MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022525	TGG	2	6	258461	258466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478317
5002	NC_022525	GTC	2	6	258550	258555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478317
5003	NC_022525	CGG	2	6	258575	258580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478317
5004	NC_022525	ATT	2	6	258599	258604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478317
5005	NC_022525	TGAC	2	8	258641	258648	25 %	25 %	25 %	25 %	549478317
5006	NC_022525	A	7	7	258829	258835	100 %	0 %	0 %	0 %	549478318
5007	NC_022525	CGG	2	6	258899	258904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478318
5008	NC_022525	CAG	2	6	258934	258939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5009	NC_022525	GGT	2	6	258981	258986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478318
5010	NC_022525	CAC	2	6	259008	259013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478318
5011	NC_022525	CGC	2	6	259022	259027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478318
5012	NC_022525	CAG	2	6	259045	259050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5013	NC_022525	GCG	2	6	259118	259123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478318
5014	NC_022525	CGG	2	6	259128	259133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478318
5015	NC_022525	CGG	2	6	259137	259142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478318
5016	NC_022525	CAA	2	6	259144	259149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478318
5017	NC_022525	ATT	2	6	259180	259185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478318
5018	NC_022525	CGC	2	6	259188	259193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478318
5019	NC_022525	CGT	2	6	259203	259208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5020	NC_022525	CAA	2	6	259212	259217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478318
5021	NC_022525	GTG	2	6	259285	259290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478318
5022	NC_022525	GAA	2	6	259338	259343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478318
5023	NC_022525	CGC	2	6	259512	259517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478318
5024	NC_022525	CGG	2	6	259536	259541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478318
5025	NC_022525	CGG	2	6	259602	259607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478318
5026	NC_022525	TGG	2	6	259667	259672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478318
5027	NC_022525	CAG	2	6	259860	259865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5028	NC_022525	GCG	2	6	259870	259875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478318
5029	NC_022525	GC	3	6	259878	259883	0 %	0 %	50 %	50 %	549478318
5030	NC_022525	GCA	2	6	259907	259912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5031	NC_022525	CTG	2	6	259927	259932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5032	NC_022525	GCA	2	6	259968	259973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5033	NC_022525	AGC	2	6	259975	259980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5034	NC_022525	AGC	2	6	260068	260073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5035	NC_022525	CGC	2	6	260091	260096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478318
5036	NC_022525	A	6	6	260110	260115	100 %	0 %	0 %	0 %	549478318
5037	NC_022525	CAG	2	6	260140	260145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478318
5038	NC_022525	GTG	2	6	260219	260224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478318
5039	NC_022525	TATT	2	8	260232	260239	25 %	75 %	0 %	0 %	549478318
5040	NC_022525	TGGC	3	12	260407	260418	0 %	25 %	50 %	25 %	549481702
5041	NC_022525	GC	3	6	260451	260456	0 %	0 %	50 %	50 %	549481702
5042	NC_022525	CAT	2	6	260465	260470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481702
5043	NC_022525	GCG	2	6	260518	260523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481702
5044	NC_022525	GC	3	6	260554	260559	0 %	0 %	50 %	50 %	549481702
5045	NC_022525	CGA	2	6	260594	260599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481702
5046	NC_022525	TTG	2	6	260668	260673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481702
5047	NC_022525	GT	3	6	260727	260732	0 %	50 %	50 %	0 %	549481702
5048	NC_022525	ATG	2	6	260745	260750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481702
5049	NC_022525	TGA	2	6	260812	260817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481702
5050	NC_022525	GAA	2	6	260832	260837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481702
5051	NC_022525	TGG	2	6	260851	260856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481702
5052	NC_022525	GGC	2	6	260900	260905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481702
5053	NC_022525	GGT	2	6	260906	260911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481702
5054	NC_022525	CAG	2	6	260961	260966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481702
5055	NC_022525	AAC	2	6	260997	261002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481702
5056	NC_022525	TGG	2	6	261031	261036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481702
5057	NC_022525	ATC	2	6	261082	261087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481702
5058	NC_022525	AGC	2	6	261100	261105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481702
5059	NC_022525	CCGGG	2	10	261169	261178	0 %	0 %	60 %	40 %	549481702
5060	NC_022525	GC	3	6	261204	261209	0 %	0 %	50 %	50 %	549481702
5061	NC_022525	GAT	2	6	261215	261220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481702
5062	NC_022525	AG	3	6	261242	261247	50 %	0 %	50 %	0 %	549481702
5063	NC_022525	TGC	2	6	261274	261279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481702
5064	NC_022525	GGC	2	6	261303	261308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481702
5065	NC_022525	GC	3	6	261327	261332	0 %	0 %	50 %	50 %	549481702
