MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022525	ATA	2	6	316889	316894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478359
6002	NC_022525	GC	4	8	317008	317015	0 %	0 %	50 %	50 %	549478360
6003	NC_022525	TCA	2	6	317020	317025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478360
6004	NC_022525	ACCCAT	2	12	317062	317073	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	549478360
6005	NC_022525	GCA	2	6	317095	317100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478360
6006	NC_022525	T	6	6	317125	317130	0 %	100 %	0 %	0 %	549478360
6007	NC_022525	TTC	2	6	317164	317169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478360
6008	NC_022525	CGA	2	6	317261	317266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478360
6009	NC_022525	CGC	2	6	317268	317273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478360
6010	NC_022525	TGG	2	6	317294	317299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478360
6011	NC_022525	GT	3	6	317303	317308	0 %	50 %	50 %	0 %	549478360
6012	NC_022525	T	6	6	317324	317329	0 %	100 %	0 %	0 %	549478360
6013	NC_022525	ACC	2	6	317361	317366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478360
6014	NC_022525	ACC	2	6	317529	317534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478361
6015	NC_022525	GC	3	6	317551	317556	0 %	0 %	50 %	50 %	549478361
6016	NC_022525	ATT	2	6	317574	317579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478361
6017	NC_022525	CGT	2	6	317607	317612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478361
6018	NC_022525	CAA	2	6	317621	317626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478361
6019	NC_022525	TGG	2	6	317656	317661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478361
6020	NC_022525	CTG	2	6	317703	317708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478361
6021	NC_022525	CGCGG	2	10	317757	317766	0 %	0 %	60 %	40 %	549478361
6022	NC_022525	GATA	2	8	317945	317952	50 %	25 %	25 %	0 %	549478361
6023	NC_022525	CGGG	2	8	318022	318029	0 %	0 %	75 %	25 %	549478361
6024	NC_022525	GA	3	6	318058	318063	50 %	0 %	50 %	0 %	549478361
6025	NC_022525	GCA	2	6	318071	318076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478361
6026	NC_022525	GCCAG	2	10	318106	318115	20 %	0 %	40 %	40 %	549478361
6027	NC_022525	GCTG	2	8	318149	318156	0 %	25 %	50 %	25 %	549478361
6028	NC_022525	CAT	2	6	318744	318749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478362
6029	NC_022525	CCA	2	6	318820	318825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478362
6030	NC_022525	CGA	2	6	318888	318893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478362
6031	NC_022525	CAT	2	6	318916	318921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478362
6032	NC_022525	AGG	2	6	318957	318962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478362
6033	NC_022525	GGC	2	6	318987	318992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478362
6034	NC_022525	CTGGCG	2	12	319051	319062	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549478362
6035	NC_022525	GCA	2	6	319102	319107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478362
6036	NC_022525	CAA	2	6	319112	319117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478362
6037	NC_022525	CGC	2	6	319211	319216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478362
6038	NC_022525	CGGA	2	8	319260	319267	25 %	0 %	50 %	25 %	549478362
6039	NC_022525	CG	3	6	319307	319312	0 %	0 %	50 %	50 %	549478362
6040	NC_022525	GGC	2	6	319340	319345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478362
6041	NC_022525	CAG	2	6	319397	319402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478362
6042	NC_022525	CGC	2	6	319403	319408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478362
6043	NC_022525	GC	3	6	319421	319426	0 %	0 %	50 %	50 %	549478362
6044	NC_022525	AGC	2	6	319473	319478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478362
6045	NC_022525	TGGA	2	8	319481	319488	25 %	25 %	50 %	0 %	549478362
6046	NC_022525	TG	3	6	319524	319529	0 %	50 %	50 %	0 %	549478362
6047	NC_022525	CTG	2	6	319559	319564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478362
6048	NC_022525	GCA	3	9	319576	319584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478362
6049	NC_022525	GC	3	6	319625	319630	0 %	0 %	50 %	50 %	549478362
6050	NC_022525	G	6	6	319702	319707	0 %	0 %	100 %	0 %	549478362
6051	NC_022525	CAG	3	9	319721	319729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478362
6052	NC_022525	GTT	2	6	319765	319770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478362
6053	NC_022525	CATG	2	8	319868	319875	25 %	25 %	25 %	25 %	549478363
6054	NC_022525	CCG	2	6	319915	319920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478363
6055	NC_022525	TTG	2	6	320023	320028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478363
6056	NC_022525	CCG	2	6	320029	320034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478363
6057	NC_022525	TCC	2	6	320053	320058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478363
6058	NC_022525	GGC	2	6	320253	320258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478363
6059	NC_022525	CCA	2	6	320416	320421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478363
6060	NC_022525	TGCC	2	8	320442	320449	0 %	25 %	25 %	50 %	549478363
6061	NC_022525	CAGC	2	8	320460	320467	25 %	0 %	25 %	50 %	549478363
6062	NC_022525	GGT	2	6	320468	320473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478363
6063	NC_022525	GAC	2	6	320510	320515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478363
6064	NC_022525	TCG	2	6	320657	320662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478363
6065	NC_022525	CTGC	2	8	320707	320714	0 %	25 %	25 %	50 %	549478363
