MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_022525	AT	3	6	25383	25388	50 %	50 %	0 %	0 %	549478149
503	NC_022525	TAT	2	6	25393	25398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478149
504	NC_022525	ACCG	2	8	25417	25424	25 %	0 %	25 %	50 %	549478149
505	NC_022525	TATTT	2	10	25437	25446	20 %	80 %	0 %	0 %	549478149
506	NC_022525	AAAT	2	8	25477	25484	75 %	25 %	0 %	0 %	549478149
507	NC_022525	TAC	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478149
508	NC_022525	A	6	6	25670	25675	100 %	0 %	0 %	0 %	549478149
509	NC_022525	CCG	2	6	25694	25699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478149
510	NC_022525	ACG	2	6	25769	25774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478149
511	NC_022525	ATG	2	6	25798	25803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478149
512	NC_022525	TCTG	2	8	25934	25941	0 %	50 %	25 %	25 %	549478150
513	NC_022525	GGC	2	6	25991	25996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
514	NC_022525	ACG	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
515	NC_022525	GC	3	6	26086	26091	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
516	NC_022525	GCCT	2	8	26115	26122	0 %	25 %	25 %	50 %	549478150
517	NC_022525	GGC	3	9	26183	26191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
518	NC_022525	GCC	2	6	26226	26231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478150
519	NC_022525	GCA	2	6	26252	26257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
520	NC_022525	GGC	2	6	26282	26287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
521	NC_022525	GGC	2	6	26400	26405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
522	NC_022525	ACT	2	6	26473	26478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478150
523	NC_022525	GCG	2	6	26497	26502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
524	NC_022525	AGCGAC	2	12	26511	26522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
525	NC_022525	GCA	2	6	26525	26530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
526	NC_022525	ATT	2	6	26609	26614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478150
527	NC_022525	CCTT	2	8	26621	26628	0 %	50 %	0 %	50 %	549478150
528	NC_022525	GAC	2	6	26652	26657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
529	NC_022525	CAT	2	6	26750	26755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478150
530	NC_022525	GCC	2	6	26771	26776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478150
531	NC_022525	CCG	2	6	26809	26814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478150
532	NC_022525	GCG	2	6	26818	26823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
533	NC_022525	CCG	2	6	26884	26889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478150
534	NC_022525	GGC	2	6	26911	26916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
535	NC_022525	GCG	2	6	26925	26930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
536	NC_022525	TAG	2	6	26954	26959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
537	NC_022525	TCAG	2	8	26980	26987	25 %	25 %	25 %	25 %	549478150
538	NC_022525	GCG	2	6	27076	27081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
539	NC_022525	ATA	2	6	27145	27150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478150
540	NC_022525	GAT	2	6	27264	27269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
541	NC_022525	ATT	2	6	27346	27351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478150
542	NC_022525	TAT	2	6	27360	27365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478150
543	NC_022525	AGG	2	6	27369	27374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478150
544	NC_022525	ATCA	2	8	27393	27400	50 %	25 %	0 %	25 %	549478150
545	NC_022525	TTA	2	6	27427	27432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478150
546	NC_022525	CAGC	2	8	27437	27444	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
547	NC_022525	TGA	2	6	27461	27466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
548	NC_022525	TTG	2	6	27477	27482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478150
549	NC_022525	ACA	2	6	27532	27537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478150
550	NC_022525	GAT	2	6	27621	27626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
551	NC_022525	CTG	2	6	27720	27725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478150
552	NC_022525	ACA	2	6	27745	27750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478150
553	NC_022525	GCG	2	6	27787	27792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
554	NC_022525	CAG	2	6	27867	27872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
555	NC_022525	GCG	2	6	27889	27894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
556	NC_022525	AGCC	2	8	27927	27934	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
557	NC_022525	CG	3	6	28016	28021	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
558	NC_022525	GGT	2	6	28031	28036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478150
559	NC_022525	ACA	2	6	28047	28052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478150
560	NC_022525	GAT	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
561	NC_022525	TGA	2	6	28109	28114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
562	NC_022525	CCGA	2	8	28134	28141	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
563	NC_022525	GC	3	6	28144	28149	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
564	NC_022525	GC	3	6	28180	28185	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
565	NC_022525	ACGGTG	2	12	28236	28247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549478150
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567	NC_022525	GT	3	6	28358	28363	0 %	50 %	50 %	0 %	549478150
568	NC_022525	ATC	2	6	28372	28377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478150
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570	NC_022525	TCC	2	6	28383	28388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478150
571	NC_022525	ACA	2	6	28406	28411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478150
572	NC_022525	CTG	2	6	28452	28457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478151
573	NC_022525	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	549478151
574	NC_022525	ATTA	2	8	28527	28534	50 %	50 %	0 %	0 %	549478151
575	NC_022525	A	6	6	28594	28599	100 %	0 %	0 %	0 %	549478151
576	NC_022525	GT	3	6	28623	28628	0 %	50 %	50 %	0 %	549478151
577	NC_022525	CCG	2	6	28630	28635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478151
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582	NC_022525	TCG	2	6	28894	28899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478151
583	NC_022525	CCG	2	6	28948	28953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478151
584	NC_022525	A	6	6	29121	29126	100 %	0 %	0 %	0 %	549478151
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588	NC_022525	AAC	2	6	29633	29638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478152
589	NC_022525	ATG	2	6	29815	29820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478152
590	NC_022525	AAT	2	6	29841	29846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478152
591	NC_022525	GGT	2	6	29855	29860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478152
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593	NC_022525	ATGA	2	8	29974	29981	50 %	25 %	25 %	0 %	549478152
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596	NC_022525	CT	3	6	30108	30113	0 %	50 %	0 %	50 %	549478153
597	NC_022525	GCA	2	6	30226	30231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478153
598	NC_022525	GCG	2	6	30238	30243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478153
599	NC_022525	GCG	2	6	30264	30269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478153
600	NC_022525	AG	3	6	30377	30382	50 %	0 %	50 %	0 %	549478153
601	NC_022525	CG	3	6	30434	30439	0 %	0 %	50 %	50 %	549478153
602	NC_022525	GGC	2	6	30453	30458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478153
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604	NC_022525	TGCT	2	8	30544	30551	0 %	50 %	25 %	25 %	549478154
605	NC_022525	TATC	2	8	30600	30607	25 %	50 %	0 %	25 %	549478154
606	NC_022525	GTAA	2	8	30637	30644	50 %	25 %	25 %	0 %	549478154
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610	NC_022525	GC	3	6	30766	30771	0 %	0 %	50 %	50 %	549478154
611	NC_022525	GGT	2	6	30789	30794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478154
612	NC_022525	CCG	2	6	30815	30820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478154
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614	NC_022525	TTCG	2	8	30899	30906	0 %	50 %	25 %	25 %	549478154
615	NC_022525	GCA	2	6	30951	30956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478154
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617	NC_022525	TTACG	2	10	31023	31032	20 %	40 %	20 %	20 %	549478154
618	NC_022525	TTA	2	6	31039	31044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478154
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621	NC_022525	TAT	2	6	31279	31284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478155
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623	NC_022525	CGG	2	6	31391	31396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478155
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625	NC_022525	GGT	2	6	31434	31439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478155
626	NC_022525	CGC	2	6	31476	31481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478155
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