MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022525	GCGA	2	8	233888	233895	25 %	0 %	50 %	25 %	549478301
4502	NC_022525	GC	3	6	233900	233905	0 %	0 %	50 %	50 %	549478301
4503	NC_022525	GGC	2	6	233919	233924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478301
4504	NC_022525	GGC	2	6	233946	233951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478301
4505	NC_022525	GCC	2	6	233983	233988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478301
4506	NC_022525	GCC	2	6	233992	233997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478301
4507	NC_022525	CGC	2	6	234023	234028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478301
4508	NC_022525	GCG	3	9	234029	234037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478301
4509	NC_022525	GTA	2	6	234052	234057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478301
4510	NC_022525	GCA	2	6	234081	234086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478301
4511	NC_022525	CAG	2	6	234094	234099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478301
4512	NC_022525	TTA	2	6	234146	234151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478301
4513	NC_022525	CG	3	6	234186	234191	0 %	0 %	50 %	50 %	549478301
4514	NC_022525	CGT	2	6	234193	234198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478301
4515	NC_022525	CGC	2	6	234287	234292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478301
4516	NC_022525	TTG	2	6	234331	234336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478301
4517	NC_022525	TCA	2	6	234510	234515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478301
4518	NC_022525	GTCC	2	8	234549	234556	0 %	25 %	25 %	50 %	549478301
4519	NC_022525	CGTCTG	2	12	234586	234597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478301
4520	NC_022525	GCG	2	6	234604	234609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478301
4521	NC_022525	GCT	2	6	234654	234659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478301
4522	NC_022525	TGC	2	6	234680	234685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478301
4523	NC_022525	TGC	2	6	234770	234775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478301
4524	NC_022525	CCCG	2	8	234855	234862	0 %	0 %	25 %	75 %	549478301
4525	NC_022525	GCGAA	2	10	234893	234902	40 %	0 %	40 %	20 %	549478301
4526	NC_022525	CAGCG	2	10	234956	234965	20 %	0 %	40 %	40 %	549478301
4527	NC_022525	CG	3	6	234980	234985	0 %	0 %	50 %	50 %	549478301
4528	NC_022525	GAA	2	6	235101	235106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478301
4529	NC_022525	CGT	2	6	235329	235334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4530	NC_022525	GCA	2	6	235337	235342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4531	NC_022525	GAC	2	6	235344	235349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4532	NC_022525	ATG	3	9	235354	235362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481699
4533	NC_022525	GAA	2	6	235374	235379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481699
4534	NC_022525	GGCT	2	8	235431	235438	0 %	25 %	50 %	25 %	549481699
4535	NC_022525	A	6	6	235507	235512	100 %	0 %	0 %	0 %	549481699
4536	NC_022525	CGG	3	9	235549	235557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481699
4537	NC_022525	GAT	2	6	235700	235705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481699
4538	NC_022525	CGT	2	6	235707	235712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4539	NC_022525	AAG	2	6	235735	235740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481699
4540	NC_022525	GC	4	8	235748	235755	0 %	0 %	50 %	50 %	549481699
4541	NC_022525	AAC	2	6	235803	235808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481699
4542	NC_022525	CTT	2	6	235820	235825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481699
4543	NC_022525	TTC	2	6	235856	235861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481699
4544	NC_022525	AGC	2	6	235873	235878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4545	NC_022525	CTG	2	6	235911	235916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4546	NC_022525	ATG	2	6	235960	235965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481699
4547	NC_022525	CGG	2	6	236011	236016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481699
4548	NC_022525	CAG	2	6	236049	236054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4549	NC_022525	GAA	2	6	236060	236065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481699
4550	NC_022525	GTC	2	6	236248	236253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4551	NC_022525	CAG	2	6	236277	236282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4552	NC_022525	TGG	2	6	236290	236295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481699