5066	NC_022525	AAC	2	6	261360	261365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481702
5067	NC_022525	TTA	2	6	261369	261374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481702
5068	NC_022525	CTTA	2	8	261651	261658	25 %	50 %	0 %	25 %	549478319
5069	NC_022525	CGA	2	6	261705	261710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478319
5070	NC_022525	GTC	2	6	261730	261735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478319
5071	NC_022525	CCA	2	6	261864	261869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478319
5072	NC_022525	CTT	2	6	261966	261971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478319
5073	NC_022525	CGAT	2	8	261986	261993	25 %	25 %	25 %	25 %	549478319
5074	NC_022525	CATA	2	8	262032	262039	50 %	25 %	0 %	25 %	549478319
5075	NC_022525	CTA	2	6	262304	262309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478320
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5079	NC_022525	T	8	8	262406	262413	0 %	100 %	0 %	0 %	549478320
5080	NC_022525	TCT	2	6	262444	262449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478320
5081	NC_022525	GC	3	6	262490	262495	0 %	0 %	50 %	50 %	549478320
5082	NC_022525	T	6	6	262498	262503	0 %	100 %	0 %	0 %	549478320
5083	NC_022525	TTA	2	6	262540	262545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478320
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5085	NC_022525	TGCC	2	8	262588	262595	0 %	25 %	25 %	50 %	549478320
5086	NC_022525	GC	3	6	262613	262618	0 %	0 %	50 %	50 %	549478320
5087	NC_022525	TGC	2	6	262710	262715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478320
5088	NC_022525	GC	3	6	262739	262744	0 %	0 %	50 %	50 %	549478320
5089	NC_022525	AGG	2	6	262755	262760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478320
5090	NC_022525	ATT	2	6	262773	262778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478320
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5092	NC_022525	GTT	2	6	262824	262829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478320
5093	NC_022525	TA	3	6	262886	262891	50 %	50 %	0 %	0 %	549478320
5094	NC_022525	AGC	2	6	262937	262942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478320
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5100	NC_022525	T	6	6	263056	263061	0 %	100 %	0 %	0 %	549478320
5101	NC_022525	CGA	2	6	263090	263095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478320
5102	NC_022525	CTG	2	6	263149	263154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478320
5103	NC_022525	CAT	2	6	263181	263186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478320
5104	NC_022525	GC	3	6	263225	263230	0 %	0 %	50 %	50 %	549478320
5105	NC_022525	GCT	2	6	263265	263270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478320
5106	NC_022525	TGA	2	6	263291	263296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478320
5107	NC_022525	TTA	2	6	263315	263320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478320
5108	NC_022525	CTT	2	6	263354	263359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478320
5109	NC_022525	T	6	6	263358	263363	0 %	100 %	0 %	0 %	549478320
5110	NC_022525	TCA	2	6	263401	263406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478320
5111	NC_022525	GTTG	2	8	263496	263503	0 %	50 %	50 %	0 %	549478320
5112	NC_022525	AAT	2	6	263639	263644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478321
5113	NC_022525	T	6	6	263683	263688	0 %	100 %	0 %	0 %	549478321
5114	NC_022525	CCG	2	6	263760	263765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478321
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5117	NC_022525	ATG	2	6	263915	263920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478321
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5119	NC_022525	CGC	2	6	263964	263969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478321
5120	NC_022525	ACG	2	6	264131	264136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478321
5121	NC_022525	CTT	2	6	264144	264149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478321
5122	NC_022525	TCG	2	6	264164	264169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478321
5123	NC_022525	AG	3	6	264250	264255	50 %	0 %	50 %	0 %	549478321
5124	NC_022525	TTC	2	6	264266	264271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478321
5125	NC_022525	GTGA	2	8	264280	264287	25 %	25 %	50 %	0 %	549478321
5126	NC_022525	T	6	6	264303	264308	0 %	100 %	0 %	0 %	549478321
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5131	NC_022525	GTT	2	6	264515	264520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478322
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5135	NC_022525	TCT	2	6	264583	264588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478322
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5154	NC_022525	CGC	3	9	265583	265591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478322
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5163	NC_022525	GGC	2	6	265934	265939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478322
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5222	NC_022525	CTGA	2	8	269693	269700	25 %	25 %	25 %	25 %	549478325
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5225	NC_022525	GCT	2	6	269783	269788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478325
5226	NC_022525	GACT	2	8	269851	269858	25 %	25 %	25 %	25 %	549478325
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5230	NC_022525	GC	3	6	270062	270067	0 %	0 %	50 %	50 %	549478325
5231	NC_022525	AGC	2	6	270114	270119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478325
5232	NC_022525	GCAA	2	8	270137	270144	50 %	0 %	25 %	25 %	549478325
5233	NC_022525	CTG	2	6	270174	270179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478325
5234	NC_022525	GAAA	2	8	270238	270245	75 %	0 %	25 %	0 %	549478325
5235	NC_022525	GAA	2	6	270274	270279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478325
