MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022525	A	6	6	51277	51282	100 %	0 %	0 %	0 %	549481673
1002	NC_022525	TAA	2	6	51312	51317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481673
1003	NC_022525	TCA	2	6	51383	51388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481673
1004	NC_022525	GTG	2	6	51407	51412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481673
1005	NC_022525	TGC	2	6	51456	51461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481673
1006	NC_022525	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	549481673
1007	NC_022525	GAC	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481673
1008	NC_022525	GAT	3	9	51588	51596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481673
1009	NC_022525	ATA	2	6	51625	51630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481673
1010	NC_022525	CAG	3	9	51636	51644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481673
1011	NC_022525	CAG	2	6	51723	51728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481673
1012	NC_022525	GTA	2	6	51767	51772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481673
1013	NC_022525	ATG	2	6	51779	51784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481673
1014	NC_022525	TTG	2	6	52290	52295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481674
1015	NC_022525	AGC	2	6	52355	52360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481674
1016	NC_022525	GCA	2	6	52404	52409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481674
1017	NC_022525	TGA	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481674
1018	NC_022525	CAT	2	6	52460	52465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481674
1019	NC_022525	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	549478166
1020	NC_022525	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	549478166
1021	NC_022525	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	549478166
1022	NC_022525	GAA	2	6	52989	52994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478166
1023	NC_022525	GGT	3	9	53015	53023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478166
1024	NC_022525	GCG	2	6	53122	53127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478166
1025	NC_022525	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	549478166
1026	NC_022525	CGC	2	6	53157	53162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478166
1027	NC_022525	CTG	2	6	53199	53204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478166
1028	NC_022525	GAT	2	6	53241	53246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478166
1029	NC_022525	TTA	2	6	53283	53288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478166
1030	NC_022525	GGC	2	6	53346	53351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478166
1031	NC_022525	AGT	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478166
1032	NC_022525	GGA	2	6	53390	53395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478166
1033	NC_022525	CTG	2	6	53418	53423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478166
1034	NC_022525	CGA	2	6	53462	53467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478166
1035	NC_022525	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	549478166
1036	NC_022525	CAA	2	6	53628	53633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478166
1037	NC_022525	CTG	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478166
1038	NC_022525	AGC	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478166
1039	NC_022525	TGA	2	6	53735	53740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478166
1040	NC_022525	T	6	6	53784	53789	0 %	100 %	0 %	0 %	549478166
1041	NC_022525	TGA	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478167
1042	NC_022525	GCG	2	6	53907	53912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478167
1043	NC_022525	GAT	3	9	53954	53962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478167
1044	NC_022525	CAT	2	6	53971	53976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478167
1045	NC_022525	A	6	6	53987	53992	100 %	0 %	0 %	0 %	549478167
1046	NC_022525	A	7	7	53996	54002	100 %	0 %	0 %	0 %	549478167
1047	NC_022525	ATG	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478167
1048	NC_022525	GCA	2	6	54039	54044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1049	NC_022525	GCC	2	6	54242	54247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478167
1050	NC_022525	CAT	2	6	54346	54351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478167
1051	NC_022525	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
1052	NC_022525	GCGGAA	2	12	54440	54451	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549478167
1053	NC_022525	ACC	2	6	54575	54580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478167
1054	NC_022525	CTG	2	6	55010	55015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1055	NC_022525	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
1056	NC_022525	A	6	6	55044	55049	100 %	0 %	0 %	0 %	549478167
1057	NC_022525	GCA	2	6	55051	55056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1058	NC_022525	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
1059	NC_022525	AAG	2	6	55134	55139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478167
1060	NC_022525	GCT	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1061	NC_022525	GGC	2	6	55330	55335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478167
1062	NC_022525	TGG	2	6	55382	55387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478167
1063	NC_022525	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	549478167
1064	NC_022525	CCA	2	6	55476	55481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478167
1065	NC_022525	TGC	2	6	55522	55527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1066	NC_022525	TCC	2	6	55574	55579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478167
1067	NC_022525	TGA	2	6	55581	55586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478167
1068	NC_022525	CGC	2	6	55695	55700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478167
1069	NC_022525	TGA	2	6	55707	55712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478167
1070	NC_022525	TGC	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1071	NC_022525	TCG	2	6	55816	55821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1072	NC_022525	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
1073	NC_022525	CTG	2	6	55844	55849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1074	NC_022525	TGG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478167