4553	NC_022525	CGT	2	6	236355	236360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4554	NC_022525	CAG	3	9	236382	236390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4555	NC_022525	ATC	2	6	236394	236399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481699
4556	NC_022525	GC	3	6	236425	236430	0 %	0 %	50 %	50 %	549481699
4557	NC_022525	CG	3	6	236449	236454	0 %	0 %	50 %	50 %	549481699
4558	NC_022525	GCG	3	9	236452	236460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481699
4559	NC_022525	CAGC	2	8	236472	236479	25 %	0 %	25 %	50 %	549481699
4560	NC_022525	TC	3	6	236537	236542	0 %	50 %	0 %	50 %	549481699
4561	NC_022525	CAC	2	6	236558	236563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481699
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4564	NC_022525	GCG	2	6	236683	236688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481699
4565	NC_022525	GC	3	6	236693	236698	0 %	0 %	50 %	50 %	549481699
4566	NC_022525	GGCGG	2	10	236706	236715	0 %	0 %	80 %	20 %	549481699
4567	NC_022525	GC	3	6	236751	236756	0 %	0 %	50 %	50 %	549481699
4568	NC_022525	CGC	2	6	236887	236892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481699
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4570	NC_022525	TCG	2	6	236903	236908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4571	NC_022525	TGG	2	6	236935	236940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481699
4572	NC_022525	CGG	2	6	237001	237006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481699
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4574	NC_022525	CG	3	6	237141	237146	0 %	0 %	50 %	50 %	549481699
4575	NC_022525	GGC	2	6	237236	237241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481699
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4580	NC_022525	AAC	2	6	237420	237425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481699
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4585	NC_022525	TGG	2	6	237529	237534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481699
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4588	NC_022525	GGAC	2	8	237598	237605	25 %	0 %	50 %	25 %	549481699
4589	NC_022525	CAG	2	6	237624	237629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
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4591	NC_022525	GCA	2	6	237641	237646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4592	NC_022525	CAG	3	9	237648	237656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4593	NC_022525	GTC	2	6	237680	237685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481699
4594	NC_022525	GCA	2	6	237692	237697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481699
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4599	NC_022525	GTA	2	6	238126	238131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478302
4600	NC_022525	TGTC	2	8	238151	238158	0 %	50 %	25 %	25 %	549478302
4601	NC_022525	GGC	2	6	238167	238172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478302
4602	NC_022525	AGA	2	6	238185	238190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478302
4603	NC_022525	CGC	2	6	238254	238259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478302
4604	NC_022525	CCA	4	12	238271	238282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478302
4605	NC_022525	A	6	6	238301	238306	100 %	0 %	0 %	0 %	549478302
4606	NC_022525	GGT	2	6	238323	238328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478302
4607	NC_022525	AGATGC	2	12	238340	238351	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549478302
4608	NC_022525	CAGT	2	8	238360	238367	25 %	25 %	25 %	25 %	549478302
4609	NC_022525	AAG	2	6	238370	238375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478302
4610	NC_022525	AGC	2	6	238405	238410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478302
4611	NC_022525	AAC	2	6	238477	238482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478302
4612	NC_022525	GTTGA	2	10	238555	238564	20 %	40 %	40 %	0 %	549478302
4613	NC_022525	CGTC	2	8	238577	238584	0 %	25 %	25 %	50 %	549478302
4614	NC_022525	ACT	2	6	238639	238644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478302
4615	NC_022525	GAAA	2	8	238653	238660	75 %	0 %	25 %	0 %	549478302
4616	NC_022525	TTCAA	2	10	238661	238670	40 %	40 %	0 %	20 %	549478302
4617	NC_022525	GGAC	2	8	238676	238683	25 %	0 %	50 %	25 %	549478302
4618	NC_022525	AGC	2	6	238778	238783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478302
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4620	NC_022525	GAAC	2	8	238878	238885	50 %	0 %	25 %	25 %	549478302
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4865	NC_022525	TTCA	2	8	251884	251891	25 %	50 %	0 %	25 %	549478311
4866	NC_022525	GCC	2	6	251906	251911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478311
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