478186
1526	NC_022525	GCG	2	6	79574	79579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1527	NC_022525	CGTAC	2	10	79580	79589	20 %	20 %	20 %	40 %	549478186
1528	NC_022525	GGC	2	6	79630	79635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1529	NC_022525	GC	3	6	79634	79639	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
1530	NC_022525	TAC	2	6	79697	79702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478186
1531	NC_022525	GTG	2	6	79715	79720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478186
1532	NC_022525	CCA	2	6	79848	79853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478186
1533	NC_022525	GAA	2	6	79855	79860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478186
1534	NC_022525	GCT	2	6	79873	79878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1535	NC_022525	GTG	2	6	79907	79912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478186
1536	NC_022525	CGC	2	6	79918	79923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478186
1537	NC_022525	GCT	2	6	79927	79932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1538	NC_022525	CCAC	2	8	79956	79963	25 %	0 %	0 %	75 %	549478186
1539	NC_022525	GTC	2	6	80028	80033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1540	NC_022525	CAT	2	6	80074	80079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478186
1541	NC_022525	ACC	2	6	80084	80089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478186
1542	NC_022525	GCC	2	6	80094	80099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478186
1543	NC_022525	CGC	2	6	80126	80131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478186
1544	NC_022525	GC	3	6	80133	80138	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
1545	NC_022525	CGG	2	6	80173	80178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1546	NC_022525	ACG	2	6	80186	80191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1547	NC_022525	TG	3	6	80541	80546	0 %	50 %	50 %	0 %	549478187
1548	NC_022525	GAT	2	6	80590	80595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478187
1549	NC_022525	TTGT	2	8	80703	80710	0 %	75 %	25 %	0 %	549478187
1550	NC_022525	GAT	2	6	80719	80724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478187
1551	NC_022525	TGCCAG	2	12	80750	80761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549478187
1552	NC_022525	GAAA	2	8	80825	80832	75 %	0 %	25 %	0 %	549478187
1553	NC_022525	C	6	6	80870	80875	0 %	0 %	0 %	100 %	549478187
1554	NC_022525	GAT	2	6	80905	80910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478187
1555	NC_022525	CGTC	2	8	81036	81043	0 %	25 %	25 %	50 %	549478188
1556	NC_022525	TTC	2	6	81067	81072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478188
1557	NC_022525	GTA	2	6	81186	81191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478188
1558	NC_022525	CG	3	6	81192	81197	0 %	0 %	50 %	50 %	549478188
1559	NC_022525	CAG	2	6	81211	81216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478188
1560	NC_022525	TTGCC	2	10	81217	81226	0 %	40 %	20 %	40 %	549478188
1561	NC_022525	GGC	2	6	81259	81264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478188
1562	NC_022525	CT	3	6	81272	81277	0 %	50 %	0 %	50 %	549478188
1563	NC_022525	CAC	2	6	81337	81342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478188
1564	NC_022525	GGTATC	2	12	81394	81405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549478188
1565	NC_022525	GCCT	2	8	81445	81452	0 %	25 %	25 %	50 %	549478188
1566	NC_022525	CAC	2	6	81571	81576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478188
1567	NC_022525	TCT	2	6	81779	81784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478189
1568	NC_022525	GCA	2	6	81789	81794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478189
1569	NC_022525	CGC	2	6	81816	81821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478189
1570	NC_022525	CTT	2	6	81840	81845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478189
1571	NC_022525	CG	3	6	81865	81870	0 %	0 %	50 %	50 %	549478189
1572	NC_022525	GTT	2	6	81918	81923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478189
1573	NC_022525	CG	3	6	81933	81938	0 %	0 %	50 %	50 %	549478189
1574	NC_022525	CTT	2	6	81996	82001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478189
1575	NC_022525	GCA	2	6	82053	82058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478189
1576	NC_022525	CGC	3	9	82077	82085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478189
1577	NC_022525	CCG	2	6	82155	82160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478189
1578	NC_022525	CCG	2	6	82178	82183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478189
1579	NC_022525	GCC	2	6	82255	82260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478189
1580	NC_022525	CAGC	2	8	82313	82320	25 %	0 %	25 %	50 %	549478189
1581	NC_022525	CGC	2	6	82338	82343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478189
1582	NC_022525	GGTC	2	8	82442	82449	0 %	25 %	50 %	25 %	549478189
1583	NC_022525	ACTC	2	8	82494	82501	25 %	25 %	0 %	50 %	549478189
1584	NC_022525	T	8	8	82567	82574	0 %	100 %	0 %	0 %	549478190
1585	NC_022525	ATT	2	6	82576	82581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478190
1586	NC_022525	TCA	2	6	82729	82734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478190
1587	NC_022525	ACCA	2	8	82752	82759	50 %	0 %	0 %	50 %	549478190