6066	NC_022525	CGC	2	6	320743	320748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478363
6067	NC_022525	GGC	2	6	321034	321039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6068	NC_022525	GGT	2	6	321050	321055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481708
6069	NC_022525	CAG	2	6	321122	321127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481708
6070	NC_022525	GCC	2	6	321143	321148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481708
6071	NC_022525	GCC	2	6	321205	321210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481708
6072	NC_022525	CAGC	2	8	321226	321233	25 %	0 %	25 %	50 %	549481708
6073	NC_022525	GGC	2	6	321234	321239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6074	NC_022525	GCG	2	6	321241	321246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6075	NC_022525	GCG	2	6	321250	321255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6076	NC_022525	CGCC	2	8	321271	321278	0 %	0 %	25 %	75 %	549481708
6077	NC_022525	CGC	2	6	321287	321292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481708
6078	NC_022525	ATC	2	6	321305	321310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481708
6079	NC_022525	GGCAG	2	10	321331	321340	20 %	0 %	60 %	20 %	549481708
6080	NC_022525	GCG	2	6	321464	321469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6081	NC_022525	GCG	2	6	321485	321490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6082	NC_022525	ACG	2	6	321497	321502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481708
6083	NC_022525	ATT	2	6	321536	321541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481708
6084	NC_022525	ATC	2	6	321567	321572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481708
6085	NC_022525	CCA	3	9	321649	321657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481708
6086	NC_022525	GTG	3	9	321696	321704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481708
6087	NC_022525	CGTC	2	8	321754	321761	0 %	25 %	25 %	50 %	549481708
6088	NC_022525	TGA	2	6	321762	321767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481708
6089	NC_022525	CGG	2	6	321779	321784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6090	NC_022525	GAA	2	6	321863	321868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481708
6091	NC_022525	GCA	2	6	321901	321906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481708
6092	NC_022525	GCA	2	6	321940	321945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481708
6093	NC_022525	CCCTG	2	10	321948	321957	0 %	20 %	20 %	60 %	549481708
6094	NC_022525	GCA	2	6	322057	322062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481708
6095	NC_022525	TTC	2	6	322088	322093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481708
6096	NC_022525	GGC	2	6	322200	322205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6097	NC_022525	GGGC	2	8	322219	322226	0 %	0 %	75 %	25 %	549481708
6098	NC_022525	CGG	2	6	322232	322237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6099	NC_022525	CGG	2	6	322240	322245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6100	NC_022525	CCT	2	6	322255	322260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481708
6101	NC_022525	GCT	2	6	322292	322297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481708
6102	NC_022525	AACG	2	8	322340	322347	50 %	0 %	25 %	25 %	549481708
6103	NC_022525	CG	3	6	322354	322359	0 %	0 %	50 %	50 %	549481708
6104	NC_022525	GAC	2	6	322454	322459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481708
6105	NC_022525	TG	3	6	322473	322478	0 %	50 %	50 %	0 %	549481708
6106	NC_022525	GGC	2	6	322595	322600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481708
6107	NC_022525	GC	3	6	322741	322746	0 %	0 %	50 %	50 %	549478364
6108	NC_022525	GGC	2	6	322865	322870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478364
6109	NC_022525	GC	3	6	322899	322904	0 %	0 %	50 %	50 %	549478364
6110	NC_022525	CATA	2	8	322939	322946	50 %	25 %	0 %	25 %	549478364
6111	NC_022525	GCG	2	6	322960	322965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478364
6112	NC_022525	CGC	3	9	322988	322996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478364
6113	NC_022525	GA	3	6	323055	323060	50 %	0 %	50 %	0 %	549478364
6114	NC_022525	CGA	2	6	323064	323069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478364
6115	NC_022525	CA	3	6	323137	323142	50 %	0 %	0 %	50 %	549478364
6116	NC_022525	GCA	2	6	323161	323166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478364
6117	NC_022525	GGT	2	6	323167	323172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478364
6118	NC_022525	CAG	2	6	323245	323250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478365
6119	NC_022525	GGT	2	6	323302	323307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478365
6120	NC_022525	CAG	2	6	323446	323451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478365
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6122	NC_022525	AGCG	2	8	323483	323490	25 %	0 %	50 %	25 %	549478365
6123	NC_022525	CGC	2	6	323520	323525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478365
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6236	NC_022525	GAA	2	6	329384	329389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478369
6237	NC_022525	GCGGT	2	10	329514	329523	0 %	20 %	60 %	20 %	549478369
6238	NC_022525	GGC	2	6	329561	329566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478369
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6490	NC_022525	CTG	2	6	341645	341650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478378
6491	NC_022525	CGG	2	6	341673	341678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478378
6492	NC_022525	TGG	2	6	341694	341699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478378
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