5236	NC_022525	CTG	2	6	270347	270352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478325
5237	NC_022525	GACT	2	8	270421	270428	25 %	25 %	25 %	25 %	549478325
5238	NC_022525	GCA	2	6	270431	270436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478325
5239	NC_022525	TGC	2	6	270442	270447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478325
5240	NC_022525	GCG	2	6	270660	270665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478326
5241	NC_022525	TGGTG	2	10	270763	270772	0 %	40 %	60 %	0 %	549478326
5242	NC_022525	GGT	2	6	270779	270784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478326
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5244	NC_022525	CTG	2	6	270983	270988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478326
5245	NC_022525	TAA	2	6	270991	270996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478326
5246	NC_022525	TCTG	2	8	271009	271016	0 %	50 %	25 %	25 %	549478326
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5353	NC_022525	AG	3	6	276682	276687	50 %	0 %	50 %	0 %	549478331
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5357	NC_022525	CTC	2	6	276840	276845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478332
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5365	NC_022525	GAA	2	6	277284	277289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478332
5366	NC_022525	GTG	2	6	277325	277330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478332
5367	NC_022525	CGT	2	6	277334	277339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478332
5368	NC_022525	GGCG	2	8	277370	277377	0 %	0 %	75 %	25 %	549478332
5369	NC_022525	CTA	2	6	277397	277402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478332
5370	NC_022525	CG	3	6	277418	277423	0 %	0 %	50 %	50 %	549478332
5371	NC_022525	CG	3	6	277672	277677	0 %	0 %	50 %	50 %	549478332
5372	NC_022525	CTT	2	6	277892	277897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478332
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5374	NC_022525	GCG	2	6	278020	278025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478332
5375	NC_022525	CAG	2	6	278046	278051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478332
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5378	NC_022525	GAC	2	6	278202	278207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478332
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5380	NC_022525	TACGG	2	10	278238	278247	20 %	20 %	40 %	20 %	549478332
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5382	NC_022525	CTG	2	6	278377	278382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478332
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5384	NC_022525	TGA	2	6	278402	278407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478332
5385	NC_022525	GACG	2	8	278462	278469	25 %	0 %	50 %	25 %	549478332
5386	NC_022525	CG	3	6	278473	278478	0 %	0 %	50 %	50 %	549478332
5387	NC_022525	TAC	2	6	278523	278528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478332
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5389	NC_022525	GGC	2	6	278625	278630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478332
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5392	NC_022525	ATG	2	6	278755	278760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478332
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5400	NC_022525	TTA	2	6	279263	279268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478333
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5441	NC_022525	TGAT	2	8	281331	281338	25 %	50 %	25 %	0 %	549478336
5442	NC_022525	TTG	2	6	281421	281426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478336
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5473	NC_022525	CTGG	2	8	283017	283024	0 %	25 %	50 %	25 %	549478337
5474	NC_022525	CTG	2	6	283066	283071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478337
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5478	NC_022525	TGG	2	6	283330	283335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478338
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5480	NC_022525	TCG	2	6	283381	283386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478338
5481	NC_022525	A	6	6	283401	283406	100 %	0 %	0 %	0 %	549478338
5482	NC_022525	CGT	2	6	283419	283424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478338
5483	NC_022525	CG	3	6	283476	283481	0 %	0 %	50 %	50 %	549478338
5484	NC_022525	TGA	2	6	283496	283501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478338
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5486	NC_022525	GC	3	6	283538	283543	0 %	0 %	50 %	50 %	549478338
5487	NC_022525	GTG	2	6	283626	283631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478338
5488	NC_022525	GCG	2	6	283662	283667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478338
5489	NC_022525	GGC	2	6	283703	283708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478338
5490	NC_022525	GCA	2	6	283742	283747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478338
5491	NC_022525	CAC	2	6	283806	283811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478338
5492	NC_022525	ACT	2	6	283923	283928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478339
5493	NC_022525	GGC	2	6	283972	283977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
5494	NC_022525	TCG	2	6	284076	284081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5495	NC_022525	CTG	2	6	284108	284113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5496	NC_022525	GGC	2	6	284143	284148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
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5498	NC_022525	TGGT	2	8	284240	284247	0 %	50 %	50 %	0 %	549478339
5499	NC_022525	AAG	2	6	284256	284261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478339
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