1588	NC_022525	ATA	2	6	82792	82797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478190
1589	NC_022525	CCG	2	6	82828	82833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478190
1590	NC_022525	CGA	2	6	82859	82864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478190
1591	NC_022525	CATCCT	2	12	82877	82888	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549478190
1592	NC_022525	CGG	2	6	83021	83026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478190
1593	NC_022525	TCG	2	6	83044	83049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478190
1594	NC_022525	AAT	2	6	83124	83129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478190
1595	NC_022525	CAG	2	6	83163	83168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478190
1596	NC_022525	GAT	2	6	83243	83248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478190
1597	NC_022525	GCG	2	6	83266	83271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478190
1598	NC_022525	ATC	2	6	83293	83298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478190
1599	NC_022525	TGC	2	6	83387	83392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478190
1600	NC_022525	CGG	2	6	83393	83398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478190
1601	NC_022525	GCG	2	6	83413	83418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478190
1602	NC_022525	TCA	2	6	83467	83472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478190
1603	NC_022525	AGT	2	6	83498	83503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478190
1604	NC_022525	CAC	2	6	83535	83540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478190
1605	NC_022525	GGT	2	6	83556	83561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478190
1606	NC_022525	CCG	2	6	83582	83587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478190
1607	NC_022525	CGT	2	6	83666	83671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478190
1608	NC_022525	GCT	2	6	83681	83686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478190
1609	NC_022525	CAGA	2	8	83694	83701	50 %	0 %	25 %	25 %	549478190
1610	NC_022525	CAG	2	6	83772	83777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478190
1611	NC_022525	TTC	2	6	83811	83816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478190
1612	NC_022525	A	6	6	83948	83953	100 %	0 %	0 %	0 %	549478190
1613	NC_022525	GTC	2	6	84066	84071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478190
1614	NC_022525	GGC	2	6	84251	84256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481676
1615	NC_022525	GTT	2	6	84302	84307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481676
1616	NC_022525	ATG	2	6	84321	84326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481676
1617	NC_022525	TCAGC	2	10	84445	84454	20 %	20 %	20 %	40 %	549481676
1618	NC_022525	GC	3	6	84458	84463	0 %	0 %	50 %	50 %	549481676
1619	NC_022525	GT	4	8	84480	84487	0 %	50 %	50 %	0 %	549481676
1620	NC_022525	GCCA	2	8	84489	84496	25 %	0 %	25 %	50 %	549481676
1621	NC_022525	CGA	2	6	84514	84519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481676
1622	NC_022525	GATG	2	8	84544	84551	25 %	25 %	50 %	0 %	549481676
1623	NC_022525	GGCCA	2	10	84593	84602	20 %	0 %	40 %	40 %	549481676
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1876	NC_022525	AATG	2	8	99166	99173	50 %	25 %	25 %	0 %	549478203
1877	NC_022525	TGG	2	6	99252	99257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478203
1878	NC_022525	GAT	2	6	99259	99264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478203
1879	NC_022525	GCT	2	6	99268	99273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478203
1880	NC_022525	GCC	2	6	99275	99280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478203
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1884	NC_022525	GCGCT	2	10	99383	99392	0 %	20 %	40 %	40 %	549478203
1885	NC_022525	CG	3	6	99397	99402	0 %	0 %	50 %	50 %	549478203
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1895	NC_022525	GGC	2	6	99871	99876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478203
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1908	NC_022525	GC	3	6	100393	100398	0 %	0 %	50 %	50 %	549478203
1909	NC_022525	TGG	2	6	100428	100433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478203
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1917	NC_022525	GTC	2	6	100946	100951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478204
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1991	NC_022525	TTGTT	2	10	105424	105433	0 %	80 %	20 %	0 %	549478209
1992	NC_022525	TCT	2	6	105488	105493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478209
1993	NC_022525	CGT	2	6	105557	105562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478209
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1995	NC_022525	CCTG	2	8	105577	105584	0 %	25 %	25 %	50 %	549478209
1996	NC_022525	ACG	2	6	105637	105642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478209
1997	NC_022525	ATT	2	6	105645	105650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478209
1998	NC_022525	GAC	2	6	105651	105656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478209
1999	NC_022525	G	6	6	105680	105685	0 %	0 %	100 %	0 %	549478209
2000	NC_022525	AGC	2	6	105724	105729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478209

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