1075	NC_022525	GCA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1076	NC_022525	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	549478167
1077	NC_022525	CAT	2	6	56047	56052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478167
1078	NC_022525	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
1079	NC_022525	TGA	2	6	56173	56178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478167
1080	NC_022525	ACG	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1081	NC_022525	GTT	2	6	56242	56247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478167
1082	NC_022525	GAA	2	6	56264	56269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478167
1083	NC_022525	CAA	2	6	56317	56322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478167
1084	NC_022525	AAG	2	6	56414	56419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478167
1085	NC_022525	G	6	6	56488	56493	0 %	0 %	100 %	0 %	549478167
1086	NC_022525	TGA	3	9	56497	56505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478167
1087	NC_022525	GCT	2	6	56580	56585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478167
1088	NC_022525	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	549478167
1089	NC_022525	AAC	2	6	56670	56675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478167
1090	NC_022525	TGA	2	6	56687	56692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478167
1091	NC_022525	GTA	2	6	56734	56739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478168
1092	NC_022525	GCA	2	6	56762	56767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478168
1093	NC_022525	TCC	2	6	56777	56782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478168
1094	NC_022525	GCG	2	6	56879	56884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478168
1095	NC_022525	TGA	2	6	56942	56947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478168
1096	NC_022525	ATC	2	6	56998	57003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478168
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1098	NC_022525	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	549478168
1099	NC_022525	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478168
1100	NC_022525	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	549478168
1101	NC_022525	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	549478169
1102	NC_022525	GAT	2	6	57401	57406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478169
1103	NC_022525	CGG	2	6	57414	57419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478169
1104	NC_022525	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	549478169
1105	NC_022525	AGC	3	9	57489	57497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478169
1106	NC_022525	AAG	2	6	57510	57515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478169
1107	NC_022525	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	549478169
1108	NC_022525	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478169
1109	NC_022525	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478169
1110	NC_022525	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	549478169
1111	NC_022525	TTG	2	6	57857	57862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478170
1112	NC_022525	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	549478170
1113	NC_022525	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	549478170
1114	NC_022525	GAA	2	6	58135	58140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478170
1115	NC_022525	G	6	6	58210	58215	0 %	0 %	100 %	0 %	549478170
1116	NC_022525	TGG	2	6	58223	58228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478170
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1118	NC_022525	TCG	2	6	58358	58363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478170
1119	NC_022525	TGG	2	6	58448	58453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478170
1120	NC_022525	TCTAAC	2	12	58471	58482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478170
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1122	NC_022525	CGA	2	6	58530	58535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478170
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1124	NC_022525	AGG	2	6	58550	58555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478170
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1374	NC_022525	GTG	2	6	71074	71079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478181
1375	NC_022525	GTC	2	6	71088	71093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478181
1376	NC_022525	GTG	2	6	71202	71207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478181
1377	NC_022525	CGG	2	6	71297	71302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478181
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1381	NC_022525	TTGAT	2	10	71527	71536	20 %	60 %	20 %	0 %	549478181
1382	NC_022525	GGC	2	6	71630	71635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478181
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1387	NC_022525	GC	3	6	71968	71973	0 %	0 %	50 %	50 %	549478181
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1393	NC_022525	GTG	2	6	72120	72125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478181
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1484	NC_022525	CAT	2	6	77536	77541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478186
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1488	NC_022525	GCT	2	6	77647	77652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1489	NC_022525	TGA	2	6	77656	77661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478186
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1491	NC_022525	CAT	2	6	77722	77727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478186
1492	NC_022525	CGATG	2	10	77749	77758	20 %	20 %	40 %	20 %	549478186
1493	NC_022525	TGC	2	6	77850	77855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1494	NC_022525	CGG	2	6	77875	77880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1495	NC_022525	GTC	2	6	77916	77921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478186
1496	NC_022525	CG	3	6	77943	77948	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
1497	NC_022525	CTC	2	6	77956	77961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478186
1498	NC_022525	GGC	2	6	78004	78009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186
1499	NC_022525	TGA	2	6	78042	78047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478186
1500	NC_022525	CGG	2	6	78058	78063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478186

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